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Analysis of a simulated microarray dataset : Comparison of methods for data normalisation and detection of differential expression

 Michael Watson , Mónica Pérez-Alegre , Michael Denis Baron , Céline Delmas , Peter Dovč , et al.
Genetics Selection Evolution, 2007, 39 (6), pp.669-683
Article dans une revue hal-02657926v1

Metabolic and Innate Immune Cues Merge into a Specific Inflammatory Response via the UPR

 Denis Mogilenko , Joel Haas , Laurent L’homme , Sébastien Fleury , Sandrine Quemener , et al.
Cell, 2019, 178 (1), pp.263. ⟨10.1016/j.cell.2019.06.017⟩
Article dans une revue hal-03534481v1

Sequential analysis for microarray data based on sensitivity and meta-analysis.

 Guillemette Marot , Florence Jaffrezic , Jean Louis J. L. Foulley , C.D. Mayer
XXIV International Biometric Conference, July 13-18, 2008, Dublin, pp.Inconnu
Communication dans un congrès hal-02813478v1

Analyse transcriptomique des gènes exprimés de façon différentielle dans l'épididyme de verrat

 Benoit Guyonnet , Jean-Louis Dacheux , Françoise Dacheux , Florence Jaffrezic , A. Lacoste , et al.
4. Workshop International sur l’Epididyme, Dec 2006, Chatel-Guyon, France
Communication dans un congrès hal-02754518v1
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Clinical score building from high-throughput proteomic data

 Guillemette Marot , Wilfried Heyse , Vincent Vandewalle , Christophe Bauters , Florence Pinet
ICM/Inria/SCAI workshop “Computational and mathematical approaches for neuroscience”, Jun 2022, Paris, France
Communication dans un congrès hal-03942723v1
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Analysis of a simulated microarray dataset: Comparison of methods for data normalisation and detection of differential expression (Open Access publication)

 Michael Watson , Mónica Pérez-Alegre , Michael Denis Baron , Céline Delmas , Peter Dovč , et al.
Genetics Selection Evolution, 2007, 39 (6), pp.669-683
Article dans une revue hal-00894626v1

metaRNASeq

 Guillemette Marot , Andrea Rau
2013
Autre publication scientifique hal-01193762v1

Detection of differentially expressed genes: the importance of variance modelling in the test statistics

 Florence Jaffrezic , Guillemette Marot , Severine S. Degrelle , Isabelle Hue , Jean Louis J. L. Foulley
2. International Meeting on Mammalian Embryogenomics, Oct 2007, Paris, France
Communication dans un congrès hal-02752273v1
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Proteomic signature for early diagnosis of left ventricular remodeling after myocardial infarction

 Wilfried Heyse , Vincent Vandewalle , Philippe Amouyel , Guillemette Marot , Christophe Bauters , et al.
Printemps de la Cardiologie 2020, Oct 2020, Grenoble / Virtual, France
Poster de conférence hal-03124837v1
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An extended transcription factor regulatory network controls hepatocyte identity

 Julie Dubois‐chevalier , Céline Gheeraert , Alexandre Berthier , Clémence Boulet , Vanessa Dubois , et al.
EMBO Reports, 2023, ⟨10.15252/embr.202357020⟩
Article dans une revue hal-04169341v1
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Sélection de groupes de variables corrélées par classification ascendante hiérarchique et group-lasso

 Quentin Grimonprez , Alain Celisse , Guillemette Marot
47èmes Journées de Statistique, Jun 2015, Lille, France
Communication dans un congrès hal-01238248v1

A structural mixed model for variances in differential gene expression studies

 Florence Jaffrezic , Guillemette Marot , S. Degrelle , I. Hué , J-L. Foulley
Genet. Res. Camb, 2007, 89(1), pp.19-25
Article dans une revue hal-00697961v1

Moderated effect size and P-value combinations for microarray meta-analyses

 Guillemette Marot , J.-L. Foulley , C.-D. Mayer , Florence Jaffrezic
Bioinformatics, 2009, 25(20), pp.2692-2699
Article dans une revue hal-00539379v1

Sequential Analysis for Microarray Data Based on Sensitivity and Meta-Analysis

 Guillemette Marot , C.-D. Mayer
Statistical Applications in Genetics and Molecular Biology, 2009, 8(1), pp.1-35
Article dans une revue hal-00539377v1
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Statistical modelling for differential gene expression studies: variance-covariance models, sequential and meta-analysis.

