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23 résultats
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Preliminary results from Nanopore Q20+ sequencing

Claire Kuchly , Jules Sabban , Eden Darnige , Camille Eché , Amandine Suin , et al.
JOBIM 2022 : Journées Ouvertes Biologie Informatique Mathématiques, Jul 2022, RENNES, France. 2022
Poster de conférence hal-03719401v1
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A 3.7 Mb deletion encompassing ZEB2 causes a novel polled and multisystemic syndrome in the progeny of a somatic mosaic bull

Aurelien Capitan , Aurélie Allais-Bonnet , Alain Pinton , Brigitte Marquant-Le Guienne , Daniel Le Bourhis , et al.
PLoS ONE, 2012, 7, online (11), Non paginé. ⟨10.1371/journal.pone.0049084⟩
Article dans une revue hal-01019835v1

Local score based method on pool-sequenced behaviour-divergent quail lines precisely detected selection signatures related to autism

Simon S. Boitard , Maria Inès M. I. Fariello Rico , Sabine Mercier , David Robelin , Thomas Faraut , et al.
35. Colloque du Petit Pois Déridé, Aug 2013, Marseille, France
Communication dans un congrès hal-02810860v1
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NG6: Integrated next generation sequencing storage and processing environment.

Jérôme J. Mariette , Frédéric Escudié , Nicolas Allias , Gérald Salin , Céline Noirot , et al.
BMC Genomics, 2012, 13 (1), pp.462. ⟨10.1186/1471-2164-13-462⟩
Article dans une revue inserm-00733481v1
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A Long Read project to find optimal technologic combinations for genome assembly and variability, epigenetic marks detection and metagenomic analysis

Carole Iampietro , Camille Eché , Adrien Castinel , Rémy-Félix Serre , Christophe C. Klopp , et al.
PAG XXVIII, Plant and Animal Genome, Jan 2020, San Diego, United States. 2020
Poster de conférence hal-02947690v1

Impact of embryonic heat exposure on bird methylome

Vincent Coustham , Frederique Pitel , Thomas Loyau , Sabine Crochet , Nathalie Couroussé , et al.
DNA methylation and demethylation, Sep 2013, Roscoff, France. 2013
Poster de conférence hal-01190758v1
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Genome-wide methylation analysis of heat-acclimated chicken

Vincent Coustham , Diane D. Esquerre , Céline Noirot , Julien Plenecassagnes , Clara Lejeune , et al.
Conférence Jacques Monod, DNA methylation and demethylation, Nov 2015, Roscoff, France. 2015
Poster de conférence hal-02792841v1

Impact d'une exposition embryonnaire à la chaleur sur le methylome du poulet de chair.

Vincent Coustham , Julien Plenecassagnes , Clara Lejeune , Sarah-Anne David , Sabine Crochet , et al.
11. Journées de la Recherche Avicole et Palmipèdes à Foie Gras, Mar 2015, Tours, France
Communication dans un congrès hal-01194084v1
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Genome-wide study of structural variants in bovine Holstein, Montbéliarde and Normande dairy breeds

Mekki Boussaha , Diane Esquerre , Johanna Barbieri , Anis Djari , Alain Pinton , et al.
PLoS ONE, 2015, 10 (8), pp.1-21. ⟨10.1371/journal.pone.0135931⟩
Article dans une revue hal-01194172v1

Analyse du méthylome du poulet de chair acclimaté à la chaleur

Vincent Coustham , Julien Plenecassagnes , Clara Lejeune , Sabine Crochet , Sarah-Anne David , et al.
1. Journée de Séminaires du Département Phase sur l'Epigénétique EpiPhase, Institut National de Recherche Agronomique (INRA). UAR Département Physiologie Animale et Systèmes d'Elevage (0558)., Jun 2015, Paris, France
Communication dans un congrès hal-01194134v1
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Local Score Based Method On Pool-Sequenced Behavior-Divergent Quail Lines Precisely Detected Selection Signatures Related To Autism

Maria Inès Fariello Rico , Cécile Arnould , Simon Boitard , Patrice Dehais , Thomas Faraut , et al.
Journée Régionale de Bioinformatique et Biostatistique, Génopole Toulouse, Jun 2014, Toulouse, France. 2014
Poster de conférence hal-01194044v1
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Whole‐genome sequencing of SARS‐CoV‐2: Comparison of target capture and amplicon single molecule real‐time sequencing protocols

Florence Nicot , Pauline Trémeaux , Justine Latour , Nicolas Jeanne , Noémie Ranger , et al.
Journal of Medical Virology, 2023, 95 (1), pp.e28123. ⟨10.1002/jmv.28123⟩
Article dans une revue hal-03988344v1

