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Nathalie Vialaneix

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Documents

Présentation

Publications

Should we really use graph neural networks for transcriptomic prediction?

Céline Brouard , Raphaël Mourad , Nathalie Vialaneix
Briefings in Bioinformatics, 2024, 25 (2), pp.bbae027. ⟨10.1093/bib/bbae027⟩
Article dans une revue hal-04459067v1
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Plasma 1H-NMR metabolic and amino acid profiles of newborn piglets from two lines divergently selected for residual feed intake

Laurence Liaubet , Camille Guilmineau , Gaëlle Lefort , Yvon Billon , Sébastien Reigner
Scientific Reports, 2023, 13 (1), pp.7127. ⟨10.1038/s41598-023-34279-5⟩
Article dans une revue hal-04091374v1
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ASTERICS: A Simple Tool for the ExploRation and Integration of omiCS data

Élise Maigné , Céline Noirot , Julien Henry , Yaa Adu Kesewaah , Ludovic Badin
BMC Bioinformatics, 2023, 24 (1), pp.391. ⟨10.1186/s12859-023-05504-9⟩
Article dans une revue hal-04248315v1
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Network analyses reveal negative link between changes in adipose tissue GDF15 and BMI during dietary-induced weight loss

Alyssa Imbert , Nathalie Vialaneix , Julien Marquis , Julie Vion , Aline Charpagne
Journal of Clinical Endocrinology and Metabolism, 2022, 107 (1), pp.e130-e142. ⟨10.1210/clinem/dgab621⟩
Article dans une revue hal-03540946v1
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Feature selection for kernel methods in systems biology

Celine Brouard , Jérôme J. Mariette , Rémi Flamary , Nathalie Vialaneix
NAR Genomics and Bioinformatics, 2022, 4 (1), ⟨10.1093/nargab/lqac014⟩
Article dans une revue hal-03601435v1
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R-miss-tastic: a unified platform for missing values methods and workflows

Imke Mayer , Aude Sportisse , Nicholas Tierney , Nathalie Vialaneix , Julie Josse
The R Journal, 2022, 14 (2), pp.244-266. ⟨10.32614/RJ-2022-040⟩
Article dans une revue hal-02879337v3
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Applicability and interpretability of Ward's hierarchical agglomerative clustering with or without contiguity constraints

Nathanaël Randriamihamison , Nathalie Vialaneix , Pierre Neuvial
Journal of Classification, 2021, 38, pp.363-389. ⟨10.1007/s00357-020-09377-y⟩
Article dans une revue hal-02294847v2
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Joint automatic metabolite identification and quantification of a set of 1H NMR spectra

Gaëlle Lefort , Laurence Liaubet , Nathalie Marty-Gasset , Cécile Canlet , Nathalie Vialaneix
Analytical Chemistry, 2021, 93 (5), pp.2861-2870. ⟨10.1021/acs.analchem.0c04232⟩
Article dans une revue hal-03224485v1
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Major reorganization of chromosome conformation during muscle development in pig

Maria Marti-Marimon , Nathalie Vialaneix , Yvette Lahbib Mansais , Matthias Zytnicki , Sylvie Camut
Frontiers in Genetics, 2021, 12, pp.19 P. ⟨10.3389/fgene.2021.748239⟩
Article dans une revue hal-03367056v1
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The maturity in fetal pigs using a multi-fluid metabolomic approach

Gaëlle Lefort , Rémi Servien , Hélène Quesnel , Yvon Billon , Laurianne L. Canario
Scientific Reports, 2020, 10, pp.19912. ⟨10.1038/s41598-020-76709-8⟩
Article dans une revue hal-03034560v1
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Interpretable sparse SIR for functional data

Victor Picheny , Rémi Servien , Nathalie Vialaneix
Statistics and Computing, 2019, 29 (2), pp.255 - 267. ⟨10.1007/s11222-018-9806-6⟩
Article dans une revue hal-02618466v1

Reprise atypique de la cyclicité ovarienne chez la vache laitière : une forte association avec la cétose

Sylvie S. Chastant-Maillard , Claire Saby , Wenting Zhang , René Fournier , Rémi Servien
Le Point vétérinaire, 2019, 393
Article dans une revue hal-02617694v1
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Multi-species annotation of transcriptome and chromatin structure in domesticated animals

Sylvain Foissac , Sarah Djebali , Kylie Munyard , Nathalie Vialaneix , Andrea Rau
BMC Biology, 2019, 17 (1), 25 p. ⟨10.1186/s12915-019-0726-5⟩
Article dans une revue hal-02437599v1
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ASICS: an R package for a whole analysis workflow of 1D 1H NMR spectra

Gaëlle Lefort , Laurence Liaubet , Cécile Canlet , Patrick Tardivel , Marie-Christine Pere
Bioinformatics, 2019, 35 (21), pp.4356-4363. ⟨10.1093/bioinformatics/btz248⟩
Article dans une revue hal-02626125v1
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Adjacency-constrained hierarchical clustering of a band similarity matrix with application to Genomics

Christophe Ambroise , Alia Dehman , Pierre Neuvial , Guillem Rigaill , Nathalie Vialaneix
Algorithms for Molecular Biology, 2019, 14, pp.22. ⟨10.1186/s13015-019-0157-4⟩
Article dans une revue hal-02006331v2
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A new approach of gene co-expression network inference reveals significant biological processes involved in porcine muscle development in late gestation

Maria Marti-Marimon , Nathalie Vialaneix , Valentin Voillet , Martine Bouissou-Matet , Yvette Lahbib Mansais
Scientific Reports, 2018, 8, ⟨10.1038/s41598-018-28173-8⟩
Article dans une revue hal-02622725v1
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Multiple hot-deck imputation for network inference from RNA sequencing data

Alyssa Imbert , Armand Valsesia , Caroline Le Gall , Claudia Armenise , Gregory Lefebvre
Bioinformatics, 2018, 34 (10), pp.1726 - 1732. ⟨10.1093/bioinformatics/btx819⟩
Article dans une revue hal-01794575v1
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Self-Organizing Maps, theory and applications

Marie Cottrell , Madalina Olteanu , Fabrice Rossi , Nathalie N. Villa-Vialaneix
Revista de Investigacion Operacional, 2018, 39 (1), pp.1-22
Article dans une revue hal-01796059v1

Cutting edge bioinformatics and biostatistics approaches are bringing precision medicine and nutrition to a new era

Sanjeena Dang , Nathalie Vialaneix
Lifestyle Genomics, 2018, 11 (2), pp.73-76. ⟨10.1159/000494131⟩
Article dans une revue hal-02624369v1
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Décrire, prendre en compte, imputer et évaluer les valeurs manquantes dans les études statistiques : une revue des approches existantes

Alyssa Imbert , Nathalie Vialaneix
Journal de la Société Française de Statistique, 2018, 159 (2), pp.1-55
Article dans une revue hal-02618033v1
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Unsupervised multiple kernel learning for heterogeneous data integration

Jérôme J. Mariette , Nathalie Vialaneix
Bioinformatics, 2018, 34 (6), pp.1009-1015. ⟨10.1093/bioinformatics/btx682⟩
Article dans une revue hal-01738461v1
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Random Forests for Big Data

Robin Genuer , Jean-Michel Poggi , Christine Tuleau-Malot , Nathalie Vialaneix
Big Data Research, 2017, 9, pp.28-46. ⟨10.1016/j.bdr.2017.07.003⟩
Article dans une revue hal-01233923v2

Molecular biomarkers for weight control in obese individuals subjected to a multiphase dietary intervention

Jennifer Bolton , Emilie Montastier , Jérôme Carayol , Sophie Bonnel , Lucile Mir
Journal of Clinical Endocrinology and Metabolism, 2017, 102 (8), pp.2751-2761. ⟨10.1210/jc.2016-3997⟩
Article dans une revue hal-01608397v1
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Efficient interpretable variants of online SOM for large dissimilarity data

Jérôme J. Mariette , Madalina Olteanu , Nathalie Vialaneix
Neurocomputing, 2017, 225, pp.31-48. ⟨10.1016/j.neucom.2016.11.014⟩
Article dans une revue hal-01465340v1
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(NMR)-N-1H-Based metabolomic profiling method to develop plasma biomarkers for sensitivity to chronic heat stress in growing pigs

Samir Dou , Nathalie Villa-Vialaneix , Laurence Liaubet , Yvon Billon , Mario Giorgi
PLoS ONE, 2017, 12 (11), Non paginé. ⟨10.1371/journal.pone.0188469⟩
Article dans une revue hal-02626025v1
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Time course study of the response to LPS targeting the pig immune gene networks

Elena Terenina , Valérie Sautron , Caroline Ydier , Darya Bazovkina , Amélie Sevin-Pujol
BMC Genomics, 2017, 18, ⟨10.1186/s12864-017-4363-5⟩
Article dans une revue hal-02627295v1
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On combining wavelets expansion and sparse linear models for Regression on metabolomic data and biomarker selection

