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33 résultats
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Diversité moléculaire de la région chromosomique contrôlant la résistance à la rouille foliaire dans les collections de peupliers

Alois Bresson , Véronique V. Jorge , Arnaud A. Dowkiw , Redouane R. El-Malki , Vincent Segura , et al.
Colloque FRB : Les Ressources Génétiques (RG) face aux nouveaux enjeux environnementaux, économiques et sociétaux, Sep 2011, Montpellier, France. Fondation pour la Recherche sur la Biodiversité, 84 p., 2011, Les ressources génétiques face aux nouveaux enjeux environnementaux, économiques et sociaux
Poster de conférence hal-02749127v1

Unraveling the world of halophilic and halotolerant bacteria in cheese by combining cultural, genomic and metagenomic approaches

Caroline Isabel Kothe , Alexander Bolotin , Bochra-Farah Kraïem , Bedis Dridi , Sandra Dérozier , et al.
International Journal of Food Microbiology, 2021, 358, pp.109312. ⟨10.1016/j.ijfoodmicro.2021.109312⟩
Article dans une revue hal-04311697v1

GnpSeq NGS: a new tool to manage NGS data in URGI's information system (GnpIS)

Célia Michotey , Nacer Mohellibi , Hadi Quesneville , Delphine Steinbach
JOBIM 2012 : Journées Ouvertes en Biologie, Informatique et Mathématiques, 2012, 2012
Poster de conférence hal-02807359v1

GnpIS-Asso : A Generic Database for Managing and Exploiting Plant Genetic Association Studies Results Using High Throughput Genotyping and Phenotyping Data

Delphine Steinbach , Guillaume Merceron , Célia Michotey , Raphaël-Gauthier Flores , Nacer Mohellibi , et al.
23. Plant and Animal Genome, Jan 2015, San Diego, United States
Communication dans un congrès hal-01174322v1

BreedWheat GWAS data in GnpIS information system

Mathilde Lainé , Thomas Letellier , Raphaël Flores , Nacer Mohellibi , Cyril Pommier , et al.
Eucarpia Cereal Section - Breeding cereals for sustainable agriculture, Mar 2018, Clermont-Ferrand, France
Communication dans un congrès hal-02340450v1
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Improving the « FAIRness » of Inra’s data for plant biology and breeding

Michael Alaux , Cyril Pommier , Esther Dzale Yeumo , Sophie Durand , Raphaël Flores , et al.
PAG XXVI - Plant and Animal Genome Conference, Jan 2018, San Diego, United States. pp.14 slides
Communication dans un congrès hal-02790227v1

Analysis of expressed sequence tags in maritime pine (Pinus pinaster Aiton)

Grégoire G. Le Provost , Jean-Marc Frigerio , Philippe Chaumeil , Saneyoshi Ueno , Camille Lepoittevin , et al.
Conference on Forest Ecosystem Genomics and Adaptation, Jun 2010, Madrid, Spain
Communication dans un congrès hal-02758480v1

A reference genome for pea provides insight into legume genome evolution

Jonathan J. Kreplak , Mohammed-Amin Madoui , Petr Cápal , Petr Novak , Karine Labadie , et al.
Nature Genetics, 2019, 51 (9), pp.1411-1422. ⟨10.1038/s41588-019-0480-1⟩
Article dans une revue hal-02278272v1

Revealing the microbial heritage of traditional Brazilian cheeses through metagenomics

Caroline Isabel Kothe , Nacer Mohellibi , Pierre Renault
Food Research International, 2022, 157, pp.111265. ⟨10.1016/j.foodres.2022.111265⟩
Article dans une revue hal-04106517v1

Accelerate gut microbiota recovery to enhance resistance to colonisation against vancomycin-resistant Enterococci (VRE)

