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Article dans une revue13 documents

  • Amine Abdaoui, Jérôme Azé, Sandra Bringay, Pascal Poncelet. FEEL: a French Expanded Emotion Lexicon. Language Resources and Evaluation, Springer Verlag, 2016, pp.1-23. <10.1007/s10579-016-9364-5>. <lirmm-01348016>
  • Hugo Alatrista Salas, Jérôme Azé, Sandra Bringay, Flavie Cernesson, Nazha Selmaoui-Folcher, et al.. A knowledge discovery process for spatiotemporal data: Application to river water quality monitoring. Ecological Informatics, Elsevier, 2015, 26, pp.127-139. <10.1016/j.ecoinf.2014.05.011>. <hal-01130144>
  • Jérôme Azé, Christophe Sola, Jian Zhang, Florian Lafosse-Marin, Memona Yasmin, et al.. Genomics and Machine Learning for Taxonomy Consensus: The Mycobacterium tuberculosis Complex Paradigm. PLoS ONE, Public Library of Science, 2015, 10 (7), pp.210-218. <10.1371/journal.pone.0130912>. <lirmm-01348924>
  • Thomas Bourquard, Flavie Landomiel, Eric Reiter, Pascale Crépieux, David W. Ritchie, et al.. Unraveling the molecular architecture of a G protein-coupled receptor/β-arrestin/Erk module complex. Scientific Reports, Nature Publishing Group, 2015, pp.5:10760. <http://www.nature.com/srep/2015/150601/srep10760/full/srep10760.html>. <10.1038/srep10760>. <lirmm-01162594>
  • Adrien Guilhot-Gaudeffroy, Christine Froidevaux, Jérôme Azé, Julie Bernauer. Protein-RNA Complexes and Efficient Automatic Docking: Expanding RosettaDock Possibilities.. PLoS ONE, Public Library of Science, 2014, 9 (9), pp.e108928. <http://www.plosone.org/article/info%3Adoi%2F10.1371%2Fjournal.pone.0108928>. <10.1371/journal.pone.0108928>. <hal-01071876>
  • Damien De Vienne, Jérôme Azé. Efficient Prediction of Co-Complexed Proteins Based on Coevolution. PLoS ONE, Public Library of Science, 2012. <hal-00756120>
  • Hugo Alatrista Salas, Jérôme Azé, Sandra Bringay, Flavie Cernesson, Frédéric Flouvat, et al.. Recherche de séquences spatio-temporelles peu contredites dans des données hydrologiques. Revue des Nouvelles Technologies de l'Information, Hermann, 2012, MQDC 2012, RNTI-E-22, pp.165-188. <lirmm-01090662>
  • Sarel J Fleishman, Timothy A Whitehead, Eva-Maria Strauch, Jacob E Corn, Sanbo Qin, et al.. Community-Wide Assessment of Protein-Interface Modeling Suggests Improvements to Design Methodology.. Journal of Molecular Biology, Elsevier, 2011, in press. <10.1016/j.jmb.2011.09.031>. <inria-00637848>
  • Thomas Bourquard, Julie Bernauer, Jérôme Azé, Anne Poupon. A collaborative filtering approach for protein-protein docking scoring functions.. PLoS ONE, Public Library of Science, 2011, 6 (4), pp.e18541. <10.1371/journal.pone.0018541>. <inria-00625000>
  • Jérôme Azé, Mathieu Roche, Erick Alphonse, Ahmed Amrani, Thomas Heitz, et al.. Bilan du premier défi francophone de Fouille de Textes. Revue des Nouvelles Technologies de l'Information, Hermann, 2007, DEFT'2007: Défi Fouille de Textes : reconnaissance automatique des auteurs de discours - Campagne DEFT'05 (TALN'05), RNTI-E-10, pp.15-38. <lirmm-00138129>
  • Julie Bernauer, Jérôme Azé, Joël Janin, Anne Poupon. A new protein-protein docking scoring function based on interface residue properties.. Bioinformatics, Oxford University Press (OUP), 2007, 23 (5), pp.555-62. <http://bioinformatics.oxfordjournals.org/cgi/reprint/23/5/555.pdf>. <10.1093/bioinformatics/btl654>. <inria-00431697>
  • Julie Bernauer, Anne Poupon, Jérôme Azé, Joël Janin. A docking analysis of the statistical physics of protein-protein recognition.. Physical Biology, Institute of Physics: Hybrid Open Access, 2005, 2 (2), pp.S17-23. <http://www.iop.org/EJ/article/1478-3975/2/2/S02/ph5_2_s02.pdf>. <10.1088/1478-3975/2/2/S02>. <inria-00431699>
  • Jérôme Azé, Serge Guillaume, P. Castagliola. EVALUATION DE LA RESISTANCE AU BRUIT DE QUELQUES MESURES QUANTITATIVES. Revue des Nouvelles Technologies de l'Information Actes des 35èmes Journées de Statistique de la SFdS, 2003, 2-6 Juin, pp.159-170. <hal-00113977>

