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Gilles Pilate

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Présentation

### **Équipe Physiologie Moléculaire de la Formation du Bois (BOIS) - "Décryptage des mécanismes moléculaires impliqués dans la formation du bois"** [https://www6.val-de-loire.inrae.fr/biofora/Recherche/Equipe-BOIS ](https://www6.val-de-loire.inrae.fr/biofora/Recherche/Equipe-BOIS) <gilles.pilate@inrae.fr> ### Fonctions Directeur de Recherches à l’UMR BioForA (Biologie intégrée pour la valorisation de la diversité des arbres et de la forêt, rattachée au département ECOFA) Responsable scientifique du LICA (<https://www6.inrae.fr/lica>) Chargé de mission auprès de la Présidence du Centre INRAE Val de Loire ### Diplômes - 2019. **DU BioInformatique Intégrée**, Université Paris Diderot - 2002. **HDR Sciences de la Vie**, CNU section 66, UFR Sciences, Université d’Orléans - 1985-1987. **Thèse de l’Université Paris VI**, Sciences de la Vie, Biologie et Physiologie végétales, Laboratoire d’Ontogenèse expérimentale, Université Paris VI, bourse MRT. Etude du role des phytohormones dans le développement végétatif et floral chez Pseudotsuga menziesii (Mirb.) Franco, par des méthodes immunoenzymatiques. - 1984. **DEA de Biologie et Physiologie Végétales**, Université Paris VI. Contribution à l’étude de la micropropagation de la jojoba, Simmondsia chinensis (Link) Schneid. ### Expériences professionnelles - Novembre 1991-présent. Chercheur INRA puis INRAE, UMR BioForA, Centre Val de Loire - 1989-1991. Research Associate, Conifer Biotechnology Lab, Plant Biotechnology Institute, NRCC, Saskatoon, Saskatchewan, Canada - 1988. Stage post-doctoral, Molecular Genetic Lab, Biological Science Division, NRCC, Ottawa, Ontario, Canada, Summit Canadian fellowship. ### Sociétés savantes - 2009. Elu à l’ “International Academy of Wood Science” ### Thèmes de Recherche / techniques utilisées - Etude des déterminants moléculaires responsable des contraintes mises en place dans le bois de tension (collaboration avec LMGC (CNRS Montpellier) et ECOFOG UMR INRAE CNRS Guyane, projet ANR Blanc ‘Stress in Trees’, thèses de Fernanda Guedes et de Amra Secerovic - Aptitude à la saccharification de bois de peupliers GM à lignines modifiées. Collaboration avec le VIB Ghent, BIA INRAE Nantes, IJPB INRAE Versailles, FARE INRAE Reims - Bois de tension : peluchage et aptitude à la saccharification (projet FP7 EnergyPoplar, projet ANR Blanc Stress in Trees, projet régional OPeNSPeNU) - Vers l’élaboration d’un modèle de construction des parois secondaires des fibres de bois chez le peuplier (thèse de Clément Cuello) - Mise en oeuvre des nouvelles techniques d’édition du génome sur le peuplier (projet PIA Genius
### **Molecular Physiology of Wood Formation Team (BOIS) - "Deciphering molecular mechanisms responsible for wood formation"** <https://www6.val-de-loire.inrae.fr/biofora/Recherche/Equipe-BOIS> <gilles.pilate@inrae.fr> ### Position Research Officer at BioForA UMR (Integrated Biology for Forest and Tree Diversity Valuation, part of the ECOFA Department of INRAE) Scientific Manager of LICA (Tree Cellular Engineering Lab, [https://www6.inrae.fr/lica](https://www6.inrae.fr/lica,)) Assignment manager to the Presidence of INRAE Val de Loire Centre ### Education - 2019. **DU Integrated Bioinformatics**, Paris Diderot University - 2002. **HDR in Life Sciences**, Faculty of Sciences, Orleans University - 1985-1987. **PhD thesis**, Paris VI University, Life Sciences, Plant Biology and Physiology, Experimental Ontogeny Laboratory, fellowship from the French Research Ministry - 1984. **MS degree in Plant Biology and Physiology**, Paris VI University ### Professional experiences - November 1991-present. Research scientist at INRA, now INRAE, BioForA UMR (previously AGPF), Val de Loire Centre - 1989-1991. Research Associate, Conifer Biotechnology Lab, Plant Biotechnology Institute, NRCC, Saskatoon, Saskatchewan, Canada - 1988. Post-doctoral position, Molecular Genetic Laboratory, Biological Science Division, NRCC, Ottawa, Ontario, Canada, Summit Canadian fellowship. ### Academic associations - 2009 : elected at the “International Academy of Wood Science” ### Research area / technical skills - Identification of the molecular mechanisms responsible for the tension stresses present in the cell walls of tension wood fibres. Collaborations with LMGC (CNRS-Montpellier) and ECOFOG (INRAE CNRS UMR in French Guyana, ANR Blanc project ‘Stress in Trees’, PhD of Fernanda Guedes and Amra Secerovic) - Effects of lignin modifications of GM poplar wood on saccharification efficiency. Collaboration with VIB Ghent, BIA (INRAE Nantes), IJPB (INRAE Versailles), FARE (INRAE Reims) - Tension wood : lint and saccharification efficiency (FP7 EnergyPoplar EU project, ANR Blanc project ‘Stress in Trees’, regional project ‘OPeNSPeNU’) - Toward designing a model for secondary cell wall construction in poplar wood fibres (Clément Cuello PhD) - Implementation on poplar of novel genome editing techniques (PIA Genius project)

