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Jean-Charles LEPLE

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Présentation

Jean-Charles LEPLÉ Adresse professionnelle : INRA, UMR 1202 Biodiversité Gènes & Communautés 69 route d'Arcachon 33610 CESTAS – France tel: +33 (0) 05 35 38 53 78 email: jean-charles.leple@inrae.fr Diplômes : 1990-1993 Thèse de Doctorat de l'Université d'Orléans effectuée à la Station d'Amélioration des Arbres Forestiers du Centre INRA d'Orléans. Titre :"Transformation génétique de peupliers hybrides par Agrobacterium tumefaciens. Application à la résistance aux insectes". Directeur de thèse : Dr. Francis DELMOTTE, professeur à l'Université d'Orléans. Thèse soutenue le 22/01/93 à l'Université d'Orléans. 1989 DEA de Biophysicochimie et Biologie Moléculaires et Cellulaires effectué au Centre de Biophysique Moléculaire, Département de Biochimie des Glycoconjugués et Lectines Endogènes, CNRS, Orléans. Titre :"Polysaccharides de parois de cellules de peuplier : extraction, caractérisation et leur implication dans l'attachement d'Agrobacterium tumefaciens". Responsable de stage : Prof. Francis DELMOTTE. 1986-1987 Licence et Maîtrise de Biochimie (Université d'Orléans) 1983-1985 DEUG CG2 (Université d'Orléans) 1982 Baccalauréat C (Périgueux, Dordogne) Activités de recherches 2019 -- Nommé CRHC à l’UMR Biogeco, INRA Centre de Bordeaux, site de Pierroton 2017 à 2019 Nommé CR1 à l’UMR Biogeco, INRA Centre de Bordeaux, site de Pierroton 1999 - 2017 Nommé CR1 à l’UR0588 AGPF, INRA Centre Val de Loire, site d’Ardon Novembre 1995 Nommé CR2 à l’INRA Centre d’Orléans 1994-1995 Stage Post-Doctoral effectué au Laboratoire de Génétique de l'Université de Gand (Belgique). Projet de recherche : Clonage de la CCR (Cinnamoyl CoA réductase, EC 1.2.1.44.) de peuplier - introduction de gènes antisens de CCR chez le peuplier avec pour objectif la modification du contenu en lignine dans les peupliers transgéniques. Directeur : Prof. Marc VAN MONTAGU Superviseurs : Dr. Dirk INZE, Dr. Wout BOERJAN 1993-1994 Stage Post-Doctoral effectué au Laboratoire de Génétique de l'Université de Gand (Belgique). Projet de recherche: Clonage et caractérisation d'un gène de laccase chez le peuplier. Directeur : Prof. Marc VAN MONTAGU Superviseur : Dr. Dirk INZE Activités d'enseignement 1983-1990 Employé de l’Éducation Nationale sur des postes de Maître d'Externat et Maître d'Internat. 1990-1991 Travaux Pratiques (50 heures) effectués à la Station d'Amélioration des Arbres Forestiers du Centre INRA d'Orléans. Travaux Dirigés (25 heures) pour la formation de Licence de Biochimie délivrée à l'Université d'Orléans (enseignant du CNAM). Co-encadrement de nombreux étudiants de maîtrise, de DEA et de Thèse lors de mon travail de thèse et de mes stages Post-Doctoraux, participation 2012-2014 Cours de « Functional Genomics of wood formation » dans le cadre du Master BIOVIGPA (UE02 et UE11) Principales collaborations internationales \- Collaboration pour le projet d’annotation du génome du peuplier (Jamboree 2004) \- Collaboration France Japon : Mission éffectuée du 31 Mars au 10 Avril 2006 dans le cadre de notre collaboration avec Dr. Ara Yoshinaga (Université de Kyoto) – Centres d’intérets : lignification et formation du bois de tension chez le peuplier \- Collaboration avec Dr. W. Boerjan (Institut de Biotechnologies des Flandres, Université de Gand, Belgique) pour la mise au champ de lignées de peupliers transgéniques modifiés pour l’expression de gènes de la lignification (1993 - actuelle) \- Collaboration pour le projet d’annotation du génome du chêne pédonculé (Jamboree 2016)

