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Mathieu Giraud


Mathieu Giraud, directeur de recherche CNRS en informatique au laboratoire CRIStAL (CNRS, Université de Lille, Centrale Lille), conçoit des méthodes algorithmiques pour étudier des séquences au service de projets culturels et de santé.

Il l'équipe d'informatique musicale Algomus sur la modélisation, l'analyse, la visualisation et la génération de partitions vues comme des séquences de notes. Est-ce qu'un ordinateur peut aider à faire comprendre et même à faire apprécier la musique ? Ces travaux en humanités numériques concernent la mélodie, l'harmonie (accords, progressions d'accords, cadences), les rythmes, la texture musicale, pour finalement modéliser la structure et la forme musicale.

Mathieu a mené durant 15 ans des recherches sur l'analyse et la comparaison de séquences d'ADN, notamment dans l'équipe de bioinformatique Bonsai, Il travaille toujours sur des méthodes pour mieux connaître les populations de globules blancs, en particulier pour améliorer les diagnostics et les suivis de leucémie. Il est le responsable technique du consortium VidjilNet au sein d'Inria et s'intéresse à l'éthique des traitements de données médicales.

Mathieu collabore avec des musiciens (artistes, enseignants, grand public...) ainsi qu'avec des cliniciens et des professionels de santé. Il s'inscrit dans une démarche de science ouverte.


Hélène Touzet   

Journal articles2 documents

  • Azadeh Saffarian, Mathieu Giraud, Hélène Touzet. Modeling alternate RNA structures in genomic sequences.. Journal of Computational Biology, Mary Ann Liebert, 2015, 22 (3), pp.190-204. ⟨hal-01228130⟩
  • Azadeh Saffarian, Mathieu Giraud, Antoine de Monte, Hélène Touzet. RNA Locally Optimal Secondary Structures. Journal of Computational Biology, Mary Ann Liebert, 2012, 19 (10), pp.1120-1133. ⟨10.1089/cmb.2010.0178⟩. ⟨hal-00756249⟩

Conference papers3 documents

  • Azadeh Saffarian, Mathieu Giraud, Hélène Touzet. Searching for alternate RNA structures in genomic sequences. Computational Methods for Structural RNAs, CMSR'14, Sep 2014, Strasbourg, France. pp.13-24, ⟨10.15455/CMSR.2014.0002⟩. ⟨hal-01084319⟩
  • Jean-Frédéric Berthelot, Charles Deltel, Mathieu Giraud, Stéphane Janot, Laetitia Jourdan, et al.. biomanycores.org: a repository of interoperable open-source code for many-core bioinformatics. JOBIM 2011, Jul 2011, Paris, France. ⟨hal-00637847⟩
  • Mathieu Giraud, Stéphane Janot, Jean-Frédéric Berthelot, Charles Deltel, Laetitia Jourdan, et al.. Biomanycores, open-source parallel code for many-core bioinformatics. Bioinformatics Open Source Conference (BOSC 2011), 2011, Vienne, Austria. ⟨inria-00623390⟩