Recherche - Archive ouverte HAL Accéder directement au contenu

Filtrer vos résultats

38 résultats

RegulBASS : Un programme intégré de la tolérance au jeûne chez le bar (Dicentrarchus labrax)

B. Guinand , D. Mckenzie , E. Desmarais , Jean-Christophe Avarre , K. Belkhir , et al.
Colloque FRB : Les Ressources Génétiques (RG) face aux nouveaux enjeux environnementaux, économiques et sociétaux, Sep 2011, Montpellier, France. pp.Poster
Communication dans un congrès hal-01019786v1

Development of twelve novel polymorphic microsatellite DNA markers for the Boeseman’s rainbowfish (Melanotaenia boesemani) and tests for their cross-utility in 21 rainbowfish species from West Papua (Indonesia)

Media Fitri Isma Nugraha , Laurent Pouyaud , Odang Carman , Ph.D Kadarusman , Utut Widyastuti , et al.
European Journal of Wildlife Research, 2014, 60 (6), pp.941-946. ⟨10.1007/s10344-014-0868-2⟩
Article dans une revue hal-02924523v1
Image document

DNA Barcoding Indonesian freshwater fishes: challenges and prospects

Nicolas Hubert , Ph.D Kadarusman , Arif Wibowo , Frédéric Busson , Domenico Caruso , et al.
DNA Barcodes, 2015, 3 (1), pp.144-169. ⟨10.1515/dna-2015-0018⟩
Article dans une revue hal-01958706v1
Image document

Editorial: Molecular Tracing of Aquatic Viruses: Where Epidemiology Needs to Meet Genomics

Jean-Christophe Avarre
Frontiers in Microbiology, 2017, 8, ⟨10.3389/fmicb.2017.01498⟩
Article dans une revue hal-02921323v1
Image document

Eight new species of Rainbowfishes (Melanotaeniidae) from the Birds Head Region, West Papua, Indonesia

Media Fitri Isma Nugraha , K Kadarusman , Nicolas Hubert , Jean-Christophe Avarre , Renny Kurnia Hadiaty , et al.
Cybium : Revue Internationale d’Ichtyologie, 2015, 39 (2), pp.99-130. ⟨10.26028/cybium/2015-392-003⟩
Article dans une revue hal-01959344v1
Image document

Innovative integrated system for real-time measurement of hybridization and melting on standard format microarrays

Yann Marcy , Pierre-Yves Cousin , Maxime Rattier , Gordana Cerovic , Guilhem Escalier , et al.
Biotechniques, 2008, 44, pp.913-920. ⟨10.2144/000112758⟩
Article dans une revue hal-00814717v1
Image document

Ethnobotanical Uses and Antimicrobial Properties of Plants in Small-Scale Tropical Fish Farms : The Case of Indonesian Fish Farmers in Java (Indonesia)

Samira Sarter , Domenico Caruso , Angela Maria Lusiastuti , Taukhid Taukhid , Jean-Christophe Avarre , et al.
Journal of the World Aquaculture Society, 2017, 48 (1), pp.83-92. ⟨10.1111/jwas.12345⟩
Article dans une revue hal-01939093v1
Image document

Phylogeography of infectious disease: genetic diversity and connectivity of the Ostreid herpesvirus 1 population in France

Jean Delmotte , Camille Pelletier , Benjamin Morga , Richard Galinier , Bruno Petton , et al.
2021
Pré-publication, Document de travail hal-03217723v1
Image document

Plasticity of gene expression according to salinity in the testis of broodstock and F1 black-chinned tilapia, Sarotherodon melanotheron heudelotii

Jean-Christophe Avarre , Bruno Guinand , Rémi Dugué , Jacky Cosson , Marc Legendre , et al.
PeerJ, 2014, 2, ⟨10.7717/peerj.702⟩
Article dans une revue hal-01922667v1
Image document

Le saut d'espèce : quand un virus animal engendre l'émergence d'une maladie humaine

Jean-Christophe Avarre , A.S. Gosselin-Grenet (dir.)
2020, en ligne [4 p.]
Autre publication scientifique hal-03000390v1
Image document

