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Logique paracohérente pour l’annotation fonctionnelle des génomes au travers de réseaux biologiques

 Jonathan Mercier
Sciences agricoles. Université Paris Saclay (COmUE), 2017. Français. ⟨NNT : 2017SACLE007⟩
Thèse tel-04190606v1
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Contrasting tectonically driven exhumation and incision patterns, western versus central Nepal Himalaya

 Peter van Der Beek , Camille Litty , Mallory Baudin , Jonathan Mercier , Xavier Robert , et al.
Geology, 2016, 44 (4), pp.327-330. ⟨10.1130/G37579.1⟩
Article dans une revue hal-03135825v1
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A simple model for regolith formation by chemical weathering

 Jean Braun , Jonathan Mercier , François Guillocheau , Cécile Robin
Journal of Geophysical Research: Earth Surface, 2016, 121 (11), pp.2140-2171 ⟨10.1002/2016JF003914⟩
Article dans une revue insu-01384700v1
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MicroScope in 2017: an expanding and evolving integrated resource for community expertise of microbial genomes

 David Vallenet , Alexandra Calteau , Stéphane Cruveiller , Mathieu Gachet , Aurélie Lajus , et al.
Nucleic Acids Research, 2017, 45 (D1), pp.D517-D528. ⟨10.1093/nar/gkw1101⟩
Article dans une revue cea-04320303v1
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GROOLS: reactive graph reasoning for genome annotation through biological processes

 Jonathan Mercier , Adrien Josso , Claudine Medigue , David Vallenet
BMC Bioinformatics, 2018, 19, pp.132. ⟨10.1186/s12859-018-2126-1⟩
Article dans une revue cea-04313474v1
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Oak genome reveals facets of long lifespan

 Christophe Plomion , Jean-Marc Aury , Joelle Amselem , Thibault Leroy , Florent Murat , et al.
Nature Plants, 2018, 4 (7), pp.440-452. ⟨10.1038/s41477-018-0172-3⟩
Article dans une revue hal-01820559v1

Evaluating Workflow Management Systems: A Bioinformatics Use Case

 Elise Larsonneur , Jonathan Mercier , Nicolas Wiart , Edith Le Floch , Olivier Delhomme , et al.
2018 IEEE International Conference on Bioinformatics and Biomedicine (BIBM), Dec 2018, Madrid, Spain. pp.2773-2775, ⟨10.1109/BIBM.2018.8621141⟩
Communication dans un congrès cea-04475033v1
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Fore arc tectonothermal evolution of the El Oro metamorphic province (Ecuador) during the Mesozoic

 Nicolas Riel , Jean-Emmanuel Martelat , Stephane Guillot , Etienne Jaillard , Patrick Monie , et al.
Tectonics, 2014, 33 (10), pp.1989-2012. ⟨10.1002/2014TC003618⟩
Article dans une revue hal-01115714v1
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Rapid protein evolution, organellar reductions, and invasive intronic elements in the marine aerobic parasite dinoflagellate Amoebophrya spp

 Sarah Farhat , Phuong Le , Ehsan Kayal , Benjamin Noel , Estelle Bigeard , et al.
BMC Biology, 2021, 19 (1), ⟨10.1186/s12915-020-00927-9⟩
Article dans une revue hal-03114990v1

Decoding the oak genome: public release of sequence data, assembly, annotation and publication strategies.

 Christophe Plomion , Jean-Marc Aury , Joëlle Amselem , Tina Alaeitabar , Valérie Barbe , et al.
Molecular Ecology Resources, 2015, 16 (1), pp.254-265. ⟨10.1111/1755-0998.12425⟩
Article dans une revue istex hal-01579667v1
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Two genomes of highly polyphagous lepidopteran pests (Spodoptera frugiperda, Noctuidae) with different host-plant ranges

 Anaïs Gouin , Anthony Bretaudeau , Kiwoong Nam , Sylvie Gimenez , Jean-Marc Aury , et al.
Scientific Reports, 2017, 7 (1), pp.1-12. ⟨10.1038/s41598-017-10461-4⟩
Article dans une revue hal-01633879v1
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