Magalie Faivre

Microfluidique et microsystèmes pour les biotechnologies ======================================================== Magalie Faivre, magalie.faivre@univ-lyon1.fr INL UMR 5270, http://inl.cnrs.fr ### Formation : - Doctorat de Physique de l'Université Joseph Fourier Grenoble 1 (UJF), 2006. Thèse réalisée sous la direction du Dr. Annie Viallat (Laboratoire de Spectrométrie Physique, Grenoble), du Pr. Howard A. Stone (SEAS, Harvard University, Cambridge USA) et du Dr. Brigitte Pépin-Donat (CEA, Grenoble). - DEA Chimie Physique Moléculaire et Structurale de l'UJF, mention AB, 2003. - Maîtrise de Sciences Physiques de l'UJF, mention AB, 2002. ### Parcours professionnel : - CR CNRS depuis janvier 2011: Développement d'outils diagnostiques microfluidiques basés sur l'exploitation des propriétés mécaniques des cellules. CNRS/Institut des Nanotechnologies de Lyon UMR5270, Lyon : CR2 CNRS. - Post-doctorat, 2009-2010 : Encapsulation d'une nano-émulsion et relargage loalisé *in vivo* par application d'ultrasons. ESPCI Paris-Tech/Laboratoire Microfluidique, MEMs et Nanostructures, Paris. - Post-doctorat, 2007-2009 : Mise au point d'un microsystème réalisant des analyses biomédicales sur une goutte de sang capillaire. CEA Minatec/LETI/Département des Technologies pour la Biologie et la Santé, Grenoble. - Thèse, 2004-2006 : Gouttes, vésicules et globules rouges : déformabilité et comportement sous écoulement. Laboratoire de Spectrométrie Physique, Grenoble et Harvard University/School of Engineering and Applied Sciences (SEAS), Cambridge, USA. - Stage (9 mois), 2004 : Experimental studies of red blood cells and multiphase flows in microfluidic devices. Harvard University / SEAS, Cambridge, USA. - Stage de DEA (6 mois), 2003 : Dynamique de globules rouges isolés sous écoulement. Laboratoire de Spectométrie Physique, Grenoble. ### Activités de recherches : Mes activités de recherches visent à développer des outils diagnostic microfluidiques permettant de détecter des signatures mécaniques anormales de cellules associées avec certaines pathologies. Dernièrement, la thèse d'Amin Amirouche, soutenue en décembre 2017, a permis de développer une approche prometteuse testée sur des cellules artificiellement rigidifiées. Grâce aux récentes collaborations avec le Pr. Stéphane Picot de la Malaria Research Unit et le Pr. Philippe Connes du LIBM (équipe "Vascular Biology and Red Blood Cell") et à l'implantation d'un banc de caractérisation mécanique microfluidique aux Hospices Civiles de Lyon (service parasitologie et mycologie médicale), nous validons les dispositifs microfluidiques développés ces 3 dernières années sur des chantillons pathologiques issus de patients. ### Encadrement : - Thèses : Co-encadrement de 5 thèses: R. Gelszinnis (soutenue le 2 juillet 2015), A. Amirouche (soutenue le 25 octobre 2017), J.A. Martinez SantaMaria (soutenue le 05 février 2019), A. Kheir Aldine (soutenance prévue en 2022) et B. Allais (soutenance prévue en 2023). - ATER : Encadrement d'un ATER: J. Esteves (financement UCBL 2014-2015 et financement INSA 2015-2016). - Stagiaires : Encadrement ou co-encadrement de 17 stagiaires (L3, M1 ou M2) depuis 2011. ### Animation de la communauté scientifique : - Organisation du 1er Workshop "Cancer Cell on Chip" à Lyon en Juin 2012 (~ 100 participants). - Organisation du 2nd Workshop "Cancer Cell on Chip" à Lyon en Mars 2019. - Ateliers INL pour la fête de la Science en 2015, 2016, 2017 et 2018. - Visite / Atelier INL dans le cadre des rendez-vous du Rize (Villeurbanne) en 2018. ### Distinction : 2011 Sylvia Sorkin Greenfield Award pour le meilleur article scientifique dans Medical Physics. ### Activités et responsabilités collectives : - Mise en place d'un Laboratoire de type L2 dans le cadre du nouveau bâtiment INL/CPE (2022). - Mise en place d'un espace exprimental de manipulation d'agents biologiques et de nanoparticules dans le cadre de la plateforme technologique Nanolyon, budget 40k€ (2012). - Agent de prévention sur le site UCBL de l'INL depuis 2012. - Sauveteur Secouriste du Travail depuis 2018. - Participe au groupe de travail pour la conception d'un laboratoire de type "L2" dans le cadre du nouveau bâtiment INL/CPE. ### Production scientifique quantitative : 1 chapitre de livre, 16 articles dans des journaux internationaux à comité de lecture, 5 brevets, 6 actes de confrences internationales. **h-facteur de 10 et 1245 citations.** - **Ouvrages** "Chapter 4: Mechanics for fluidcs and biology, G. Villanueva, A. De Pastina and M. Faivre, in Engineering of micro/nano bio systems: fundamental and applications, Ed. Springer, en cours de publication. - **Revues internationales à comité de lecture** "Mechanical signature of Red Blood Cells flowing out of a microfluidic constriction is impacted by membrane elasticity, cell surface-to-volume ratio and diseases", M. Faivre, C. Renoux, A. Bessaa, L. Da Costa, P. Joly, A. Gauthier and P. Connes, Frontiers in Physiology, 11:576 (2020). "Dual shape recovery of Red Blood Cells flowing out of a microfluidic constriction", A. Amirouche, J. Esteves, A. Lavoignat, S. picot, R. Ferrigno and M. Faivre, Biomicrofluidics, 14(2), 024116 (2020). "Impact of surface-area-to-volume ratio, internal viscosity and membrane viscoelasticity on red blood cell deformability measured in isotonic condition", C. Renoux, M. Faivre, A. Bessaa, L. Da Costa, P. Joly, A. Gauthier and P. Connes, Scientific Reports, 9:6771, (2019). "Anisotropic ferromagnetic polymer: a first step for their implementation in microfluidic systems", D. Le Roy, D. Dhungana, L. Ourry, M. Faivre, R. Ferrigno, A. Tamion, V. Dupuis, V. Salles and A.L. Deman, AIP Advances, 6(5):056604 (2016). "Magnetophoretic manipulation in microsystem using i-PDMS microstructures", M. Faivre, R. Gelszinnins, J. Degouttes, N. Terrier, C. Rivire, R. Ferrigno and A.L. Deman, Biomicrofluidics, 8(5):054103, (2014). "Gel phase vesicles buckle into specific shapes", F. Quemeneur, C. Quillet, M. Faivre, A. Viallat and B. Pepin-Donat Phys. Rev. Lett., 108(10):108303, (2012). "Coagulation dynamics of a blood sample by multiple scattering analysis", M. Faivre, P. Peltié, A. Planat-Chrétien, M.L. Cosnier, M. Cubizolles, C. Nogier, C. Négrier and P. Pouteau, J. Biomed. Opt., 16(5):057001, (2011). "Ultrasound internal tattooing", O. Couture, M. Faivre, N. Pannacci, A. Babataheri, V. Servois, P. Tabeling and M. Tanter, Med. Phys., 38(2):1116-1123, (2011). "Drop production and tip-streaming phenomenon on microfluidic flow focusing device *via* interfacial saponication chemical reaction", T. Ward, M. Faivre, H.A. Stone, Langmuir, 26(12):9233-9239, (2010). "Cellular-scale hydrodynamics", M. Abkarian, M. Faivre, R. Horton, K. Smistrup, C.A. Best-Popescu and H. A. Stone, Biomed. Mater., 3(3):034011, (2008). "Swinging of red blood cells under shear flow", M. Abkarian, M. Faivre and A. Viallat, Phys. Rev. Lett., 98(18):188302, (2007). "Geometrical focusing of cells in a microfluidic device: A route to separate blood plasma", M. Faivre, M. Abkarian, K. Bickraj and H. A. Stone, Biorheology, 43(2):147-159, (2006). "High-speed microfluidic