Nathalie Vialaneix , Noslen Hernández , Alain Paris , Céline Domange , Nathalie Priymenko
Communications in Statistics - Simulation and Computation, 2016, 45 (1), pp.282-298. ⟨10.1080/03610918.2013.862273⟩
Article dans une revue hal-01270963v1
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Analyse statistique des profils et de l’activité des participants d’un MOOC

Avner Bar-Hen , Hubert Javaux , Nathalie N. Villa-Vialaneix
Revue internationale des technologies en pédagogie universitaire, 2016, 12 (1-2), pp.11-22
Article dans une revue hal-02630053v1
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A non parametric approach for calibration with functional data

Noslen Hernández , Rolando Biscay , Nathalie Vialaneix , Isneri Talavera
Statistica Sinica, 2015, 22 (4), pp.1547-1566. ⟨10.5705/ss.2013.242⟩
Article dans une revue hal-01199287v1

Statistical Analysis of the profiles and of the activity of participants of MOOC

Avner Bar-Hen , Hubert Javaux , Nathalie N. Villa-Vialaneix
Revue internationale des technologies en pédagogie universitaire, 2015, 12 (1-2), pp.11-22. ⟨10.18162/ritpu-2015-v12n12-03⟩
Article dans une revue hal-02636153v1
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Analyse statistique des profils et de l’activité des participants d’un MOOC

Avner Bar-Hen , Hubert Javaux , Nathalie Vialaneix
Revue internationale des technologies en pédagogie universitaire, 2015, 12 (1-2), pp.11-22
Article dans une revue hal-01270885v1
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On-line relational and multiple relational SOM

Madalina Olteanu , Nathalie Vialaneix
Neurocomputing, 2015, 147, pp.15-30. ⟨10.1016/j.neucom.2013.11.047⟩
Article dans une revue hal-01063831v1
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Time course of the response to ACTH in pig: biological and transcriptomic study

Valérie Sautron , Elena Terenina , Laure Gress , Yannick Lippi , Yvon Billon
BMC Genomics, 2015, 16 (961), pp.PMC4650497. ⟨10.1186/s12864-015-2118-8⟩
Article dans une revue hal-01271063v1
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Using SOMbrero for clustering and visualizing graphs

Madalina Olteanu , Nathalie Vialaneix
Journal de la Société Française de Statistique, 2015, 156 (3), pp.95-119
Article dans une revue hal-01232672v1
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Beyond multidimensional data in model visualization: High-dimensional and complex nonnumeric data

Nathalie Vialaneix , Anne Ruiz-Gazen
Statistical Analysis and Data Mining, 2015, 8 (4), pp.232-239. ⟨10.1002/sam.11274⟩
Article dans une revue hal-01182932v1
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System Model Network for Adipose Tissue Signatures Related to Weight Changes in Response to Calorie Restriction and Subsequent Weight Maintenance

Emilie Montastier , Nathalie N. Villa-Vialaneix , Sylvie Caspar-Bauguil , Petr Hlavaty , Eva Tvrzicka
PLoS Computational Biology, 2015, 11 (1), pp.e1004047. ⟨10.1371/journal.pcbi.1004047⟩
Article dans une revue inserm-02150615v1
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Le metabolome, un moyen pour trouver de nouveaux biomarqueurs ?

Magali San Cristobal , Marie-Pierre Sanchez , Marie‐josé Mercat , Florian Rohart , Laurence Liaubet
La revue française de la recherche en viandes et produits carnés, 2014, Février, pp.1-5
Article dans une revue hal-01222422v1
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Exploration of a large database of French notarial acts with social network methods

Fabrice Rossi , Nathalie Vialaneix , Florent Hautefeuille
Digital Medievalist, 2014, 9, pp.2013
Article dans une revue hal-01053673v1
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Statistical exploratory analysis of agent-based simulations in a social context

Nathalie Villa-Vialaneix , Christophe Sibertin-Blanc , Pascal Roggero
Case Studies in Business, Industry and Government Statistics, 2014, 5 (2), pp.132-149
Article dans une revue hal-02629776v2

Inferring networks from multiple samples with consensus LASSO

Nathalie N. Villa-Vialaneix , Matthieu Vignes , Nathalie Viguerie , Magali San Cristobal
Quality technology & quantitative management, 2014, 11 (1), pp.39-60
Article dans une revue hal-02641674v1
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Inferring networks from multiple samples with Consensus LASSO

Nathalie Villa-Vialaneix , Matthieu Vignes , Nathalie Viguerie , Magali San Cristobal
Quality technology & quantitative management, 2014, 11 (1), pp.39-60
Article dans une revue hal-00971458v1
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The Structure of a Gene Co-Expression Network Reveals Biological Functions Underlying eQTLs

Nathalie Villa-Vialaneix , Laurence Liaubet , Thibault Laurent , Pierre Cherel , Adrien Gamot
PLoS ONE, 2013, pp.e60045
Article dans une revue hal-00817655v1
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The Structure of a Gene Co-Expression Network Reveals Biological Functions Underlying eQTLs

Nathalie N. Villa-Vialaneix , Laurence Liaubet , Thibault Laurent , Pierre Cherel , Adrien Gamot
PLoS ONE, 2013, 8, online (4), Non paginé. ⟨10.1371/journal.pone.0060045⟩
Article dans une revue hal-02646005v1
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J'ai testé pour vous... un MOOC

Nathalie Villa-Vialaneix
Statistique et Enseignement, 2013, 4 (2), pp.3-17
Article dans une revue hal-00940787v1

Exploration of a large database of French notarial acts with social network methods

Fabrice Rossi , Nathalie N. Villa-Vialaneix , Florent Hautefeuille
Digital Medievalist, 2013, 9
Article dans une revue hal-02648351v1

Spatial correlation in bipartite networks

Nathalie Villa-Vialaneix , Bertrand Jouve , Fabrice Rossi , Florent Hautefeuille
Revue des Nouvelles Technologies de l'Information, 2013, pp.97-110
Article dans une revue hal-00761081v1
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A comparison of eight metamodeling techniques for the simulation of N2O fluxes and N leaching from corn crops

Nathalie Villa-Vialaneix , Marco Follador , Marco Ratto , Adrian Leip
Environmental Modelling and Software, 2012, 34, pp.51-66. ⟨10.1016/j.envsoft.2011.05.003⟩
Article dans une revue hal-00654753v1
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Neural Networks for Complex Data

Marie Cottrell , Madalina Olteanu , Fabrice Rossi , Joseph Rynkiewicz , Nathalie Villa-Vialaneix
KI - Künstliche Intelligenz, 2012, 26 (4), pp.373-380. ⟨10.1007/s13218-012-0207-2⟩
Article dans une revue hal-00744929v1
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Determinants of human adipose tissue gene expression: impact of diet, sex, metabolic status, and cis genetic regulation.

Nathalie Viguerie , Emilie Montastier , Jean-José Maoret , Balbine Roussel , Marion Combes
PLoS Genetics, 2012, 8 (9), pp.e1002959. ⟨10.1371/journal.pgen.1002959⟩
Article dans une revue hal-00757837v1

Phenotypic prediction based on metabolomic data on the growing pig from three main European breeds.

F. Rohart , Alain Paris , Béatrice Laurent , Cécile Canlet , Jerome Molina
Journal of Animal Science, 2012, 90 (13), epub ahead of print. ⟨10.2527/jas.2012-5338⟩
Article dans une revue hal-00757827v1
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Consistency of functional learning methods based on derivatives

Fabrice Rossi , Nathalie Villa-Vialaneix
Pattern Recognition Letters, 2011, 32 (8), pp.1197-1209. ⟨10.1016/j.patrec.2011.03.001⟩
Article dans une revue hal-00589738v1
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Représentation d'un grand réseau à partir d'une classification hiérarchique de ses sommets

Fabrice Rossi , Nathalie Villa-Vialaneix
Journal de la Société Française de Statistique, 2011, 152 (3), pp.34-65
Article dans une revue hal-00651577v1
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What is a good (gene) network?