An ancient truncated duplication of the anti‐Müllerian hormone receptor type 2 gene is a potential conserved master sex determinant in the Pangasiidae catfish family

Ming Wen , Qiaowei Pan , Elodie Jouanno , Jérôme Montfort , Margot Zahm , et al.
Molecular Ecology Resources, 2022, pp.1-18. ⟨10.1111/1755-0998.13620⟩
Article dans une revue hal-03652234v1
Image document

Resting Cyst Distribution and Molecular Identification of the Harmful Dinoflagellate Margalefidinium polykrikoides (Gymnodiniales, Dinophyceae) in Lampung Bay, Sumatra, Indonesia

Hikmah Thoha , M. Muawanah , Mariana D. Bayu Intan , Arief Rachman , Oksto Ridho Sianturi , et al.
Frontiers in Microbiology, 2019, 10, pp.306. ⟨10.3389/fmicb.2019.00306⟩
Article dans une revue hal-02921394v1
Image document

Aquaculture at the crossroads of global warming and antimicrobial resistance

Miriam Reverter , Samira Sarter , Domenico Caruso , Jean-Christophe Avarre , Marine Combe , et al.
Nature Communications, 2020, 11, pp.1870. ⟨10.1038/s41467-020-15735-6⟩
Article dans une revue hal-02556840v1
Image document

Genetic Diversity of Boeseman's Rainbowfish ( Melanotaenia Boesemani ) Reared in Indonesian Farms Compared to Endangered Natural Populations

Media Fitri Isma Nugraha , Laurent Pouyaud , Odang Carman , Utut Widyastuti , Muhammad Zairin Junior , et al.
Tropical Conservation Science, 2015, 8 (3), pp.796-812. ⟨10.1177/194008291500800315⟩
Article dans une revue hal-02922337v1
Image document

Development of an attenuated vaccine against Koi Herpesvirus Disease (KHVD) suitable for oral administration and immersion

Sandro Klafack , Lars Schröder , Yeonhwa Jin , Matthias Lenk , Pei-Yu Lee , et al.
NPJ vaccines, 2022, 7 (1), pp.106. ⟨10.1038/s41541-022-00525-6⟩
Article dans une revue hal-03949406v1

Development of an HRM-based tool for the automated identification of nucleotide sequences in large datasets

Jean-Christophe Avarre , Matthieu Vignoles , Mathieu Laffont , Lise Grewis , Christelle Reynes
Biomolecular Detection and Quantification, 2017, 11, pp.S22
Article dans une revue hal-03109406v1
Image document

Neglected viral diseases in freshwater fish farming

Olga Haenen , L. Bigarré , Takafumi Ito , Jean-Christophe Avarre , Niccoló Vendramin
Bulletin of the European Association of Fish Pathologists, 2018, 38 (3), pp.105-115
Article dans une revue hal-02922463v1

Legumes Symbioses: Absence of Nod Genes in Photosynthetic Bradyrhizobia

Eric Giraud , Lionel Moulin , David Vallenet , Valérie Barbe , Eddie Cytryn , et al.
Science, 2007, 316, pp.1307 - 1312. ⟨10.1126/science.1139548⟩
Article dans une revue halsde-00151340v1
Image document

Antimicrobial properties against Aeromonas hydrophila and immunostimulant effect on Clarias gariepinus of Piper betle, Psidium guajava, and Tithonia diversifolia plants

Nunak Nafiqoh , S. Sukenda , Muhammad Zairin Junior , A. Alimuddin , Angela Maria Lusiastuti , et al.
Aquaculture International, 2020, 28 (1), pp.1-13. ⟨10.1007/s10499-019-00439-6⟩
Article dans une revue hal-02921646v1
Image document

Genetic Diversity and Connectivity of the Ostreid Herpesvirus 1 Populations in France: A First Attempt to Phylogeographic Inference for a Marine Mollusc Disease

Jean Delmotte , Camille Pelletier , Benjamin Morga , Richard Galinier , Bruno Petton , et al.
Virus Evolution, 2022, 8 (1), pp.veac039. ⟨10.1093/ve/veac039⟩
Article dans une revue hal-03652456v1
Image document