Alan Jan , Perrine Bayle , Nacer Mohellibi , Clara Lemoine , Frédéric Pepke , et al.
6th International Conference on Enterococci (ICE-6), Sep 2023, Porto, Portugal
Communication dans un congrès hal-04304171v1
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Linking the International Wheat Genome Sequencing Consortium bread wheat reference genome sequence to wheat genetic and phenomic data

Michael Alaux , Jane Rogers , Thomas Letellier , Raphaël Flores , Françoise Alfama , et al.
Genome Biology, 2018, 19 (1), pp.905-911. ⟨10.1186/s13059-018-1491-4⟩
Article dans une revue hal-02278879v1
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GnpIS: an information system to integrate genetic and genomic data from plants and fungi

Delphine D. Steinbach , Michael M. Alaux , Joelle J. Amselem , Nathalie Choisne , Sophie S. Durand , et al.
Database - The journal of Biological Databases and Curation, 2013, 2013, pp.1-9. ⟨10.1093/database/bat058⟩
Article dans une revue hal-02648084v1

A generic tool for managing and exploiting genetic association studies results using high throughput genotyping and phenotyping

Célia Michotey , Frédéric Sapet , Pierre Dubreuil , Jacques Le Gouis , Mathilde Causse , et al.
Plant Genomics Seminar 2012, Apr 2012, Pont-Royal en Provence, France
Communication dans un congrès hal-01268379v1

Enhancing resistance to colonisation of the gut microbiota against vancomycin-resistant Enterococci

Alan Jan , Perrine Bayle , Nacer Mohellibi , Clara Lemoine , Frédéric Pepke , et al.
Journée scientifique de la GS LSH Université Paris-Saclay "Environment and Host Microbiomes-Functional Interactions", May 2023, Paris-Saclay, France
Poster de conférence hal-04305662v1

Developing grapevine FAIR Data

Cyril Pommier , Eric Duchêne , Thierry Lacombe , Timothée Flutre , Michael Alaux , et al.
PAG Conference 2018, Jan 2018, San Diego, United States
Communication dans un congrès hal-02738117v1
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Mining plant genomic and genetic data using the GnpIS information system

Anne-Francoise Adam-Blondon , Michael Alaux , Sophie Durand , Thomas Letellier , Guillaume Merceron , et al.
Aalt D.J van Dijk. Plant Genomics Databases. Methods and Protocols, 1533, Springer, 2017, Methods in Molecular Biology, 978-1-4939-6658-5. ⟨10.1007/978-1-4939-6658-5_5⟩
Chapitre d'ouvrage hal-03206731v1
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Improvement of the Grapevine genome assembly

Aurelie A. Canaguier , Simone Scalabrin , Marie-Christine Le Paslier , Eric Duchêne , Nacer Mohellibi , et al.
Plant and Animal Genome Conference, Jan 2014, San Diego, CA, United States. 2014
Poster de conférence hal-02796033v1
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TD5: Metagenomics Shotgun Sequencing Analysis: Food Microbiome Transfert

P Renault , Nacer Mohellibi , M Almeida , S Chaillou
Master. France. 2021, pp.1-6
Cours hal-03431300v1
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BreedWheat genotyping and phenotyping data in GnpIS information system

Marie Laine , Thomas Letellier , Raphaël-Gauthier R.-G. Flores , Loïc Couderc , Nacer Mohellibi , et al.
JOBIM 2015 - Journées Ouvertes Biologie Informatique Mathématiques, Jul 2015, Clermont-Ferrand, France. 2015
Poster de conférence hal-02801654v1

RésiLens: A research project aiming at identifying bruchid and root rot resistance sources in lentil (Lens culinaris)

Nadim Tayeh , F. Fantin , Christian Steinberg , G. Riquet , Gael Kergoat , et al.
9. International Conference on Legume Genetics and Genomics (ICLGG 2019), Let's harness the potential of legumes, May 2019, Dijon, France. , 2019
Poster de conférence hal-02737584v1
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Diversité moléculaire de la région chromosomique contrôlant la résistance à la rouille foliaire dans les collections de peupliers