Nathalie Villa-Vialaneix , Laurence Liaubet , Magali San Cristobal
Journal of Animal Breeding and Genetics, 2011, 128 (1), pp.1-2. ⟨10.1111/j.1439-0388.2010.00916.x⟩
Article dans une revue hal-00658814v1
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Using spatial indexes for labeled network analysis

Thibault Laurent , Nathalie Villa-Vialaneix
Revue I3 - Information Interaction Intelligence, 2011, 11 (1), pp.1
Article dans une revue hal-00654754v1
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Recherche et représentation de communautés dans un grand graphe. Une approche combinée

Nathalie Villa-Vialaneix , Taoufiq Dkaki , Sébastien Gadat , Jean-Michel Inglebert , Quoc-Dinh Truong
Document numérique - Revue des sciences et technologies de l'information. Série Document numérique, 2011, 14 (1), pp.59-80. ⟨10.3166/dn.14.1.59-80⟩
Article dans une revue hal-00590612v1
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A Simulation Study of Functional Density-Based Inverse Regression

Noslen Hernandez , Rolando Biscay , Nathalie Villa-Vialaneix , Isneri Talavera
Revista Investigacion Operacional, 2011, 32 (2), pp.146-159
Article dans une revue hal-00654751v1

Optimizing an Organized Modularity Measure for Topographic Graph Clustering: a Deterministic Annealing Approach

Fabrice Rossi , Nathalie Villa-Vialaneix
Neurocomputing, 2010, 73 (7-9), pp.Pages 1142-1163. ⟨10.1016/j.neucom.2009.11.023⟩
Article dans une revue hal-00515892v1
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Batch kernel SOM and related Laplacian methods for social network analysis

Romain Boulet , Bertrand Jouve , Fabrice Rossi , Nathalie Villa
Neurocomputing, 2008, 71 (7-9), pp.1257-1273. ⟨10.1016/j.neucom.2007.12.026⟩
Article dans une revue hal-00202339v1
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Various Approaches for Predicting Land Cover in Mountain Areas

Nathalie Villa , Martin Paegelow , Maria T. Camacho Olmedo , Laurence Cornez , Frédéric Ferraty
Communications in Statistics - Simulation and Computation, 2007, 36 (1), pp.73-86. ⟨10.1080/03610910601096379⟩
Article dans une revue hal-00144147v1
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Storms prediction : Logistic regression vs random forest for unbalanced data

Anne Ruiz-Gazen , Nathalie Villa
Case Studies in Business, Industry and Government Statistics, 2007, 1 (2), pp.91-101
Article dans une revue hal-00270176v1
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Support vector machine for functional data classification

Fabrice Rossi , Nathalie Villa
Neurocomputing, 2006, 69 (7-9), pp.730-742. ⟨10.1016/j.neucom.2005.12.010⟩
Article dans une revue hal-00144141v1
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Un résultat de consistance pour des SVM fonctionnels par interpolation spline

Nathalie Villa , Fabrice Rossi
Comptes rendus de l'Académie des sciences. Série I, Mathématique, 2006, 343 (8), pp.555-560. ⟨10.1016/j.crma.2006.09.025⟩
Article dans une revue hal-00144142v1
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Multilayer Perceptron with Functional Inputs: an Inverse Regression Approach

Louis Ferré , Nathalie Villa
Scandinavian Journal of Statistics, 2006, 33 (4), pp.807-823. ⟨10.1111/j.1467-9469.2006.00496.x⟩
Article dans une revue hal-00144144v1
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Discrimination de courbes par régression inverse fonctionnelle

Louis Ferré , Nathalie Villa
Revue de Statistique Appliquée, 2005, LIII (1), pp.39-57
Article dans une revue hal-00144140v1
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Modélisation prospective de l’occupation du sol. Le cas d’une montagne méditerrannéenne.

Martin Paegelow , Nathalie Villa , Laurence Cornez , Frédéric Ferraty , Louis Ferré
Cybergeo : Revue européenne de géographie / European journal of geography, 2004, 295, 21 p. en ligne
Article dans une revue hal-03160711v1
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Modélisations prospectives de l'occupation du sol. Le cas d'une montagne méditerranéenne

Martin Paegelow , Nathalie Villa , Laurence Cornez , Frédéric Ferraty , Louis Ferré
Cybergeo : Revue européenne de géographie / European journal of geography, 2004, 295, 15 p
Article dans une revue hal-00144134v2
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Modélisation de données métabolomiques longitudinales par voies métaboliques

Camille Guilmineau , Marie Tremblay-Franco , Nathalie Vialaneix , Rémi Servien
Journées de statistique de la SFdS, Société Française de Statistique, Jul 2023, Bruxelles (BE), Belgique
Communication dans un congrès hal-04154758v1
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Extension de la NMF supervisée pour l'intégration de données omiques

Aurélie Mercadié , Eleonore Gravier , Gwendal Josse , Nathalie Vialaneix , Celine Brouard
Journée de Statistique de la SFdS, Société Française de Statistique, Jul 2023, Bruxelles, Belgium
Communication dans un congrès hal-04154752v1

Multi-omics data integration methods: kernel and other machine learning approaches

Nathalie Vialaneix
Machine Learning for Life Sciences, Key Initiative MUSE, Université de Montpellier, Nov 2022, Montpellier, France
Communication dans un congrès hal-03856931v1
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Sélection d'intervalles pour des prédicteurs fonctionnels à partir de forêts aléatoires

Rémi Servien , Nathalie Vialaneix
Journées de Statistique de la SFdS, Jun 2022, Lyon, France
Communication dans un congrès hal-03697845v1

ASTERICS: A Tool for the ExploRation and Integration of omiCS data

Élise Maigné , Céline Noirot , Jérôme Mariette , Yaa Adu Kesewaah , Sébastien Déjean
Les Journées Ouvertes en Biologie, Informatique et Mathématiques (JOBIM), Inria; INRAE, Jul 2022, Rennes, France
Communication dans un congrès hal-03697843v1
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CRAN Task Views para Guiar a usuaries de paquetes de R

Rocío Joo , Nathalie Vialaneix , Roger Bivand , Dirk Eddelbuettel , David Meyer
LatinR, Oct 2022, online, Francia
Communication dans un congrès hal-03809780v1

Plasmatic and ruminal metabolomes of lambs divergently selected on residual feed intake

Florian Touitou , Flavie Tortereau , Nathalie Marty-Gasset , Nathalie Vialaneix , Gaëlle Lefort
EAAP – European Federation of Animal Science 2021, Aug 2021, Davos, Switzerland
Communication dans un congrès hal-03547250v1
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Analyse différentielle de données Hi-C via la Classification Ascendante Hiérarchique sous Contrainte de Contiguïté

Nathanaël Randriamihamison , Marie Chavent , Sylvain Foissac , Nathalie Vialaneix , Pierre Neuvial
52èmes Journées de Statistiques de la SFdS, Société Française de Statistique, May 2020, Nice, France. pp.655-660
Communication dans un congrès hal-02892664v1
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ASICS: identification and quantification of metabolites in complex 1H NMR spectra

Gaëlle Lefort , Laurence Liaubet , Cécile Canlet , Nathalie Villa , Rémi Servien
European RFMF Metabomeeting 2020, Jan 2020, Toulouse, France
Communication dans un congrès hal-02737383v1
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ASICS : identifier et quantifier des métabolites à partir d'un spectre RMN 1H

Gaëlle Lefort , Laurence Liaubet , Cécile Canlet , Nathalie Vialaneix , Rémi Servien
51. Journées de Statistique de la SFdS, Société Française de Statistique (SFdS). FRA., Jun 2019, Nancy, France
Communication dans un congrès hal-02737497v1

Chromatin accessibility conservation across four livestock species

Sarah Djebali Quelen , Sylvain Foissac , Nathalie Vialaneix , Kylie Munyard , Andrea Rau
Conference of the International Society for Animal Genetics (ISAG 2019), Jul 2019, Llieda, Spain
Communication dans un congrès hal-02788732v1
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Classification ascendante hiérarchique, contrainte d'ordre : conditions d'applicabilité, interprétabilité des dendrogrammes

Nathanaël Randriamihamison , Pierre Neuvial , Nathalie Vialaneix
51èmes Journées de Statistique de la SFdS, Jun 2019, Nancy, France
Communication dans un congrès hal-02734011v1

Organisation nucléaire et expression génique lors du développement chez le porc

Yvette Lahbib Mansais , Maria Marti-Marimon , Nathalie Vialaneix , Sylvain Foissac , Martine Bouissou-Matet
5. Journée d'Animation Scientifique du réseau épiPhase, Jun 2019, Toulouse, France. 35 p
Communication dans un congrès hal-02736301v1
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Unsupervised variable selection for kernel methods in systems biology

Jérôme J. Mariette , Celine Brouard , Remi Flamary , Nathalie Vialaneix
Journée Régionale de Bioinformatique et Biostatistique, Génopole Toulouse, Oct 2019, Toulouse, France
Communication dans un congrès hal-02787253v1

Functional annotation of livestock genomes: chromatin structure and regulation of gene expression

Sylvain Foissac , Sarah Djebali , Kylie Munyard , Nathalie Vialaneix , Andrea Rau
ASAS/ASDS Midwest Joint Meeting, Mar 2019, Omaha, United States. ⟨10.1093/jas/skz122.028⟩
Communication dans un congrès hal-02735898v1

Multi-level conservation of chromosome conformation across livestock species reveals evolutionary links between genome structure and function

Sylvain Foissac , Sarah Djebali Quelen , Nathalie Vialaneix , Matthias Zytnicki , Andrea Rau
Conference of the International Society for Animal Genetics (ISAG 2019), Jul 2019, Lleida, Spain
Communication dans un congrès hal-02788476v1
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Learning from (dis)similarity data

Nathalie Vialaneix
European R Users Meeting (eRum 2018), May 2019, Budapest, Hungary. 70 p
Communication dans un congrès hal-02785273v1

