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Directeur de recherche en écologie marine


Journal articles64 documents

  • Henrique Cabral, Hilaire Drouineau, Ana Teles-Machado, Maud Pierre, Mario Lepage, et al.. Contrasting impacts of climate change on connectivity and larval recruitment to estuarine nursery areas. Progress in Oceanography, Elsevier, 2021, 196, pp.102608. ⟨10.1016/j.pocean.2021.102608⟩. ⟨hal-03241532⟩
  • Sophie Cauvy-Fraunié, Verena Trenkel, Martin Daufresne, Anthony Maire, H. Capra, et al.. Interpretation of interannual variability in long-term aquatic ecological surveys. Canadian Journal of Fisheries and Aquatic Sciences, NRC Research Press, 2020, 77 (5), pp.894-903. ⟨10.1139/cjfas-2019-0146⟩. ⟨hal-02493153⟩
  • Florence Mounier, Laure Pecquerie, Jérémy Lobry, Adriana Sardi, Pierre Labadie, et al.. Dietary bioaccumulation of persistent organic pollutants in the common sole Solea solea in the context of global change. Part 1: Revisiting parameterisation and calibration of a DEB model to consider inter-individual variability in experimental and natural conditions. Ecological Modelling, 2020, 433, pp.109224. ⟨10.1016/j.ecolmodel.2020.109224⟩. ⟨hal-02926101⟩
  • Florence Mounier, Véronique Loizeau, Laure Pecquerie, Hilaire Drouineau, Pierre Labadie, et al.. Dietary bioaccumulation of persistent organic pollutants in the common sole Solea solea in the context of global change. Part 2: Sensitivity of juvenile growth and contamination to toxicokinetic parameters uncertainty and environmental conditions variability in estuaries. Ecological Modelling, 2020, 431, pp.109196. ⟨10.1016/j.ecolmodel.2020.109196⟩. ⟨hal-02926105⟩
  • Camille Le Guen, Samuele Tecchio, Jean-Claude Dauvin, Gwenola de Roton, Jérémy Lobry, et al.. Assessing the ecological status of an estuarine ecosystem: linking biodiversity and food-web indicators. Estuarine, Coastal and Shelf Science, Elsevier, 2019, 228, pp.106339. ⟨10.1016/j.ecss.2019.106339⟩. ⟨hal-02346068⟩
  • Gabriel Munoz, Hélène Budzinski, Marc Babut, Jérémy Lobry, Jonathan Selleslagh, et al.. Temporal variations of perfluoroalkyl substances partitioning between surface water, suspended sediment, and biota in a macrotidal estuary. Chemosphere, Elsevier, 2019, 233, pp.319-326. ⟨10.1016/j.chemosphere.2019.05.281⟩. ⟨hal-02145736⟩
  • Xavier Chevillot, Samuele Tecchio, Aurélie Chaalali, Géraldine Lassalle, Jonathan Selleslagh, et al.. Global Changes Jeopardize the Trophic Carrying Capacity and Functioning of Estuarine Ecosystems. Ecosystems, Springer Verlag, 2019, 22 (3), pp.473-495. ⟨10.1007/s10021-018-0282-9⟩. ⟨hal-02154192⟩
  • Marine Ballutaud, Hilaire Drouineau, Laure Carassou, Gregory Munoz, Xavier Chevillot, et al.. EStimating Contaminants tRansfers Over Complex food webs (ESCROC): An innovative Bayesian method for estimating POP's biomagnification in aquatic food webs. Science of the Total Environment, Elsevier, 2019, 658, pp.638-659. ⟨10.1016/j.scitotenv.2018.12.0580048-9697⟩. ⟨hal-02608305⟩
  • Nils Teichert, Mario Lepage, Jérémy Lobry. Beyond classic ecological assessment: The use of functional indices to indicate fish assemblages sensitivity to human disturbance in estuaries. Science of the Total Environment, Elsevier, 2018, 639, pp.465-475. ⟨10.1016/j.scitotenv.2018.05.179⟩. ⟨hal-02607510⟩
  • Nils Teichert, Laure Carassou, Yohan Sahraoui, Jérémy Lobry, Mario Lepage. Influence of intertidal seascape on the functional structure of fish assemblages: Implications for habitat conservation in estuarine ecosystems. Aquatic Conservation: Marine and Freshwater Ecosystems, Wiley, 2018, 28 (4), pp.798-809. ⟨10.1002/aqc.2914⟩. ⟨halshs-03169433⟩
  • Nils Teichert, Laure Carassou, Yohan Sahraoui, Jérémy Lobry, Mario Lepage. Influence of intertidal seascape on the functional structure of fish assemblages: Implications for habitat conservation in estuarine ecosystems. Aquatic Conservation: Marine and Freshwater Ecosystems, Wiley, 2018, 28 (4), pp.798-809. ⟨10.1002/aqc.2914⟩. ⟨hal-02607511⟩
