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Michel DENIS

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Présentation

Michel DENIS, Dr ès Sciences, directeur de recherche émérite CNRS, Institut Méditerranéen d’Océanologie, Marseille Physicien de formation, M. Denis a été recruté au CNRS en 1969 pour développer des approches de physique en biologie : étude du transfert d’électrons dans le système respiratoire mitochondrial à l’aide notamment de différentes techniques optiques, potentiométriques et magnétiques. M. Denis a rejoint le Centre d’Océanologie de Marseille (COM) en 1985 pour appliquer ces approches aux microorganismes marins dont les systèmes respiratoires étaient largement inconnus. Son activité a évolué vers l’étude individuelle des microorganismes marins à l’aide de la cytométrie en flux, technique émergente dans le milieu marin à la fin des années 1980. C’est ainsi qu’il a introduit cette approche au COM et formé des étudiants dans cette discipline. En faisant l’acquisition du premier cytomètre en flux submersible et automatisé en 2004, il a développé avec Melilotus Thyssen, l’observation haute fréquence *in situ* du phytoplancton dont son groupe est devenu un leader mondial. Parallèlement, avec le concours de Gérald Grégori, il a créé en 2005 une plate-forme régionale de cytométrie pour la microbiologie (PRECYM, labellisée Pôle Mer, <https://precym.mio.univ-amu.fr/>) pour mettre à disposition des chercheurs du secteur public ou privé et des entreprises (biotechnologie) des outils performants (analyseurs, trieurs, cytomètres automatisés) et le savoir-faire du groupe. Contact : <michel.denis@mio.osupytheas.fr>

Publications

aude-e-barani

Assessing ultraphytoplankton and heterotrophic prokaryote composition by flow cytometry in a Mediterranean lagoon

Amel Dhib , Michel Denis , Boutheina Ziadi , Aude Barani , Souad Turki
Environmental Science and Pollution Research, 2017, pp.1-12. ⟨10.1007/s11356-017-8939-z⟩
Article dans une revue hal-01504969v1

Ultra- and microplankton assemblages as indicators of trophic status in a Mediterranean lagoon

Amel Dhib , Michel Denis , Aude Barani , Souad Turki , Lotfi Aleya
Ecological Indicators, 2016, 64, pp.59 - 71. ⟨10.1016/j.ecolind.2015.12.032⟩
Article dans une revue hal-01436592v1

Microbial composition and ecological features of phototrophic biofilms proliferating in the Moidons Caves (France): investigation at the single-cell level

Fabien Borderie , Michel Denis , Aude Barani , Badr Alaoui-Sossé , Lotfi Aleya
Environmental Science and Pollution Research, 2016, 23 (12), pp.12039-12049. ⟨10.1007/s11356-016-6414-x⟩
Article dans une revue hal-03066683v1

The characterisation and summer distribution of ultraphytoplankton in the Gulf of Gabes (Eastern Mediterranean Sea, Tunisia) by using flow cytometry

I. Hamdi , Michel Denis , A. Bellaaj-Zouari , H. Khemakhem , M. Bel Hassen
Continental Shelf Research, 2015, 93, pp.27-38. ⟨10.1016/j.csr.2014.10.002⟩
Article dans une revue hal-01436533v1

Seasonal distribution of ultraphytoplankton and heterotrophic prokaryotes in relation to abiotic variables on the north coast of Sfax after restoration

Amira Rekik , Michel Denis , Mathilde Dugenne , Aude Barani , Sami Maalej
Marine Pollution Bulletin, 2014, 84 (1-2), pp.280-305. ⟨10.1016/j.marpolbul.2014.05.003⟩
Article dans une revue hal-01436552v1

Possible bloom of free trichomes in the Bay of Marseille, NW Mediterranean Sea: an anomaly evidenced by flow cytometry

Li Zhao , Michel Denis , Aude Barani , Beatriz Beker , Claude Manté
Journal of Plankton Research, 2012, 34 (8), pp.711-718
Article dans une revue hal-00749091v1

Possible bloom of free trichomes in the Bay of Marseille, NW Mediterranean Sea: an anomaly evidenced by flow cytometry

Li Zhao , Michel Denis , Aude Barani , Beatriz Beker , Claude Manté
Journal of Plankton Research, 2012, 34 (8), pp.711-718. ⟨10.1093/plankt/fbs038⟩
Article dans une revue hal-00721512v1
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Characterization of heterotrophic prokaryote subgroups in the Sfax coastal solar salterns by combining flow cytometry cell sorting and phylogenetic analysis

Hana Trigui , Salma Masmoudi , Céline Brochier-Armanet , Aude Barani , Gérald Grégori
Extremophiles, 2011, 15, pp.347-358. ⟨10.1007/s00792-011-0364-5⟩
Article dans une revue hal-00598296v1