An innovative method of gene co expression network inference reveals significant biological processes involved in fetal porcine muscle development

Maria Marti-Marimon , Nathalie Villa-Vialaneix , Valentin Voillet , Martine Yerle-Bouissou , Laurence Liaubet
23rd International Colloquium on Animal Cytogenetics and Genomics, Jun 2018, Saint Petersburg, Russia. pp.2
Communication dans un congrès hal-02734342v1
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RNAseqNet : un package pour l'inférence de réseaux à partir de données RNA-seq

Alyssa Imbert , Nathalie Villa-Vialaneix
7ème Rencontres R, Jul 2018, Rennes, France
Communication dans un congrès hal-02791466v1
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Random forests for big data

Robin Genuer , Jean-Michel Poggi , Christine Tuleau-Malot , Nathalie Villa-Vialaneix
Data Science, Statistics & Visualization (DSSV) 2018, Jul 2018, Vienne, Austria
Communication dans un congrès hal-02787208v1
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ASICS : un package R pour l'identification et la quantification de métabolites dans un spectre RMN 1H

Gaëlle Lefort , Laurence Liaubet , Cécile Canlet , Nathalie Villa-Vialaneix , Rémi Servien
7ème Rencontres R, Jul 2018, Rennes, France
Communication dans un congrès hal-02791362v1
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Multiple hot-deck imputation for network inference from RNA sequencing data

Alyssa Imbert , Armand Valsesia , Claudia Armenise , Gregory Lefebvre , Pierre-Antoine Gourraud
European Conference on Computational Biology (ECCB 2018), Sep 2018, Athènes, Greece
Communication dans un congrès hal-02788524v1
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Using ASICS to quantify metabolites in 1D 1H NMR spectra: an application to perinatal survival in pigs

Gaëlle Lefort , Laurence Liaubet , Patrick Tardivel , Cécile Canlet , Marie Tremblay-Franco
Journée des Plateformes BioInfo et BioStat du Génotoul, Jan 2018, Toulouse, France
Communication dans un congrès hal-02788399v1

Adjacency-constrained hierarchical clustering of a band similarity matrix with application to genomics

Christophe Ambroise , Alia Dehman , Michel Koskas , Pierre Neuvial , Guillem Rigaill
Journée Régionale de Bioinformatique et Biostatistique, Génopole Toulouse, Dec 2018, Toulouse, France
Communication dans un congrès hal-02788245v1
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Stochastic Self-Organizing Map variants with the R package SOMbrero

Nathalie Villa-Vialaneix
12th International Workshop on Self-Organizing Maps and Learning Vector Quantization, Clustering and Data Visualization (WSOM), Jun 2017, Nancy, France. 7 p., ⟨10.1109/WSOM.2017.8020014⟩
Communication dans un congrès hal-01605663v1
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Accelerating stochastic kernel SOM

Jérôme J. Mariette , Fabrice Rossi , Madalina Olteanu , Nathalie Villa-Vialaneix
XXVth European Symposium on Artificial Neural Networks, Computational Intelligence and Machine Learning, Apr 2017, Bruges, Belgium. 6 p
Communication dans un congrès hal-02734663v1

Progesterone and betahydroxybutyrate in line measurements for a better description and understanding of Holstein cows fertility in field conditions

Claire Saby , Wenting Zhang , René Fournier , Rémi Servien , Nathalie Villa-Vialaneix
8th European Conference on Precision Livestock Farming (EC-PLF), Sep 2017, Nantes, France. 7 p
Communication dans un congrès hal-01607267v1

Random forests for big data

Robin Genuer , Jean-Michel Poggi , Christine Tuleau-Malot , Nathalie Villa-Vialaneix
10th International Conference of the ERCIM WG on Computational and Methodological Statistics, Dec 2017, Londres, United Kingdom
Communication dans un congrès hal-02785199v1
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Characterization of 3D genomic interactions in fetal pig muscle

Maria Eugenia Marti Marimon , Hervé Acloque , Matthias Zytnicki , David Robelin , Sarah Djebali Quelen
36. International Society for Animal Genetics Conference (ISAG), Jul 2017, Dublin, Ireland. pp.43
Communication dans un congrès hal-02868765v1
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Unsupervised multiple kernel learning to integrate various metagenomic sources

Jérôme J. Mariette , Nathalie Villa-Vialaneix
4ème colloque de Génomique Environnementale, Sep 2017, Marseille, France
Communication dans un congrès hal-01604708v1
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Accelerating stochastic kernel SOM

Jérôme J. Mariette , Fabrice Rossi , Madalina Olteanu , Nathalie Vialaneix
XXVth European Symposium on Artificial Neural Networks, Computational Intelligence and Machine Learning, Apr 2017, Bruges, Belgium. pp.269-274
Communication dans un congrès hal-01516660v1

Interval sparsity for functional inverse regression

Rémi Servien , Victor Picheny , Nathalie N. Villa-Vialaneix
2016 CRoNoS Summer Course, 22nd International Conference on Computational Statistics (COMPSTAT), Aug 2016, Oviedo, Spain
Communication dans un congrès hal-02799603v1
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Outils pour l'analyse et la simulation de données RNA-seq

Alyssa Imbert , Nathalie N. Villa-Vialaneix
Cinquièmes Rencontres R 2016, Jun 2016, Toulouse, France. 2 p
Communication dans un congrès hal-02739876v1

Random forests for big data

Nathalie N. Villa-Vialaneix , Robin Genuer , Jean-Michel Poggi , Christine Tuleau-Malot
Journées de Statistique de Rennes (JSTAR), Oct 2016, Rennes, France
Communication dans un congrès hal-02796431v1

3D nuclear positioning of IGF2 alleles and trans interactions with imprinted genes

Yvette Lahbib Mansais , Maria Marti-Marimon , Valentin Voillet , Harmonie Barasc , Florence Mompart
35. Conference of the International Society for Animal Genetics (ISAG), Jul 2016, Salt Lake City, United States
Communication dans un congrès hal-02742818v1
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Aggregating Self-Organizing Maps with Topology Preservation

Jérôme J. Mariette , Nathalie Vialaneix
WSOM 2016, Jan 2016, Houston, TX, United States. pp.27-37, ⟨10.1007/978-3-319-28518-4_2⟩
Communication dans un congrès hal-01270640v1
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Theoretical and applied aspects of the self-organizing maps

Marie Cottrell , Madalina Olteanu , Fabrice Rossi , Nathalie Vialaneix
WSOM 2016, Jan 2016, Houston, TX, United States. pp.3-26, ⟨10.1007/978-3-319-28518-4_1⟩
Communication dans un congrès hal-01270701v1
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Parcimonie par intervalle pour la régression inverse par tranche fonctionnelle

Victor Picheny , Rémi Servien , Nathalie Vialaneix
48e Journées de Statistique de la SFdS, May 2016, Montpellier, France. pp.6
Communication dans un congrès hal-01325538v1

Using SOMbrero for clustering and visualizing complex data

Madalina Olteanu , Nathalie Vialaneix
CMStatistics, Dec 2016, Seville, Spain
Communication dans un congrès hal-01519707v1

Using SOMbrero for clustering and visualizing complex data

Madalina Olteanu , Nathalie Villa-Vialaneix
9th International Conference of the ERCIM WG on Computational and Methodological Statistics, Dec 2016, Séville, Spain
Communication dans un congrès hal-01604379v1
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Sparse online self-organizing maps for large relational data

Madalina Olteanu , Nathalie Vialaneix
WSOM 2016, Jan 2016, Houston, TX, United States. pp.27-37, ⟨10.1007/978-3-319-28518-4_6⟩
Communication dans un congrès hal-01270710v1

3D nuclear positioning of IGF2 alleles and trans interactions with imprinted genes in pig fetal cells

Yvette Lahbib Mansais , Maria Marti-Marimon , Valentin Voillet , Harmonie Barasc , Florence Mompart
22. International Colloquim on Animal Cytogenetics and Genomics (ICACG), Jul 2016, Toulouse, France. 116 p
Communication dans un congrès hal-02743243v1
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Integrating Tara oceans data sets using multiple kernels

Jérôme J. Mariette , Helene H. Chiapello , Nathalie N. Villa-Vialaneix
15th European Conference on Computational Biology (ECCB 2016), Workshop "Recent Computational Advances in Metagenomics (RCAM)", Sep 2016, The Hague, Netherlands. pp.3
Communication dans un congrès hal-02792439v1

Multiway-SIR for longitudinal multi-table data integration

Valérie Sautron , Marie Chavent , Nathalie Viguerie , Nathalie N. Villa-Vialaneix
22nd International Conference on Computational Statistics (COMPSTAT), Aug 2016, Oviedo, Spain. pp.1
Communication dans un congrès hal-02796270v1
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Interpretable sparse sliced inverse regression for functional data

Victor Picheny , Rémi Servien , Nathalie N. Villa-Vialaneix
Workshop Learning with Functional Data, Oct 2016, Lille, France
Communication dans un congrès hal-02799481v1
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Imputation de données manquantes pour l'inférence de r éseau à partir de données RNA-seq

Alyssa Imbert , Caroline Le Gall , Claudia Armenise , Gregory Lefebvre , Jorg Hager
48e Journées de la Société Française de Statistique, May 2016, Montpellier, France
Communication dans un congrès hal-01325523v1
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Outils pour chercher de l'information sur R et se former

Nathalie N. Villa-Vialaneix , Christophe Bontemps , Sébastien Dejean
Cinquièmes Rencontres R 2016, Jun 2016, Toulouse, France
Communication dans un congrès hal-02743654v1
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Outils pour chercher de l'information sur R et se former

Nathalie Vialaneix , Christophe Bontemps , Sébastien Dejean
Rencontres R 2016, Jun 2016, Toulouse, France
Communication dans un congrès hal-01352178v1

What is a MOOC?