  • A. Lechêne, Philippe Boët, P. Laffaille, Jérémy Lobry. Nekton communities of tidally restored marshes: A whole-estuary approach. Estuarine, Coastal and Shelf Science, Elsevier, 2018, 207 (31), pp.368-382. ⟨10.1016/j.ecss.2017.08.038⟩. ⟨hal-02606996⟩
  • A. Lechêne, Jérémy Lobry, Philippe Boët, P. Laffaille. Change in fish functional diversity and assembly rules in the course of tidal marsh restoration. PLoS ONE, Public Library of Science, 2018, 13 (12), pp.e0209025. ⟨10.1371/journal.pone.0209025⟩. ⟨hal-02074291⟩
  • Nils Teichert, Mario Lepage, X. Chevillot, Jérémy Lobry. Environmental drivers of taxonomic, functional and phylogenetic diversity (alpha, beta and gamma components) in estuarine fish communities. Journal of Biogeography, Wiley, 2018, 45 (2), pp.406-417. ⟨10.1111/jbi.13133⟩. ⟨hal-02607012⟩
  • F. Massiot Granier, Géraldine Lassalle, P.R. Almeida, M. Aprahamian, M. Castonguay, et al.. A generic method to assess species exploratory potential under climate change. Ecological Indicators, Elsevier, 2018, 90, pp.615-623. ⟨10.1016/j.ecolind.2018.03.047⟩. ⟨hal-02607496⟩
  • Gabriel Munoz, Hélène Budzinski, Marc Babut, Hilaire Drouineau, Mathilde Lauzent, et al.. Evidence for the Trophic Transfer of Perfluoroalkylated Substances in a Temperate Macrotidal Estuary. Environmental Science and Technology, American Chemical Society, 2017, 51 (15), pp.8450-8459. ⟨10.1021/acs.est.7b02399⟩. ⟨hal-02067250⟩
  • Orlane Anneville, C. Vogel, Jérémy Lobry, Jean Guillard. Fish communities in the Anthropocene: detecting drivers of changes in the deep peri-alpine Lake Geneva. Inland Waters, Taylor & Francis, 2017, 7 (1), pp.65-76. ⟨10.1080/20442041.2017.1294350⟩. ⟨hal-02606314⟩
  • Hilaire Drouineau, Jérémy Lobry, Nicolas Bez, M. Travers Trolet, Youen Vermard, et al.. L'halieutique ou l'exploitation des ressources vivantes aquatiques : une science protéiforme. Subaqua, 2017, pp.28-29. ⟨hal-02606150⟩
  • X. Chevillot, Hilaire Drouineau, Patrick Lambert, Laure Carassou, B. Sautour, et al.. How does climate change make fish late for dinner?. Environmental Science Journal for Teens, 2017, pp.5. ⟨hal-02607235⟩
  • X. Chevillot, Hilaire Drouineau, Patrick Lambert, Laure Carassou, B. Sautour, et al.. Toward a phenological mismatch in estuarine pelagic food web?. PLoS ONE, Public Library of Science, 2017, 12 (3), pp.e0173752. ⟨10.1371/journal.pone.0173752⟩. ⟨hal-01541495⟩
  • Aurélie Chaalali, Grégory Beaugrand, Virginie Raybaud, Géraldine Lassalle, Blanche Saint-Béat, et al.. From species distributions to ecosystem structure and function: A methodological perspective. Ecological Modelling, Elsevier, 2016, 334, pp.78-90. ⟨10.1016/j.ecolmodel.2016.04.022⟩. ⟨hal-01318422⟩
  • Samuele Tecchio, Aurélie Chaalali, Aurore Raoux, Armonie Tous Rius, Justine Lequesne, et al.. Evaluating ecosystem-level anthropogenic impacts in a stressed transitional environment: The case of the Seine estuary. Ecological Indicators, Elsevier, 2016, 61 (2), pp.833-845. ⟨10.1016/j.ecolind.2015.10.036⟩. ⟨hal-01483254⟩
  • J. Selleslagh, A. Echard, C. Pecheyran, M. Baudrimont, Jérémy Lobry, et al.. Can analysis of Platichthys flesus otoliths provide relevant data on historical metal pollution in estuaries? Experimental and in situ approaches. Sci. Total Environ., 2016, 557-558, pp.20--30. ⟨10.1016/j.scitotenv.2016.03.014⟩. ⟨hal-01495766⟩
  • V. David, J. Selleslagh, A. Nowaczyk, S. Dubois, G. Bachelet, et al.. Estuarine habitats structure zooplankton communities: Implications for the pelagic trophic pathways. Estuarine, Coastal and Shelf Science, Elsevier, 2016, 179, pp.99-111. ⟨10.1016/j.ecss.2016.01.022⟩. ⟨hal-02604791⟩
  • Hilaire Drouineau, Jérémy Lobry, N. Bez, M. Travers Trolet, Y. Vermard, et al.. The need for a protean fisheries science to address the degradation of exploited aquatic ecosystems. Aquatic Living Resources, EDP Sciences, 2016, 29 (2), 20 p. ⟨10.1051/alr/2016021⟩. ⟨hal-01394122⟩
