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Genome sequence of[i] Lactobacillus delbrueckii[/i] subsp. [i]lactis[/i] CNRZ327, a dairy bacterium with anti-inflammatory properties.

 Hela El Kafsi , Johan Binesse , Valentin Loux , Julien Buratti , Samira Boudebbouze , et al.
Genome Announcements, 2014, 2 (4), pp.1-2. ⟨10.1128/genomeA.00328-14⟩
Article dans une revue hal-01204323v1

Human gut microbes impact host serum metabolome and insulin sensitivity

 Helle Krogh Pedersen , Valborg Gudmundsdottir , Henrik Bjørn Nielsen , Tuulia Hyotylainen , Trine Nielsen , et al.
Nature, 2016, 535 (12), ⟨10.1038/nature18646⟩
Article dans une revue hal-01594855v1
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Molecular basis of virulence in Staphylococcus aureus mastitis

 Caroline Le Maréchal , Nubia Seyffert , Julien Jardin , David Hernandez , Gwénaël Jan , et al.
PLoS ONE, 2011, 6 (11), ⟨10.1371/journal.pone.0027354⟩
Article dans une revue hal-01189501v1

Rerouting of pyruvate metabolism during acid adaptation in Lactobacillus bulgaricus

 Annabelle Fernandez , Jun Ogawa , Stéphanie Penaud , Samira S. Boudebbouze , Stanislav S. Ehrlich , et al.
Proteomics, 2008, 8 (15), pp.3154-3163. ⟨10.1002/pmic.200700974⟩
Article dans une revue istex hal-02663514v1

Dynamic properties of the intestinal ecosystem; diagnostics and role in the remission from Ulcerative Colitis

 Maarten van de Guchte
Rôle des microbiotes dans les fonctions immunitaires : Stratégies de prévention et de traitement, Adebiotech, 2021, En ligne, France
Communication dans un congrès hal-03719527v1
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Functional comparison of bacteria from the human gut and closely related non-gut bacteria reveals the importance of conjugation and a paucity of motility and chemotaxis functions in the gut environment

 Dragana Dobrijevic , Anne-Laure Abraham , Alexandre Jamet , Emmanuelle Maguin , Maarten van de Guchte
PLoS ONE, 2016, 11 (7), pp.e0159030. ⟨10.1371/journal.pone.0159030⟩
Article dans une revue hal-01353535v1
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High-throughput system for the presentation of secreted and surface-exposed proteins from Gram-positive bacteria in functional metagenomics studies

 Dragana Dobrijevic , Gaetana Vandemeulebrouck , Kosei Tanaka , Tomas de Wouters , Rozenn Dervyn , et al.
PLoS ONE, 2013, 8 (6), ⟨10.1371/journal.pone.0065956⟩
Article dans une revue hal-01190549v1
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Richness of human gut microbiome correlates with metabolic markers

 Emmanuelle Le Chatelier , Trine Nielsen , Junjie Qin , Edi Prifti , Falk Hildebrand , et al.
Nature, 2013, 500 (7464), pp.541-546. ⟨10.1038/nature12506⟩
Article dans une revue hal-01190602v1
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Lactobacillus delbrueckii ssp. lactis and ssp. bulgaricus: a chronicle of evolution in action.

 Hela El Kafsi , Johan Binesse , Valentin Loux , Julien Buratti , Samira Boudebbouze , et al.
BMC Genomics, 2014, 15 (1), pp.407. ⟨10.1186/1471-2164-15-407⟩
Article dans une revue pasteur-01017376v1

Lactobacillus casei is able to survive and initiate protein synthesis during its transit in the digestive tract of human flora-associated mice

 R. Oozeer , N. Goupil-Feuillerat , C.A. Alpert , Maarten van de Guchte , Jamila Anba Mondoloni , et al.
Applied and Environmental Microbiology, 2002, 68 (7), pp.3570-3574
Article dans une revue hal-02678707v1
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Alternative stable states in the intestinal ecosystem: proof of concept in a rat model and a perspective of therapeutic implications

 Maarten van de Guchte , Sebastian D Burz , Julie Cadiou , Jiangbo Wu , Stanislas Mondot , et al.
Microbiome, 2020, 8 (1), pp.153. ⟨10.1186/s40168-020-00933-7⟩
Article dans une revue hal-03634946v1

SYMBIO-THERAPY TARGETING INFLAMMATION AND MICROBIOTA IN ULCERATIVE COLITIS

 Maarten van de Guchte , Stanislas Mondot , Joel Dore
4TH INTERNATIONAL WORLD OF MICROBIOME CONFERENCE, Oct 2023, Sofia, Bulgaria
Poster de conférence hal-04305587v1

Etats stables alternatifs d’un holobiont : La relation entre le microbiote intestinal et l’hôte

 Maarten van de Guchte , Sebastian D. Burz , Julie Cadiou , Jiangbo Wu , Stanislas Mondot , et al.
AFEM 2019: Fonctions et diversité des microbiotes dans les environnements naturels et anthropisés, 2019, Bussang, France
Communication dans un congrès hal-02888963v1
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Extensive horizontal transfer of core genome genes between two Lactobacillus species found in the gastrointestinal tract

 Pierre P. Nicolas , Philippe Bessières , Stanislav S. Ehrlich , Emmanuelle Maguin , Maarten van de Guchte
BMC Evolutionary Biology, 2007, 7, paper numéro 141. ⟨10.1186/1471-2148-7-141⟩
Article dans une revue hal-02660996v1

Discovering lactic acid bacteria by genomics

 Todd Klaenhammer , Eric Altermann , Fabrizio Arigoni , Alexander Bolotin , Fred Breidt , et al.
Lactic Acid Bacteria: Genetics, Metabolism and Applications, 82 (1-4), Springer Netherlands, pp.29-58, 2002, ⟨10.1007/978-94-017-2029-8_3⟩
Chapitre d'ouvrage hal-03372153v1

