Federica Calevro
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Identifiants chercheurs
- federica-calevro
- 0000-0001-7856-9617
Présentation
**Federica Calevro-Eisenlohr**
ORCID: 0000-0001-7856-9617
IdHAL: federica-calevro
### **Positions**
Since Sept. 2020 INRAE Research Director (DR2), BF2i Unit (INRAE – INSA Lyon) Lyon, France
2004-2020 Associate Professor, Department of Biosciences (INSA Lyon) and BF2i Unit, Lyon, France
2001-2004 Temporary Lecturer and Research Assistant, Department of Biosciences (INSA Lyon) and BF2i Unit, Lyon, France
**Other appointments or responsabilities**
Since Jan. 2021 INSA Lyon Directors’ Board
Since Jan. 2021 Head of the BF2i Unit, Lyon, France
Since Jan. 2021 Member (elected) of the scientific advisory board of the INRAE Plant Health and Environment (SPE) Division
2018-present Member of the pedagogic and orientation advisory board of the E2M2 (Evolution, Ecosystems, Microbiology & Modeling) Doctoral School, University of Lyon
2017-present Co-coordinator of the French Aphid research network (BAPOA, more than 230 members in France, Belgium and Switzerland) of the INRAE SPE Division
2015-present Leader of the Trophic Symbioses team (SymT), BF2i Unit, Lyon
2015-2020 Deputy Head of the BF2i Unit, Lyon
2012-2020 Director of the Biology teaching service and member of the Executive Committe of the Department of Biosciences, INSA Lyon
### **Education and Training**
2018 Accreditation to supervise research (French HDR), INSA Lyon and University of Lyon
2000-2001 Postdoctoral Fellow, Pasteur Institute of Lille, Lille, France
1999-2000 Postdoctoral Fellow WHO, International Agency of Research on Cancer (IARC), Lyon, France
1995-1998 PhD, Biology (Cell and Developmental Biology) and Research Assistant, Department of Physiology and Biochemistry, University of Pisa, Italy
1998 Visiting Scientist, Brain Research Institute, University of Bremen, Germany
1997 Visiting Scientist, Department of Biochemistry, University of Bremen, Germany
1996 Professional Qualification (Biologist), University of Pisa, Italy, summa cum laude (50/50 cum laude)
1995 Diploma of Laurea, Molecular and Developmental Biology, University of Pisa, Italy, summa cum laude (110/110 cum laude)
### **Awards**
2000-2001 Director’s Fellow from the Pasteur Institute of Lille (Post-doc position)
1999-2000 WHO Fellowship (Post-doc position at IARC)
1998 Brain Research Institute Fellowship (visit to Bremen University, G. Roth lab)
1997 EMBO Short term Fellowship (visit to Bremen University, D. Beyersmann lab)
1997 Doctoral Mobility Fellowship from the University of Pisa (visit to Bremen University)
1995-1998 Doctoral Fellowship from the Italian National Agency for new technologies, Energy and sustainable Economic development (ENEA)
1994-1995 Pre-Graduate Fellowship from University of Pisa (1-year laboratory training)
### **Supervision of graduate students and post-doc fellows**
### Since 1995:
### 7 Postdocs
### 7 PhD students (degrees obtained in 2004, 2008, 2010, 2011, 2016, 2020, 2021) 6 have been recruited as Scientists (5 permanent positions/1 post-doc). 2 PhD projects are ongoing.
### 20 Master Students (11 M2 level and 9 M1 level).
### 3 students from University Institutes (*e.g.* IUT).
### **Teaching**
### Since 2020: INSA-Lyon, 12 h/year: Molecular genetics.
### 2001-2020: INSA-Lyon. 200-220 h/year: Anatomy, Biotechnology, Cell biology, Molecular genetics.
### 1995-1998: University of Pisa. 50 h/year: Molecular biology, Molecular toxicology, Comparative anatomy.
**Fundings**
43 funded research projects: 2 International, 4 European, 2 IDEX and 6 ANR Programs, 1 France-Génomique grant, 1 Agropolis Foundation grant, 1 SPE-INRAE grant, 4 regional grants, 4 INSA Bonus, 4 INSA Invited Professorships, 4 FR BioEEnViS grants, 4 Investment Programs, 6 projects with industry (including 1 ANR).
