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Gilles Pilate

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Présentation

### **Équipe Physiologie Moléculaire de la Formation du Bois (BOIS) - "Décryptage des mécanismes moléculaires impliqués dans la formation du bois"** [https://www6.val-de-loire.inrae.fr/biofora/Recherche/Equipe-BOIS ](https://www6.val-de-loire.inrae.fr/biofora/Recherche/Equipe-BOIS) <gilles.pilate@inrae.fr> ### Fonctions Directeur de Recherches à l’UMR BioForA (Biologie intégrée pour la valorisation de la diversité des arbres et de la forêt, rattachée au département ECOFA) Responsable scientifique du LICA (<https://www6.inrae.fr/lica>) Chargé de mission auprès de la Présidence du Centre INRAE Val de Loire ### Diplômes - 2019. **DU BioInformatique Intégrée**, Université Paris Diderot - 2002. **HDR Sciences de la Vie**, CNU section 66, UFR Sciences, Université d’Orléans - 1985-1987. **Thèse de l’Université Paris VI**, Sciences de la Vie, Biologie et Physiologie végétales, Laboratoire d’Ontogenèse expérimentale, Université Paris VI, bourse MRT. Etude du role des phytohormones dans le développement végétatif et floral chez Pseudotsuga menziesii (Mirb.) Franco, par des méthodes immunoenzymatiques. - 1984. **DEA de Biologie et Physiologie Végétales**, Université Paris VI. Contribution à l’étude de la micropropagation de la jojoba, Simmondsia chinensis (Link) Schneid. ### Expériences professionnelles - Novembre 1991-présent. Chercheur INRA puis INRAE, UMR BioForA, Centre Val de Loire - 1989-1991. Research Associate, Conifer Biotechnology Lab, Plant Biotechnology Institute, NRCC, Saskatoon, Saskatchewan, Canada - 1988. Stage post-doctoral, Molecular Genetic Lab, Biological Science Division, NRCC, Ottawa, Ontario, Canada, Summit Canadian fellowship. ### Sociétés savantes - 2009. Elu à l’ “International Academy of Wood Science” ### Thèmes de Recherche / techniques utilisées - Etude des déterminants moléculaires responsable des contraintes mises en place dans le bois de tension (collaboration avec LMGC (CNRS Montpellier) et ECOFOG UMR INRAE CNRS Guyane, projet ANR Blanc ‘Stress in Trees’, thèses de Fernanda Guedes et de Amra Secerovic - Aptitude à la saccharification de bois de peupliers GM à lignines modifiées. Collaboration avec le VIB Ghent, BIA INRAE Nantes, IJPB INRAE Versailles, FARE INRAE Reims - Bois de tension : peluchage et aptitude à la saccharification (projet FP7 EnergyPoplar, projet ANR Blanc Stress in Trees, projet régional OPeNSPeNU) - Vers l’élaboration d’un modèle de construction des parois secondaires des fibres de bois chez le peuplier (thèse de Clément Cuello) - Mise en oeuvre des nouvelles techniques d’édition du génome sur le peuplier (projet PIA Genius
### **Molecular Physiology of Wood Formation Team (BOIS) - "Deciphering molecular mechanisms responsible for wood formation"** <https://www6.val-de-loire.inrae.fr/biofora/Recherche/Equipe-BOIS> <gilles.pilate@inrae.fr> ### Position Research Officer at BioForA UMR (Integrated Biology for Forest and Tree Diversity Valuation, part of the ECOFA Department of INRAE) Scientific Manager of LICA (Tree Cellular Engineering Lab, [https://www6.inrae.fr/lica](https://www6.inrae.fr/lica,)) Assignment manager to the Presidence of INRAE Val de Loire Centre ### Education - 2019. **DU Integrated Bioinformatics**, Paris Diderot University - 2002. **HDR in Life Sciences**, Faculty of Sciences, Orleans University - 1985-1987. **PhD thesis**, Paris VI University, Life Sciences, Plant Biology and Physiology, Experimental Ontogeny Laboratory, fellowship from the French Research Ministry - 1984. **MS degree in Plant Biology and Physiology**, Paris VI University ### Professional experiences - November 1991-present. Research scientist at INRA, now INRAE, BioForA UMR (previously AGPF), Val de Loire Centre - 1989-1991. Research Associate, Conifer Biotechnology Lab, Plant Biotechnology Institute, NRCC, Saskatoon, Saskatchewan, Canada - 1988. Post-doctoral position, Molecular Genetic Laboratory, Biological Science Division, NRCC, Ottawa, Ontario, Canada, Summit Canadian fellowship. ### Academic associations - 2009 : elected at the “International Academy of Wood Science” ### Research area / technical skills - Identification of the molecular mechanisms responsible for the tension stresses present in the cell walls of tension wood fibres. Collaborations with LMGC (CNRS-Montpellier) and ECOFOG (INRAE CNRS UMR in French Guyana, ANR Blanc project ‘Stress in Trees’, PhD of Fernanda Guedes and Amra Secerovic) - Effects of lignin modifications of GM poplar wood on saccharification efficiency. Collaboration with VIB Ghent, BIA (INRAE Nantes), IJPB (INRAE Versailles), FARE (INRAE Reims) - Tension wood : lint and saccharification efficiency (FP7 EnergyPoplar EU project, ANR Blanc project ‘Stress in Trees’, regional project ‘OPeNSPeNU’) - Toward designing a model for secondary cell wall construction in poplar wood fibres (Clément Cuello PhD) - Implementation on poplar of novel genome editing techniques (PIA Genius project)