SURFING: A national project to understand immunomodulatury effects of dairy starters

 Benoît Foligné , Valentin Loux , Christophe Hervé , Jean-René Kerjean , Denis Matter , et al.
2nd International Symposium "Microbes For Health", Dec 2011, Paris, France
Communication dans un congrès hal-01190437v1
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AGMIAL: implementing an annotation strategy for prokaryote genomes as a distributed system

 K. Bryson , Valentin Loux , Robert R. Bossy , P. Nicolas , Stephane S. Chaillou , et al.
Nucleic Acids Research, 2006, 34 (12), pp.3533-3545. ⟨10.1093/nar/gkl471⟩
Article dans une revue hal-02665192v1
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Humans as holobionts: implications for prevention and therapy

 Maarten van de Guchte , Herve Blottiere , Joel Dore
Microbiome, 2018, 6, pp.1-6. ⟨10.1186/s40168-018-0466-8⟩
Article dans une revue hal-02625522v1
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Dynamic Properties of the Intestinal Ecosystem Call for Combination Therapies, Targeting Inflammation and Microbiota, in Ulcerative Colitis

 Maarten van de Guchte , Stanislas Mondot , Joël Doré
Gastroenterology, 2021, 161, pp.1969 - 1981.e12. ⟨10.1053/j.gastro.2021.08.057⟩
Article dans une revue hal-03634959v1

Prediction of surface exposed proteins in Streptococcus pyogenes, with a potential application to other Gram-positive bacteria

 Aleksandr Barinov , Valentin Loux , Amal Hammani , Pierre P. Nicolas , Philippe P. Langella , et al.
Proteomics, 2009, 9 (1), pp.61-73. ⟨10.1002/pmic.200800195⟩
Article dans une revue hal-02663676v1
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Tolérance et réponse adaptative au stress acide chez Lactobacillus delbrueckii ssp. bulgaricus

 Isabelle Guillouard , Eng-Mong Lim , Maarten van de Guchte , Christine Grimaldi , Stéphanie Penaud , et al.
Le Lait, 2004, 84 (1-2), pp.1-6. ⟨10.1051/lait:2003044⟩
Article dans une revue hal-00895529v1

Transcriptional interactions suggest niche segregation among microorganisms in the human gut

 Damian Rafal Plichta , Agnieszka Sierakowska Juncker , Marcelo Bertalan , Elizabeth Rettedal , Laurent Gautier , et al.
Nature Microbiology, 2016, 1 (11), pp.1-6. ⟨10.1038/NMICROBIOL.2016.152⟩
Article dans une revue hal-01533942v1

Alternative stable states in the intestinal ecosystem: proof of concept and a perspective of therapeutic implications

 Maarten van de Guchte , Sebastian D. Burz , Julie Cadiou , Jiangbo Wu , Stanislas Mondot , et al.
KEYSTONE SYMPOSIA. Microbiome: Therapeutic Implications (T1), 2019, Killarney, Ireland. ⟨10.1186/s40168-020-00933-7⟩
Poster de conférence hal-02888849v1

Horizontal gene transfer and ecosystem function dynamics

 Maarten van de Guchte
Trends in Microbiology, 2017, 25 (9), pp.699-700. ⟨10.1016/j.tim.2017.07.002⟩
Article dans une revue hal-02629171v1

Partindo de dados (meta)genômicos para entender as relações bactéria-hospedeiro no trato gastro intestinal

 Maarten van de Guchte , Clarissa Santos Rocha
Microbiologia in Foco, 2009, 9 (2), pp.4-6
Article dans une revue hal-01204337v1

Properties of probiotic bacteria explored by proteomic approaches

 Maarten van de Guchte , Thibault Chaze , Gwénaël Jan , Michel Mistou
Current Opinion in Microbiology, 2012, 15 (3), pp.381-389. ⟨10.1016/j.mib.2012.04.003⟩
Article dans une revue istex hal-01191213v1

Development of an Efficient In Vivo System (P-junc-TpaseIS(1223)) for Random Transposon Mutagenesis of Lactobacillus casei

 Helene H. Licandro-Seraut , Sophie S. Brinster , Maarten van de Guchte , Helene H. Scornec , Emmanuelle Maguin , et al.
Applied and Environmental Microbiology, 2012, 78 (15), pp.5417 - 5423. ⟨10.1128/AEM.00531-12⟩
Article dans une revue hal-01004149v1

OntoBiotope, technologies sémantiques pour l’étude des habitats microbiens

 Claire Nédellec , Robert Bossy , Zorana Ratkovic , Dialekti Valsamou , Louise Deleger , et al.
Méta-omiques des Ecosystèmes Microbiens, Sep 2015, Paris, France
Poster de conférence hal-02889012v1
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Importance of IL-10 modulation by probiotic microorganisms in gastrointestinal inflammatory diseases

 Alejandra de Moreno de Leblanc , Silvina del Carmen , Meritxell Zurita-Turk , Clarissa Santos Rocha , Maarten van de Guchte , et al.
ISRN Gastroenterology, 2011, 2011, pp.1-11. ⟨10.5402/2011/892971⟩
Article dans une revue hal-01204334v1

Genomics of the Genus Lactobacillus

 Aleksandr Barinov , Alexandre Bolotine , Philippe Langella , Emmanuelle Maguin , Maarten van de Guchte
Lactic Acid Bacteria and Bifidobacteria - Current Progress in Advanced Research, Caister Academic Press, 286 p., 2011, 978-1-904455-82-0
Chapitre d'ouvrage hal-01204336v1
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