### **Scientific Impact and other scientific output**
***Publications:*** 50 original publications, 2 invited reviews, 6 invited contributions to book chapters, 2323 citations, H-index 24, i10-index 33.
***Metabolic databases for arthropod genomes (most recent):*** 1) **DakvicCyc**, <http://arthropodacyc.cycadsys.org/DAKVI/>, *Daktulosphaira vitifoliae*, doi: 10.1186/s12915-020-00820-5 ; 2) **OruabCyc** et **AthroCyc**, <http://arthropodacyc.cycadsys.org/ORUAB/> et <http://arthropodacyc.cycadsys.org/ATHRO/>, *Orussus abietinus* et *Athalia rosae*, doi: 10.1093/gbe/**,** 3) **SitorCyc**, <http://arthropodacyc.cycadsys.org/SITOR/>, *Sitophilus oryzae*, doi: 10.1186/s12915-021-01158-2; **ArtSymbioCyc** (<http://artsymbiocyc.cycadsys.org/>) project containing the reconstruction of the integrated symbiotic metabolism between arthropods and their symbiotic or mutualistic bacteria, private.
***Tools (most recent):*** GReNaDIne: Data-Driven Approaches to Infer Gene Regulatory Networks in Python. <https://grenadine.readthedocs.io/en/latest/>
***Organization of meetings (most important*):** Joint 10th International Symbiosis Society & 3rd International Conference on Holobionts (Lyon, July 2022); Annual Entomophagous meeting (2017, Lyon); Annual meetings of the Aphid French Network: 2010 and 2012 (Lyon), 2018 (Rennes) and 2022 (Nice); Colloque de Biologie de l’Insecte (16th edition, 2010, Lyon); Lyon’s International Multidisciplinary Meeting on Post-Genomics (5 editions, from 2006 to 2010, Lyon).
***Organization of practical courses:*** « Insect cell cultures », Aphid French Network (Bordeaux, October 2019); « Isolation of aphid bacteriocytes as a platform for transcriptomic analyses », HMicMac ANR grant (May 2017, Lyon); « RNAi in aphids: feeding and injection techniques », Aphid French Network (March 2008, Lyon).
***Ad hoc reviewer for Grant Organizations.*** Western University (Canada); FWO (Belgium); HRZZ (Croatian Science Foundation); CNR (Italy); ANR (France); FranceAgriMer (France); INRAE SPE research grants (France); Research Federation BioEEnViS University of Lyon (France); BQR (Bonus Qualité Recherche) INSA Lyon (France).
***Ad hoc reviewer for journals.*** Apoptosis, Arch. Insect Biochem. Physiol., BMC Biol., BMC Genomics, Cell Death Differ., Cell Rep., Current Biol., Cytom. Part A, Entomol. Exp. Appl., Environ. Microbiome, Eur. J. Entomol., FEMS Microbiol. Ecol., Insect Biochem. Mol. Biol., Insect Mol. Biol., Insect Sci., Insects, Int. J. Mol. Sci., iScience, J. Pest Sci., Microbiome, Microbiol. Spectr., Mol. Ecol., PNAS, Peptides, PlosOne, Sci. Rep., ISME J.
***Member of University selection committees (France).* INSA Lyon**: « Physiology » in 2012, « Insect symbiosis » in 2013, President of the jury « Insect Genomics » in 2015, « Symbiotic network modeling » in 2018, Coordinator of the jury « Microbes and Adaptation » in 2021, « Developmental genetics » in 2021. **University Claude Bernard Lyon1**: « Environmental and molecular microbiology » in 2012, « Plant physiology » in 2017. **University of Dijon:** « Invertebrate physiology » in 2015, **University of Nice**: « Host-Microbes interactions » in 2010 and 2012.
