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Transposable Element Misregulation Is Linked to the Divergence between Parental piRNA Pathways in Drosophila Hybrids

 Valèria Romero-Soriano , Laurent Modolo , Hélène Lopez-Maestre , Bruno Mugat , Eugénie Pessia , et al.
Genome Biology and Evolution, 2017, 9 (6), pp.1450 - 1470. ⟨10.1093/gbe/evx091⟩
Article dans une revue hal-01596041v1
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Playing hide and seek with repeats in local and global de novo transcriptome assembly of short RNA-seq reads

 Leandro Lima , Blerina Sinaimeri , Gustavo Sacomoto , Helene Lopez-Maestre , Camille Marchet , et al.
Algorithms for Molecular Biology, 2017, 12 (1), pp.2. ⟨10.1186/s13015-017-0091-2⟩
Article dans une revue hal-01474524v1
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Identification of misexpressed genetic elements in hybrids between Drosophila-related species

 Hélène Lopez-Maestre , Elias Alberto Gutierrez Carnelossi , Vincent Lacroix , Nelly Burlet , Bruno Mugat , et al.
Scientific Reports, 2017, 7, pp.40618. ⟨10.1038/srep40618⟩
Article dans une revue hal-01524879v2
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SNP calling from RNA-seq data without a reference genome: identification, quantification, differential analysis and impact on the protein sequence

 Hélène Lopez-Maestre , Lilia Brinza , Camille Marchet , Janice Kielbassa , Sylvère Bastien , et al.
Nucleic Acids Research, 2016, ⟨10.1093/nar/gkw655⟩
Article dans une revue hal-01352586v1
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TEtools facilitates big data expression analysis of transposable elements and reveals an antagonism between their activity and that of piRNA genes

 Emmanuelle Lerat , Marie Fablet , Laurent Modolo , Hélène Lopez-Maestre , Cristina Vieira
Nucleic Acids Research, 2017, 45, pp.13. ⟨10.1093/nar/gkw953⟩
Article dans une revue hal-01524877v1
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Throughout in vitro first spermatogenic wave: Next-generation sequencing gene expression patterns of fresh and cryopreserved prepubertal mice testicular tissue explants

 Ludovic Dumont , Hélène Lopez-Maestre , Frédéric Chalmel , Louise Huber , Aurélie Rives-Feraille , et al.
Frontiers in Endocrinology, 2023, 14, pp.1112834. ⟨10.3389/fendo.2023.1112834⟩
Article dans une revue hal-04061371v1
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Analyses et méthodes pour les données transcriptomiques issues d’espèces non modèles : variation de l’expression des éléments transposables (et des gènes) et variants nucléotidiques

 Hélène Lopez-Maestre
Bio-informatique [q-bio.QM]. Université de Lyon, 2017. Français. ⟨NNT : 2017LYSE1025⟩
Thèse tel-01575640v3
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Rapid protection induced by a single-shot Lassa vaccine in male cynomolgus monkeys

 Mathieu Mateo , Stéphanie Reynard , Natalia Pietrosemoli , Emeline Perthame , Alexandra Journeaux , et al.
Nature Communications, 2023, 14 (1), pp.1352. ⟨10.1038/s41467-023-37050-6⟩
Article dans une revue pasteur-04122340v1
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