  • X. Chevillot, M. Pierre, A. Rigaud, Hilaire Drouineau, A. Chaalali, et al.. Abrupt shifts in the Gironde fish community: an indicator of ecological changes in an estuarine ecosystem. Marine Ecology Progress Series, Inter Research, 2016, 549, pp.137-151. ⟨10.3354/meps11681⟩. ⟨hal-01411213⟩
  • Zacharie de Grève, Patrick Dular, Gérard Meunier, Christophe Geuzaine, Olivier Deblecker, et al.. Subproblem finite-element refinement of homogenized dielectric layers in wound inductors for accurate local stresses computation. IEEE Transactions on Magnetics, Institute of Electrical and Electronics Engineers, 2015, 51 (3), pp.DOI10.1109/TMAG.2014.2364331. ⟨hal-01298587⟩
  • Aurélie Chaalali, Blanche Saint-Béat, Géraldine Lassalle, François Le Loc’h, Samuele Tecchio, et al.. A new modeling approach to define marine ecosystems food-web status with uncertainty assessment. Progress in Oceanography, Elsevier, 2015, 135, pp.37-47. ⟨10.1016/j.pocean.2015.03.012⟩. ⟨hal-01158158⟩
  • Samuele Tecchio, Armonie Tous Rius, Jean-Claude Dauvin, Jérémy Lobry, Géraldine Lassalle, et al.. The mosaic of habitats of the Seine estuary: Insights from food-web modelling and network analysis. Ecological Modelling, Elsevier, 2015, 312, pp.91-101. ⟨10.1016/j.ecolmodel.2015.05.026⟩. ⟨hal-02154211⟩
  • Valérie Samedy, M. Wach, Jérémy Lobry, Jonathan Selleslagh, Maud Pierre, et al.. Hydroacoustics as a relevant tool to monitor fish dynamics in large estuaries. Fisheries Research, Elsevier, 2015, 172, pp.225-233. ⟨10.1016/j.fishres.2015.07.025⟩. ⟨hal-02560897⟩
  • Jérémy Lobry. Les poissons de l’estuaire de la Gironde : 30 ans de changements, et maintenant ?. Adour Garonne, 2015, pp.20-21. ⟨hal-02602031⟩
  • J. Selleslagh, H. Blanchet, G. Bachelet, Jérémy Lobry. Feeding Habitats, Connectivity and Origin of Organic MatterSupporting Fish Populations in an Estuary with a ReducedIntertidal Area Assessed by Stable Isotope Analysis. Estuaries and Coasts, Springer Verlag, 2015, 38, pp.1431-1447. ⟨10.1007/s12237-014-9911-5⟩. ⟨hal-02601670⟩
  • Vanessa Guesnet, Géraldine Lassalle, Aurélie Chaalali, Kelly Kearney, Blanche Saint-Béat, et al.. Incorporating food-web parameter uncertainty into Ecopath-derived ecological network indicators. Ecological Modelling, Elsevier, 2015, 313, pp.29-40. ⟨10.1016/j.ecolmodel.2015.05.036⟩. ⟨hal-01186765⟩
  • N. Niquil, A. Baeta, J.C. Marques, A. Chaalali, Jérémy Lobry, et al.. Reaction of an estuarine food web to disturbance: Lindeman's perspective. Marine Ecology Progress Series, 2014, 512, pp.141--154. ⟨10.3354/meps10885⟩. ⟨hal-02454840⟩
  • N. Niquil, A. Baeta, J.C. Marques, A. Chaalali, Jérémy Lobry, et al.. Reaction of an estuarine food web to disturbance: Lindeman’s perspective. Marine Ecology Progress Series, Inter Research, 2014, 512, pp.141-154. ⟨hal-02602265⟩
  • Géraldine Lassalle, Jérémy Lobry, François Le Loc’h, S. Mackinson, F. Sanchez, et al.. Ecosystem status and functioning: Searching for rules of thumb using an intersite comparison of food-web models of Northeast Atlantic continental shelves. ICES Journal of Marine Science, Oxford University Press (OUP), 2013, 70 (1), pp.135--149. ⟨10.1093/icesjms/fss168⟩. ⟨hal-02454848⟩
  • S. Pasquaud, A. Courrat, V.F. Fonseca, R. Gamito, C.I. Gonçalves, et al.. Strength and time lag of relationships between human pressures and fish-based metrics used to assess ecological quality of estuarine systems. Estuarine, Coastal and Shelf Science, Elsevier, 2013, 134, pp.119-127. ⟨hal-02599074⟩
  • A. Tableau, Hilaire Drouineau, C. Delpech, M. Pierre, Jérémy Lobry, et al.. A fish-based index of estuarine ecological quality incorporating information from both scientific fish survey and experts knowledge. Ecological Indicators, Elsevier, 2013, 32, p. 147 - p. 156. ⟨10.1016/j.ecolind.2013.03.030⟩. ⟨hal-00824755⟩
