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Analysis of a simulated microarray dataset : Comparison of methods for data normalisation and detection of differential expression

 Michael Watson , Mónica Pérez-Alegre , Michael Denis Baron , Céline Delmas , Peter Dovč , et al.
Genetics Selection Evolution, 2007, 39 (6), pp.669-683
Article dans une revue hal-02657926v1

Metabolic and Innate Immune Cues Merge into a Specific Inflammatory Response via the UPR

 Denis Mogilenko , Joel Haas , Laurent L’homme , Sébastien Fleury , Sandrine Quemener , et al.
Cell, 2019, 178 (1), pp.263. ⟨10.1016/j.cell.2019.06.017⟩
Article dans une revue hal-03534481v1

Sequential analysis for microarray data based on sensitivity and meta-analysis.

 Guillemette Marot , Florence Jaffrezic , Jean Louis J. L. Foulley , C.D. Mayer
XXIV International Biometric Conference, July 13-18, 2008, Dublin, pp.Inconnu
Communication dans un congrès hal-02813478v1
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Clinical score building from high-throughput proteomic data

 Guillemette Marot , Wilfried Heyse , Vincent Vandewalle , Christophe Bauters , Florence Pinet
ICM/Inria/SCAI workshop “Computational and mathematical approaches for neuroscience”, Jun 2022, Paris, France
Communication dans un congrès hal-03942723v1

Analyse transcriptomique des gènes exprimés de façon différentielle dans l'épididyme de verrat

 Benoit Guyonnet , Jean-Louis Dacheux , Françoise Dacheux , Florence Jaffrezic , A. Lacoste , et al.
4. Workshop International sur l’Epididyme, Dec 2006, Chatel-Guyon, France
Communication dans un congrès hal-02754518v1

A structural mixed model to shrink covariance matrices for time-course differential gene expression studies.

 Guillemette Marot , Jean Louis J. L. Foulley , Florence Jaffrezic
XXIV International Biometric Conference, July 13-18, 2008, Dublin, pp.Inconnu
Communication dans un congrès hal-02814217v1

The adult boar testicular and epididymal transcriptomes

 B. Guyonnet , Guillemette Marot , J.-L. Dacheux , M.-J. Mercat , S. Schwob , et al.
BMC Genomics, 2009, 10(369), pp.339-343
Article dans une revue hal-00539378v1

A structural mixed model to shrink covariances matrices for time-course differential gene expression studies

 Guillemette Marot , Jean Louis J. L. Foulley , Florence Jaffrezic
Computational Statistics and Data Analysis, 2009, 53 (5), pp.1630-1638. ⟨10.1016/j.csda.2008.04.018⟩
Article dans une revue hal-02668170v1

Modélisation statistique pour l'analyse des données d'expression de gènes.

 Guillemette Marot
[Stage] Ecole Nationale de la Statistique et de l'Analyse de l'Information (Ensai), Inconnu, FRA. 2006
Rapport hal-02815899v1

Pre-malignant transformation by senescence evasion is prevented by the PERK and ATF6alpha branches of the Unfolded Protein Response

 Claire Drullion , Guillemette Marot , Nathalie Martin , Julie Desle , Laure Saas , et al.
Cancer Letters, 2018, 438, pp.187-196. ⟨10.1016/j.canlet.2018.09.008⟩
Article dans une revue hal-04277155v1

Détection de ruptures à partir de méthodes à noyaux

 Morgane Pierre-Jean , Guillemette Marot , Guillem Rigaill , Alain Celisse
United Kingdom, Patent n° : 0000000. 2013
Brevet hal-00943423v1

Introduction to statistics for omics data

 Guillemette Marot
Thematic school FTMS 2022 - Fourier Transform Mass Spectrometry: treatment of ultra high resolution data, Nov 2022, Ambleteuse, France
Communication dans un congrès hal-03942855v1

Change-point detection with kernel methods : application to DNA copy number signals

 Morgane Pierre-Jean , Guillemette Marot , Rigaill Guillem , Alain Celisse
France, Patent n° : 00000000000000. 2013
Brevet hal-00943413v1

A Novel 8-Predictors Signature to Predict Complicated Disease Course in Pediatric-onset Crohn’s Disease: A Population-based Study

 Hélène Sarter , Guillaume Savoye , Guillemette Marot , Delphine Ley , Dominique Turck , et al.
Inflammatory Bowel Diseases, 2023, ⟨10.1093/ibd/izad090⟩
Article dans une revue hal-04124611v1
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An extended transcription factor regulatory network controls hepatocyte identity