Patricia P. Faivre-Rampant , Alois Bresson , Véronique V. Jorge , Arnaud A. Dowkiw , Redouane R. El-Malki , et al.
Colloque FRB : Les Ressources Génétiques (RG) face aux nouveaux enjeux environnementaux, économiques et sociétaux, Sep 2011, Montpellier, France. 84 p
Communication dans un congrès hal-02750107v1

Enhancing resistance to colonisation of the gut microbiota against vancomycin-resistant Enterococci

Alan Jan , Perrine Bayle , Nacer Mohellibi , Clara Lemoine , Frédéric Pepke , et al.
Atelier INSERM n°272 "Les microbiotes-de l'exploration à l'application thérapeutique", May 2023, Bordeaux, France
Poster de conférence hal-04304241v1

Information system for phenotype data: trait, trials and genotypes identification and integration

Cyril Pommier , Michael M. Alaux , Sophie S. Durand , Raphaël-Gauthier R.-G. Flores , Aminah A. Keliet , et al.
22. Conference Plant and Animal Genome, European Molecular Biology Laboratory, European Bioinformatics Institute (EMBL-EBI). GBR., Jan 2014, San Diego, United States
Communication dans un congrès hal-02795958v1
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The IWGSC Data repository and wheat data resources hosted at URGI: Overview and perspectives

Michael Alaux , Jane Rogers , Thomas Letellier , Raphaël Flores , Cyril Pommier , et al.
PAG XXVI - Plant and Animal Genome Conference, Jan 2018, San Diego, United States. pp.32 slides
Communication dans un congrès hal-02788401v1

IWGSC Sequence repository : Blast your favorite gene against the wheat survey sequence

Michael Alaux , Françoise Alfama-Depauw , Véronique Jamilloux , Raphaël Flores , Daphné Verdelet , et al.
PAG XXI - Plant and Animal Genome, Jan 2013, San Diego, United States
Communication dans un congrès hal-02804578v1
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Lebanese fermented goat milk products: From tradition to meta-omics

I. Ammoun , C.I. Kothe , N. Mohellibi , Catherine Béal , R. Yaacoub , et al.
Food Research International, 2023, 168, pp. 112762. ⟨10.1016/j.foodres.2023.112762⟩
Article dans une revue hal-04057222v1
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A new version of the grapevine reference genome assembly (12X.v2) and of its annotation (VCost.v3)

Aurelie Canaguier , Jérome Grimplet , Gabriele Di Gaspero , Simone Scalabrin , Eric Duchêne , et al.
Genomics Data, 2017, 14, pp.56-62. ⟨10.1016/j.gdata.2017.09.002⟩
Article dans une revue hal-01619926v1
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Contribution to a European roadmap for data standardisation in Plant Science at URGI-INRA

Cyril Pommier , Michael M. Alaux , Windpouire Esther Dzale Yeumo , Guillaume Cornut , Sophie S. Durand , et al.
Plant Biology Europe EPSO / FESBP 2016 Congress, Jun 2016, Prague, Czech Republic
Communication dans un congrès hal-02794139v1
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URGI plant and fungi platform: distributed resources through GMOD tools

Joelle J. Amselem , Michael M. Alaux , Nathalie Choisne , Olivier Inizan , Nicolas Lapalu , et al.
Plant and Animal Genome conference XXII, GMOD session, Jan 2014, San Diego (CA), United States
Communication dans un congrès hal-02796293v1
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Findable, Accessible, Interoperable and Reusable data linked to genetic resources for plant biology and breeding at INRA

Sophie Durand , Esther Dzale Yeumo , Cyril Pommier , Michaël Alaux , Guillaume Cornut , et al.
Crop diversification in a changing world : Mobilizing the green gold of plant genetic resources, May 2017, Montpellier, France. , 2017, EUCARPIA Genetic Resources 2017
Poster de conférence hal-01606277v1