 Guillemette Marot
Life Sciences [q-bio]. AgroParisTech, 2009. English. ⟨NNT : 2009AGPT0039⟩
Thèse tel-00458988v1

Le transcriptome épididymaire du verrat : étude de la régionalisation

 Benoit Guyonnet , Jean-Louis Dacheux , Florence Jaffrezic , A. Lacoste , Guillemette Marot , et al.
40. Journées de la Recherche Porcine, Feb 2008, Paris, France
Communication dans un congrès hal-02758015v1
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Circulating proteomic signature of early death in heart failure patients with reduced ejection fraction

 Marie Cuvelliez , Vincent Vandewalle , Maxime Brunin , Olivia Beseme , Audrey Hulot , et al.
Scientific Reports, 2019, 9, pp.19202. ⟨10.1038/s41598-019-55727-1⟩
Article dans une revue hal-02414293v2

A structural mixed model for variances in differential gene expression studies

 Florence Jaffrezic , Guillemette Marot , Severine S. Degrelle , Isabelle Hue , Jean Louis J. L. Foulley
Genetics Research, 2007, 89 (1), pp.19-25
Article dans une revue hal-02654281v1

Functional Analysis of microRNAs:mRNA Interactions Between Pseudorabies Virus (PrV) and Its Natural Pig Host

 Sophie Pollet , Guillemette Marot , Jerôme Lecardonnel , Marco Moroldo , Florence Jaffrezic , et al.
24. Plant and Animal Genome Conference (PAG), Jan 2016, San Diego, United States
Communication dans un congrès hal-01606998v1
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Analysis of the real EADGENE data set : Comparison of methods and guidelines for data normalisation and selection of differentially expressed genes

 Florence Jaffrezic , Dirk-Jan Koning , P.J. Boettcher , Agnès Bonnet , Bart Buitenhuis , et al.
Genetics Selection Evolution, 2007, 39 (6), pp.633-650. ⟨10.1051/gse:2007029⟩
Article dans une revue hal-02657968v1
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Analysis of the real EADGENE data set: Comparison of methods and guidelines for data normalisation and selection of differentially expressed genes (Open Access publication)

 Florence Jaffrezic , Dirk-Jan de Koning , Paul J. Boettcher , Agnès Bonnet , Bart Buitenhuis , et al.
Genetics Selection Evolution, 2007, 39 (6), pp.633-650
Article dans une revue hal-00894624v1

Embryonic and extraembryonic abnormalities in Day-18 cloned bovine conceptuses

 Severine S. Degrelle , Isabelle Hue , Evelyne E. Campion , Florence Jaffrezic , Guillemette Marot , et al.
2. International Meeting on Mammalian Embryogenomics, Oct 2007, Paris, France
Communication dans un congrès hal-02756590v1
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Effects of Immunoglobulins G From Systemic Sclerosis Patients in Normal Dermal Fibroblasts: A Multi-Omics Study

 Aurelien Chepy , Solange Vivier , Fabrice Bray , Camille Ternynck , Jean-Pascal Meneboo , et al.
Frontiers in Immunology, 2022, Frontiers in Immunology, 13, pp.904631. ⟨10.3389/fimmu.2022.904631⟩
Article dans une revue hal-03898588v1
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Support of temporal structure in the statistical analysis of high-throughput proteomic data

 Wilfried Heyse , Vincent Vandewalle , Philippe Amouyel , Guillemette Marot , Christophe Bauters , et al.
Journées de Statistique 2021, Jun 2021, Nice, France
Communication dans un congrès hal-03525345v1
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Biomarkers of haemodynamic severity of systemic sclerosis-associated pulmonary arterial hypertension by serum proteome analysis

 Sébastien Sanges , Lisa Rice , Ly Tu , Eleanor Valenzi , Jean-Luc Cracowski , et al.
Annals of the Rheumatic Diseases, 2023, pp.ard-2022-223237. ⟨10.1136/ard-2022-223237⟩
Article dans une revue hal-03927525v1

Metabolic and Innate Immune Cues Merge into a Specific Inflammatory Response via the UPR

 Denis Mogilenko , Joel Haas , Laurent L’homme , Sébastien Fleury , Sandrine Quemener , et al.
Cell, 2019, 178 (1), pp.263. ⟨10.1016/j.cell.2019.06.017⟩
Article dans une revue hal-04397652v1
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The mirna-targeted transcriptome of porcine alveolar macrophages upon infection with porcine reproductive and respiratory syndrome virus

 Sophie Dhorne-Pollet , Elisa Crisci , Núria Mach , Patricia Renson , Florence Jaffrezic , et al.
Scientific Reports, 2019, 9 (1), pp.3160. ⟨10.1038/s41598-019-39220-3⟩
Article dans une revue hal-02573144v1
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BACH2 promotes indolent clinical presentation in Waldenström macroglobulinemia

 Charles Herbaux , Elisabeth Bertrand , Guillemette Marot , Christophe Roumier , Nicolas Poret , et al.
Oncotarget, 2016
Article dans une revue hal-01423307v1

Underfeeding affects IGF-1 and gene expression in genital tract tissues in high producing dairy cows

 Damien Valour , Severine S. Degrelle , Guillemette Marot , S. Déjean , Olivier O. Dubois , et al.
8. International Ruminant Reproduction Symposium, Sep 2010, Anchorage, Alaska, United States
Communication dans un congrès hal-02754246v1

Wavelet-based clustering for mixed-effects functional models in high dimension

 Madison Giacofci , Sophie Lambert-Lacroix , Guillemette Marot , Franck Picard
Biometrics, 2013, 69 (1), pp.31-40. ⟨10.1111/j.1541-0420.2012.01828.x⟩
Article dans une revue istex hal-00782458v1
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