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149 résultats
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Generations of Sequencing Technologies: From First to Next Generation

Kchouk Mehdi , Jean-Francois Gibrat , Mourad Elloumi
Electromagnetic Biology and Medicine, 2017, 9 (3), 8 p. ⟨10.4172/0974-8369.1000395⟩
Article dans une revue hal-02621960v1
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Insyght: Using symbols to visualize homologies, conserved syntenies and genomic insertions across multiple genomes

Thomas Lacroix , Valentin Loux , Annie Gendrault-Jacquemard Gendrault , Mark M. Hoebeke , Jean-François Gibrat
JOBIM 2013 - Journées Ouvertes en Biologie, Informatique et Mathématiques, Jul 2013, Toulouse, France. Société Française de Bio-Informatique -SFBI, pp.231, 2013, JOBIM TOULOUSE 2013 RÉSUMÉS COURS (affiches) - Volume 2/2
Poster de conférence hal-02748920v1
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IGO, Integration from Genomes to Organisms

Sandra S. Derozier , Helene H. Chiapello , Thomas Lacroix , Cyprien Guerin Guérin , Valentin Loux , et al.
JOBIM 2013, Jul 2013, Toulouse, France. , pp.246, 2013, JOBIM TOULOUSE 2013 - RÉSUMÉS COURTS (affiches)
Poster de conférence hal-02746442v1

Web services for microbial genome annotation using data integration

Célia Michotey , Ludovic Legrand , Helene H. Chiapello , Valentin Loux , Annie A. Gendrault-Jacquemard , et al.
JOBIM 2010 : Journées Ouvertes en Biologie, Informatique et Mathématiques, Sep 2010, Montpellier, France
Communication dans un congrès hal-02752226v1
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CompaGB: An open framework for genome browsers comparison

Thomas Lacroix , Valentin Loux , Annie Gendrault-Jacquemard Gendrault , Jean-François Gibrat , Hélène Chiapello
BMC Research Notes, 2011, 4, pp.133. ⟨10.1186/1756-0500-4-133⟩
Article dans une revue hal-02644023v1

Automatic modelling of olfactory receptor 3D structures and classification of odor - receptor affinities

Stéphane Téletchéa , Serigne Fallou Wade , Antoine Marin , Jean-François Gibrat , Edith Pajot , et al.
52. Annual Meeting Biophysical Society, Feb 2008, Long Beach, United States
Communication dans un congrès hal-02752770v1

Stratégies permettant d'assigner une fonction in silico aux séquences protéiques issues de projets de génomique

Jean-François Gibrat , Antoine Marin
La génomique en biologie végétale, INRA Editions, 2004, Science Update, 2-7380-1167-5
Chapitre d'ouvrage hal-02833608v1
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AGMIAL: an annotation platform for microbial genomes

Jean-François Gibrat
WDD12, Xi’an, Apr 2012, Xian, China. 46 p
Communication dans un congrès hal-02802934v1

Influence of the local amino acid sequence upon the zones of the torsional angles and adopted by residues in proteins

Jean-François Gibrat , B. Robson , J. Garnier
Biochemistry, 1991, 30, pp.1578-1586
Article dans une revue hal-02703530v1

GOR method for predicting protein secondary structure from amino acid sequence

Jean Garnier , Jean-François Gibrat , Barry Robson
Methods in Enzymology, pp.540-553, 1996, ⟨10.1016/S0076-6879(96)66034-0⟩
Chapitre d'ouvrage hal-03328018v1

Local protein threading by Mixed Integer Programming

Guillaume Collet , Rumen Andonov , Jean-François Gibrat , Nicola Yanev
Discrete Applied Mathematics, 2011, 159 (16), pp.1707-1716. ⟨10.1016/j.dam.2010.05.024⟩
Article dans une revue inria-00536537v1

Complete genome sequence of the probiotic Lactobacillus casei strain BL23

Alain Mazé , Grégory Boël , Manuel Zùniga , Alexa Bourand , Valentin Loux , et al.
Journal of Bacteriology, 2010, 192 (10), pp.2647-2648. ⟨10.1128/JB.00076-10⟩
Article dans une revue hal-01204245v1

Evaluation of genome assembly software based on long reads

Laurent Bouri , Dominique Lavenier , Jean-Francois J.-F. Gibrat , Victoria Fabia Dominguez del Angel
[Research Report] France Genomique. 2017
Rapport hal-01481801v1

A 3D model of human P450c21: study of the putative effects of steroid 21-hydroxylase gene mutations

Etienne Mornet , Jean-François Gibrat
Human Genetics, 2000, 106, pp.330-339
Article dans une revue hal-02699191v1
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Recent Advances in Solving the Protein Threading Problem

Rumen Andonov , Guillaume Collet , Jean-François Gibrat , Antoine Marin , Vincent Poirriez , et al.
[Research Report] PI 1856, 2007, pp.38
Rapport inria-00170619v1
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The complete genome of Propionibacterium freudenreichii CIRM-BIA1T, a Hardy actinobacterium with food and probiotic applications

Hélène Falentin , Stéphanie-Marie Deutsch , Gwénaël Jan , Valentin Loux , Anne Thierry , et al.
PLoS ONE, 2010, 5 (7), pp.1-12. ⟨10.1371/journal.pone.0011748⟩
Article dans une revue hal-01204238v1
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E-Biothon: an experimental platform for BioInformatics

Michel Daydé , Benjamin Depardon , Alain Franc , Jean-François Gibrat , Romaric Guillier , et al.
International Conference on Computer Science and Information Technologies, Sep 2015, Yerevan, Armenia. ⟨10.1109/CSITechnol.2015.7358239⟩
Communication dans un congrès hal-01207320v1

What does your tongue smell ?

