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Céline Lavergne

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Dans mes recherches, je m'intéresse au fonctionnement du réseau microbien en particulier au fonctionnement des communautés de procaryotes (bactéries et archées). Dans le cadre de ma thèse, je me suis focalisée sur le rôle des procaryotes dans le cycle de l'azote dans un écosystème particulier : une vasière intertidale de type européen. J'ai étudié les communautés suivant un gradient vertical de profondeurs de sédiment entre 0 et 10 cm (0-0,5 cm, 0,5-1 cm, 1-2 cm, 2-5 cm et 5-10 cm). Ce travail a permis de développer une base de données conséquente sur la diversité des bactéries et des archées benthiques à marée basse entre 0 et 10 cm de profondeur. Actuellement en poste en tant qu'ATER (Attaché Temporaire d'Enseignement et de Recherche) à l'Université de La Rochelle, j'enseigne la microbiologie, l'écologie, l'écologie évolutive, l'écophysiologie ou encore la physiologie végétale à des étudiants de L1 à M1. Je réalise mes activités de recherche en continuité avec mes travaux de thèse au laboratoire LIENSs à La Rochelle
Dans mes recherches, je m'intéresse au fonctionnement du réseau microbien en particulier au fonctionnement des communautés de procaryotes (bactéries et archées). Dans le cadre de ma thèse, je me suis focalisée sur le rôle des procaryotes dans le cycle de l'azote dans un écosystème particulier : une vasière intertidale de type européen. J'ai étudié les communautés suivant un gradient vertical de profondeurs de sédiment entre 0 et 10 cm (0-0,5 cm, 0,5-1 cm, 1-2 cm, 2-5 cm et 5-10 cm). Ce travail a permis de développer une base de données conséquente sur la diversité des bactéries et des archées benthiques à marée basse entre 0 et 10 cm de profondeur. Actuellement en poste en tant qu'ATER (Attaché Temporaire d'Enseignement et de Recherche) à l'Université de La Rochelle, j'enseigne la microbiologie, l'écologie, l'écologie évolutive, l'écophysiologie ou encore la physiologie végétale à des étudiants de L1 à M1. Je réalise mes activités de recherche en continuité avec mes travaux de thèse au laboratoire LIENSs à La Rochelle

Publications

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A combined microbial and biogeochemical dataset from high-latitude ecosystems with respect to methane cycle

Maialen Barret , L. Gandois , Frederic Thalasso , Karla Martinez Cruz , Armando Sepulveda Jauregui
Scientific Data , 2022, 9 (1), pp.674. ⟨10.1038/s41597-022-01759-8⟩
Article dans une revue hal-03993305v2
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Sub-oxycline methane oxidation can fully uptake CH4 produced in sediments: case study of a lake in Siberia

Frédéric Thalasso , Armando Sepulveda-Jauregui , Laure Gandois , Karla Martinez-Cruz , Oscar Gerardo-Nieto
Scientific Reports, 2020, 10 (1), ⟨10.1038/s41598-020-60394-8⟩
Article dans une revue hal-03147113v1
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Microbial Diversity and Cyanobacterial Production in Dziani Dzaha Crater Lake, a Unique Tropical Thalassohaline Environment

Christophe Leboulanger , Hélène Agogué , Cécile Bernard , Marc Bouvy , Claire Carré
PLoS ONE, 2017, 12 (1), pp.e0168879. ⟨10.1371/journal.pone.0168879⟩
Article dans une revue hal-01465841v1
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Factors influencing prokaryotes in an intertidal mudflat and the resulting depth gradients

Céline Lavergne , Hélène Agogué , Aude Leynaert , Mélanie Raimonet , Rutger de Wit
Estuarine, Coastal and Shelf Science, 2017, 189, pp.74 - 83. ⟨10.1016/j.ecss.2017.03.008⟩
Article dans une revue hal-01491829v1
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An efficient and rapid method for the enumeration of heterotrophic prokaryotes in coastal sediments by flow cytometry

Céline Lavergne , Laureen Beaugeard , Christine Dupuy , Courties Claude , Agogué Hélène
Journal of Microbiological Methods, 2014, 105, http://www.journals.elsevier.com/journal-of-microbiological-methods/. ⟨10.1016/j.mimet.2014.07.002⟩
Article dans une revue hal-01086641v1
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Isolation and distribution of iridescent Cellulophaga and further iridescent marine bacteria in the Charente Maritime coast, French Atlantic coast

Betty Kientz , Hélène Agogué , Céline Lavergne , Pauline Marié , Eric Rosenfeld
Systematic and Applied Microbiology, 2013, 36 (4), pp.244-251. ⟨10.1016/j.syapm.2013.02.004⟩
Article dans une revue hal-01090460v1