Publications

clement-cuello
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ATR-FTIR imaging: phenotyping at the cell wall level in poplar wood

Clement Cuello , Paul Marchand , Francoise Laurans , Camille Grand-Perret , Véronique Laine-Prade
2nd International Plant Spectroscopy Conference, Mar 2019, Berlin, Germany
Communication dans un congrès hal-03289322v1

Integrative biology of secondary cell wall formation in poplar wood fibers and rays

Clément Cuello , Françoise Laurans , Odile Rogier , Marie-Claude Lesage-Descauses , Nathalie Boizot
XV Cell Wall Meeting, Jul 2019, Cambridge, United Kingdom
Communication dans un congrès hal-02967651v1
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Imagerie ATR-FTIR : phénotypage à l’échelle de la paroi dans le modèle bois de tension de peuplier

Clément Cuello , Paul Marchand , Françoise Laurans , Camille Grand-Perret , Véronique Lainé-Prade
12èmes journées du Réseau Français des Parois, May 2019, Roscoff, France
Communication dans un congrès hal-03289260v1
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ATR-FTIR imaging: phenotyping at the cell wall level in poplar wood

Clément Cuello , Paul Marchand , Françoise Laurans , Camille Grand-Perret , Véronique Laine-Prade
Paris single cell day 2018, Groupement de Recherche Génomique Environnementale (GDR3692). FRA., Oct 2018, Paris, France
Communication dans un congrès hal-02787350v1
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Fiber-and ray-specific transcriptomics in poplar wood: what can we learn for the building of secondary cell walls?

Annabelle Déjardin , Clément Cuello , Françoise Laurans , Marie-Claude Lesage-Descauses , Odile Rogier
12èmes journées du Réseau Français des Parois, May 2019, Roscoff, France. 2019
Poster de conférence hal-03289317v1

Microspectroscopie ATR-FTIR : nouvelle méthode de phénotypage à l’échelle de la paroi

Clément Cuello , Paul Marchand , Françoise Laurans , Camille Grand-Perret , Véronique Laine-Prade
8e journées scientifiques du GDR 3544 Sciences du Bois, Nov 2019, Epinal, France
Poster de conférence hal-03556968v1

Ce peuplier, quelle bonne pâte (à papier)

Clément Cuello , Françoise Laurans , Véronique Lainé-Prade , Camille Grand-Perret , Marie-Claude Lesage-Descauses
32e Colloque Biotechnocentre, ‘Rencontres dans les domaines de la Santé, de la Biologie et du Bien-être en région Centre Val de Loire’, Oct 2019, Seillac, France
Poster de conférence hal-03557368v1
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Caractérisation de lignées de peupliers transgéniques par (micro-)spectroscopie ATR-FTIR

Romaric Monteil , Clément Cuello , Véronique Lainé-Prade , Gilles Pilate , Annabelle Déjardin
12èmes journées du Réseau Français des Parois, May 2019, Roscoff, France. 2019
Poster de conférence hal-03289290v1