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Topological and semantic Web based method for analyzing TGF-β signaling pathways

 Jean Coquet , Geoffroy Andrieux , Jacques Nicolas , Olivier Dameron , Nathalie Théret
JOBIM 2015, Dec 2015, Clermont-Ferrand, France. JOBIM : Journées Ouvertes en Biologie, Informatique & Mathématiques, 2015
Poster de conférence hal-01242893v1
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Phylogenetic Functional Module Characterization of the ADAMTS / ADAMTS like Protein Family

 Olivier Dennler , Samuel Blanquart , François Coste , Catherine Belleannée , Nathalie Theret
WABI 2021 - Workshop on Algorithms in Bioinformatics, Aug 2021, Chicago (Online), United States
Poster de conférence hal-03543214v1
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Proteomic screening identifies the zonula occludens protein ZO-1 as a new partner for ADAM12 in invadopodia-like structures

 Bassil Dekky , Michaël Ruff , Dominique Bonnier , Vincent Legagneux , Nathalie Theret
Oncotarget, 2018, 9 (30), pp.21366-21382. ⟨10.18632/oncotarget.25106⟩
Article dans une revue hal-01773337v1

Multiclock discrete models of the eukaryotic cell cycle.

 Nolwenn Le Meur , Jérémy Gruel , Michel Le Borgne , Nathalie Théret
Journées Ouvertes en Biologie, Informatique et Mathématiques., Jun 2009, Nantes, France
Communication dans un congrès hal-00435771v1

Signaling and Modeling

 Nathalie Theret
System biology group, Oct 2008, Londres, United Kingdom
Communication dans un congrès hal-00678059v1

Upregulation of the tumor suppressor gene menin in hepatocellular carcinomas and its significance in fibrogenesis.

 Pierre J. Zindy , Annie L'Helgoualc'H , Dominique Bonnier , Antony Le Béchec , Katia Bourd-Boitin , et al.
Hepatology, 2006, 44 (5), pp.1296-307. ⟨10.1002/hep.21367⟩
Article dans une revue hal-00702090v1

Hepatocyte iron loading capacity is associated with differentiation and repression of motility in the HepaRG cell line.

 Marie-Bérengère Troadec , Denise Glaise , Guillaume Lamirault , Martine Le Cunff , Emilie Guérin , et al.
Genomics, 2006, 87 (1), pp.93-103. ⟨10.1016/j.ygeno.2005.08.016⟩
Article dans une revue hal-00700240v1
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In silico investigation of ADAM12 effect on TGF-beta receptors trafficking.

 Jérémy Gruel , Michel Leborgne , Nolwenn Lemeur , Nathalie Théret
BMC Research Notes, 2009, 2 (1), pp.193. ⟨10.1186/1756-0500-2-193⟩
Article dans une revue inserm-00663589v1

The disintegrin and metalloproteinase ADAM12 contributes to TGF-beta signaling through interaction with the type II receptor.

 Azeddine Atfi , Emmanuelle Dumont , Frédéric Colland , Dominique Bonnier , Annie L'Helgoualc'H , et al.
Journal of Cell Biology, 2007, 178 (2), pp.201-8. ⟨10.1083/jcb.200612046⟩
Article dans une revue hal-00697048v1

The probiotic [i]Propionibacterium freudenreichii[/i] as a new adjuvant for TRAIL-based therapy in colorectal cancer

 Fabien Cousin , Sandrine Jouan-Lanhouet , Nathalie Théret , Catherine Brenner , Elodie Jouan , et al.
International Scientific Conference on Probiotics and Prebiotics - IPC2016, Jun 2016, Budapest, Hungary
Communication dans un congrès hal-01286497v1
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A Kappa model for hepatic stellate cells activation by TGFB1

 Matthieu Bouguéon , Pierre Boutillier , Jerome Feret , Octave Hazard , Nathalie Theret
CMSB 2021 - 19th International Conference on Computational Methods in Systems Biology, Sep 2021, Bordeaux / Virtual, France. pp.1-6
Poster de conférence hal-03545256v1
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A Kappa model for hepatic stellate cells activation by TGFB1

 Matthieu Bouguéon , Pierre Boutillier , Jerome Feret , Octave Hazard , Nathalie Theret
CompSysBio 2021 - Advanced Lecture Course on Computational Systems Biology, Nov 2021, Aussois, France. pp.1-1
Poster de conférence hal-03545135v1

MAPK signaling in cisplatin-induced death: predominant role of ERK1 over ERK2 in human hepatocellular carcinoma cells.

 Jean-Philippe Guégan , Frédéric Ezan , Nathalie Théret , Sophie Langouët , Georges Baffet
Carcinogenesis, 2013, 34 (1), pp.38-47. ⟨10.1093/carcin/bgs317⟩
Article dans une revue inserm-00814096v1

Modeling cell signaling pathways with discrete dynamical systems : Application to the Transforming Growth Factor β (TGFβ) dependent Epithelial-Mesenchymal Transition

 Geoffroy Andrieux , Michel Le Borgne , Nathalie Theret
ISMB 2012, Jul 2012, Long Beach, United States
Communication dans un congrès hal-00760189v1
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Molecular and tissue alterations of collagens in fibrosis

 Sylvie Ricard-Blum , Georges Baffet , Nathalie Théret
Matrix Biology, 2018, 68-69, pp.122-149. ⟨10.1016/j.matbio.2018.02.004⟩
Article dans une revue hal-01808771v1

Etude de l'expression d'une nouvelle cytokine angiogénique Bv8 dans le carcinome hépatocellulaire