 Julie Dubois‐chevalier , Céline Gheeraert , Alexandre Berthier , Clémence Boulet , Vanessa Dubois , et al.
EMBO Reports, 2023, ⟨10.15252/embr.202357020⟩
Article dans une revue hal-04169341v1
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Proteomic signature for early diagnosis of left ventricular remodeling after myocardial infarction

 Wilfried Heyse , Vincent Vandewalle , Philippe Amouyel , Guillemette Marot , Christophe Bauters , et al.
Printemps de la Cardiologie 2020, Oct 2020, Grenoble / Virtual, France
Poster de conférence hal-03124837v1
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Analysis of a simulated microarray dataset: Comparison of methods for data normalisation and detection of differential expression (Open Access publication)

 Michael Watson , Mónica Pérez-Alegre , Michael Denis Baron , Céline Delmas , Peter Dovč , et al.
Genetics Selection Evolution, 2007, 39 (6), pp.669-683
Article dans une revue hal-00894626v1

metaRNASeq

 Guillemette Marot , Andrea Rau
2013
Autre publication scientifique hal-01193762v1

Detection of differentially expressed genes: the importance of variance modelling in the test statistics

 Florence Jaffrezic , Guillemette Marot , Severine S. Degrelle , Isabelle Hue , Jean Louis J. L. Foulley
2. International Meeting on Mammalian Embryogenomics, Oct 2007, Paris, France
Communication dans un congrès hal-02752273v1

A structural mixed model for variances in differential gene expression studies

 Florence Jaffrezic , Guillemette Marot , S. Degrelle , I. Hué , J-L. Foulley
Genet. Res. Camb, 2007, 89(1), pp.19-25
Article dans une revue hal-00697961v1

Moderated effect size and P-value combinations for microarray meta-analyses

 Guillemette Marot , J.-L. Foulley , C.-D. Mayer , Florence Jaffrezic
Bioinformatics, 2009, 25(20), pp.2692-2699
Article dans une revue hal-00539379v1

Sequential Analysis for Microarray Data Based on Sensitivity and Meta-Analysis

 Guillemette Marot , C.-D. Mayer
Statistical Applications in Genetics and Molecular Biology, 2009, 8(1), pp.1-35
Article dans une revue hal-00539377v1
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Statistical modelling for differential gene expression studies: variance-covariance models, sequential and meta-analysis.

 Guillemette Marot
Life Sciences [q-bio]. AgroParisTech, 2009. English. ⟨NNT : 2009AGPT0039⟩
Thèse tel-00458988v1
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Circulating proteomic signature of early death in heart failure patients with reduced ejection fraction

 Marie Cuvelliez , Vincent Vandewalle , Maxime Brunin , Olivia Beseme , Audrey Hulot , et al.
Scientific Reports, 2019, 9, pp.19202. ⟨10.1038/s41598-019-55727-1⟩
Article dans une revue hal-02414293v2
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Sélection de groupes de variables corrélées par classification ascendante hiérarchique et group-lasso

 Quentin Grimonprez , Alain Celisse , Guillemette Marot
47èmes Journées de Statistique, Jun 2015, Lille, France
Communication dans un congrès hal-01238248v1

Le transcriptome épididymaire du verrat : étude de la régionalisation

 Benoit Guyonnet , Jean-Louis Dacheux , Florence Jaffrezic , A. Lacoste , Guillemette Marot , et al.
40. Journées de la Recherche Porcine, Feb 2008, Paris, France
Communication dans un congrès hal-02758015v1

Underfeeding affects IGF-1 and gene expression in genital tract tissues in high producing dairy cows

 Damien Valour , Severine S. Degrelle , Guillemette Marot , S. Déjean , Olivier O. Dubois , et al.
8. International Ruminant Reproduction Symposium, Sep 2010, Anchorage, Alaska, United States
Communication dans un congrès hal-02754246v1

Toxoplasma transcription factor TgAP2XI-5 regulates the expression of genes involved in parasite virulence and host invasion.

 Robert Walker , Mathieu Gissot , Ludovic Huot , Thilabalo Dilezitoko Alayi , David Hot , et al.
Journal of Biological Chemistry, 2013, 288 (43), pp.31127-31138. ⟨10.1074/jbc.M113.486589⟩
Article dans une revue hal-00921150v1
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Variable selection with Multi-Layer Group Lasso

 Guillemette Marot , Quentin Grimonprez , Samuel Blanck , Alain Celisse
useR! 2022, Jun 2022, Virtual, United States
Communication dans un congrès hal-03942579v1
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SMAGEXP: a galaxy tool suite for transcriptomics data meta-analysis.

 Samuel Blanck , Guillemette Marot
GigaScience, 2019, GigaScience, 8 (2), ⟨10.1093/gigascience/giy167⟩
Article dans une revue hal-03897308v1
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