  • J. Selleslagh, Jérémy Lobry, Jean-Michel Brylinski, Rachid Amara, Philippe Boët. Trophic functioning of coastal ecosystems along an anthropogenic pressure gradient: A French case study with emphasis on a small and low impacted estuary. Estuarine, Coastal and Shelf Science, Elsevier, 2012, 112, pp.73-85. ⟨10.1016/j.ecss.2011.08.004⟩. ⟨hal-00760872⟩
  • J. Selleslagh, Jérémy Lobry, A.R. N'Zigou, G. Bachelet, H. Blanchet, et al.. Seasonal succession of estuarine fish, shrimps, macrozoobenthos and plankton: physico-chemical and trophic influence. The ironde estuary as a case study. Estuarine, Coastal and Shelf Science, Elsevier, 2012, 112, pp.243-254. ⟨10.1016/j.ecss.2012.07.030⟩. ⟨hal-02597393⟩
  • S. Pasquaud, M. Béguer, M. H. Larsen, A. Chaalali, Henrique Cabral, et al.. Increase of marine juvenile fish abundances in the middle Gironde estuary related to warmer and more saline waters, due to global changes. Estuarine, Coastal and Shelf Science, Elsevier, 2012, 104-105, pp.46-53. ⟨10.1016/j.ecss.2012.03.021⟩. ⟨hal-02597096⟩
  • Géraldine Lassalle, Didier Gascuel, François Le Loc’h, Jérémy Lobry, Gj. Pierce, et al.. An ecosystem approach for the assessment of fisheries impacts on marine top predators: the Bay of Biscay case study. ICES Journal of Marine Science, Oxford University Press (OUP), 2012, 69 (6), pp.925-938. ⟨10.1093/icesjms/fss049⟩. ⟨hal-00840402⟩
  • Hilaire Drouineau, Jérémy Lobry, C. Delpech, M. Bouchoucha, S. Mahévas, et al.. A Bayesian framework to objectively combine metrics when developing stressor specific multimetric indicator. Ecological Indicators, Elsevier, 2012, 13 (1), p. 314 - p. 321. ⟨10.1016/j.ecolind.2011.06.029⟩. ⟨hal-00654282⟩
  • Didier Gascuel, Nicolas Bez, André Forest, Patrice Guillotreau, Francis Laloe, et al.. A future for marine fisheries in Europe (Manifesto of the Association Francaise d'Halieumetrie). Fisheries Research, Elsevier, 2011, 109 (1), pp.6. ⟨10.1016/j.fishres.2011.02.002⟩. ⟨hal-00730149⟩
  • Gilles Lassalle, Jérémy Lobry, F. Le Loc'H, P. Bustamante, G. Certain, et al.. Lower trophic levels and detrital biomass control the Bay of Biscay continental shelf food web: Implications for ecosystem management. Progress in Oceanography, Elsevier, 2011, 91 (4), pp.561-575. ⟨hal-02596643⟩
  • Géraldine Lassalle, Jérémy Lobry, François Le Loc’h, Paco Bustamante, Grégoire Certain, et al.. Lower trophic levels and detrital biomass control the Bay of Biscay continental shelf food web: Implications for ecosystem management. Progress in Oceanography, Elsevier, 2011, 91 (4), pp.561-575. ⟨10.1016/j.pocean.2011.09.002⟩. ⟨hal-00683349⟩
  • D. Nicolas, A. Chaalali, Hilaire Drouineau, Jérémy Lobry, A. Uriarte, et al.. Impact of global warming on European tidal estuaries: some evidence of northward migration of estuarine fish species. Regional Environmental Change, Springer Verlag, 2011, 11 (3), pp.639-649. ⟨10.1007/s10113-010-0196-3⟩. ⟨hal-02596093⟩
  • D. Nicolas, Jérémy Lobry, Olivier Le Pape, Philippe Boët. Functional diversity in European estuaries: Relating the composition of fish assemblages to the abiotic environment. Estuarine, Coastal and Shelf Science, Elsevier, 2010, 88 (3), p. 329 - p. 338. ⟨10.1016/j.ecss.2010.04.010⟩. ⟨hal-00584043⟩
  • Z. de Grève, C. Versèle, Jérémy Lobry. Gyroscopic magnetic levitation: an original design procedure based on the finite element method. European Physical Journal: Applied Physics, EDP Sciences, 2010, 52 (2), ⟨10.1051/epjap/2010080⟩. ⟨hal-00634371⟩
  • C. Delpech, A. Courrat, S. Pasquaud, Jérémy Lobry, Olivier Le Pape, et al.. Development of a fish-based index to assess the ecological quality of transitional waters: The case of French estuaries. Marine Pollution Bulletin, Elsevier, 2010, 60 (6), p. 908 - p. 918. ⟨10.1016/j.marpolbul.2010.01.001⟩. ⟨hal-00584047⟩