Publications

christophe-plomion
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Trade-offs and Trait Integration in Tree Phenotypes: Consequences for the Sustainable Use of Genetic Resources

Jose Climent , Ricardo Alía , Katri Karkkainen , Catherine Bastien , Marta Benito-Garzon
Current Forestry Reports, 2024, ⟨10.1007/s40725-024-00217-5⟩
Article dans une revue hal-04512732v1

Tracking population structure and phenology through time using ancient genomes from waterlogged white oak wood

Stefanie Wagner , Andaine Seguin-Orlando , Jean-Charles Leplé , Thibault Leroy , Céline Lalanne
Molecular Ecology, 2023, ⟨10.1111/mec.16859⟩
Article dans une revue hal-04158430v1
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Genome‐wide evolutionary response of European oaks during the Anthropocene

Dounia Saleh , Jun Chen , Jean-Charles Leplé , Thibault Leroy , Laura Truffaut
Evolution Letters, 2022, 6 (1), pp.4-20. ⟨10.1002/evl3.269⟩
Article dans une revue hal-03553889v1

The pulse of the tree is under genetic control: eucalyptus as a case study

J. Bartholomé , A. Mabiala , R. Burlett , Didier Bert , Jean-Charles Leplé
Plant Journal, 2020, pp.1-19. ⟨10.1111/tpj.14734⟩
Article dans une revue hal-02555321v1
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Oak genome reveals facets of long lifespan

Christophe Plomion , Jean-Marc Aury , Joelle Amselem , Thibault Leroy , Florent Murat
Nature Plants, 2018, 4 (7), pp.440-452. ⟨10.1038/s41477-018-0172-3⟩
Article dans une revue hal-01820559v1

Implication of the suberin pathway in adaptation to waterlogging and hypertrophied lenticels formation in pedunculate oak (Quercus robur L.)

Grégoire Le Provost , Isabelle Lesur Kupin , Céline Lalanne , Corinne da Silva , Karine Labadie
Tree Physiology, 2016, 36 (11), pp.1330-1342. ⟨10.1093/treephys/tpw056⟩
Article dans une revue hal-01602423v1
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Forest tree genomics: 10 achievements from the past 10 years and future prospects

Christophe Plomion , Catherine Bastien , Marie-Béatrice Bogeat-Triboulot , Laurent Bouffier , Annabelle Déjardin
Annals of Forest Science, 2016, 73 (1), pp.77-103. ⟨10.1007/s13595-015-0488-3⟩
Article dans une revue hal-01330031v1

Quantitative proteomic and phosphoproteomic approaches for deciphering the signaling pathway for tension wood formation in poplar

Mélanie Mauriat , Jean-Charles Leplé , Stéphane Claverol , Jérôme Bartholomé , Luc Négroni
Journal of Proteome Research, 2015, 14 (8), pp.3188-3203. ⟨10.1021/acs.jproteome.5b00140⟩
Article dans une revue hal-02640086v1

A unigene set for European beech (Fagus sylvatica L.) and its use to decipher the molecular mechanisms involved in dormancy regulation

Isabelle Lesur Kupin Lesur , Alison Bechade , Céline C. Lalanne , Christophe C. Klopp , Céline Noirot
Molecular Ecology Resources, 2015, 15 (5), pp.1192-1204. ⟨10.1111/1755-0998.12373⟩
Article dans une revue hal-02640346v1
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The oak gene expression atlas: insights into Fagaceae genome evolution and the discovery of genes regulated during bud dormancy release

Isabelle Lesur , Grégoire G. Le Provost , Pascal Bento , Corinne da Silva , Jean-Charles Leplé
BMC Genomics, 2015, 16 (1), pp.112. ⟨10.1186/s12864-015-1331-9⟩
Article dans une revue hal-02285504v1

Decoding the oak genome: public release of sequence data, assembly, annotation and publication strategies.

