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Jean-Charles LEPLE

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Présentation

Jean-Charles LEPLÉ Adresse professionnelle : INRA, UMR 1202 Biodiversité Gènes & Communautés 69 route d'Arcachon 33610 CESTAS – France tel: +33 (0) 05 35 38 53 78 email: jean-charles.leple@inrae.fr Diplômes : 1990-1993 Thèse de Doctorat de l'Université d'Orléans effectuée à la Station d'Amélioration des Arbres Forestiers du Centre INRA d'Orléans. Titre :"Transformation génétique de peupliers hybrides par Agrobacterium tumefaciens. Application à la résistance aux insectes". Directeur de thèse : Dr. Francis DELMOTTE, professeur à l'Université d'Orléans. Thèse soutenue le 22/01/93 à l'Université d'Orléans. 1989 DEA de Biophysicochimie et Biologie Moléculaires et Cellulaires effectué au Centre de Biophysique Moléculaire, Département de Biochimie des Glycoconjugués et Lectines Endogènes, CNRS, Orléans. Titre :"Polysaccharides de parois de cellules de peuplier : extraction, caractérisation et leur implication dans l'attachement d'Agrobacterium tumefaciens". Responsable de stage : Prof. Francis DELMOTTE. 1986-1987 Licence et Maîtrise de Biochimie (Université d'Orléans) 1983-1985 DEUG CG2 (Université d'Orléans) 1982 Baccalauréat C (Périgueux, Dordogne) Activités de recherches 2019 -- Nommé CRHC à l’UMR Biogeco, INRA Centre de Bordeaux, site de Pierroton 2017 à 2019 Nommé CR1 à l’UMR Biogeco, INRA Centre de Bordeaux, site de Pierroton 1999 - 2017 Nommé CR1 à l’UR0588 AGPF, INRA Centre Val de Loire, site d’Ardon Novembre 1995 Nommé CR2 à l’INRA Centre d’Orléans 1994-1995 Stage Post-Doctoral effectué au Laboratoire de Génétique de l'Université de Gand (Belgique). Projet de recherche : Clonage de la CCR (Cinnamoyl CoA réductase, EC 1.2.1.44.) de peuplier - introduction de gènes antisens de CCR chez le peuplier avec pour objectif la modification du contenu en lignine dans les peupliers transgéniques. Directeur : Prof. Marc VAN MONTAGU Superviseurs : Dr. Dirk INZE, Dr. Wout BOERJAN 1993-1994 Stage Post-Doctoral effectué au Laboratoire de Génétique de l'Université de Gand (Belgique). Projet de recherche: Clonage et caractérisation d'un gène de laccase chez le peuplier. Directeur : Prof. Marc VAN MONTAGU Superviseur : Dr. Dirk INZE Activités d'enseignement 1983-1990 Employé de l’Éducation Nationale sur des postes de Maître d'Externat et Maître d'Internat. 1990-1991 Travaux Pratiques (50 heures) effectués à la Station d'Amélioration des Arbres Forestiers du Centre INRA d'Orléans. Travaux Dirigés (25 heures) pour la formation de Licence de Biochimie délivrée à l'Université d'Orléans (enseignant du CNAM). Co-encadrement de nombreux étudiants de maîtrise, de DEA et de Thèse lors de mon travail de thèse et de mes stages Post-Doctoraux, participation 2012-2014 Cours de « Functional Genomics of wood formation » dans le cadre du Master BIOVIGPA (UE02 et UE11) Principales collaborations internationales \- Collaboration pour le projet d’annotation du génome du peuplier (Jamboree 2004) \- Collaboration France Japon : Mission éffectuée du 31 Mars au 10 Avril 2006 dans le cadre de notre collaboration avec Dr. Ara Yoshinaga (Université de Kyoto) – Centres d’intérets : lignification et formation du bois de tension chez le peuplier \- Collaboration avec Dr. W. Boerjan (Institut de Biotechnologies des Flandres, Université de Gand, Belgique) pour la mise au champ de lignées de peupliers transgéniques modifiés pour l’expression de gènes de la lignification (1993 - actuelle) \- Collaboration pour le projet d’annotation du génome du chêne pédonculé (Jamboree 2016)

Publications

annabelle-dejardin

Non-cellulosic polysaccharide distribution during G-layer formation in poplar tension wood fibers: abundance of rhamnogalacturonan I and arabinogalactan proteins but no evidence of xyloglucan

Fernanda Trilstz Perassolo Guedes , Françoise Laurans , Bernard Quemener , Carole Antoine Assor , Véronique Laine-Prade
Planta, 2017, 246 (5), pp.857-878. ⟨10.1007/s00425-017-2737-1⟩
Article dans une revue hal-01603838v1
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Forest tree genomics: 10 achievements from the past 10 years and future prospects

Christophe Plomion , Catherine Bastien , Marie-Béatrice Bogeat-Triboulot , Laurent Bouffier , Annabelle Déjardin
Annals of Forest Science, 2016, 73 (1), pp.77-103. ⟨10.1007/s13595-015-0488-3⟩
Article dans une revue hal-01330031v1
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Expression analysis of LIM gene family in poplar, toward an updated phylogenetic classification.

