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Mathilde Causse

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Identifiants chercheurs

Présentation

Personal details ================ Dr Mathilde Causse Work department: INRAE Genetics and Breeding of Fruit and vegetables Address:CS60094 84143 Montfavet France E-mail:Mathilde.Causse@inrae.fr Tel:33 4 32 72 28 03 Website: http://w3.avignon.inra.fr/gafl/fr/personnes/mathilde\_causse Work experience ================ Leader of the research group "Diversity Quality and Environment of Tomato " in the INRAE research unit on Genetics and Breeding of Fruit and Vegetables (GAFL). The group works on Tomato fruit quality (sensory and nutritional), genetic diversity and the impact of environment stress. It is composed of 4 scientists, 1 assistant engineers, 4 technicians and 2 PhD. Main themes of research over the last five years ================================================= Genetic control of tomato fruit quality traits (QTL mapping and cloning; GWAS) Impact of environmental stress on fruit quality; G x E interaction History of tomato domestication; Natural diversity and association genetics in tomato Integrative systems biology and genomic approaches (resequencing) Methodology of selection **Other academic activities** Deputy head of the Plant Biology and Breeding Division (since 2022) Head of the GAFL research unit for 8 years (2004-2012) Coordinator of the Cluster for Integrated Horticulture Research of INRA Avignon Center Coordinator of several research projects on tomato quality; Co-chair of the SOL (Solanaceae genomic) meetings; Co-chair of the Solanaceae workshop at Plant and Animal Genome Conference (San Diego) Member of the French Academy of Agriculture
Directrice de Recherche à INRAE – Centre PACA (DR1) **Coordonnées professionnelles** ``` <pre style="margin-left: 91.6pt;"><span style="mso-bidi-font-size: 11.0pt; font-family: 'Calibri',sans-serif; mso-bidi-font-family: 'Times New Roman';">INRAE, UR 1052, GAFL - Unité de Génétique et Amélioration des Fruits et Légumes CS60094 - 84143 MONTFAVET CEDEX (France)<br></br><span style="mso-spacerun: yes;"> </span>email : mathilde.causse@inrae.fr<br style="mso-special-character: line-break;"></br> <br style="mso-special-character: line-break;"></br> </span> ``` **Formation** Habilitation à Diriger des Recherches (HDR), Université de Montpellier, avril 2001 Doctorat de l’Université Paris XI, soutenu en mars 1989, préparé au Laboratoire d'Amélioration des Plantes Tropicales de l'ORSTOM, Côte d'Ivoire **Carrière** Depuis 2002, responsable de l’équipe Qualité Diversité Environnement chez la Tomate De 2004 à 2012, Directrice de l’UR GAFL (90 permanents) Depuis le 1er février 2010, Directrice de Recherche 1ère Classe à l'INRA. De 2000 à 2010, Directrice de Recherche DR2 à l'INRA. Affectée à l’UR GAFL de Montfavet en 1995 Recrutée en 1990, CR2 à l'INRA. Station de Génétique Végétale du Moulon, Gif/Yvette De 1989 à 1990, post-doc du Ministère des Affaires Etrangères au Département d'Amélioration des Plantes (Pr. S.D. TANKSLEY) de l'Université Cornell, U.S.A **Domaines d’expertises** Génétique, physiologie et génomique de la qualité de la tomate Impact des stress environnementaux sur la production et la qualité de la tomate Méthodologie de la sélection **Formation, jurys** · Encadrement de plus de 10 thèses depuis 1995 et de 5 postdoc ; en moyenne un étudiant de Master chaque année · Rapporteur de 2 à 5 thèses ou HDR chaque année **ACTIVITES AUTRES QUE LA RECHERCHE (**depuis 2010)**:** · Depuis 2022, Chef de Département Adjoint du Département BAP . De 2004 à 2012, Directrice de l’UR GAFL · Membre du bureau de la CSS « Génétique Végétale et Animale » de 2011 à 2020 · Présidente ou membre de plusieurs commissions AERES/HCERES · Elue au Conseils Scientifique de l’INRA de 2007 à 2010 · Elue au CS du Département DGAP puis BAP de 2010 à 2020 · Co-animatrice du Comité « Méthodologie de la sélection» du GIS Biotechnologie Verte de 2014 à 2019 · Co-animatrice du GT « matériel végétal » du GIS PicLeg de 2012 à 2018 · Membre du Conseil Scientifique Unique des filières fruits et légumes frais et transformés depuis 2010 · Membre du comité scientifique des congrès annuels Solanaceae Genome de 2004 à 2018 · Co-chair du Solanaceae workshop au Plant and Animal Meeting (San Diego) de 2016 à 2020 · Co-animatrice du GT « Biologie Végétale » d’Allenvi depuis 2017 **Prix et distinction** - Prix Dufresnoy de l’Académie d’Agriculture de France en 2004 - Chevalier de l’Ordre du Mérite Agricole, 2015 - Elue Membre correspondante de l’Académie d’Agriculture de France en 2017 - Prix Dujarric de la Rivière de l’Académie des Sciences en 2018