Publications

odilerogier
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Fiber-and ray-specific transcriptomics in poplar wood: what can we learn for the building of secondary cell walls?

Annabelle Déjardin , Clément Cuello , Françoise Laurans , Marie-Claude Lesage-Descauses , Odile Rogier
12èmes journées du Réseau Français des Parois, May 2019, Roscoff, France. 2019
Poster de conférence hal-03289317v1
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Unraveling the function of MYB090 and MYB156 in secondary cell wall formation in poplar using both ChIP-SEQ and in planta gene modification approach

Annabelle Dejardin , Wassim Lakhal , Nathalie Boizot , Marie-Claude Lesage Descauses , Odile Rogier
XIV Cell Wall Meeting, Jun 2016, Chania, Grèce. , 2016, XIV Cell Wall Meeting. Programme and Book of Abstracts
Poster de conférence hal-02740921v1
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Integration of transcriptomic and proteomics approaches in characterizing short-term gravi-perception signaling networks in poplar wood.

Nicolas N. Richet , Mélanie Mauriat , Marie-Claude Lesage Descauses , Odile Rogier , Françoise F. Laurans
8. Plant Biomechanics International Conference PBM8, Nov 2015, Nagoya, Japan. Nagoya University, Proceedings of the Plant Biomechanics Conference, 253 p., 2015, 8th Plant Biomechanics International Conference
Poster de conférence hal-02744040v1
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Genome-wide characterisation of mechanical stress responsive miRNAs from xylem tissues of different poplar genotypes

Delphine Gourcilleau , Nicolas N. Richet , Marie-Claude Lesage Descauses , Odile Rogier , Nadège Millet
13. Cell Wall Meeting, Jul 2013, Nantes, France. 2013, The 13th Cell Wall Meeting : abstract book
Poster de conférence hal-02745515v1
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Identification of miRNAs and their target genes in developing xylem of tension wood by degradome analysis

Nicolas N. Richet , Delphine Gourcilleau , Odile Rogier , Marie-Claude Lesage Descauses , Nadège Millet
13. Cell Wall Meeting, Jul 2013, Nantes, France. 2013, The 13th Cell Wall Meeting : abstract book
Poster de conférence hal-02745523v1
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Identification, cibles et diversité de régulateurs expressionnels majeurs impliqués dans la production de biomasse chez le peuplier

Véronique V. Jorge , Jean-Charles Leplé , Vincent Segura , Marie-Claude Lesage Descauses , Redouane El Malki
Séminaire AIP Bio-ressources, Feb 2013, Paris, France. 2013, ⟨10.13140/RG.2.1.3449.0403⟩
Poster de conférence hal-02807304v1