Communication dans un congrès29 documents

  • Jessica Pinaire, Jérôme Azé, Sandra Bringay, Paul Landais. Extraire semi-automatiquement des connaissances dans la littérature biomédicale . IC: Ingénierie des Connaissances, Jun 2016, Montpellier, France. 27es Journées francophones d'Ingénierie des Connaissances, 2016. <hal-01333470>
  • Yves Mercadier, Jessica Pinaire, Jérôme Azé, Sandra Bringay, Maguelonne Teisseire. Manipulation interactive d'ensemble de motifs : application aux parcours hospitaliers. EGC: Extraction et Gestion des Connaissances, Jan 2016, Reims, France. <lirmm-01288468>
  • Yves Mercadier, Jessica Pinaire, Jérôme Azé, Sandra Bringay, Maguelonne Teisseire. La confiance est dans l'air ! Application à l'identification des parcours hospitaliers. GAST: Gestion et Analyse des données Spatiales et Temporelles, Jan 2016, Reims, France. 2nd atelier – Gestion et Analyse des données Spatiales et Temporelles (GAST’2016), 2016, <https://gt-gast.irisa.fr/cfp/>. <lirmm-01288459>
  • Oky Purwantiningsih, Arnaud Sallaberry, Sebastien Andary, Antoine Seilles, Jérôme Azé. Visual Analysis of Body Movement in Serious Games for Healthcare. PacificVis: Pacific Visualization Symposium, Apr 2016, Taipei, Taiwan. IEEE, 9th IEEE Pacific Visualization Symposium, pp.229-233, 2016. <lirmm-01304601>
  • Cédric Maigrot, Sandra Bringay, Jérôme Azé. Concept drift vs suicide: comment l'un peut prévenir l'autre ?. EGC: Extraction et Gestion des Connaissances, Jan 2016, Reims, France. 2016. <hal-01283889>
  • Amine Abdaoui, Mike Donald Tapi Nzali, Jérôme Azé, Sandra Bringay, Christian Lavergne, et al.. ADVANSE: Sentiment, Opinion and Emotion Analysis in French Tweets. DEFT: Défi Fouille de Texte, Jun 2015, Caen, France. Actes de la 11e Défi Fouille de Texte (DEFT'2015) à TALN. <hal-01222629>
  • Mike Donald Tapi Nzali, Sandra Bringay, Christian Lavergne, Thomas Opitz, Jérôme Azé, et al.. Construction d'un vocabulaire patient/médecin dédié au cancer du sein à partir des médias sociaux. IC: Ingénierie des Connaissances, Jun 2015, Rennes, France. collection AFIA, 2015, 26es journées francophones d'Ingénierie des Connaissances. <hal-01166796>
  • Jessica Pinaire, Julien Rabatel, Jérôme Azé, Sandra Bringay, Paul Landais. Recherche et visualisation de trajectoires dans les parcours de soins des patients ayant eu un infarctus du myocarde. SIIM: Symposium Ingénierie de l’Information Médicale, Jun 2015, Rennes, France. 3ème Symposium Ingénierie de l’Information Médicale, 2015. <hal-01180416>
  • Amine Abdaoui, Jérôme Azé, Sandra Bringay, Pascal Poncelet. Assisting e-patients in an Ask the Doctor Service. MIE: Medical Informatics Europe, May 2015, Madrid, Spain. 26th Medical Informatics Europe Conference, Digital healthcare empowering Europeans, 2015. <lirmm-01130746>
  • Jessica Pinaire, Soumaya Ben Alouane, Jérôme Azé, Sandra Bringay, Paul Landais, et al.. Visualisation interactive de trajectoires de patients. IC: Ingénierie des Connaissances, Jun 2015, Rennes, France. 2015. <hal-01179448>
  • Amine Abdaoui, Jérôme Azé, Sandra Bringay, Pascal Poncelet. Collaborative Content-Based Method for Estimating User Reputation in Online Forums. WISE: Web Information Systems Engineering, Nov 2015, Miami, United States. Springer, 16th International Conference, Miami, FL, USA, November 1–3, 2015, Proceedings, Part II, LNCS (9419), pp.292-299, 2015, Web Information Systems Engineering – WISE 2015. <10.1007/978-3-319-26187-4_26>. <lirmm-01222961>
  • Amine Abdaoui, Jérôme Azé, Sandra Bringay, Pascal Poncelet. E-Patient reputation in Health Forums. MEDINFO: World Congress on Health and Biomedical Informatics, Aug 2015, São Paulo, Brazil. pp.137-141, MEDINFO'2015: 15th World Congress on Health and Biomedical Informatics. <lirmm-01131961>
  • Thomas Opitz, Jérôme Azé, Sandra Bringay, Cyrille Joutard, Christian Lavergne, et al.. Breast cancer and quality of life: medical information extraction from health forums. Medical Informatics Europe, Aug 2014, Istanbul, Turkey. pp.1070-1074, 2014. <hal-01061891>
  • Thomas Opitz, Jérôme Azé, Sandra Bringay, Cyrille Joutard, Christian Lavergne, et al.. Paroles de patients dans les forums de santé: une perspective originale sur la qualité de la vie. 25es Journées francophones d'Ingénierie des Connaissances, May 2014, Clermont-Ferrand, France. pp.Actes de l'Atelier IA & Santé, 2014. <hal-01057095>