Publications

crothan

Validated MAGIC and GWAS population mapping reveals the link between vitamin E content and natural variation in chorismate metabolism in tomato

Estanislao Burgos , Maria Belen de Luca , Isidore Diouf , Luis Haro , Elise Albert
Plant Journal, 2021, 105 (4), pp.907-923. ⟨10.1111/tpj.15077⟩
Article dans une revue hal-03347595v1

Trait discovery and editing in tomato.

Christophe Rothan , Isidore Diouf , Mathilde Causse
Plant Journal, 2019, 97 (1), pp.73-90. ⟨10.1111/tpj.14152⟩
Article dans une revue hal-02623465v1
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A systems biology study in tomato fruit reveals correlations between the ascorbate pool and genes involved in ribosome biogenesis, translation, and the heat-shock response

Rebecca Stevens , Pierre Baldet , Jean-Paul Bouchet , Mathilde Causse , Catherine Deborde
Frontiers in Plant Science, 2018, 9 (137), 16 p. ⟨10.3389/fpls.2018.00137⟩
Article dans une revue hal-01721265v1

The tomato genome sequence provides insights into fleshy fruit evolution

Shusei Sato , Satoshi Tabata , Hideki Hirakawa , Erika Asamizu , Kenta Shirasawa
Nature, 2012, 485 (7400), pp.635-641. ⟨10.1038/nature11119⟩
Article dans une revue hal-02651748v1

The tomato genome sequence provides insights into fleshy fruit evolution

Shusei Sato , Satoshi Tabata , Hideki Hirakawa , Erika Asamizu , Kenta Shirasawa
Nature, 2012, 485 (7400), pp.635-641. ⟨10.1038/nature11119⟩
Article dans une revue hal-04198562v1
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Genotype-dependent response to carbon availability in growing tomato fruit

Marion Prudent , Nadia Bertin , Michel Génard , Stephane S. Munos , Sophie Rolland
Plant, Cell and Environment, 2010, pp.33, 1186-1204. ⟨10.1111/j.1365-3040.2010.02139.x⟩
Article dans une revue hal-00600426v1

An integrative genomics approach for deciphering the complex interactions between ascorbate metabolism and fruit growth and composition in tomato

Virginie Garcia , Rebecca Stevens , Laurent Gil , Louise Gilbert , Noé Gest
Comptes Rendus. Biologies, 2009, 332, pp.1007 - 1021. ⟨10.1016/j.crvi.2009.09.013⟩
Article dans une revue hal-03371236v1

GDP-d-mannose 3,5-epimerase (GME) plays a key role at the intersection of ascorbate and non-cellulosic cell-wall biosynthesis in tomato

Louise Gilbert , Moftah Alhagdow , Adriano Nunes-Nesi , Bernard Quemener , Fabienne F. Guillon
Plant Journal, 2009, 60 (3), pp.499-508. ⟨10.1111/j.1365-313X.2009.03972.x⟩
Article dans une revue hal-02666860v1

An integrative genomics approach for deciphering the complex interactions between ascorbate metabolism and fruit growth and composition in tomato.