Analyse du méthylome chez l'embryon de poulet par séquençage haut-débit

Marjorie Mersch , Celine Noirot , Sophie Leroux , Diane Esquerre , David Gourichon , et al.
12. Journées de la Recherche Avicole et des Palmipèdes à Foie Gras, Apr 2017, Tours, France. ITAVI - Institut Technique de l'Aviculture, 1124 p., 2017, 12èmes Journées de la Recherche Avicole et des Palmipèdes à Foie Gras
Poster de conférence hal-01606018v1

Impact de l’acclimatation embryonnaire à la chaleur sur la méthylation de l’ADN chez l’oiseau

Vincent Coustham , Frederique Pitel , Sabine Crochet , Thomas Loyau , Nathalie Couroussé , et al.
5. Journées d'Animation Scientifique du département Phase (JAS Phase 2013), Institut National de Recherche Agronomique (INRA). UAR Département Physiologie Animale et Systèmes d'Elevage (0558)., Oct 2013, Paris, France
Communication dans un congrès hal-01194031v1
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Impact of embryonic heat exposure on bird methylome

Vincent Coustham , Frederique Pitel , Gérald Salin , Céline Noirot , Thomas Loyau , et al.
EPICONCEPT Workshop 2013 Epigenetics and Periconception Environment, Oct 2013, Sant Feliu de Guíxols, Spain. 2013, Proceedings of the EPICONCEPT Workshop 2013 Epigenetics for Improved Food Production: from Model to Practice
Poster de conférence hal-02744805v1
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Population genomics of picophytoplankton unveils novel chromosome hypervariability

Romain Blanc-Mathieu , Marc Krasovec , Maxime Hebrard , Sheree Yau , Elodie Desgranges , et al.
Science Advances , 2017, 3 (7), pp.e1700239. ⟨10.1126/sciadv.1700239⟩
Article dans une revue lirmm-01842137v1

Local Score Based Method On Pool-Sequenced Behavior-Divergent Quail Lines Precisely Detected Selection Signatures Related To Autism

Maria Inès Fariello Rico , Simon Boitard , S. Mercier , David Robelin , Thomas Faraut , et al.
10. World Congress on Genetics Applied to Livestock Production (WCGALP), Aug 2014, Vancouver, Canada. American Society of Animal Science, 2014, 10th Word Congress on Genetics Applied to Livestock Production
Poster de conférence hal-01194042v1
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Les systèmes d’informations transversaux multi‑espèces

Alexandre Journaux , Matthieu Matthieu.Reichstadt@inrae.Fr Reichstadt , Gerald Salin , Katia Feve , Pierre Chalier , et al.
Cahier des Techniques de l'INRA, 2018, pp.68-77
Article dans une revue hal-02625964v1

Accounting for Linkage Disequilibrium in genome scans for selection without individual genotypes: the local score approach

Maria Inès Fariello Rico , Simon Boitard , Sabine Mercier , David Robelin , Thomas Faraut , et al.
Molecular Ecology, 2017, 26 (14), pp.3700-3714. ⟨10.1111/mec.14141⟩
Article dans une revue hal-01607837v1

Plateforme génomique de la génopole Toulouse Midi-Pyrénées.

Cecile Donnadieu , Gérald Salin , Amandine Marty , Frédéric Martins Martins , Denis Milan
Journées Scientifiques, Département de Génétique Animale, Apr 2008, Lacanau
Communication dans un congrès hal-02757454v1
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Prediction of SARS-CoV-2 Variant Lineages Using the S1-Encoding Region Sequence Obtained by PacBio Single-Molecule Real-Time Sequencing

Sébastien Lhomme , Justine Latour , Nicolas Jeanne , Pauline Trémeaux , Noémie Ranger , et al.
Viruses, 2021, 13 (12), pp.2544. ⟨10.3390/v13122544⟩
Article dans une revue hal-03771640v1
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A new local score based method applied to behavior-divergent quail lines sequenced in pools precisely detects selection signatures on genes related to autism

Maria Inès Fariello Rico , Simon Boitard , Sabine Mercier , David Robelin , Thomas Faraut , et al.
2015
Pré-publication, Document de travail hal-01194146v1
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AgroDataRing: Une infrastructure partagée et mutualisée pour le stockage longue durée

Pierre Adenot , Stéphane Bansard , David Benaben , Veronique Brunaud , Christophe Caron , et al.
Cahier des Techniques de l'INRA, 2018, pp.1-7
Article dans une revue hal-02097192v1