Publications
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Deciphering growth/nutrition dynamics at the aphid – symbiont interface through metabolic modeling3e Rencontre du Réseau Français de Biologie Adaptative des Pucerons et Organismes Associés (BAPOA), Nov 2023, Villeurbanne, France
Communication dans un congrès
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Study of host-symbionts coevolution in the whitefly Bemisia tabaci: an experimental evolution approach13e Rencontre du Réseau Français de Biologie Adaptative des Pucerons et Organismes Associés (BAPOA), Nov 2023, Villeurbanne, France
Communication dans un congrès
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Peptides « Bacteriocyte-specific Cysteine Rich » (BCR) : un rôle dans le contrôle de la symbiose ? Focus sur BCR4 chez le puceron du pois12. Rencontre du Réseau Français de Biologie Adaptative des Pucerons et Organismes Associés (BAPOA), May 2022, Nice, France
Communication dans un congrès
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Plasticity of bacteriocytes facing nutritional stresses in the pea aphid development.12. Rencontre du Réseau Français de Biologie Adaptative des Pucerons et Organismes Associés (BAPOA), May 2022, Nice, France
Communication dans un congrès
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Sustainable laser-based technology for insect pest controlICESB 2021, Jan 2022, Osaka (visio), Japan
Communication dans un congrès
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Analysis of the inhibitor of aPoptosis (IAP) repertoire in insects reveals a complex pattern of gene losses and amplificationsIncontri di diversità delle forme e degli animali, Università di Pisa, 2021, Pisa, Italy
Communication dans un congrès
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Analysis of the Inhibitor of aPoptosis (IAP) repertoire in insects reveals a complex pattern of gene losses and amplificationsWebinaires BAPOA 2021, 2021, Villeurbanne (virtual), France
Communication dans un congrès
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IAP (Inhibitor-of-Apoptosis Protein) gene family expansion and functional diversification in aphidsUK-France joint Meeting Aphid Special Interest Group – BAPOA, Apr 2019, Rothamsted, United Kingdom
Communication dans un congrès
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Amplification des gènes codant les protéines de la famille des IAP et leur rôle dans l'homéostasie bactériocytaire11. Réunion du Réseau Français de Biologie Adaptative des Pucerons et Organismes Associés (BAPOA), Nov 2018, Rennes, France
Communication dans un congrès
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Bacteriocyte reprogramming to cope with nutritional stress in a phloem sap feeding hemipteran, the pea aphid Acyrthosiphon pisumFrance-Israel PRC Meeting – The role of metabolic interactions in shaping the bacterial endosymbiotic community of Hemyptera, Nov 2018, Villeurbanne, France
Communication dans un congrès
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Another way to die for bacteriocytes in the aphid/Buchnera symbiotic systemJournée des doctorants du département SPE, Jun 2018, Nice, France
Communication dans un congrès
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Bacteriocyte reprogramming to cope with nutritional stress in a phloem sap feeding hemipteran, the pea aphid Acyrthosiphon pisumInternational Partner Days, Oct 2018, Villeurbanne (INSA-Lyon), France
Communication dans un congrès
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Expansion of genes encoding Apoptosis Inhibitor Proteins (IAPs) and their role in a novel bacteriocyte cell death process in aphid symbiosis22. Evolutionary Biology Meeting, Sep 2018, Marseille, France
Communication dans un congrès
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A novel cell death process is involved in the elimination of bacteriocytes and their symbionts through aphid agingFrance-Israel PRC Meeting – The role of metabolic interactions in shaping the bacterial endosymbiotic community of Hemyptera, Nov 2018, Villeurbanne, France
Communication dans un congrès
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Rôle clé du bactériocyte dans la résilience du puceron aux stress nutritionnels11ème Réunion du Réseau Français de Biologie Adaptative des Pucerons et Organismes Associés (BAPOA), Nov 2018, Rennes, France
Communication dans un congrès