Virginie Garcia , Rebecca Stevens , Laurent Gil , Louise Gilbert , Noé Gest
Comptes Rendus Biologies, 2009, 332 (11), pp.1007-21. ⟨10.1016/j.crvi.2009.09.013⟩
Article dans une revue hal-00645936v1

Candidate Genes and Quantitative Trait Loci Affecting Fruit Ascorbic Acid Content in Three Tomato Populations

Rebecca Stevens , Michel Buret , Philippe Duffé , Cécile Garchery , Pierre Baldet
Plant Physiology, 2007, 143 (4), pp.1943-1953. ⟨10.1104/pp.106.091413⟩
Article dans une revue hal-03348017v1

A genetic map of candidate genes and QTLs involved in tomato fruit size and composition

Mathilde M. Causse , Philippe Duffe , M.C. Gomez , Michel Buret , Rene Damidaux
Journal of Experimental Botany, 2004, 55 (403), pp.1671-1685. ⟨10.1093/jxb/erh207⟩
Article dans une revue hal-02679748v1

Chromosome location of tomato ESTs related to carbon metabolism

Philippe Duffe , M.C. Gomez , D. Just , M. Lemaire-Chamley , Christophe Rothan
Report of the Tomato Genetics Cooperative, 2003, 53, pp.16-18
Article dans une revue hal-02670834v1

A fruit-specific phospho enol pyruvate carboxylase is related to rapid growth of tomato fruit

Carine Guillet , Daniel Just , Nathalie Bénard , Agnès Destrac-Irvine , Pierre Baldet
Planta, 2002, 214 (5), pp.717-726. ⟨10.1007/s00425-001-0687-z⟩
Article dans une revue hal-03348041v1
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Ascorbate redox control of plant growth, carbon metabolism and source-sink regulation in tomato

Noé Gest , Cecile Garchery , Mathilde M. Causse , Hélène Gautier , T Do Phuc
10. International Conference on reactive Oxygen and Nitrogene species in Plants, Jul 2011, Budapest, Hungary
Communication dans un congrès hal-02747094v1

GDP-d-mannose 3,5-epimerase (GME) plays a key role at the intersection of ascorbate and non-cellulosic cell-wall biosynthesis in tomato

Louise Gilbert , Moftah Alhagdow , Adriano Nunes-Nesi , Bernard Quemener , Fabienne F. Guillon
EUSOL Workshop, Oct 2009, Toledo, Spain
Communication dans un congrès hal-02754553v1
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TILLING in tomato: a reverse genetic approach for tomato crop improvement. The french platforms

Florence Piron , Maryse Nicolaï , Christophe Rothan , Dani Zamir , Carole Caranta
Naro International Symposium Solanaceae, Mar 2009, Tsu, Mie, Japan
Communication dans un congrès hal-02754219v1

Gene and metabolite regulatory network analyses in tomato fruit

Annick Moing , Fabien F. Mounet , Catherine C. Deborde , Mickael M. Maucourt , Johann J. Petit
Metabomeeting 2009, Jul 2009, Norwich, United Kingdom
Communication dans un congrès hal-02754208v1

Mapping QTLs and genes involved in tomato fruit weight and sugar content

Mathilde M. Causse , Michel Buret , V. Saliba-Colombani , C. Chevalier , Christophe Rothan
International conference on the status of plant and animal genome research, Jan 2000, San Diego CA, United States
Communication dans un congrès hal-02767911v1

Expression of phosphoenolpyruvate carboxylase during tomato fruit development

C. Guillet , Christophe Rothan , D. Just , N. Benard , Agnes Destrac
Tomato molecular biology, Jul 1999, York, CA, United States
Communication dans un congrès hal-02765765v1

Mapping QTLs and genes involved in tomato fruit weight and sugar content

Mathilde M. Causse , Michel Buret , V. Saliba-Colombani , C. Chevalier , Christophe Rothan
Tomato molecular biology, Jul 1999, York, CA, United States
Communication dans un congrès hal-02767287v1

Impact of iron availability on tomato fruit quality

Ester Izquierdo Alegre , Pierre Fourcroy , Jossia Boucherez , Geneviève Conejero , Nicolas Tissot
XVIII International Symposium on Iron Nutrition and Interactions in Plants, May 2016, Madrid, Spain. 2016
Poster de conférence hal-01594726v1

Influence of iron availability on tomato fruit quality

Ester Izquierdo Alegre , Pierre Fourcroy , Jossia Boucherez , Geneviève Conejero , Nicolas Tissot
11e Colloque National de la Société Française de Biologie Végétale SFBV, Jul 2016, Angers, France. 2016
Poster de conférence hal-01594731v1