Dominique Arnaud , Annabelle Déjardin , Jean-Charles Leplé , Marie-Claude Lesage-Descauses , Nathalie Boizot
BMC Research Notes, 2012, 5, pp.102. ⟨10.1186/1756-0500-5-102⟩
Article dans une revue hal-00721759v1
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Wood formation in Angiosperms

Annabelle Dejardin , Françoise F. Laurans , Dominique Arnaud , Christian Breton , Gilles G. Pilate
Comptes Rendus Biologies, 2010, 333 (4), pp.325-334. ⟨10.1016/j.crvi.2010.01.010⟩
Article dans une revue hal-02664282v1

Cloning and expression analysis of a wood-associated xylosidase gene (PtaBXL1) in poplar tension wood.

Raphael Decou , Sabine Lhernould , Françoise Laurans , Elodie Sulpice , Jean-Charles Leplé
Phytochemistry, 2009, 70 (2), pp.163-72. ⟨10.1016/j.phytochem.2008.12.019⟩
Article dans une revue hal-00696082v1
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Genome-wide analysis of LIM gene family in Populus trichocarpa, Arabidopsis thaliana and Oryza sativa

Dominique Arnaud , Annabelle Dejardin , Jean-Charles Leplé , Marie-Claude Lesage Descauses , Gilles G. Pilate
DNA Research, 2007, 14 (3), pp.1-14. ⟨10.1093/dnares/dsm013⟩
Article dans une revue hal-02666164v1

Physiologie de la formation des parois de fibres de bois

Françoise F. Laurans , Annabelle Dejardin , Jean-Charles Leplé , Gilles G. Pilate
Revue des composites et des matériaux avancés = Journal of Composite and Advanced Materials, 2006, 16 (1), pp.25-40
Article dans une revue hal-02665320v1

The genome of black cottonwood, Populus trichocarpa (Torr. & Gray)

Gerald A. Tuskan , Stephen Difazio , Stefan Jansson , Jörg Bohlmann , Igor Grigoriev
Science, 2006, 313 (5793), pp.1596-1604. ⟨10.1126/science.1128691⟩
Article dans une revue hal-02669155v1

Physiologie et génomique de la formation du bois

Jean-Charles Leplé , Annabelle Dejardin , Françoise F. Laurans , Gilles G. Pilate , Nadia Goué
Biofutur, 2004, 247, pp.43-48
Article dans une revue hal-02679521v1

Poplar genes encoding fasciclin-like arabinogalactan proteins are highly expressed in tension wood

Florian Lafarguette , Jean-Charles Leplé , Annabelle Dejardin , Françoise F. Laurans , Guy Costa
New Phytologist, 2004, 164 (1), pp.107-121. ⟨10.1111/j.1469-8137.2004.01175.x⟩
Article dans une revue hal-02682928v1

Transgénèse chez le peuplier : apport aux études sur la formation du bois

Gilles G. Pilate , Annabelle Dejardin , Daniel Cornu , Jean-Charles Leplé
Biofutur, 2004, 23 (247), pp.49-53
Article dans une revue hal-02681788v1

Tension wood as a model for functional genomics of wood formation

Gilles G. Pilate , Annabelle Dejardin , Françoise F. Laurans , Jean-Charles Leplé
New Phytologist, 2004, 164 (1), pp.63-72. ⟨10.1111/j.1469-8137.2004.01176.x⟩
Article dans une revue hal-02682383v1

Expressed Sequence Tags from Poplar Wood Tissues - A Comparative Analysis from Multiple Libraries

Annabelle Dejardin , Jean-Charles Leplé , Marie-Claude Lesage Descauses , Guy Costa , Gilles G. Pilate
Plant Biology, 2004, 6 (1), pp.55-64. ⟨10.1055/s-2003-44744⟩
Article dans une revue hal-02681152v1
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Characterization of a poplar GM tree with strong alterations in growth and wood anatomy: transgene expression level vs insertion site effects?