Nathalie N. Villa-Vialaneix
15th Annual Conference of ENBIS, Sep 2015, Prague, Czech Republic
Communication dans un congrès hal-02792063v1
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Random forests and big data

Robin Genuer , Jean-Michel Poggi , Christine Tuleau-Malot , Nathalie Villa-Vialaneix
47ème Journées de Statistique de la SFdS, Société Française de Statistique, Jun 2015, Lille, France
Communication dans un congrès hal-01160643v1
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Enseigner la statistique pour l'analyse de mégadonnées

Philippe Besse , Nathalie Villa-Vialaneix , Anne Ruiz-Gazen
47èmes Journées de Statistique de la SFdS, Jun 2015, Lille, France
Communication dans un congrès hal-01160638v1
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Enseigner la statistique pour l'analyse de mégadonnées

Philippe Besse , Nathalie N. Villa-Vialaneix , Anne Ruiz-Gazen
47ème Journées de Statistique de la SFdS, Société Française de Statistique (SFdS). FRA., Jun 2015, Lille, France
Communication dans un congrès hal-02742204v1
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Multiple dissimilarity SOM for clustering and visualizing graphs with node and edge attributes

Nathalie Vialaneix , Madalina Olteanu
International Conference on Machine Learning, Workshop FEAST, Jul 2015, Lille, France. 1p
Communication dans un congrès hal-01175731v1
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Classification et visualisation de graphes avec SOMbrero

Madalina Olteanu , Nathalie N. Villa-Vialaneix
Quatrièmes Rencontres R, Jun 2015, Grenoble, France. pp.2
Communication dans un congrès hal-02795287v1
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Classification et visualisation de graphes avec SOMbrero

Madalina Olteanu , Nathalie Villa-Vialaneix
Quatrièmes Rencontres R, Jun 2015, Grenoble, France
Communication dans un congrès hal-01171557v1
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Reconstruction quality of a biological network when its constituting elements are partially observed

Victor Picheny , Jimmy Vandel , Matthieu Vignes , Nathalie Villa-Vialaneix
Seventeenth International Conference on Artificial Intelligence and Statistics (AI & Statistics 2014), Apr 2014, Reykjavik, Iceland. pp.L014
Communication dans un congrès hal-00982758v1

SOMbrero: an R package for numeric and non-numeric self-organizing maps

Julien Boelaert , Laura Bendhaiba , Madalina Olteanu , Nathalie N. Villa-Vialaneix
WSOM 2014, Jul 2014, Mittweida, Germany. ⟨10.1007/978-3-319-07695-9_21⟩
Communication dans un congrès hal-02743631v1

Inferring networks from multiple samples with consensus LASSO

Nathalie Vialaneix , Matthieu Vignes , Nathalie Viguerie , Magali San Cristobal
ENBIS Spring Meeting, Apr 2014, Paris, France
Communication dans un congrès hal-02793667v1
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Data analysis of social simulations outputs: Interpreting the dispersion of variables

Christophe Sibertin-Blanc , Nathalie Vialaneix
15th International Workshop on Multi-Agent-Based Simulation (MBAS 2014 @ AAMAS), May 2014, Paris, France. pp.133-150, ⟨10.1007/978-3-319-14627-0_10⟩
Communication dans un congrès hal-01270802v1
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Genetics systems of stress responses in pigs

Valérie Sautron , Elena Mormede Terenina , Pierre Mormède , Nathalie N. Villa-Vialaneix
Bioinformatics/Biostatistics regional workshop, Jun 2014, Toulouse, France
Communication dans un congrès hal-02793146v1
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SOMbrero: an R package for numeric and non-numeric Self-Organizing Maps

Julien Boelaert , Laura Bendhaiba , Madalina Olteanu , Nathalie Vialaneix
10th International Workshop, WSOM 2014, Jul 2014, Mittweida, Germany. pp.219-228
Communication dans un congrès hal-01018732v1
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Blood transcriptome response to LPS in pigs

Elodie Merlot , Armelle Prunier , Marie Damon , Florence Vignoles , Nathalie Villa-Vialaneix
65. Annual Meeting of the European Federation of Animal Science (EAAP), Aug 2014, Copenhague, Denmark. pp.274
Communication dans un congrès hal-01210717v1
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Self-organizing maps for clustering and visualization of bipartite graphs

Madalina Olteanu , Nathalie N. Villa-Vialaneix
46e Journées de la Société Française de Statistique, Jun 2014, Rennes, France. pp.109
Communication dans un congrès hal-02739820v1

Adipose tissue signatures related to weight changes in response to calorie restriction and subsequent weight maintenance using lipidome and gene profiling network analysis

Emilie Montastier , Nathalie N. Villa-Vialaneix , Ignacio González , Sylvie Caspar-Bauguil , Wim H.M. Saris
Bioinformatics/Biostatistics regional workshop, Jun 2014, Toulouse, France. 2 p
Communication dans un congrès hal-02797111v1
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J'ai testé pour vous... un MOOC

Nathalie Vialaneix
Journées de Statistique de la SFdS, Jun 2014, Rennes, France. pp.90
Communication dans un congrès hal-01001759v1
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Bagged kernel SOM

Jérôme J. Mariette , Madalina Olteanu , Julien Boelaert , Nathalie Vialaneix
10th International Workshop, WSOM 2014, Hochschule Esslingen University of Applied Sciences. DEU., Jul 2014, Mittweida, Germany. pp.45-54, ⟨10.1007/978-3-319-07695-9⟩
Communication dans un congrès hal-01018374v1
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Self-Organizing Maps for clustering and visualization of bipartite graphs

Madalina Olteanu , Nathalie Vialaneix
46e Journées de Statistique de la SFdS, Jun 2014, Rennes, France. pp.109
Communication dans un congrès hal-01001991v1
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Data Analysis of Social Simulations Outputs - Focus on variables dispersion

Christophe Sibertin-Blanc , Nathalie Vialaneix
Workshop on Multi-Agent-Based Simulation, May 2014, Paris, France. Paper session 3, paper 2
Communication dans un congrès hal-00990219v1
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J'ai testé pour vous... un MOOC

Nathalie N. Villa-Vialaneix
46e Journées de la Société Française de Statistique, Société Française de Statistique (SFdS). FRA., Jun 2014, Rennes, France
Communication dans un congrès hal-02740506v1
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Consensus LASSO : inférence conjointe de réseaux de gènes dans des conditions expérimentales multiples

Nathalie Villa-Vialaneix , Magali San Cristobal
45èmes Journées de Statistique de la SFdS, May 2013, Toulouse, France
Communication dans un congrès hal-00829157v1
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Multiple kernel self-organizing maps

Madalina Olteanu , Nathalie Villa-Vialaneix , Christine Cierco-Ayrolles
European Symposium on Artificial Neural Networks, Computational Intelligence and Machine Learning, Apr 2013, Bruges, Belgium. pp.83
Communication dans un congrès hal-00817920v1
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Which dissimilarity is to be used when extracting typologies in sequence analysis? A comparative study

Sébastien Massoni , Madalina Olteanu , Nathalie N. Villa-Vialaneix
International Workshop on Artificial Neural Networks, Jun 2013, Puerto de la Cruz, Tenerife, Spain
Communication dans un congrès hal-02806089v1
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Multiple kernel self-organizing maps

Madalina Olteanu , Nathalie N. Villa-Vialaneix , Christine Cierco-Ayrolles
21. European Symposium on Artificial Neural Networks, Computational Intelligence and Machine Learning (ESANN 2013), Apr 2013, Bruges, Belgium
Communication dans un congrès hal-02747111v1

Carte auto-organisatrice pour graphes étiquetés

Nathalie N. Villa-Vialaneix , Madalina Olteanu , Christine Cierco-Ayrolles
Atelier Fouilles de Grands Graphes - EGC, Jan 2013, Toulouse, France
Communication dans un congrès hal-02807496v1
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sexy-rgtk: a package for programming RGtk2 GUI in a user-friendly manner

Damien Leroux , Nathalie Villa-Vialaneix
2èmes Rencontres R, Jun 2013, Lyon, France. pp.103-104
Communication dans un congrès hal-00850516v1
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SOMbrero : Cartes auto-organisatrices stochastiques pour l'intégration de données décrites par des tableaux de dissimilarités

Laura Bendhaiba , Madalina Olteanu , Nathalie Villa-Vialaneix
2èmes Rencontres R, Jun 2013, Lyon, France. pp.99-100
Communication dans un congrès hal-00850514v1
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Carte auto-organisatrice pour graphes étiquetés.