  • S. Pasquaud, V. David, Jérémy Lobry, Michel Girardin, B. Sautour, et al.. Exploitation of trophic resources by fish under stressful estuarine conditions. Marine Ecology Progress Series, Inter Research, 2010, 400, p. 207 - p. 219. ⟨hal-00474342⟩
  • S. Pasquaud, Jérémy Lobry. Regard critique sur la mise en place d'indicateurs d'évaluation de l'efficacité des aires marines protégées. Sciences Eaux & Territoires, INRAE, 2010, p. 122 - p. 125. ⟨10.14758/SET-REVUE.2010.3.23⟩. ⟨hal-00553052⟩
  • D. Nicolas, Jérémy Lobry, Mario Lepage, B. Sautour, Olivier Le Pape, et al.. Fish under influence: a macroecological analysis of relations between fish species richness and environmental gradients among European tidal estuaries. Estuarine, Coastal and Shelf Science, Elsevier, 2010, 86 (1), p. 137 - p. 147. ⟨10.1016/j.ecss.2009.11.006⟩. ⟨hal-00474505⟩
  • Marie Hermant, Jérémy Lobry, Sylvain Bonhommeau, Jean Charles Poulard, Olivier Le Pape. Impact of warming on abundance and occurrence of flatfish populations in the Bay of Biscay (France). Journal of Sea Research (JSR), Elsevier, 2010, 64 (1-2), pp.45-53. ⟨10.1016/j.seares.2009.07.001⟩. ⟨hal-00494573⟩
  • A. Brind'Amour, Jérémy Lobry. Assessment of the ecological status of coastal areas and estuaries in France, using multiple fish-based indicators: a comparative analysis on the Vilaine estuary. Aquatic Living Resources, EDP Sciences, 2009, 22, p. 559 - p. 572. ⟨10.1051/alr/2009052⟩. ⟨hal-00585653⟩
  • A. Courrat, Jérémy Lobry, D. Nicolas, P. Laffargue, Rachid Amara, et al.. Anthropogenic disturbance on nursery function of estuarine areas for marine species. Estuarine, Coastal and Shelf Science, Elsevier, 2009, 81 (81), pp.179-190. ⟨10.1016/j.ecss.2008.10.017⟩. ⟨hal-00480403⟩
  • S. Rochette, Jérémy Lobry, Mario Lepage, Philippe Boët. Dealing with uncertainly in qualitative models with a semi-quantitative approach based on simulations: applications to the Gironde estuarine food web (France). Ecological Modelling, Elsevier, 2009, 220 (2), pp.122-132. ⟨hal-02592907⟩
  • Jérémy Lobry, V. David, S. Pasquaud, Mario Lepage, B. Sautour, et al.. From detritus to man: diversity and stability of an estuarine trophic network. Marine Ecology Progress Series, Inter Research, 2008, 358, pp.13-25. ⟨10.3354/meps07294⟩. ⟨hal-02590036⟩
  • S. Pasquaud, Jérémy Lobry, Pierre Elie. Facing the necessity of describing estuarine ecosystems: a review of food web ecology study techniques. Hydrobiologia, Springer, 2007, 588, pp.159-172. ⟨hal-02588755⟩
  • Jérémy Lobry, Mario Lepage, Michel Girardin. L'échantillonnage de la diversité piscicole en estuaires : stratégie et représentativité dans le contexte de la Directive cadre européenne sur l'eau. Ingénieries eau-agriculture-territoires, Lavoisier ; IRSTEA ; CEMAGREF, 2006, p. 3 - p. 14. ⟨hal-00601100⟩
  • Jérémy Lobry, Mario Lepage, Eric Rochard. From seasonal patterns to a reference situation in an estuarine environment: Example of the small fish and shrimp fauna of the Gironde estuary (SW France). Estuarine, Coastal and Shelf Science, Elsevier, 2006, 70 (1-2), pp.239-250. ⟨hal-02588349⟩
  • Jérémy Lobry, L. Mourand, Eric Rochard, Pierre Elie. Structure of the Gironde estuarine fish assemblages: a comparison of European estuaries perspective. Aquatic Living Resources, EDP Sciences, 2003, 16 (2), pp.47-58. ⟨10.1016/S0990-7440(03)00031-7⟩. ⟨hal-02581413⟩
  • Jérémy Lobry, Eric Rochard, Pierre Elie. Les cortèges ichtyologiques de l'estuaire de la Gironde. Réflexion sur l'établissement d'une situation de référence en vue d'identifier les perturbations. Journal de Recherche Océanographique., 2003, 28 (1 et 2), pp.76-80. ⟨hal-02583638⟩
  • Jérémy Lobry, Didier Gascuel, F. Domain. La biodiversité spécifique des ressources démersales du plateau continental guinéen : utilisation d'indices classiques pour un diagnostic sur l'évolution de l'écosystème. Aquatic Living Resources, EDP Sciences, 2003, 16 (2), pp.59-68. ⟨10.1016/S0990-7440(03)00010-X⟩. ⟨hal-02581414⟩