  • Adrien Guilhot-Gaudeffroy, Jérôme Azé, Julie Bernauer, Christine Froidevaux. Apprentissage de fonctions de tri pour la prédiction d'interactions protéine-ARN. Extraction et Gestion des Connaissances, Jan 2014, Rennes, France. 2014, <http://editions-rnti.fr/?inprocid=1001960>. <hal-01016683>
  • Amine Abdaoui, Jérôme Azé, Sandra Bringay, Pascal Poncelet, Natalia Grabar. Analyse des messages des patients et des médecins dans les fora de santé. Atelier IC & Santé, 2014, Clermont-Ferrand, France. <lirmm-01130737>
  • Amine Abdaoui, Jérôme Azé, Sandra Bringay, Natalia Grabar, Pascal Poncelet. Predicting Medical Roles in Online Health Fora. SLSP: Statistical Language and Speech Processing, Oct 2014, Grenoble, France. 2nd International Conference on Statistical Language and Speech Processing, LNCS (8791), pp.247-258, 2014, Statistical Language and Speech Processing. <10.1007/978-3-319-11397-5_19>. <lirmm-01130749>
  • Soumia Melzi, Amine Abdaoui, Jérôme Azé, Sandra Bringay, Pascal Poncelet, et al.. Que ressentent les patients ?. EGC'2014: 14èmes Journées Francophones "Extraction et Gestion des Connaissances", Jan 2014, Rennes, France. <lirmm-01130711>
  • Soumia Melzi, Amine Abdaoui, Jérôme Azé, Sandra Bringay, Pascal Poncelet, et al.. Patient's rationale: Patient Knowledge retrieval from health forums. eTELEMED: eHealth, Telemedicine, and Social Medicine, 2014, Barcelone, Spain. 6th International Conference on eHealth, Telemedicine, and Social Medicine, 2014. <lirmm-01130720>
  • Thomas Bourquard, Damien De Vienne, Jérôme Azé. Identification de complexes protéine-protéine par combinaison de classifieurs. Application à Escherichia coli. Djamel A. Zighed and Gilles Venturini. EGC 2013 - 13eme conférence Francophone sur l'Extraction et la Gestion des Connaissances, Jan 2013, Toulouse, France. Hermann, E.24, pp.419-430, 2013, RNTI; Extraction et Gestion des Connaissances - EGC'2013. <hal-00785473>
  • Cécile Pereira, Jérôme Azé, Alain Denise, Christine Drevet, Christine Froidevaux, et al.. Comparative analysis of phylogenetic profiles for the enzymatic characterization of fungal group. JOBIM 2013, 2013, Toulouse, France. à paraître, 2013. <hal-00842021>
  • Hugo Alatrista Salas, Jérôme Azé, Sandra Bringay, Flavie Cernesson, Frédéric Flouvat, et al.. The Least Temporal Contradiction Measure: Application to Hydrological Data. AGILE: International Conference on Geographic Information Science, 2012, Avignon, France. AGILE'12: 15th International Conference on Geographic Information Science, pp.197-202, 2012. <lirmm-00802112>
  • Thomas Bourquard, Jérôme Azé, Anne Poupon, David Ritchie. Protein-protein docking based on shape complementarity and Voronoi fingerprint. Emmanuel BARILLOT, Christine F ROIDEVAUX, Eduardo PC ROCHA. Journées Ouvertes Biologie Informatique Mathématiques, Jun 2011, Paris, France. Institut Pasteur, pp.9-16, 2011, JOBIM 2011. <inria-00613186>
  • Jérôme Azé, Thomas Bourquard, Sylvie Hamel, Anne Poupon, David Ritchie. Using Kendall-Tau Meta-Bagging to Improve Protein-Protein Docking Predictions. M. Loog. PRIB 2011, Nov 2011, DELFT, Netherlands. pp.284-295, 2011. <inria-00628038>
  • Thomas Bourquard, Julie Bernauer, Jérôme Azé, Anne Poupon. Comparing Voronoi and Laguerre tessellations in the protein-protein docking context. Sixth annual International Symposium on Voronoi Diagrams, Jun 2009, Copenhagen, Denmark. 2009. <inria-00429618>
  • Jérôme Azé, Thomas Heitz, Augusta Mela, Amar-Djalil Mezaour, Peter Peinl, et al.. Présentation de DEFT'06 (DEfi Fouille de Textes). Atelier DEFT'06 : DEfi Fouille de Textes, Sep 2006, pp.10, 2006. <lirmm-00113164>
  • Thomas Heitz, Jérôme Azé, Mathieu Roche, Augusta Mela, Peter Peinl, et al.. Présentation de DEFT 06 (DÉfi Fouille de Textes). Atelier DEFT'06 - SDN'06 (Semaine du Document Numérique), 2006, Fribourg, Suisse. pp.1-10, 2006, Actes de l'atelier DEFT'06, SDN'06 (Semaine du Document Numérique). <inria-00119612>
  • Julie Bernauer, Jérôme Azé, Joël Janin, Anne Poupon. Une nouvelle fonction de score pour l'amarrage protéine-protéine fondée sur les diagrammes de Voronoï. Journées Ouvertes de Biologie Informatique Mathématiques, Jul 2005, Lyon, France. 2005, <http://pbil.univ-lyon1.fr/events/jobim2005/proceedings/E05Bernauer.pdf>. <inria-00431703>
  • Jérôme Azé, Mathieu Roche, Yves Kodratoff, Michèle Sebag. Preference Learning in Terminology Extraction: A ROC-based approach. Jacques Janssen and Philippe Lenca. 2005, pp.209-219, 2005. <hal-00015665>

