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Un Modèle de Solvatation Semi-Implicite pour la Simulation des Macromolécules Biologiques

Nathalie Basdevant
Biophysique [physics.bio-ph]. Université d'Evry-Val d'Essonne, 2003. Français. ⟨NNT : ⟩
Thèse tel-00010619v1

Current Rectification and Ionic Selectivity of α-Hemolysin: Coarse-Grained Molecular Dynamics Simulations

Delphine Dessaux , Jérôme Mathé , Rosa Ramirez , Nathalie Basdevant
Journal of Physical Chemistry B, 2022, 126 (23), pp.4189-4199. ⟨10.1021/acs.jpcb.2c01028⟩
Article dans une revue hal-03838328v1

Influence of GTP/GDP and magnesium ion on the solvated structure of the protein FtsZ: a molecular dynamics study

Carla Jamous , Nathalie Basdevant , Tap Ha-Duong
Journal of Biomolecular Structure and Dynamics, 2014, 32 (6), pp.916-927. ⟨10.1080/07391102.2013.799436⟩
Article dans une revue hal-02112312v1

Modeling Protein–Protein Recognition in Solution Using the Coarse-Grained Force Field SCORPION

Nathalie Basdevant , Daniel Borgis , Tap Ha-Duong
Journal of Chemical Theory and Computation, 2013, 9 (1), pp.803-813. ⟨10.1021/CT300943W⟩
Article dans une revue hal-02112584v1

Interaction of chemokine receptor CXCR4 in monomeric and dimeric state with its endogenous ligand CXCL12: coarse-grained simulations identify differences

Pasquale Cutolo , Nathalie Basdevant , Guillaume Bernadat , Françoise Bachelerie , Tâp Ha-Duong
Journal of Biomolecular Structure and Dynamics, 2017, 35 (2), pp.399-412. ⟨10.1080/07391102.2016.1145142⟩
Article dans une revue hal-02110176v1
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Ionic transport through a protein nanopore: a Coarse-Grained Molecular Dynamics Study

Nathalie Basdevant , Delphine Dessaux , Rosa Ramirez
Scientific Reports, 2019, 9 (1), ⟨10.1038/s41598-019-51942-y⟩
Article dans une revue hal-02395220v1

Structure of ring-shaped Aβ42 oligomers determined by conformational selection

Linh Tran , Nathalie Basdevant , C Prévost , Tâp Ha-Duong
Scientific Reports, 2016, 6, pp.21429. ⟨10.1038/srep21429⟩
Article dans une revue hal-01497983v1