Next-generation sequencing: a revolution in the field of fish diseases

Jean-Christophe Avarre
Bulletin of the European Association of Fish Pathologists, 2020, 40 (2), pp.62-69
Article dans une revue hal-02922349v1
Image document

Rapid detection and identification of nontuberculous mycobacterial pathogens in fish by using high-resolution melting analysis

Thu Nguyet Phung , Domenico Caruso , S. Godreuil , N. Keck , T. Vallaeys , et al.
Applied and Environmental Microbiology, 2013, 79 (24), pp.7837-7845. ⟨10.1128/AEM.00822-13⟩
Article dans une revue ird-00940286v1

Osmoregulatory strategies in natural populations of the black-chinned tilapia Sarotherodon melanotheron exposed to extreme salinities in West African estuaries

Catherine Lorin-Nebel , Jean-Christophe Avarre , Nicolas Faivre , Sophie Wallon , Guy Charmantier , et al.
Journal of Comparative Physiology B, 2012, 182 (6), pp.771-780. ⟨10.1007/s00360-012-0657-8⟩
Article dans une revue istex hal-02924103v1
Image document

Structural variation turnovers and defective genomes: key drivers for the in vitro evolution of the large double-stranded DNA koi herpesvirus (KHV)

Nurul Novelia Fuandila , Anne-Sophie Gosselin-Grenet , Marie-Ka Tilak , Sven M Bergmann , Jean-Michel Escoubas , et al.
Peer Community Journal, 2022, ⟨10.24072/pcjournal.154⟩
Article dans une revue hal-03895944v1
Image document

Molecular tracing of viral diseases in aquaculture

S. S. Mikkelsen , L. Bigarré , Jørgen Bang-Jensen , Anja Bråthen Kristoffersen , P. A. Jansen , et al.
Bulletin of the European Association of Fish Pathologists, 2016, 36 (1), pp.46-51
Article dans une revue hal-02921413v1

Investigation of Cyprinid herpesvirus-3 genetic diversity by a multi-locus variable number of tandem repeats analysis

Jean-Christophe Avarre , Jean-Paul Madeira , Ayi Santika , Zakki Zainun , Marine Baud , et al.
Journal of Virological Methods, 2011, 173 (2), pp.320-327. ⟨10.1016/j.jviromet.2011.03.002⟩
Article dans une revue istex hal-02923907v1
Image document

Tolérance et intolérance au jeûne chez un téléostéen, le bar ([i]Dicentrarchus labrax[/i]) : bases physiologiques moléculaires et détection de polymorphismes par approches génomiques haut-débit

Erick Desmarais , Catherine Breton , Jean-Christophe Avarre , Khalid Belkhir , Alain Vergnet , et al.
Colloque de Génomique Environnementale et Fonctionnelle, Nov 2013, Rennes, France
Communication dans un congrès hal-01019595v1
Image document

Potret Profil Manajemen Hatcherypada Pembudidaya Ikan Pelangi Melanotaenia boesemani(Allen & Cross, 1980) di Kawasan Jakarta

Media Fitri Isma Nugraha , Jean-Christophe Avarre , Laurent Pouyaud , Kadarusman Kadarusman , Odang Carman , et al.
TORANI: Journal of Fisheries and Marine Science, 2018, 1 (2), pp.81-92. ⟨10.35911/torani.v1i2.4484⟩
Article dans une revue hal-03131535v1

Le niébé, une alternative pour la souveraineté alimentaire des pays d'Afrique subsaharienne ?

Jean-Christophe Avarre , Antoine Le Quéré , Mouhamadou Moussa Diangar , Moustapha Guèye
The Conversation France, 2022, en ligne
Article dans une revue hal-04048265v1
Image document

Contribution of Next-Generation Sequencing to Aquatic and Fish Virology

Andriniaina Andy Nkili-Meyong , Laurent Bigarré , Ingrid Labouba , Tatiana Vallaeys , Jean-Christophe Avarre , et al.
Intervirology, 2016, 59 (5-6), pp.285-300. ⟨10.1159/000477808⟩
Article dans une revue hal-02922791v1