Christophe Plomion , Jean-Marc Aury , Joëlle Amselem , Tina Alaeitabar , Valérie Barbe
Molecular Ecology Resources, 2015, 16 (1), pp.254-265. ⟨10.1111/1755-0998.12425⟩
Article dans une revue hal-01579667v1
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Transcriptional profiling of bud dormancy induction and release in oak by next-generation sequencing

Saneyoshi Ueno , Christophe C. Klopp , Jean-Charles Leplé , Jérémy Derory , Céline Noirot
BMC Genomics, 2013, 14, 15 p. ⟨10.1186/1471-2164-14-236⟩
Article dans une revue hal-02650124v1

Les biotechnologies chez les arbres forestiers

Gilles G. Pilate , Marc Pâques , Jean-Charles Leplé , Christophe Plomion
Revue forestière française, 2002, 54 (2), pp.161-180
Article dans une revue hal-02677508v1
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Daily stem radial fluctuations in Eucalyptus reveals the dynamic of the genetic determinants of trees response to environment

Jérôme Bartholome , André Mabiala , Régis Burlett , Didier Bert , Jean-Charles Leplé
Managing eucalypt plantations under global changes; IUFRO 2.08.03 Improvement and culture of Eucalyptus, Sep 2018, Montpellier, France
Communication dans un congrès hal-02734817v1
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An integrated information system dedicated to oak genomics and genetics

Joëlle Amselem , Nicolas Francillonne , Célia Michotey , Thomas Letellier , Jean-Marc Aury
PAG XXVI Plant and Animal Genome Conference, Jan 2018, San Diego, United States. pp.27 slides
Communication dans un congrès hal-01839185v1

Annotation of the oak genome sequence and associated bioinformatic resources

Joelle J. Amselem , Jean Marc Aury , Nicolas Francillonne , Tina Alaeitabar , Corinne da Silva
IUFRO Genomics and Forest Tree Genetics, Institut National de Recherche Agronomique (INRA). UMR Biodiversité, Gènes et Communautés (1202)., May 2016, Arcachon, France. 134 p
Communication dans un congrès hal-02741128v1

Identification of genes involved in bud dormancy in sessile oak (Quercus petraea Matt. Liebl) using RNA-seq

Grégoire G. Le Provost , Ueno Saneyoshi , Christophe C. Klopp , Jean-Charles Leplé , Jérémy Derory
IUFRO working group “Genetics of Quercus and Nothofagus”, Institut National de Recherche Agronomique (INRA). UMR Biodiversité, Gènes et Communautés (1202)., Oct 2012, Bordeaux, France. 1 p
Communication dans un congrès hal-02809075v1
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POPSEC : molecular bases of acclimation to water deficit in poplar

Marie-Béatrice Bogeat-Triboulot , David Cohen , Didier Le Thiec , Sandrine Balzergue , Marie-Laure Martin-Magniette
Séminaire Génoplante, Mar 2010, Mallemort-en-Provence, France. 22 p
Communication dans un congrès hal-02823287v1
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POPSEC : molecular bases of acclimation to water deficit in poplar

Marie-Béatrice Bogeat-Triboulot , David Cohen , Didier Le Thiec , Sandrine Balzergue , Marie-Laure Martin-Magniette
3. symposium franco-suédois UPRA, Nov 2009, Champenoux, France. 26 p
Communication dans un congrès hal-02817980v1
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Integration of transcriptomic and proteomics approaches in characterizing short-term gravi-perception signaling networks in poplar wood.

Nicolas N. Richet , Mélanie Mauriat , Marie-Claude Lesage Descauses , Odile Rogier , Françoise F. Laurans
8. Plant Biomechanics International Conference PBM8, Nov 2015, Nagoya, Japan. Nagoya University, Proceedings of the Plant Biomechanics Conference, 253 p., 2015, 8th Plant Biomechanics International Conference
Poster de conférence hal-02744040v1

Molecular bases of acclimation and adaptation to water deficit in poplar

Marie-Béatrice Bogeat-Triboulot , Didier Le Thiec , David Cohen , Erwin Dreyer , Christophe Plomion
Séminaire Génoplante, Apr 2008, Arles, France. , 1 p., 2008
Poster de conférence hal-02822891v1