Conference papers21 documents

  • Marine Lemaire, Jean Guillard, Orlane Anneville, Jérémy Lobry. Major biomass fluctuations in lake food webs – An example in the peri-alpine Lake Annecy. Joint Conference of the European Large Lakes Symposium (ELLS) / Conference of the International-Association-for-Great-Lakes-Research (IAGLR) - Big Lakes - Small World, 2019, Evian, France. pp.798-812, ⟨10.1016/j.jglr.2020.04.007⟩. ⟨hal-03151915⟩
  • S. Cauvy Fraunie, Verena Trenkel, H. Capra, J.M. Olivier, A. Maire, et al.. What drives the interannual variability in fish-population time series?. International Long Term Ecological Research Network & LTER-France (Zones Ateliers Network & Critical Zone Observatories) joint conference, Oct 2017, Nantes, France. pp.15. ⟨hal-02606638⟩
  • S. Cauvy Fraunie, H. Capra, J.M. Olivier, Martin Daufresne, Jérémy Lobry, et al.. What drives the interannual variability in fish-population time series?. SEFS 10: Symposium of European Freshwater Sciences, Jul 2017, Olomouc, Czech Republic. pp.1. ⟨hal-02609335⟩
  • A. Lechêne, Philippe Boët, P. Laffaille, Jérémy Lobry. Habitat value of tidally restored marshes for fish and macrocrustaceans: feedback from two study cases in the Gironde estuary. Estuarine restoration: from theory to practice and back, ECSA symposium, Jul 2016, Anvers, Belgium. pp.30. ⟨hal-02605029⟩
  • Jérémy Lobry. La marinisation de l'estuaire de la Gironde. Ecosystèmes aquatiques : quelles évolutions dans un contexte de changement climatique ?, Jun 2015, Toulouse, France. pp.7-10. ⟨hal-02602264⟩
  • A. Chaalali, G. Beaugrand, M. Chifflet, V. Raybaud, Géraldine Lassalle, et al.. Climate-driven changes’ incidence on the food-web status of the Bay of Biscay: a focus on dominant fish species. ISOBAY 14, XIV International Symposium on Oceanography of the Bay of Biscay, Jun 2014, Bordeaux, France. pp.17. ⟨hal-02604895⟩
  • F. Fauvel, A. Just, V. Marieu, A. Sottolichio, Jérémy Lobry. Towards the evaluation of ecological consequences of hydromorphological evolutions of the Gironde estuary: A preliminary approach combining GIS and hydrodynamics modelling. ECSA 50, Jun 2012, Venise, Italy. pp.14. ⟨hal-02597280⟩
  • S. Pasquaud, A. Courrat, Jérémy Lobry, Mario Lepage, C.I. Gonçalves, et al.. Cause-effect relationships strength and time lag in response to human pressures of metrics used to assess ecological quality of estuarine systems based on fish assemblages. ELET Estuarine and Lagoon Ecosystem Trajectories, ECSA Symposium, Oct 2011, Bordeaux, France. ⟨hal-02596312⟩
  • Jérémy Lobry, J. Selleslagh, H. Blanchet, N. Niquil. Structural vs functional approaches: A first comparison between WFD indicators and Ecological Network Analysis indices on French estuaries. ECSA 47 Symposium, Sep 2010, Figueira da Foz, Portugal. pp.22. ⟨hal-02594568⟩
  • J. Selleslagh, Jérémy Lobry, R. Amara, J.M. Brylinski, V. Cornille, et al.. Trophic model of the Canche estuary, a small estuary of the eastern English Channel: a comparison with other French coastal systems. ECSA 47 Symposium, Sep 2010, Figueira da fos, Portugal. pp.16. ⟨hal-02594569⟩
  • D. Nicolas, Jérémy Lobry, Philippe Boët. Fish under influence? A large-scale functional analysis of relations between abiotic gradients and fish assemblages of European tidal estuaries. ECSA 47 symposium, Sep 2010, Figueira da Foz, Portugal. pp.1. ⟨hal-02594060⟩
  • Hilaire Drouineau, Jérémy Lobry, C. Delpech, M. Bouchoucha, Stéphanie Mahévas, et al.. Assessing contamination levels in transitional waters using fish-based core metrics: an original approach based on Bayesian framework. ECSA Symposium 47, Sep 2010, Figueira da Foz, Portugal. pp.11. ⟨hal-02594116⟩
  • Hilaire Drouineau, Jérémy Lobry, C. Delpech, M. Bouchoucha, Stéphanie Mahévas, et al.. Assessing contamination levels in transitional waters using fish-based core metrics: an original approach based on Bayesian framework. ICES Annual Science Conference, Sep 2010, Nantes, France. pp.12. ⟨hal-02594115⟩
  • Michel Girardin, R. Amara, Mario Lepage, Philippe Boët, Jérémy Lobry, et al.. Développement d'un indicateur poisson pour les eaux de transition : APR Liteau2 2005. Colloque Liteau. Science et gouvernance en appui au développement durable du littoral, Dec 2009, Montpellier, France. pp.9. ⟨hal-02596103⟩
  • Mario Lepage, R. Amara, Philippe Boët, A. Courrat, C. Delpech, et al.. Présentation de l'indicateur poisson dans les estuaires : Travail collaboratif réalisé dans le cadre de LITEAU II. Séminaire de lancement du projet Liteau III BEEST « Vers une approche multicritère du Bon Etat / potentiel écologique des grands ESTuaires Seine, Loire et Gironde », Nov 2009, Paris, France. pp.24. ⟨hal-02594418⟩
  • A. Courrat, Jérémy Lobry, P. Laffargue, Mario Lepage, Michel Girardin, et al.. Indicateurs ichtyologiques pour le suivi de la fonctionnalité de nourricerie des masses d'eau de transition / xénobiotiques dans le cadre de la DCE. Impact des organismes pathogènes et des micropolluants sur l'état de santé des poissons, mollusques et crustacés des milieux naturels : de l'individu au peuplement, Mar 2008, Nantes, France. pp.20. ⟨hal-02593126⟩
  • Mario Lepage, A. Courrat, Jérémy Lobry, Olivier Le Pape, C. Delpech, et al.. Développement d'un indicateur poisson pour les eaux de transition : Définitions d'états de référence par type de MET. Séminaire Aquaref « Les approches hydrobiologiques pour la DCE et le continuum eaux douces- eaux littorales », Jun 2008, Paris, France. pp.10. ⟨hal-02594420⟩
  • C. Delpech, Mario Lepage, S. Pasquaud, A. Courrat, D. Nicolas, et al.. Etat d'avancement des travaux sur l'indicateur poisson. Séminaire Aquaref « Les approches hydrobiologiques pour la DCE et le continuum eaux douces- eaux littorales », Jun 2008, Paris, France. pp.19. ⟨hal-02594421⟩
  • D. Nicolas, Jérémy Lobry, Mario Lepage, B. Sautour, Olivier Le Pape, et al.. Toward a macroscopic analysis of European tidal estuaries fish assemblages patterns. ECSA 44 symposium, Sep 2008, Bahia Blanca, Argentina. pp.41. ⟨hal-02594061⟩
  • Jérémy Lobry, V. David, S. Pasquaud, B. Sautour, Eric Rochard. Detritus, fish and men...: The Gironde estuarine trophic structure. Changes in land uses: consequences on estuaries and coastal zones, ECSA, 38th symposium, Rouen, 13-17 september 2004, 2004, pp.2. ⟨hal-02583640⟩
  • Jérémy Lobry, Eric Rochard, Pierre Elie. Approche de la dynamique des assemblages ichtyologiques dans l'estuaire de la Gironde. 2èmes rencontres de l'ichtyologie en France, Paris, 25-28 mars 2003, 2003, France. pp.1. ⟨hal-02581310⟩