differential manometer for cellular-scale hydrodynamics", M. Abkarian, M. Faivre and H. A. Stone, Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 103(3):538-542, (2006). "Reversible giant vesicles lled with Poly(N-isopropylacrylamide) sols or gels", M. Faivre, C. Campillo, B. Pepin-Donat and A. Viallat, Progr. Colloid. Polym. Sci., 133:41-44, (2006). "Microfluidic flow focusing: Drop size and scaling in pressure versus flow-rate driven fluid pumping", T. Ward, M. Faivre, M. Abkarian and H. A. Stone, Electrophoresis, 26(19):3716-3724, (2005). - **Actes de congrés internationaux** "Determination of Red Blood Cell fatigue using electrodeformation", A. Amirouche, M. Faivre, J.F. Chateaux and R. Ferrigno, IEEE Eng. Med. Biol. Soc., (2017). "Effect of electrode material on the sensitivity of interdigitated electrodes used for Electrical Cell-Substrate Impedance Sensing technology", J.A. Martinez Santa Maria, A. Montalibet, E. McAdams, M. Faivre and R. Ferrigno, IEEE Eng. Med. Biol. Soc., (2017). "The role of the energy dissipation in the high speed mechanical relaxation of the Red Blood Cells", A. Amirouche, J. Esteves, R. Ferrigno and M. Faivre, Proceedings of the 20th International Conference on Miniaturized Systems for Chemistry and Life Sciences, µTAS 2016 - 09-13 October 2016 - Dublin, Ireland, (2016). "Manipulation of rare cells in microfluidic device using magnetophoresis and dielectrophoresis based on composite-PDMS", J. Marchalot, R. Gelszinnins, A.L. Deman, M. Faivre, J.F. Chateaux, C. Riviere, H. Mertani and R. Ferrigno, Proceedings of the 4th European Conference on Microfluidics, Microfluidics 2014 - Limerick, December 10-12, 2014, (2014). "Magnetophoretic manipulation in microsystem using i-PDMS microstructures", R. Gelszinnins, M. Faivre, J. Degouttes, N. Terrier, R. Ferrigno and A.L. Deman, Proceedings of the 17th International Conference on Miniaturized Systems for Chemistry and Life Sciences, TAS 2013 - 27-31 October 2013 - Freiburg, Germany, (2013). "A passive microfluidic device for plasma extraction from whole human blood", E. Sollier, M. Cubizolles, M. Faivre, Y. Fouillet, J.L. Achard, IEEE Eng. Med. Biol. Soc., 7030-7033, (2009). - **Brevets** "Pressure determination in microfluidic systems", H.A. Stone, M. Abkarian, M. Faivre and K. Smistrup, WO2007014336A1 (Harvard University). "Method and a device for characterizing the coagulation or sedimentation dynamics of a fluid such as blood or blood plasma", P. Pouteau, M. Faivre, P. Peltie, C.A. Planat, EP2233923B1 (CEA/Leti). "Method and apparatus for counting thrombocytes", M. Faivre, P. Caillat, M. Cubizolles, C. Peponnet and C. Vauchier, EP2246691A1 (CEA/Leti). "Method for assaying plasma enzymes in whole blood", M. Cubizolles, M.L. Cosnier, M. Faivre and P. Pouteau, EP2249258A1 (CEA/Leti). "Appareil et dispositif consommable pour effectuer des analyses sanguines", M.L. Cosnier, P. Caillat, M. Cubizolles, M. Faivre, P. Peltie, C. Peponnet, P. Pouteau, C. Vauchier and L. Talini, WO2010128221A1 (CEA/Leti). - **Communications Orales** \- Conférences internationales "Dual mechanical characterization of Red Blood Cells: Role of surface area, internal viscosity and membrane rigidity", C. Renaoux, M. Faivre, A. Bessaa, P. Joly and P. Connes, Joint Meeting of The European Society for Clinical Hemorheology and Microcirculation, The International Society of Clinical Hemorheology and The International Society of Biorheology, Cracovie, Pologne, (Juillet 2018). "Flow of healthy and thermally rigidied erythrocytes in a microfluidic