Miyuki Takeuchi , Fernanda Trilstz Perassolo Guedes , Françoise Laurans , Marie-Claude Lesage Descauses , Nathalie Boizot
IUFRO Tree Biotech 2017, Jun 2017, Concepcion, Chile
Communication dans un congrès hal-01605241v1

Changements biochimiques pendant la maturation des parois

Fernanda Guedes , Françoise Laurans , Bernard Quemener , Amra Secerovic , Carole Antoine Assor
Workshop final du projet ANR Blanc StressInTrees "Approches couplées physiologique et micro-mécanique de la génération des contraintes de maturation dans le bois de tension", Jun 2017, Orléans, France
Communication dans un congrès hal-01605687v1
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Effects of CTL2 down-regulation on tension wood formation in GM poplars

Marie-Claude Lesage Descauses , Veronique Laine-Prade , Françoise F. Laurans , Jean-Charles Leplé , Vincent Segura
14. Cell Wall Meeting, Jun 2016, Chania, Greece
Communication dans un congrès hal-02739267v1

Both ChIP-SEQ and in planta gene modification demonstrate the involvement of MYB090 and MYB156 in secondary cell wall formation in poplar

Wassim Lakhal , Nathalie Boizot , Marie-Claude Lesage Descauses , Odile Rogier , Véronique Laine-Prade
INUPRAG-Meeting 2015, Oct 2015, Nancy, France
Communication dans un congrès hal-01604786v1
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Evaluation of non-cellulosic polysaccharide distribution in differentiating and mature poplar tension wood fibres: abundance of rhamnogalacturonan I, presence of acetylated glucomannan and absence of xyloglucan in the G-layer

Fernanda Guedes , Françoise F. Laurans , Bernard Quemener , Carole Assor , Nathalie Boizot
8. Plant Biomechanics International Conference PBM8, Nov 2015, Nagoya, Japan
Communication dans un congrès hal-02742591v1
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β-Galactosidase : un rôle dans les couches G du bois de tension ?

Amra Secerovic , Fernanda Guedes , Marie-Claude Lesage Descauses , Nadège Millet , Veronique Laine-Prade
10. Congrès Réseau Français des Parois, Jul 2014, Amiens, France
Communication dans un congrès hal-02743954v1
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Peut-on évaluer le bois de tension par spectrométrie proche infrarouge ?

Vincent Segura , Kévin Ader , Marjolaine Martin , Moreau Alain , Jean-Charles Leplé
15. rencontres HélioSpir « Aux frontières du proche infrarouge », Oct 2014, Montpellier, France
Communication dans un congrès hal-01268808v1
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Searching for polysaccharides specific to tension wood fibers

Fernanda Guedes , Françoise F. Laurans , Carole Assor , Nathalie Boizot , Marie-Claude Lesage Descauses
7. Plant Biomechanics International Conference, Institut National de Recherche Agronomique (INRA). UMR UMR INRA / Univ. Clermont 2 : Physiologie Intégrée de l'Arbre Fruitier et Forestier (PIAF) (0547)., Aug 2012, Clermont-Ferrand, France
Communication dans un congrès hal-02746052v1
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POPSEC : molecular bases of acclimation to water deficit in poplar

Marie-Béatrice Bogeat-Triboulot , David Cohen , Didier Le Thiec , Sandrine Balzergue , Marie-Laure Martin-Magniette
Séminaire Génoplante, Mar 2010, Mallemort-en-Provence, France. 22 p
Communication dans un congrès hal-02823287v1
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Whole-genome transcriptomic analysis of xylem tissues for two poplar genotypes of contrasted tolerance to water deficit submitted to various drought conditions.

Jean-Charles Leplé , Philippe Label , Marie-Claude Lesage Descauses , Françoise F. Laurans , Didier Le Thiec
2nd Poplar Symposium From Genes to Function, Mar 2009, Göttingen, Germany. n.p
Communication dans un congrès hal-02816667v1
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POPSEC : molecular bases of acclimation to water deficit in poplar

Marie-Béatrice Bogeat-Triboulot , David Cohen , Didier Le Thiec , Sandrine Balzergue , Marie-Laure Martin-Magniette
3. symposium franco-suédois UPRA, Nov 2009, Champenoux, France. 26 p
Communication dans un congrès hal-02817980v1

Whole-genome transcriptomic analysis of xylem tissues for two poplar genotypes of contrasted tolerance to water deficit submitted to various drought conditions

Jean-Charles Leplé , Philippe Label , Marie-Claude Lesage Descauses , Françoise F. Laurans , Didier Le Thiec
2. Poplar symposium, Mar 2009, Göttingen, Germany. 1 p
Communication dans un congrès hal-02821989v1

