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Jean-Charles LEPLE

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Présentation

Jean-Charles LEPLÉ Adresse professionnelle : INRA, UMR 1202 Biodiversité Gènes & Communautés 69 route d'Arcachon 33610 CESTAS – France tel: +33 (0) 05 35 38 53 78 email: jean-charles.leple@inrae.fr Diplômes : 1990-1993 Thèse de Doctorat de l'Université d'Orléans effectuée à la Station d'Amélioration des Arbres Forestiers du Centre INRA d'Orléans. Titre :"Transformation génétique de peupliers hybrides par Agrobacterium tumefaciens. Application à la résistance aux insectes". Directeur de thèse : Dr. Francis DELMOTTE, professeur à l'Université d'Orléans. Thèse soutenue le 22/01/93 à l'Université d'Orléans. 1989 DEA de Biophysicochimie et Biologie Moléculaires et Cellulaires effectué au Centre de Biophysique Moléculaire, Département de Biochimie des Glycoconjugués et Lectines Endogènes, CNRS, Orléans. Titre :"Polysaccharides de parois de cellules de peuplier : extraction, caractérisation et leur implication dans l'attachement d'Agrobacterium tumefaciens". Responsable de stage : Prof. Francis DELMOTTE. 1986-1987 Licence et Maîtrise de Biochimie (Université d'Orléans) 1983-1985 DEUG CG2 (Université d'Orléans) 1982 Baccalauréat C (Périgueux, Dordogne) Activités de recherches 2019 -- Nommé CRHC à l’UMR Biogeco, INRA Centre de Bordeaux, site de Pierroton 2017 à 2019 Nommé CR1 à l’UMR Biogeco, INRA Centre de Bordeaux, site de Pierroton 1999 - 2017 Nommé CR1 à l’UR0588 AGPF, INRA Centre Val de Loire, site d’Ardon Novembre 1995 Nommé CR2 à l’INRA Centre d’Orléans 1994-1995 Stage Post-Doctoral effectué au Laboratoire de Génétique de l'Université de Gand (Belgique). Projet de recherche : Clonage de la CCR (Cinnamoyl CoA réductase, EC 1.2.1.44.) de peuplier - introduction de gènes antisens de CCR chez le peuplier avec pour objectif la modification du contenu en lignine dans les peupliers transgéniques. Directeur : Prof. Marc VAN MONTAGU Superviseurs : Dr. Dirk INZE, Dr. Wout BOERJAN 1993-1994 Stage Post-Doctoral effectué au Laboratoire de Génétique de l'Université de Gand (Belgique). Projet de recherche: Clonage et caractérisation d'un gène de laccase chez le peuplier. Directeur : Prof. Marc VAN MONTAGU Superviseur : Dr. Dirk INZE Activités d'enseignement 1983-1990 Employé de l’Éducation Nationale sur des postes de Maître d'Externat et Maître d'Internat. 1990-1991 Travaux Pratiques (50 heures) effectués à la Station d'Amélioration des Arbres Forestiers du Centre INRA d'Orléans. Travaux Dirigés (25 heures) pour la formation de Licence de Biochimie délivrée à l'Université d'Orléans (enseignant du CNAM). Co-encadrement de nombreux étudiants de maîtrise, de DEA et de Thèse lors de mon travail de thèse et de mes stages Post-Doctoraux, participation 2012-2014 Cours de « Functional Genomics of wood formation » dans le cadre du Master BIOVIGPA (UE02 et UE11) Principales collaborations internationales \- Collaboration pour le projet d’annotation du génome du peuplier (Jamboree 2004) \- Collaboration France Japon : Mission éffectuée du 31 Mars au 10 Avril 2006 dans le cadre de notre collaboration avec Dr. Ara Yoshinaga (Université de Kyoto) – Centres d’intérets : lignification et formation du bois de tension chez le peuplier \- Collaboration avec Dr. W. Boerjan (Institut de Biotechnologies des Flandres, Université de Gand, Belgique) pour la mise au champ de lignées de peupliers transgéniques modifiés pour l’expression de gènes de la lignification (1993 - actuelle) \- Collaboration pour le projet d’annotation du génome du chêne pédonculé (Jamboree 2016)

Publications

isabelle-lesur-kupin
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Oak genome reveals facets of long lifespan

Christophe Plomion , Jean-Marc Aury , Joelle Amselem , Thibault Leroy , Florent Murat
Nature Plants, 2018, 4 (7), pp.440-452. ⟨10.1038/s41477-018-0172-3⟩
Article dans une revue hal-01820559v1

Implication of the suberin pathway in adaptation to waterlogging and hypertrophied lenticels formation in pedunculate oak (Quercus robur L.)

Grégoire Le Provost , Isabelle Lesur Kupin , Céline Lalanne , Corinne da Silva , Karine Labadie
Tree Physiology, 2016, 36 (11), pp.1330-1342. ⟨10.1093/treephys/tpw056⟩
Article dans une revue hal-01602423v1

Decoding the oak genome: public release of sequence data, assembly, annotation and publication strategies.

Christophe Plomion , Jean-Marc Aury , Joëlle Amselem , Tina Alaeitabar , Valérie Barbe
Molecular Ecology Resources, 2015, 16 (1), pp.254-265. ⟨10.1111/1755-0998.12425⟩
Article dans une revue hal-01579667v1

A unigene set for European beech (Fagus sylvatica L.) and its use to decipher the molecular mechanisms involved in dormancy regulation

Isabelle Lesur Kupin Lesur , Alison Bechade , Céline C. Lalanne , Christophe C. Klopp , Céline Noirot
Molecular Ecology Resources, 2015, 15 (5), pp.1192-1204. ⟨10.1111/1755-0998.12373⟩
Article dans une revue hal-02640346v1
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The oak gene expression atlas: insights into Fagaceae genome evolution and the discovery of genes regulated during bud dormancy release

Isabelle Lesur , Grégoire G. Le Provost , Pascal Bento , Corinne da Silva , Jean-Charles Leplé
BMC Genomics, 2015, 16 (1), pp.112. ⟨10.1186/s12864-015-1331-9⟩
Article dans une revue hal-02285504v1
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An integrated information system dedicated to oak genomics and genetics

Joëlle Amselem , Nicolas Francillonne , Célia Michotey , Thomas Letellier , Jean-Marc Aury
PAG XXVI Plant and Animal Genome Conference, Jan 2018, San Diego, United States. pp.27 slides
Communication dans un congrès hal-01839185v1

Annotation of the oak genome sequence and associated bioinformatic resources

Joelle J. Amselem , Jean Marc Aury , Nicolas Francillonne , Tina Alaeitabar , Corinne da Silva
IUFRO Genomics and Forest Tree Genetics, Institut National de Recherche Agronomique (INRA). UMR Biodiversité, Gènes et Communautés (1202)., May 2016, Arcachon, France. 134 p
Communication dans un congrès hal-02741128v1