Poster communications3 documents

  • Jérémy Lobry, V. Guesnet, Géraldine Lassalle, A. Chaalali, J. Selleslagh, et al.. Structural vs functional approaches: A first comparison between water framework directive indicators and ENA indices on European estuaries. Ecopath 30 years conference, Nov 2014, Barcelona, Portugal. 2014. ⟨hal-02600797⟩
  • X. Chevillot, A. Rigaud, Hilaire Drouineau, A. Chaalali, Jérémy Lobry, et al.. Les petits pélagiques dans l'estuaire de la Gironde : 30 ans de suivi d'abondance face à 30 ans de changements globaux. Exploitation et conservation des écosystèmes aquatiques : une question d'échelle, Jun 2013, Bordeaux, France. pp.1, 2013. ⟨hal-02600367⟩
  • Michel Girardin, Mario Lepage, Philippe Boët, S. Pasquaud, D. Nicolas, et al.. Développement d'un indicateur poisson pour les eaux de transition : Liteau2 2005-2008. Colloque Liteau. Science et gouvernance en appui au développement durable du littoral, Dec 2009, Montpellier, France. pp.1, 2009. ⟨hal-02593075⟩

Books1 document

  • Jérémy Lobry, Mario Lepage, J. Dublon, A. Lechêne, E. Feunteun, et al.. Stratégie d'observation à long terme : guide pour le suivi de l'ichtyofaune dans l'estuaire de la Seine. GIP Seine aval, pp.19, 2013. ⟨hal-02605500⟩

Book sections2 documents

  • Nathalie Caill-Milly, Gilles Morandeau, Iker Castege, Florence Sanchez, Muriel Lissardy, et al.. Les ressources exploitées par la pêche et la conchyliculture. Hervé Le Treut. Acclimaterra. Anticiper les changements climatiques en Nouvelle-Aquitaine. Rapport synthétique, Editions Région Nouvelle-Aquitaine, pp.249-279, 2018, 978-2-9564516-0-0. ⟨hal-02292267⟩
  • Jérémy Lobry. Bordeaux, bientôt port de mer ?. Changement climatique, changement global : 55 résultats de recherche au service des territoires, Irstea, pp.94-95, 2015. ⟨hal-02602542⟩

Other publications3 documents

  • Didier Gascuel, N. Bez, P. Guillotreau, F. Laloe, Jérémy Lobry, et al.. Un avenir pour les pêches maritimes en Europe. 2011, 10 p. ⟨hal-00841899⟩
  • Jérémy Lobry, Eric Rochard, Pierre Elie. Les communautés de poissons et l'organisation trophique de l'estuaire de la Gironde. Système fluvio-estuarien de la Gironde, 2005, pp.11-13. ⟨hal-02587277⟩
  • Jérémy Lobry, Eric Rochard. The Gironde estuary: a European reference for fish population?. River basin management: from experience to implementation, 2003, pp.63-77. ⟨hal-02583637⟩

