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Jeune Chercheur en écologie microbienne marine


Dans mes recherches, je m'intéresse au fonctionnement du réseau microbien en particulier au fonctionnement des communautés de procaryotes (bactéries et archées). 

Dans le cadre de ma thèse, je me suis focalisée sur le rôle des procaryotes dans le cycle de l'azote dans un écosystème particulier : une vasière intertidale de type européen. J'ai étudié les communautés suivant un gradient vertical de profondeurs de sédiment entre 0 et 10 cm (0-0,5 cm, 0,5-1 cm, 1-2 cm, 2-5 cm et 5-10 cm). Ce travail a permis de développer une base de données conséquente sur la diversité des bactéries et des archées benthiques à marée basse entre 0 et 10 cm de profondeur. 

Actuellement en poste en tant qu'ATER (Attaché Temporaire d'Enseignement et de Recherche) à l'Université de La Rochelle, j'enseigne la microbiologie, l'écologie, l'écologie évolutive, l'écophysiologie ou encore la physiologie végétale à des étudiants de L1 à M1. 

Je réalise mes activités de recherche en continuité avec mes travaux de thèse au laboratoire LIENSs à La Rochelle


Journal articles5 documents

  • Frédéric Thalasso, Armando Sepulveda-Jauregui, Laure Gandois, Karla Martinez-Cruz, Oscar Gerardo-Nieto, et al.. Sub-oxycline methane oxidation can fully uptake CH4 produced in sediments: case study of a lake in Siberia. Scientific Reports, Nature Publishing Group, 2020, 10 (1), ⟨10.1038/s41598-020-60394-8⟩. ⟨hal-03147113⟩
  • Céline Lavergne, Hélène Agogué, Aude Leynaert, Mélanie Raimonet, Rutger de Wit, et al.. Factors influencing prokaryotes in an intertidal mudflat and the resulting depth gradients. Estuarine, Coastal and Shelf Science, Elsevier, 2017, 189, pp.74 - 83. ⟨10.1016/j.ecss.2017.03.008⟩. ⟨hal-01491829⟩
  • Christophe Leboulanger, Hélène Agogué, Cécile Bernard, Marc Bouvy, Claire Carré, et al.. Microbial Diversity and Cyanobacterial Production in Dziani Dzaha Crater Lake, a Unique Tropical Thalassohaline Environment. PLoS ONE, Public Library of Science, 2017, 12 (1), pp.e0168879. ⟨10.1371/journal.pone.0168879⟩. ⟨hal-01465841⟩
  • Céline Lavergne, Laureen Beaugeard, Christine Dupuy, Courties Claude, Agogué Hélène. An efficient and rapid method for the enumeration of heterotrophic prokaryotes in coastal sediments by flow cytometry. Journal of Microbiological Methods, Elsevier, 2014, 105, http://www.journals.elsevier.com/journal-of-microbiological-methods/. ⟨10.1016/j.mimet.2014.07.002⟩. ⟨hal-01086641⟩
  • Betty Kientz, Hélène Agogué, Céline Lavergne, Pauline Marié, Eric Rosenfeld. Isolation and distribution of iridescent Cellulophaga and further iridescent marine bacteria in the Charente Maritime coast, French Atlantic coast. Systematic and Applied Microbiology, Elsevier, 2013, 36 (4), pp.244-251. ⟨10.1016/j.syapm.2013.02.004⟩. ⟨hal-01090460⟩

Theses2 documents

  • Céline Lavergne. Rôle (structure et fonction) des communautés procaryotes (bactéries et archées) dans le cycle de l’azote d’une vasière littorale du Pertuis Charentais : influence des facteurs biotiques et abiotiques par une approche multi-échelle. Sciences agricoles. Université de La Rochelle, 2014. Français. ⟨NNT : 2014LAROS034⟩. ⟨tel-01334705⟩
  • Céline Lavergne. Rôle (structure et fonction) des communautés procaryotes (bactéries et archées) dans le cycle de l’azote d’une vasière littorale du Pertuis Charentais : Influence des facteurs biotiques et abiotiques par une approche multiéchelle. Biodiversité et Ecologie. Université de La Rochelle, 2014. Français. ⟨tel-01175468⟩