Nathalie Villa-Vialaneix , Madalina Olteanu , Christine Cierco-Ayrolles
Atelier Fouilles de Grands Graphes (FGG) - EGC'2013, Jan 2013, Toulouse, France. pp.Article numéro 4
Communication dans un congrès hal-00783860v1
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Which dissimilarity is to be used when extracting typologies in sequence analysis? A comparative study

Sébastien Massoni , Madalina Olteanu , Nathalie Villa-Vialaneix
IWANN 2013, Jun 2013, Puerto de la Cruz, Tenerife, Spain. session 12-1A, paper 2
Communication dans un congrès hal-00854302v1
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Classification non supervisée d'un graphe de co-expression avec des méta-données pour la détection de micro-ARNs

Florian Brunet , Jérôme J. Mariette , Christine Cierco-Ayrolles , Christine Gaspin , Philippe Bardou
MARAMI (Modèles et l'Analyse des Réseaux : Approches Mathématiques et Informatiques) 2013, Oct 2013, Saint-Étienne, France. pp.SI-1
Communication dans un congrès hal-00877561v1
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On-line relational SOM for dissimilarity data

Madalina Olteanu , Nathalie Villa-Vialaneix , Marie Cottrell
WSOM 2012, Dec 2012, Santiago, Chile. pp.13-22
Communication dans un congrès hal-00768948v1
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Genetic and phenotypic fine characterizations of French porcine reference populations

Magali San Cristobal , Simon Boitard , Maria Inès Fariello Rico , Hélène Gilbert , Laurence Liaubet
ISAG, Jul 2012, Cairns, Australia. pp.1
Communication dans un congrès hal-01019125v1
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Comparison of network inference packages and methods for multiple network inference

Nathalie Villa-Vialaneix , Nicolas A. Edwards , Laurence Liaubet , Nathalie Viguerie , Magali San Cristobal
1ères Rencontres R, Jul 2012, Bordeaux, France
Communication dans un congrès hal-00717549v1
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Comparison of network inference packages and methods for multiple network inference

Nathalie Villa-Vialaneix , Nicolas A. Edwards , Laurence Liaubet , Nathalie Viguerie , Magali San Cristobal
1ères Rencontres R, Jul 2012, Bordeaux, France. pp.93-94
Communication dans un congrès hal-00714444v1

Exploration relationnelle d'un corpus d'actes notariés médiévaux

Nathalie Villa-Vialaneix , Fabrice Rossi , Florent Hautefeuille
Colloque Configuration(s), Jun 2012, Paris, France
Communication dans un congrès hal-00721403v1
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Analyse de données pour des graphes étiquetés

Thibault Laurent , Nathalie Villa-Vialaneix
44èmes Journées de Statistique, May 2012, Bruxelles, Belgique. pp.196
Communication dans un congrès hal-00707779v1
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Diversité et biologie intégrative : des pistes à explorer pour combler le gap entre diversité génétique et diversité phénotypique

Magali San Cristobal , Simon S. Boitard , Marcel M. Bouffaud , Cécile Canlet , Leonor L. Chaltiel
COLLOQUE FRB : Les Ressources Génétiques (RG) face aux nouveaux enjeux environnementaux, économiques et sociétaux, Sep 2011, Montpellier, France
Communication dans un congrès hal-01000087v1

Exploration of a Large Database of French Charters with Social Network Methods

Fabrice Rossi , Nathalie Villa-Vialaneix , Florent Hautefeuille
International Medieval Congress (IMC 2011), Jul 2011, Leeds, United Kingdom
Communication dans un congrès hal-00668229v1
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L'analyse d'un réseau de co-expression génique met en valeur des groupes fonctionnels homogènes et des gènes importants relatifs a un phénotype d'intérêt

Nathalie Villa-Vialaneix , Laurence Liaubet , Thibault Laurent , Adrien Gamot , Pierre Cherel
Journées de la Société Française de Statistique, May 2011, Tunis, Tunisie. pp.172
Communication dans un congrès hal-00666613v1
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Sensitivity of the process-based model DNDC on microbiological parameters

Adrian Leip , Marco Follador , Stefano Tarantola , Mirko Busto , Nathalie Villa-Vialaneix
Nitrogen and Global Change - Key findings & Future challenges, Apr 2011, Edinburgh, United Kingdom. pp.S10
Communication dans un congrès hal-00674167v1
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Phenotypic prediction based on metabolomic data : lasso vs Bolasso, primary data vs wavelet transformation

Florian Rohart , Nathalie Villa-Vialaneix , Alain Paris , Cécile Canlet , J. Molina
World Congress on Genetics Applied to Livestock Production, Aug 2010, Leipzig, Germany. pp.3-55
Communication dans un congrès hal-00658819v1
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The structure of a gene network reveals 7 biological sub-graphs underlying eQTLs in pig

Laurence Liaubet , Nathalie Villa-Vialaneix , Adrien Gamot , Fabrice Rossi , Pierre Cherel
World Congress on Genetics Applied to Livestock Production, Aug 2010, Leipzig, Germany. pp.0147
Communication dans un congrès hal-00666597v1
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Classification and regression based on derivatives : a consistency result

Nathalie Villa-Vialaneix , Fabrice Rossi
II Simposio sobre Modelamiento Estadístico, Dec 2010, Valparaiso, Chile
Communication dans un congrès hal-00668212v1
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A comparison of three learning methods to predict N2O fluxes and N leaching

Nathalie Villa-Vialaneix , Marco Follador , Adrian Leip
Modèles et Apprentissage en Sciences Humaines et Sociales, Jun 2010, Lille, France. pp.57-66
Communication dans un congrès hal-00491583v1
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A functional density-based nonparametric approach for statistical calibration

Noslen Hernandez , Rolando Biscay , Nathalie Villa-Vialaneix , Isneri Talavera
15th Iberoamerican Congress on Pattern Recognition (CIARP 2010), Nov 2010, Sao Paulo, Brazil. pp.450-457, ⟨10.1007/978-3-642-16687-7_60⟩
Communication dans un congrès hal-00658811v1
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Analysis of the influence of a network on the values of its nodes : the use of spatial indexes.

Thibault Laurent , Nathalie Villa-Vialaneix
Modèles et l′Analyse des Réseaux : Approches Mathématiques et Informatique, Oct 2010, Toulouse, France. pp.Session 1 - 1
Communication dans un congrès hal-00668202v1

Are gene networks always meaningful?

Adrien Gamot , Nathalie Villa , Laurence Liaubet , Fabrice Rossi , Gwenola Tosser-Klopp
European Animal Disease Genomics Network of Excellence for Animal Health and Food Safety (EADGENE Days 2009), Oct 2009, Paris, France
Communication dans un congrès hal-00668239v1
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Méthode de classification organisée pour la recherche de communautés dans les réseaux sociaux

Nathalie Villa , Fabrice Rossi
41èmes Journées de Statistique, SFdS, Bordeaux, 2009, Bordeaux, France, France
Communication dans un congrès inria-00386797v1

Are gene networks always meaningful ?

Adrien Gamot , Nathalie Villa , Laurence Liaubet , F. Rossi , Gwenola Tosser-Klopp
EADGENE Genomics for Animal Health: Outlook for the Future, Oct 2009, Paris, France
Communication dans un congrès hal-02816128v1
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Recherche et représentation de communautés dans des grands graphes

Nathalie Villa , Taoufiq Dkaki , Sébastien Gadat , Jean-Michel Inglebert , Quoc-Dinh Truong
Veille Stratégique Scientifique & Technologique, Mar 2009, Nancy, France. Recherche et représentation de communautés dans des grands graphes
Communication dans un congrès hal-00371956v1
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Topologically Ordered Graph Clustering via Deterministic Annealing

Fabrice Rossi , Nathalie Villa-Vialaneix
European Symposium on Artificial Neural Networks, Apr 2009, Bruges, Belgium. pp.529-534
Communication dans un congrès hal-00666602v1
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Consistency of Derivative Based Functional Classifiers on Sampled Data

Fabrice Rossi , Nathalie Villa-Vialaneix
ESANN 2008, 16th European Symposium on Artificial Neural Networks, Apr 2008, Bruges, Belgium. pp.445-450
Communication dans un congrès hal-00666609v1
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Mining a medieval social network by kernel SOM and related methods

Nathalie Villa , Fabrice Rossi , Quoc-Dinh Truong
MASHS 2008 (Modèles et Apprentissages en Sciences Humaines et Sociales), Jun 2008, Créteil, France
Communication dans un congrès hal-00278196v1
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A comparison between dissimilarity SOM and kernel SOM for clustering the vertices of a graph