Effects of water stress and rewatering during tension wood formation on xylem cell differentiation

Régis R. Fichot , Marie-Claude Lesage Descauses , Jean-Charles Leplé , Françoise F. Laurans , Moreau Alain
2009 IUFRO Tree Biotechnology Conference, Jun 2009, Whistler, BC, Canada
Communication dans un congrès hal-02751062v1

Identification of the in vivo DNA targets of transcription factors involved in tension wood formation

Annabelle Dejardin , Nathalie Boizot , Carole Latruwe , Martine Decoville , Jean-Charles Leplé
Workshop "Systems biology for plant design", Jul 2009, Wageningen, Netherlands
Communication dans un congrès hal-02756157v1

Genome-wide analysis of the fasciclin-like arabinogalactan (FLA) gene family in Populus trichocarpa and their expression profiling in tension wood

Jean-Charles Leplé , Marie-Claude Lesage Descauses , Estelle Fedirko , Régis R. Fichot , Nelly Desplat
Workshop "Systems biology for plant design", Jul 2009, Wageningen, Netherlands
Communication dans un congrès hal-02758206v1

Kinetic assessment of global gene expression changes during tension wood formation in poplar

Jean-Charles Leplé , Marie-Claude Lesage Descauses , Françoise F. Laurans , Moreau Alain , Annabelle Dejardin
IUFRO - Tree Biotechnology 2007, Jun 2007, Ponta Delgada, Azores, Portugal
Communication dans un congrès hal-02751019v1

Physiological and molecular aspects of wood formation in poplar trees under both a water stress and a mechanical constraint

Gilles G. Pilate , Marie-Claude Lesage Descauses , Régis R. Fichot , Françoise F. Laurans , Annabelle Dejardin
IUFRO - Tree Biotechnology 2007, Jun 2007, Ponta Delgada, Azores, Portugal
Communication dans un congrès hal-02757226v1

Recherche de facteurs de transcription impliqués dans la différenciation des fibres G du bois de tension chez le peuplier : analyse de l'expression des gènes de la famille LIM

Dominique Arnaud , Marie-Claude Lesage Descauses , Nadège Millet , Françoise F. Laurans , Annabelle Dejardin
9. Journées du Groupe de Biologie Moléculaire des Ligneux, Mar 2006, Orléans, France
Communication dans un congrès hal-02751947v1

Recherche de facteurs de transcription impliqués dans la différenciation des fibres G du bois de tension chez le peuplier

Dominique Arnaud , Marie-Claude Lesage Descauses , Nadège Millet , Françoise F. Laurans , Annabelle Dejardin
8. Journées "Biologie Moléculaire des Ligneux", May 2004, Clermont-Ferrand, France
Communication dans un congrès hal-02764029v1

Approche génomique de la formation du bois chez le peuplier

Marie-Claude Lesage Descauses , Annabelle Dejardin , Jean-Charles Leplé , Guy Costa , Dominique Arnaud
8. Journées "Biologie Moléculaire des Ligneux", May 2004, Clermont-Ferrand, France
Communication dans un congrès hal-02761766v1

Genomics and tension wood formation : toward an understanding of Populus adaptation to mechanical stress

Annabelle Dejardin , Jean-Charles Leplé , Cyril Saintenac , Marie-Claude Lesage Descauses , Nadège Millet
12. New Phytologist Symposium, Oct 2004, Gatlinburg, Tennessee, United States
Communication dans un congrès hal-02759161v1
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Unraveling the function of MYB090 and MYB156 in secondary cell wall formation in poplar using both ChIP-SEQ and in planta gene modification approach

Annabelle Dejardin , Wassim Lakhal , Nathalie Boizot , Marie-Claude Lesage Descauses , Odile Rogier
XIV Cell Wall Meeting, Jun 2016, Chania, Grèce. , 2016, XIV Cell Wall Meeting. Programme and Book of Abstracts
Poster de conférence hal-02740921v1
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A systems biology approach for identifying candidate genes involved in the natural variability of biomass yield and chemical properties in black poplar

Vincent Segura , Marie-Claude Lesage Descauses , Jean-Paul Charpentier , Kévin Kinkel , Claire Mandin
IUFRO Genomics and Forest Tree Genetics, May 2016, Arcachon, France. , 2016, IUFRO Genomics and Forest Tree Genetics. Book of Abstract
Poster de conférence hal-01456004v1
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High throughput evaluation of tension wood proportion in poplar stem using near infrared spectroscopy

Vincent Segura , Kévin Ader , Marjolaine Martin , Moreau Alain , Jean-Charles Leplé
NIR2015Brazil; 17. international conference on Near Infrared Spectroscopy, Oct 2015, Foz do Iguassu, Brazil. , 2015, NIR 2015 Brazil. Book of abstracts. 17th International Conference on Near Infrared Spectroscopy
Poster de conférence hal-02743804v1
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β-Galactosidases : un rôle dans les couches G du bois de tension ?