Reports16 documents

  • Maud Pierre, Jérémy Lobry. Surveillance halieutique de l'estuaire de la Gironde - Etude de la faune circulante 2020. Rapport pour EDF CNPE du Blayais. [Rapport de recherche] INRAE; SEANEO; EDF. 2021. ⟨hal-03180792⟩
  • Jérémy Lobry, Gérard Castelnaud, M. Pierre. Surveillance halieutique de l'estuaire de la Gironde : suivi des captures 2015, étude de la faune circulante 2015. [Rapport de recherche] irstea. 2016, pp.241. ⟨hal-02607184⟩
  • Jérémy Lobry, Gérard Castelnaud. Surveillance halieutique de l'estuaire de la Gironde : suivi des captures 2014, étude de la faune circulante 2014. [Rapport de recherche] irstea. 2015, pp.238. ⟨hal-02604611⟩
  • Michel Girardin, Gérard Castelnaud, Jérémy Lobry. Surveillance halieutique de l'estuaire de la Gironde : suivi des captures 2013, étude de la faune circulante 2013. [Rapport de recherche] irstea. 2014, pp.238. ⟨hal-02602613⟩
  • Philippe Boët, G. Bocquené, Gabrielle Bouleau, H. Etchebert, V. Foussard, et al.. Synthèse du projet BEEST. [Rapport de recherche] irstea. 2011, pp.100. ⟨hal-02599542⟩
  • Gabrielle Bouleau, V. Foussard, C. Leveque, Jérémy Lobry, S. Moussard, et al.. Le bon potentiel des estuaires : conclusions et perspectives du projet BEEST. [Rapport de recherche] irstea. 2011, pp.20. ⟨hal-02599578⟩
  • A. Just, Jérémy Lobry. Réalisation de l'outil cartographique des habitats potentiels sur l'estuaire de la Gironde : rapport. [Rapport de recherche] irstea. 2011, pp.67. ⟨hal-02597057⟩
  • N. Bacq, S. Moussard, Jérémy Lobry. Cartographier les fonctionnalités pour spatialiser le potentiel écologique : mise en place d'un outil SIG Habitats fonctionnels sur les estuaires de la Seine, de la Loire et de la Gironde : rapport. [Rapport de recherche] irstea. 2011, pp.26. ⟨hal-02597454⟩
  • Mario Lepage, Philippe Boët, Pierre Elie, R. Amara, Olivier Le Pape, et al.. Développement d'un indicateur poisson pour les estuaires français. Indice anatomo-morphologique et parasitaire pour l'évaluation de l'état de santé des poissons. [Rapport de recherche] irstea. 2009, pp.263. ⟨hal-02592732⟩
  • Mario Lepage, R. Amara, Philippe Boët, A. Courrat, C. Delpech, et al.. Développement d'un indicateur poisson pour les eaux de transition : programme LITEAU2 2005. [Rapport de recherche] irstea. 2009, pp.75. ⟨hal-02592841⟩
  • A. Courrat, Jérémy Lobry, D. Nicolas, C. Delpech, S. Pasquaud, et al.. Indicateurs ichtyologiques pour l'état des masses d'eau de transition dans le cadre de la DCE : méthodologie. [Rapport de recherche] irstea. 2008, pp.17. ⟨hal-02593097⟩
  • S. Pasquaud, Michel Girardin, Mario Lepage, Philippe Boët, Pierre Elie, et al.. L'estuaire de la Gironde : présentation du système et des données disponibles. [Rapport de recherche] irstea. 2008, pp.18. ⟨hal-02593113⟩
  • Mario Lepage, Michel Girardin, Jérémy Lobry, M. Joanny. Méthode de classification pour la typologie des eaux côtières et de transition sur les côtes françaises de l'Atlantique et de la Manche : Document réalisé pour le Groupe de Travail National "DCE Eaux Littorales". irstea. 2004, pp.30. ⟨hal-02605607⟩
  • Mario Lepage, Jérémy Lobry, Michel Girardin, Paul Gonthier. Structure des assemblages ichtyologiques dans les milieux de transition de type estuarien : contribution à la caractérisation de l'état écologique à partir du cas de la Gironde - Année 2004 : typologie, échantillonnage et suivi. irstea. 2004, pp.93. ⟨hal-02584129⟩
  • Jérémy Lobry, Mario Lepage, Michel Girardin, Paul Gonthier. Contribution à la caractérisation de l'état écologique de masses d'eaux de transition de type " estuaire " à partir du cas de la Gironde : Structure des assemblages ichtyologiques dans les milieux de type estuarien. irstea. 2004, pp.15. ⟨hal-02605603⟩
  • Jérémy Lobry, Paul Gonthier, Pierre Elie, Eric Rochard. Contribution à la caractérisation de l'état écologique de masses d'eaux de transition de type " estuaire "à partir du cas de la Gironde. irstea. 2003, pp.22. ⟨hal-02581715⟩

typdoc_CREPORT1 document

  • Nathalie Caill-Milly, Gilles Morandeau, Iker Castege, Florence Sanchez, Muriel Lissardy, et al.. Les ressources exploitées par la pêche et la conchyliculture. 2018. ⟨hal-02785823⟩

Theses1 document

  • Jérémy Lobry. Quel référentiel de fonctionnement pour les écosystèmes estuariens ? Le cas des cortèges de poissons fréquentant l'estuaire de la Gironde. Sciences de l'environnement. Doctorat Océanographie, Université de Bordeaux I, 2004. Français. ⟨tel-02584128⟩

Habilitation à diriger des recherches1 document

  • Jérémy Lobry. Biodiversité et Fonctionnement écologique dans les écosystèmes estuariens : vers des indicateurs fonctionnels des changements globaux. Sciences de l'environnement. HDR Écologie évolutive, fonctionnelle et des communautés, Université de Bordeaux, 2016. ⟨tel-02604940⟩

Lectures1 document

  • Jérémy Lobry, Eric Rochard, T. Datry, Christian Chauvin, Marion Gosselin. MOOC Biodiversité continentale : rivières et forêts. France. 2015. ⟨hal-02601549⟩