Nathalie Villa-Vialaneix , Fabrice Rossi
WSOM'07 - Workshop on Self-Organizing Maps, Sep 2007, Bielefeld, Germany. pp.WeP-1
Communication dans un congrès hal-00674189v1
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Sur l'analyse de réseaux de sociabilité de la société paysanne médiévale

Romain Boulet , Florent Hautefeuille , Bertrand Jouve , Pascale Kuntz , Bleuenn Le Goffic
Computational Methods for Modelling and learning in Social and Human Sciences (MASHS), May 2007, Brest, France. pp.3b-3
Communication dans un congrès hal-00674238v1
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Clustering a medieval social network by SOM using a kernel based distance measure

Nathalie Villa , Romain Boulet
European Symposium on Artificial Neural Networks, Apr 2007, Bruges, Belgium. pp.31-36
Communication dans un congrès hal-00145117v1
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Integrating Remote Sensing, GIS and Prediction Models to Monitor the Deforestation and Erosion in Peten Reserve, Guatemala

Roberto Bruno , Marco Follador , Martin Paegelow , Fernanda Renno , Nathalie Villa
IAMG'2006 Annual Conference on Quantitative Geology from Multiple Sources, Sep 2006, Liège, Belgium. pp.Integrating Remote Sensing, GIS and Prediction Models to Monitor the Deforestation and Erosion in Pe
Communication dans un congrès hal-00372648v1
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SVM fonctionnels par interpolation spline

Nathalie Villa , Fabrice Rossi
Journée de Statistique de la SFdS, Société Française de Statistique, May 2006, Clamart (FR), France
Communication dans un congrès hal-04176653v1
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Classification in Hilbert Spaces with Support Vector Machines

Fabrice Rossi , Nathalie Villa
XIth International Symposium on Applied Stochastic Models and Data Analysis (ASMDA 2005), May 2005, Brest, France. pp.635-642
Communication dans un congrès hal-04176760v1
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Support Vector Machine For Functional Data Classification

Nathalie Villa , Fabrice Rossi
XIIIth European Symposium on Artificial Neural Networks, Computational Intelligence and Machine Learning (ESANN 2005), Apr 2005, Bruges, Belgium. pp.467-472
Communication dans un congrès hal-04176766v1
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Transcriptome of the feto-maternal interface in pigs in late gestation: part1fetal placenta

Agnès Bonnet , Sarah Maman , Laure Gress , Amandine Suin , Céline Bravo
Joint International Congress on Animal Science (EEAP 2023), Aug 2023, Lyon, France. pp.37.20
Poster de conférence hal-04193423v1
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Characterization of the endometrial metabolome in late gestation

Alyssa Imbert , Nathalie Marty-Gasset , Laure Gress , Cecile Bonnefont , Nathalie Vialaneix
International Conference on Pig Reproduction 2023, Jun 2023, Gent, Belgium
Poster de conférence hal-04126140v1

Neonatal metabolic profiling shows relationships between metabolites and biometric phenotypes related to piglet maturity at birth

Laurence Liaubet , Gaëlle Lefort , Yvon Billon , Sébastien Reigner , Jean Bailly
11th International Conference on Pig Reproduction (ICPR), Jun 2023, Ghent, Belgium. 90 (7), p. 732, n°49, 2023
Poster de conférence hal-04121651v1

1H-NMR metabolomic study of Large White and Meishan pigs in late gestation: part 2 - sow endometrium

Alyssa Imbert , Nassim Duprat , Nathalie Marty-Gasset , Laure Gress , Cécile Canlet
Joint International Congress on Animal Science (EEAP 2023), Aug 2023, Lyon, France. pp.37.22
Poster de conférence hal-04193451v1
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Transcriptome of the feto-maternal interface in pigs in late gestation: part2 - sow endometrium

Agnès Bonnet , Sarah Maman , Laure Gress , Amandine Suin , Sabrina Legoueix
Joint International Congress on Animal Science (EEAP 2023), Aug 2023, Lyon, France. pp.37.21
Poster de conférence hal-04193444v1
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ASTERICS: A Tool for the ExploRation and Integration of omiCS data

Élise Maigné , Céline Noirot , Jérôme J. Mariette , Yaa Adu Kesewaah , Sébastien Dejean
Journée Régional Bioinfo/Biostat, Dec 2022, Toulouse, France
Poster de conférence hal-03882998v1
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ASTERICS: A Tool for the ExploRation and Integration of omiCS data

Élise Maigné , Céline Noirot , Jérôme J. Mariette , Yaa Adu Kesewaah , Sébastien Dejean
ECCB: 21st European Conference on Computational Biology, Sep 2022, Sitges, Spain. , 2022, ⟨10.7490/f1000research.1119290.1⟩
Poster de conférence hal-03890660v1

Leçons apprises de l' évaluation des méthodes d'inférence de réseau de gènes chez Bacillus subtilis

Léa Grima , Celine Brouard , Simon De Givry , Anne Goelzer , Élise Maigné
Journée Régionale Bioinfo/Biostat, Dec 2022, Toulouse, France.
Poster de conférence hal-03882985v1
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Identification par une approche de métabolomique des voies métaboliques associées à la fragilité dans une cohorte de personnes âgées

Céline Bougel , Rémi Servien , Nathalie Vialaneix , Cécile Canlet , Laurent Debrauwer
Journées Francophones de la Nutrition, Nov 2022, Toulouse, France
Poster de conférence hal-03856941v1

Characterization of human isogenic epithelial cell lines as a relevant tool to study colon carcinogenesis and interaction between genes and environment

Arnaud Tête , Liana C. Arnaud , Hélène Le Mentec , Isabelle Gallais , Nathalie Poupin
Society of Toxicology Annual Meeting (SOT 2022), Mar 2022, San Diego, United States. , 3579, pp.P204
Poster de conférence hal-03637792v1
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Characterization of human isogenic epithelial cell lines as a relevant tool to study colon carcinogenesis and interaction between genes and environment

Arnaud Tête , Liana C. Arnaud , Hélène Le Mentec , Isabelle Gallais , Noémie Tournadre
Congrès Annuel de la Société Française de Biochimie et Biologie Moléculaire, Jul 2021, Paris, France
Poster de conférence hal-03279912v1
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Étude de la maturité des porcelets en fin de gestation par une approche métabolomique multifluide

Gaëlle Lefort , Nathalie Vialaneix , Hélène Quesnel , Marie-Christine Pere , Yvon Billon
52. Journées de la Recherche Porcine, Feb 2020, Paris, France. IFIP - Institut du Porc, Journées de la Recherche Porcine en France, pp.411-412, 2020, 52èmes journées de la recherche porcine
Poster de conférence hal-02479994v1
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Joint automatic metabolite identification and quantification of a set of 1H NMR spectra

Gaëlle Lefort , Laurence Liaubet , Nathalie Marty-Gasset , Cécile Canlet , Nathalie Vialaneix
Metabolomics 2020, Oct 2020, online, France
Poster de conférence hal-02984360v1
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Adjacency-constrained hierarchical clustering of a band similarity matrix with application to genomics

Christophe Ambroise , Alia Dehman , Pierre Neuvial , Guillem Rigaill , Nathalie Vialaneix
Statistical Methods for Post Genomic Data (SMPGD 2019), Jan 2019, Barcelona, Spain. 2019
Poster de conférence hal-02790995v1

Study of fetal pig maturity in relation with neonatal survival using a multi-fluids metabolomic approach

Gaëlle Lefort , Nathalie Vialaneix , Hélène Quesnel , Marie-Christine Pere , Nathalie Iannuccelli
15. Annual Conference of the Metabolomics Society (Metabolomics 2019), Jun 2019, La Haye, Netherlands. , 2019
Poster de conférence hal-02791588v1
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Classification ascendante hiérarchique, contrainte d'ordre : conditions d'applicabilité, interprétabilité des dendrogrammes

Nathanaël Randriamihamison , Pierre Neuvial , Nathalie Vialaneix
Conférence sur l'Apprentissage Automatique (CAp 2019), Jul 2019, Toulouse, France. , 2019
Poster de conférence hal-02786174v1

ASICS: identification and quantification of metabolites in complex 1D 1H NMR spectra

Gaëlle Lefort , Laurence Liaubet , Hélène Quesnel , Cécile Canlet , Nathalie Vialaneix
15th Annual Conference of the Metabolomics Society (Metabolomics 2019), Jun 2019, La Haye, Netherlands. , 2019
Poster de conférence hal-02790207v1
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ASICS : un package R pour l'identification et la quantification de m\'etabolites dans un spectre RMN 1H

Gaëlle Lefort , Laurence Liaubet , Cécile Canlet , Nathalie Vialaneix , Rémi Servien
Journée Régionale de Bioinformatique et Biostatistique, Génopole Toulouse, Oct 2019, Toulouse, France. 2019
Poster de conférence hal-02788670v1