Poster3 documents

  • Yves Mercadier, Jessica Pinaire, Jérôme Azé, Sandra Bringay, Maguelonne Teisseire. La r-confiance pour l'identification de trajectoires de patients. EGC: Extraction et Gestion des Connaissances, Jan 2016, Reims, France. 2016. <lirmm-01288454>
  • Julien Rabatel, Jérôme Azé, Pascal Poncelet, Mathieu Roche. RegExpMiner: Automatically discovering frequently matching regular expressions. ECML PKDD: European Conference on Machine Learning and Principles and Practice of Knowledge Discovery in Databases, Sep 2014, Nancy, France. CEUR, 1st International Workshop on Interactions between Data Mining and Natural Language Processing co-located with ECML PKDD'2014: The European Conference on Machine Learning and Principles and Practice of Knowledge Discovery in Databases, 1202, pp.143-144, 2014, <http://ecmlpkdd2014.loria.fr>. <lirmm-01054922>
  • Amine Abdaoui, Jérôme Azé, Sandra Bringay, Natalia Grabar, Pascal Poncelet. Analysis of Forum Posts Written by Patients and Health Professionals. MIE: Medical Informatics European, Aug 2014, Istanbul, Turkey. e-Health - For Continuity of Care - Proceedings of MIE2014, the 25th European Medical Informatics Conference, Istanbul, Turkey, August 31 - September 3, 2014, pp.1185, 2014. <lirmm-01130727>

Ouvrage (y compris édition critique et traduction)2 documents

  • Jérôme Azé, Nicolas Béchet, Laure Berti-Équille, Sylvie Guillaume, Mathieu Roche, et al.. Mesurer et évaluer la qualité des données et des connaissances. Éditions Hermann, pp.200, 2012, 9782705682866. <lirmm-00816287>
  • Violaine Prince, Yves Kodratoff, Jérôme Azé, Mathieu Roche. Défi Fouille de Textes : reconnaissance automatique des auteurs de discours - Campagne DEFT'05 (TALN'05). Violaine Prince, Yves Kodratoff, Jérôme Azé, Mathieu Roche. Cépaduès, E10, pp.158, 2007, Revue RNTI (Revue des Nouvelles Technologies de l'Information), 978.2.85428.7. <lirmm-00135489>

Chapitre d'ouvrage1 document

  • Israël-César Lerman, Jérôme Azé. A New Probabilistic Measure of Interestingness for Association Rules, Based on the Likelihood of the Link. Guillet, F. and Hamilton, H. Quality Measures in Data Mining. Studies in Computational Intelligence, Springer, pp.207-236, 2007. <inria-00180117>

Thèse1 document

  • Jérôme Azé. Extraction de Connaissances à partir de Données Numériques et Textuelles. Interface homme-machine [cs.HC]. Université Paris Sud - Paris XI, 2003. Français. <tel-00011196>

HDR1 document

  • Jérôme Azé. Prédiction d'Interactions et Amarrage Protéine-Protéine par combinaison de classifieurs. Apprentissage [cs.LG]. Université Paris Sud - Paris XI, 2012. <tel-00763947>