 J. Monnier , Claire Piquet-Pellorce , Jean-Jacques Feige , Bruno Turlin , Nathalie Théret , et al.
10ième réseau du colloque français d'angiogenèse, Mar 2007, Paris, France
Communication dans un congrès hal-00690829v1

Propionibacterium freudenreichii as potential adjuvant for chemotherapy in digestive cancers

 Fabien Cousin , Catherine Brenner , Sandrine Jouan-Lanhouet , L. Corcos , Nathalie Theret , et al.
5. Colloque Intenational Molécules & Ingrédients Santé, May 2014, Quimper, France. , 2014
Poster de conférence hal-01204307v1
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The probiotic Propionibacterium freudenreichii as a new adjuvant for TRAIL-based therapy in colorectal cancer

 Fabien J Cousin , Sandrine J Jouan , Nathalie Théret , Catherine Brenner , Elodie J Jouan , et al.
Oncotarget, 2016, 7 (6), pp.7161-78. ⟨10.18632/oncotarget.6881⟩
Article dans une revue hal-01404971v1

CX3CL1/fractalkine shedding by human hepatic stellate cells: contribution to chronic inflammation in the liver.

 Katia Bourd-Boittin , Laetitia Basset , Dominique Bonnier , Annie L'Helgoualc'H , Michel Samson , et al.
Journal of Cellular and Molecular Medicine, 2009, 13 (8A), pp.1526-35. ⟨10.1111/j.1582-4934.2009.00787.x⟩
Article dans une revue hal-00676408v1

Modeling the influence of EGF and TGF-b pathways in tumor progression of hepatocellular carcinoma.

 Nolwenn Le Meur , Jérémy Gruel , Michel Le Borgne , Nathalie Théret
Asian Pacific Association for Study of the Liver, Feb 2009, Hong-Kong, Hong Kong SAR China. pp.64, FP107
Communication dans un congrès hal-00435766v1

6th International Workshop on Static Analysis and Systems Biology (SASB 2015)

 Loïc Paulevé , Nathalie Théret
Loïc Paulevé; Nathalie Theret. SASB, Sep 2015, Saint-Malo, France. 326, Elsevier, pp.88, 2016, Electronic Notes in Theoretical Computer Science
Proceedings/Recueil des communications hal-01385704v1

RACK1, a new ADAM12 interacting protein. Contribution to liver fibrogenesis.

 Katia Bourd-Boittin , Hélène Le Pabic , Dominique Bonnier , Annie L'Helgoualc'H , Nathalie Théret
Journal of Biological Chemistry, 2008, 283 (38), pp.26000-9. ⟨10.1074/jbc.M709829200⟩
Article dans une revue hal-00677792v1
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A pipeline to create predictive functional networks: application to the tumor progression of hepatocellular carcinoma

 Maxime Folschette , Vincent Legagneux , Arnaud Poret , Lokmane Chebouba , Carito Guziolowski , et al.
BMC Bioinformatics, 2020, 21 (1), pp.18. ⟨10.1186/s12859-019-3316-1⟩
Article dans une revue hal-02095930v4
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KaSa: A Static Analyzer for Kappa

 Pierre Boutillier , Ferdinanda Camporesi , Jean Coquet , Jérôme Feret , Kim Quyên Lý , et al.
CMSB 2018 - 16th International Conference on Computational Methods in Systems Biology, Sep 2018, Brno, Czech Republic. pp.285-291, ⟨10.1007/978-3-319-99429-1_17⟩
Communication dans un congrès hal-01888951v1
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Identifying Functional Families of Trajectories in Biological Pathways by Soft Clustering: Application to TGF-β Signaling

 Jean Coquet , Nathalie Théret , Vincent Legagneux , Olivier Dameron
CMSB 2017 - 15th International Conference on Computational Methods in Systems Biology, Sep 2017, Darmstadt, France. pp.17
Communication dans un congrès hal-01559249v1
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Integrative analysis of high-throughput RNAi screen data identifies the FER and CRKL tyrosine kinases as new regulators of the mitogenic ERK-dependent pathways in transformed cells.

 Philippe Nizard , Frédéric Ezan , Dominique Bonnier , Nolwenn Le Meur , Sophie Langouët , et al.
BMC Genomics, 2013, 15, pp.1169. ⟨10.1186/1471-2164-15-1169⟩
Article dans une revue hal-01118475v1
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Formations à l'intégrité scientifique et à l'éthique de la recherche : un aperçu du paysage français

 Joëlle Lighezzolo-Alnot , Romain Pierronnet , Caroline Strube , Catherine Tessier , Nathalie Theret
Dalloz. Ethique, intégrité scientifique et fausses nouvelles, Thèmes et commentaires. Ethique biomédicale et normes juridiques, 2021, 978-2-247-19747-7
Chapitre d'ouvrage hal-03403482v1

Activation of TGF-# signaling pathway, an extracellular complex mechanism

 Nathalie Theret
SYMBIOSE, May 2009, Trégastel, France
Communication dans un congrès hal-00676749v1

In silico investigation of ADAM12 effect on TGF-beta receptors trafficking

 Jérémy Gruel , Nolwenn Le Meur , Michel Le Borgne , Nathalie Théret
IPG 2008, Nov 2008, Lyon, France
Communication dans un congrès inria-00337265v1

Innovative Approach to Predict DNA Adduct Formation of Environnemental Contaminants

 Maël Conan , Sophie Langouët , Anne Siegel , Nathalie Theret
Environmental and Molecular Mutagenesis, 2020, 61 (S1), pp.58. ⟨10.1002/em.22405⟩
Article dans une revue hal-02964170v1
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