ASICS: a new R package for identification and quantification of metabolites in complex 1H NMR spectra

Gaëlle Lefort , Laurence Liaubet , Cécile Canlet , Hélène Quesnel , Nathalie Vialaneix
useR! 2019, Jul 2019, Toulouse, France. , 2019
Poster de conférence hal-02788659v1

Integrative analyses of chromosome conformation, chromatin accessibility and gene expression in human and livestock genomes

Camille Mestre , Sarah Djebali Quelen , Thomas Faraut , Nathalie Vialaneix , Andrea Rau
European Conference on Computational Biology (ECCB 2018), Sep 2018, Athènes, Greece. , 2018
Poster de conférence hal-02784857v1

ASICS: a new R package for identification and quantification of metabolites in complex 1D 1H NMR spectra

Gaëlle Lefort , Laurence Liaubet , Cécile Canlet , Nathalie Vialaneix , Rémi Servien
European Conference on Computational Biology (ECCB 2018), Sep 2018, Athènes, Greece. , 2018
Poster de conférence hal-02789726v1

Developpement de biomarqueurs sanguins pour évaluer la sensibilité des porcs à la chaleur

Samir Dou , Nathalie Villa-Vialaneix , Laurence Liaubet , Hélène Gilbert , Jean-Luc Gourdine
Journées d'Animation Scientifique du département Phase (JAS Phase 2018), Apr 2018, Rennes, France. , 2018, Journées d’animation scientifiques du département Phase - Recueil des résumés
Poster de conférence hal-02736216v1

Reprise de cyclicité post partum et performances de reproduction chez la vache laitière Prim'Holstein en France

Claire Saby , Wenting Zhang , René Fournier , Rémi Servien , Nathalie Villa-Vialaneix
Journées Nationales des GTV 2017, May 2017, Reims, France. , 7 p., 2017, Recueil des Journées Nationales des GTV 2017
Poster de conférence hal-01607513v1
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Profiling the landscape of transcription, chromatin accessibility and chromosome conformation of cattle, pig, chicken and goat genomes [FAANG pilot project]

Sylvain Foissac , Sarah Djebali Quelen , Hervé Acloque , Philippe Bardou , Fany Blanc
36th International Society for Animal Genetics Conference, Jul 2017, Dublin, Ireland. 2017, ISAG 2017 - Genomes to Phenomes - Abstract Book
Poster de conférence hal-01608449v1

Integrative and differential analysis of transcriptomes and chromatin accessibility regions reveals regulatory mechanisms involved in pig immune and metabolic functions

Sarah Djebali Quelen , Kylie Munyard , Nathalie Villa-Vialaneix , Cédric Cabau , Andrea Rau
36th International Society for Animal Genetics Conference, Jul 2017, Dublin, Ireland. 2017, ISAG 2017 - Genomes to Phenomes - Abstract Book
Poster de conférence hal-01603033v1
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Characterization of 3D genomic interactions in fetal pig muscle

Maria Marti-Marimon , Hervé Acloque , Matthias Zytnicki , Sarah Djebali Quelen , Nathalie Villa-Vialaneix
36th International Society for Animal Genetics Conference, Jul 2017, Dublin, Ireland. 2017, ISAG 2017 - Genomes to Phenomes - Abstract Book
Poster de conférence hal-01608046v1

3D nuclear positioning of IGF2 alleles and trans interactions with imprinted genes in pig fetal cells

Yvette Lahbib Mansais , Maria Marti-Marimon , Valentin Voillet , Harmonie Barasc , Florence Mompart
Conference on Genome Architecture in Space and Time, Jun 2016, Trieste, Italy. 2016
Poster de conférence hal-02794242v1

Time course of the response to ACTH in pig: biological and transcriptomic study

Valérie Sautron , Elena Mormede Terenina , Laure Gress , Yannick Lippi , Yvon Billon
35. Conference of the International Society for Animal Genetics (ISAG), Jul 2016, Salt Lake City, United States. ASAS - American Society of Animal Science, 94 (S4), 2016, 35th Conference of the International Society for Animal Genetics (ISAG)
Poster de conférence hal-02740976v1

Estimating nitrous oxide fluxes from agricultural soils at European scale using a crop generic meta-model

Lily Paniagua , Adrian Leip , Nathalie N. Villa-Vialaneix , Wim de Vries
19th Nitrogen Workshop, Jun 2016, Skara, Sweden. , 2016
Poster de conférence hal-02796798v1
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Multiway SIR for biological data integration

Valérie Sautron , Marie Chavent , Nathalie Viguerie , Nathalie N. Villa-Vialaneix
Statistical Methods for Post Genomic Data, Feb 2016, Lille, France. , 2016
Poster de conférence hal-02791870v1
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Reconstruction quality of a biological network when its constituting elements are partially observed

Victor Picheny , Jimmy Vandel , Matthieu Vignes , Nathalie N. Villa-Vialaneix
17th International Conference on Artificial Intelligence and Statistics - AI & Statistics 2014, Apr 2014, Reykjavik, Iceland. , pp.1, 2014, AISTATS 2014 Talks and Papers
Poster de conférence hal-02739296v1
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Comprendre l'organisation spatiale de l'ADN à l'aide de la statistique

Pierre Neuvial , Sylvain Foissac , Nathalie Vialaneix
Martina Knoop, Stéphane Blanc, Mokrane Bouzeghoub. L’Interdisciplinarité, CNRS Editions, pp.178-182, 2023
Chapitre d'ouvrage hal-03930070v1
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Des noyaux pour les omiques

Jérôme J. Mariette , Nathalie Vialaneix
Intégration de Données Biologiques, 2022
Chapitre d'ouvrage hal-03809784v1
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Kernel and dissimilarity methods for exploratory analysis in a social context

Jérôme J. Mariette , Madalina Olteanu , Nathalie Vialaneix
Advances in Contemporary Statistics and Econometrics. Festschrift in Honor of Christine Thomas-Agnan, 2021
Chapitre d'ouvrage hal-03279887v1

Large-Scale Measurement of mRNA Degradation in Escherichia coli: To Delay or Not to Delay

Sandrine Laguerre , Ignacio González , Sébastien Nouaille , Annick Moisan , Nathalie Villa-Vialaneix
High-density sequencing applications in microbial molecular genetics, 612, ELSEVIER ACADEMIC PRESS INC, pp.47-66, 2018, Methods in Enzymology, 978-0-12-815993-4. ⟨10.1016/bs.mie.2018.07.003⟩
Chapitre d'ouvrage hal-02107623v1
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Apprentissage connexionniste

Nathalie Villa-Vialaneix , Stéphane Canu
Apprentissage Statistique et Données Massives, Editions Technip, pp.536, 2018, 9782710811824
Chapitre d'ouvrage hal-01849298v1
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Méthodes pour l’apprentissage de données massives

Nathalie Villa-Vialaneix , Fabrice Rossi
Apprentissage Statistique et Données Massives, Editions Technip, pp.536, 2018, 9782710811824
Chapitre d'ouvrage hal-01849297v1
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Depicting gene co-expression networks underlying eQTLs

Nathalie Vialaneix , Laurence Liaubet , Magali San Cristobal
Haja N. Kadarmideen. Systems Biology in Animal Production and Health vol 2, 2, Springer International Publishing, pp.1-31, 2016, 978-3-319-43330-1. ⟨10.1007/978-3-319-43332-5_1⟩
Chapitre d'ouvrage hal-01390589v1
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Prospective modelling of environmental dynamics. A methodological comparison applied to mountain land cover changes

Martin Paegelow , Maria T. Camacho Olmedo , Frédéric Ferraty , Louis Ferré , Pascal Sarda
Modelling Environmental Dynamics, Springer, pp.141-168, 2008, ⟨10.1007/978-3-540-68498-5_5⟩
Chapitre d'ouvrage hal-00667123v1
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Tropical deforestation modelling : a comparative analysis of different predictive approaches. The case study of Peten, Guatemala.

Marco Follador , Nathalie Villa , Martin Paegelow , Fernanda Renno , Roberto Bruno
Modelling Environmental Dynamics, Springer, pp.77-108, 2008, ⟨10.1007/978-3-540-68498-5_3⟩
Chapitre d'ouvrage hal-00667122v1

Recent advances in the use of SVM for functional data classification

Fabrice Rossi , Nathalie Villa
Sophie Dabo-Niang, Frédéric Ferraty. Functional and operatorial statistics, Physica-Verlag/Springer, pp.273-280, 2008, Contrib. Statist., ⟨10.1007/978-3-7908-2062-1_41⟩
Chapitre d'ouvrage hal-00635480v1
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Contributions à l'analyse de données non vectorielles

Nathalie Villa-Vialaneix
Statistiques [math.ST]. Université de Toulouse, 2014
HDR tel-01088152v1
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Contributions à l’analyse de données non vectorielles

Nathalie Villa-Vialaneix
Applications [stat.AP]. Université Toulouse 1 Capitole (UT1 Capitole), 2014
HDR tel-01523743v1