Edith Pajot-Augy , Marie-Annick Persuy , Jean-Jacques Rémy , Jean-François Gibrat , Roland Salesse
16. Annual Meeting of the European Chemoreception Research Organization (ECRO 2004), Sep 2004, Dijon, France
Communication dans un congrès hal-02760184v1

Secondary structure prediction : combination of three different methods

Valérie Biou , Jean-François Gibrat , Jonathan Levin , B. Robson , J. Garnier
Protein Engineering, 1988, 2 (3), pp.185-191
Article dans une revue hal-02720080v1

GOR method for predicting protein secondary structure from amino acid sequence

J. Garnier , Jean-François Gibrat , B. Robson
Computer methods for macromolecular sequence analysis, 266, Academic Press, 1996, Methods in Enzymology, 0-12-182167-6
Chapitre d'ouvrage hal-02841791v1
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Mapping reads on a genomic sequence: an algorithmic overview and a practical comparative analysis

Sophie S. Schbath , Veronique V. Martin , Matthias Zytnicki , Julien Fayolle , Valentin Loux , et al.
Journal of Computational Biology, 2012, 19 (6), pp.796-813. ⟨10.1089/cmb.2012.0022⟩
Article dans une revue hal-02645697v1
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AGMIAL an annotation platform for microbial genomes

Jean-François Gibrat
congrès Bethesda NCI NIH, Feb 2008, Bethesda, United States. 68p
Communication dans un congrès hal-02815543v1
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Bovine promoter annotation platform for the identification of transcription factor binding sites in genes involved in early pregnancy

Magalie Leveugle , Valentin Loux , Jean-François Gibrat
JOBIM 2010 : Journées Ouvertes en Biologie, Informatique et Mathématiques, Sep 2010, Montpellier, France. MABLI : Methods Algorithmes Bio-Informatique LIRMM, pp.176, 2010, proceeding of JOBIM 2010 Montpellier
Poster de conférence hal-02757163v1

FROST: A filter-based fold recognition method

Jean-François Gibrat , Antoine Marin , Joël Pothier , Karel Zimmermann , Jean-François Gibrat
Proteins: Structure, Function, and Genetics, 2002, 49 (4), pp.493-509. ⟨10.1002/prot.10231⟩
Article dans une revue istex hal-03328019v1
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Représentation systémique multi-échelle des processus biologiques de la bactérie

Vincent Henry , Arnaud Ferré , Christine Froidevaux , Anne Goelzer , Vincent Fromion , et al.
IC201: 27es Journées francophones d'Ingénierie des Connaissances, Jun 2016, Montpellier, France
Communication dans un congrès hal-02741418v1

Linking health and administrative data for maternal, child and young adult health

Anita Burgun , Dina V Oksen , Wolfgang Kuchinke , Hans-Ulrich Prokosch , Thomas Ganslandt , et al.
9. European Public Health Conference, Nov 2016, Vienne, Austria. ⟨10.1093/eurpub/ckw168.038⟩
Communication dans un congrès hal-01861720v1
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Proposal for a European Public Health Research Infrastructure for Sharing of health and Medical administrative data (PHRIMA).

Anita Burgun , Dina V Oksen , Wolfgang Kuchinke , Hans-Ulrich Prokosch , Thomas Ganslandt , et al.
Studies in Health Technology and Informatics, 2015, 216, pp.1005. ⟨10.3233/978-1-61499-564-7-1005⟩
Article dans une revue hal-01232643v1
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Insyght: navigating amongst abundant homologues, syntenies and gene functional annotations in bacteria, it's that symbol!

Thomas Lacroix , Valentin Loux , Annie Gendrault , Mark Hoebeke , Jean-François Gibrat
Nucleic Acids Research, 2014, 42 (21), pp.e162. ⟨10.1093/nar/gku867⟩
Article dans une revue hal-01332638v1

Mammalian olfactory receptors: Molecular mechanisms of odorant detection, 3D-modeling, and structure–activity relationships

Marie-Annick Persuy , Guenhaël Sanz , Anne Tromelin , Thierry Thomas-Danguin , Jean-Francois Gibrat , et al.
Molecular basis of olfaction, 130, Chapter 1 - Molecular Basis of Olfaction, Academic Press, 131 p., 2015, Progress in Molecular Biology and Translational Science, 978-0-12-802912-1. ⟨10.1016/bs.pmbts.2014.11.001⟩
Chapitre d'ouvrage hal-01249030v1

Genomic diversity of 24 Propionibacterium freudenreichii 1 strains

Hélène Falentin , Valentin Loux , Valérie Barbe , Amal Plaudet Hammani , Stéphanie-Marie Deutsch , et al.
6 Conference on Functional Genomics of Gram-positive Microorganisms 16 International Conference on Bacilli, Jun 2011, Montecatini, Italy
Communication dans un congrès hal-01454328v1