rheometer", A. Amirouche, J. Esteves, R. Ferrigno and M. Faivre, Blood Flow, Paris, France, (Octobre 2017). "Determination of Red Blood Cell fatigue using electrodeformation", A. Amirouche, M. Faivre, J.F. Chateaux and R. Ferrigno, EMBC, Jeju Island, Corée, (Juillet 2017). "Dynamical behavior of cancer cells migrating on nano- and micro-patterned substrates", M. Faivre (Conférencier invité), Physics of Cancer, Leipzig, Allemagne, (Septembre 2015). "Manipulation of rare cells in microfluidic devices using magnetophoresis and dielectrophoresis based on composite-PDMS", M. Faivre, J. Marchalot, R. Gelszinnis, A.L. Deman, J.F. Chateaux, C. Riviere, H. Mertani and R. Ferrigno, Microflu, Limerick, Ireland, (Décembre 2014). "A tapered channel microfluidic device for comprehensive cell adhesion of breast cancer cell lines", A. Confavreux, P. Rupprecht, L. Gole, C. Vézy, M. Faivre, H. Mertani, C. Riviere, F. Ferrigno and J.P. Rieu, Workshop \\Cancer Cell on Chip", Lyon, France (Juin 2012). "Migration of cancerous cells in microfluidic devices", M. Faivre (Conférencier invité), C. Rivière, A. Confavreux, A.L. Deman, M. Brun, J.F. Chateaux, J.P. Rieu and F. Ferrigno, EMSG Symposium, Ardgour, Ecosse, (Septembre 2011). "High-speed microfluidic differential manometer: for cellular-scale hydrodynamics" M. Faivre, M. Abkarian, K. Smistrup and H.A. Stone, American Physical Society Meeting \\Division of fluid mechanics", Chicago, USA, (Octobre 2005). "Geometrical focusing of cells in a microfluidic device", M. Faivre, K. Bikraj, M. Abkarian and H.A. Stone, American Institute of Chemistry and Engineering Annual Meeting, Cincinnati, USA, (Novembre 2005). "Production of surfactant at the interface of a flowing drop: Interfacial kinetics in a microfluidic device", M. Faivre, T. Ward, M. Abkarian and H.A. Stone, American Physical Society Meeting \\Division of fluid mechanics", Seattle, USA, (Novembre 2004). \- Conférences nationales "Microfluidic characterization of mechanical phenotype to discriminate pathological Red Blood Cells", A. Amirouche, J. Estéves, R. Ferrigno and M. Faivre (Conférencier invité), Workshop Lab-On-a-Chip, Besançon, France, (Mai 2018). "Cinétique, déformation et relaxation mécanique de globules rouges sous écoulement confiné : Quel est le rôle de la dissipation ?", A. Amirouche, J. Estéves, R. Ferrigno and M. Faivre (Conférencier invité), Journée thématique INSIS, Paris, France, (Juillet 2015). "Interplay between cell-substrate adhesion and random and chemotactic mobility for highly invasive cancer cell lines", A. Confavreux, M. Faivre, H. Mertani, C. Rivière, R. Ferrigno and J.P. Rieu, GDR CellTiss, Lyon, France, (November 2013). \- Congrès locaux "Microsystèmes fluidiques biomimétiques pour la santé", A. Amirouche, R. Ferrigno, J.F. Chateaux and M. Faivre, Journée de la Faculté des Sciences et Technologies de l'UCBL, Lyon, France, (Juin 2017). "Dynamical behavior of cancer cells migrating on nano and micropatterned substrates" J.F. Chateaux, J. Castelluci, C. Rivière, H. Mertani and M. Faivre, Mechanobiology and physics of life in Lyon, Lyon, France, (Janvier 2016). "Transmigration of cancer cells: From deformation to migration in microsystems", M. Faivre. Conférencier invité, Microfabrication for cell biology Club, Paris, France, (Mai 2013). - **Posters** \- Conférences internationales "Comparison of ITO and IrOx-modied ITO interdigitated electrodes for electrical cell substrate Impedance sensing (ECIS) applications", J.A. Martinez SantaMaria, A. Montalibet, E. McAdams, M. Faivre and R. Ferrigno, EuroSensors, Paris, France (Octobre 2017). "Impact of channel geometry on the discrimination of mechanically impaired Red Blood Cells in passive microfluidics", A. Amirouche, R. Ferrigno and M. Faivre, EuroSensors, Paris, France (Octobre 2017). "Effect of electrode material on the sensitivity of interdigitated electrodes used for Electrical Cell-Substrate Impedance Sensing technology", J.A. Martinez SantaMaria, A. Montalibet, E. McAdams, M. Faivre and R. Ferrigno, EMBC, Jeju Island, Corée, (Juillet 2017). "Analysis of Red Blood Cells relaxation time flowing out of microfluidic constrictions reveals the impact of buer viscosity and flow speed", A. Amirouche, J. Esteves, R. Ferrigno and M. Faivre, µTAS, Dublin, Ireland, (Octobre 2016). "Characterization of interdigitated electrodes for ECIS assays", J.A. Martinez SantaMaria, E. McAdams, B. Massot and M. Faivre and R. Ferrigno, Namis international Autumn school, Tokyo, Japon, (Septembre 2016). "Deformability as a new physical biomarker", A. Amirouche, J. Esteves, R. Ferrigno and M. Faivre, Namis international Autumn school, Montreal, Canada, (Juillet 2015). "Magnetophoretic manipulation in microsystem using i-PDMS microstructures", R. Gelszinnins, M. Faivre, J. Degouttes, N. Terrier, R. Ferrigno and A.L. Deman, µTAS, Freiburg, Allemagne, (Octobre 2013). \- Conférences nationales "Influence du matériau d'électrode sur la sensibilité de la mesure de bioimpédance ECIS", J.A. Martinez SantaMaria, A. Montalibet, E. McAdams, M. Faivre and R. Ferrigno, Forum Impédance, Paris, France, (Décembre 2016). "Interplay between cell-substrate adhesion, random migration & chemotactic motility for highly invasive cancer cell lines, A. Confavreux, M. Faivre, C. Rivière, H. Delanoe-Ayari, H. Mertani, R. Ferrigno and J.P. Rieu, CellMech, Obergurgl, Autriche, (Octobre 2013). "Interplay between cell-substrate adhesion, random migration & chemotactic motility for highly invasive cancer cell lines, A. Confavreux, M. Faivre, C. Rivière, H. Delanoe-Ayari, H. Mertani, R. Ferrigno and J.P. Rieu, Nanobiotech, Montreux, Suisse, (Novembre 2013). "Microfluidic tools for the analysis of the interplay between cancer cells detachment and migration", A. Confavreux, M. Faivre, H. Mertani, C. Rivière, R. Ferrigno and J.P. Rieu, DeGennes Days & PhysCell, Hyres, France, (Septembre 2012). "Microfluidic tools for the analysis of the interplay between cancer cells detachment and migration", A. Confavreux, M. Faivre, H. Mertani, C. Rivière, R. Ferrigno and J.P. Rieu, GDR Micro- Nano-Systèmes Micro- Nano-Fluidique, Bordeau, France, (Juillet 2012). "Approaches based on composite PDMS for implementation of actives functions in Lab-on-a-chip", J. Marchalot, R. Gelszinnis, A.L. Deman, J.F. Chateaux, M. Faivre and R. Ferrigno, GDR Micro- Nano-Systèmes Micro- Nano-Fluidique, Bordeaux, France, (Juillet 2012). "A tapered channel microfluidic device to analyse cancer cells adhesion properties", A. Confavreux, M. Faivre, H. Mertani, R. Ferrigno, C. Rivière, and J.P. Rieu, GDR Micro- Nano-Systèmes Micro- Nano-Fluidique, Bordeaux, France, (Juillet 2012). "Cell Lysis and sample treatment in a microfluidic environment", J. Marchalot, J.F. Chateaux, M. Faivre, A. Confavreux, C. Riviere, J.P. Rieu, H. Mertani, A.L. Deman and R. Ferrigno, Cancer cell on chip workshop, Lyon, France, (Juin 2012). \- Congres locaux "Mechanical relaxation of Red Blood Cells under confined flow: the role of dissipation", A. Amirouche, J. Esteves, R. Ferrigno and M. Faivre, Mechanobiology and physics of life in Lyon, Lyon, France, (Janvier 2016).