Fernanda Guedes , Marie-Claude Lesage Descauses , Nadège Millet , Veronique Laine-Prade , Françoise F. Laurans
Journées scientifiques du GDR 3544 « Sciences du Bois », Nov 2014, Nancy, France. 2014
Poster de conférence hal-02793634v1
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Both ChIP-SEQ and in planta gene modification indicate a function of PtaMYB221in lignin biosynthesis and secondary cell wall formation in poplar

Wassim Lakhal , Nathalie Boizot , Marie-Claude Lesage Descauses , Jean-Charles Leplé , Françoise F. Laurans
13. Cell Wall Meeting, Jul 2013, Nantes, France. 2013, The 13th Cell Wall Meeting : abstract book
Poster de conférence hal-02749954v1
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Identification of miRNAs and their target genes in developing xylem of tension wood by degradome analysis

Nicolas N. Richet , Delphine Gourcilleau , Odile Rogier , Marie-Claude Lesage Descauses , Nadège Millet
13. Cell Wall Meeting, Jul 2013, Nantes, France. 2013, The 13th Cell Wall Meeting : abstract book
Poster de conférence hal-02745523v1
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Identification, cibles et diversité de régulateurs expressionnels majeurs impliqués dans la production de biomasse chez le peuplier

Véronique V. Jorge , Jean-Charles Leplé , Vincent Segura , Marie-Claude Lesage Descauses , Redouane El Malki
Séminaire AIP Bio-ressources, Feb 2013, Paris, France. 2013, ⟨10.13140/RG.2.1.3449.0403⟩
Poster de conférence hal-02807304v1
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Genome-wide characterisation of mechanical stress responsive miRNAs from xylem tissues of different poplar genotypes

Delphine Gourcilleau , Nicolas N. Richet , Marie-Claude Lesage Descauses , Odile Rogier , Nadège Millet
13. Cell Wall Meeting, Jul 2013, Nantes, France. 2013, The 13th Cell Wall Meeting : abstract book
Poster de conférence hal-02745515v1
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Biochemical and histochemical characterization of the polysaccharides present in the G-layer of wild type and AGP-modified transgenic poplars

Fernanda Guedes , Françoise F. Laurans , Carole Assor , Miyuki Takeuchi , Nathalie Boizot
13. Cell Wall Meeting, Jul 2013, Nantes, France. 2013, The 13th Cell Wall Meeting : abstract book
Poster de conférence hal-02748700v1
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Identification in vivo des ADN cibles de facteurs de transcription impliqués dans la formation du bois de tension

Pascale Ferrigno , Nathalie Boizot , Wassim Lakhal , Marie-Claude Lesage Descauses , Jean-Charles Leplé
Journées du Réseau Français des Parois, Jun 2011, Villeneuve d’Ascq, France. , 2011, Journées du Réseau Français des Parois. Programme et Résumés
Poster de conférence hal-02745476v1

Molecular bases of acclimation and adaptation to water deficit in poplar

Marie-Béatrice Bogeat-Triboulot , Didier Le Thiec , David Cohen , Erwin Dreyer , Christophe Plomion
Séminaire Génoplante, Apr 2008, Arles, France. , 1 p., 2008
Poster de conférence hal-02822891v1

Scientific research related to genetically modified trees

Armand Séguin , Denis Lachance , Annabelle Dejardin , Jean-Charles Leplé , Gilles Pilate
Challenges and opportunities for the world’s forests in the 21st century, Section 6. Biotechnological approaches, 81, Editions Springer, 2014, Forestry Sciences, 978-94-007-7076-8. ⟨10.1007/978-94-007-7076-8_22⟩
Chapitre d'ouvrage hal-01268875v1
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Field Trials with Lignin-Modified Transgenic Trees. Chapter 1

Gilles Pilate , Annabelle Dejardin , Jean-Charles Leplé
Lignins — Biosynthesis, Biodegradation and Bioengineering, 61, Academic Press - Elsevier, 2012, Advances in Botanical Research, 978-0-12-416023-1. ⟨10.1016/B978-0-12-416023-1.00001-X⟩
Chapitre d'ouvrage hal-01267883v1