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Effecteurs et inhibiteurs de l’apoptose chez le puceron du pois : annotation et implication dans la mort cellulaire bactériocytaire10. Réunion du Réseau Français de Biologie Adaptative des Pucerons et Organismes Associés (BAPOA), Nov 2017, Colmar, France
Communication dans un congrès
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Systems biology of symbiosis: from partners’ genomics to physiology of interactionsFirst Meeting of the PRC Israel-France, Sep 2016, Villeurbanne, France
Communication dans un congrès
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Life history traits and tissue-specific gene expression changes underlying the symbiotic pea aphid resilience to a tyrosine and phenylalanine depleted diet9. Réunion du Réseau Français de Biologie Adaptative des Pucerons et Organismes Associés (BAPOA), Nov 2016, Amiens, France
Communication dans un congrès
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The long-term relationship with Buchnera aphidicola imposes another way to die for Acyrthosiphon pisum bacteriocytes9. Réunion annuelle du Réseau BAPOA (Biologie Adaptative des Pucerons et Organismes Associés), Nov 2016, Amiens, France
Communication dans un congrès
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Une nouvelle forme de mort cellulaire impliquée dans la dégénérescence des cellules bactériocytaires chez le puceron du pois, Acyrthosiphon pisum18. Colloque Biologie de l'Insecte, Jun 2016, Tours, France
Communication dans un congrès
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Coordination des dynamiques cellulaires entre bactériocytes et endosymbiotes au cours du développement des insectes : Une nouvelle approche par cytométrie en flux.Réunion annuelle du REID (Réseau National Ecologie des Interactions Durables), Réseau Ecologie des Interactions Durables (REID). Montferrier/ Lez, FRA., Mar 2015, Villeurbanne, France
Communication dans un congrès
hal-02801005v1
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Direct flow cytometry measurements and cell imaging reveal a fine-tuning of endosymbiont and bacteriocyte cell dynamics during aphid developmentUK – France joint meeting on Aphids (Réseau Français de Biologie Adaptative des Pucerons et Organismes Associés – Aphids Special Interest Group of Royal Entomological Sociaty), Nov 2015, Paris, France
Communication dans un congrès
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Specific body compartment phenotypes induced by dsRNA treatments in the pea aphid: the cathepsin-L and phenylalanine hydroxylase examples7. Rencontres du réseau Biologie Adaptative des Pucerons et Organismes Associés (BAPOA), Réseau Biologie Adaptative des Pucerons et des Organismes Associés (BAPOA). Le Rheu, FRA., Nov 2014, Avignon, France
Communication dans un congrès
hal-02795336v1
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Dynamique de la cellule bactériocytaire et des populations symbiotiques au cours du développement du puceron du pois7èmes journées du Réseau BAPOA (Biologie Adaptative des Pucerons et Organismes Associés), 2014, Avignon, France
Communication dans un congrès
hal-03513906v1
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Dynamique de la cellule bactériocytaire et des populations symbiotiques au cours du développement du puceron du pois7. Rencontres du réseau Biologie Adaptative des Pucerons et Organismes Associés (BAPOA), Réseau Biologie Adaptative des Pucerons et des Organismes Associés (BAPOA). Le Rheu, FRA., Nov 2014, Avignon, France
Communication dans un congrès
hal-02795335v1
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dsRNAi in aphids induces variable individual and tissue responses, and phenotypes specific to the administration methodsCycle de séminaires en Biophysique et Biologie Moléculaire de la Cellule et du Développement, Dipartimento di Fisiologia e Biochimica, Università di Pisa / Scuola Normale Superiore di Pisa, Oct 2013, Pisa, Italy
Communication dans un congrès
hal-03506764v1
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L'inactivation par RNAi du gène codant la phénylalanine hydrolase dans les compartiments symbiotiques provoque une baisse de la fécondité et des défauts de développement chez le puceron du pois, Acyrthosiphon pisumRéunion du GRREMI (Groupe Régional de Recherche en Microbiologie des Interactions), Oct 2013, Lyon, France
Communication dans un congrès
hal-03506724v1
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Aphicibles - Symbiosis, digestion and reproduction as aphid physiological processes to identify new targets for insecticidesANR - Colloque Plant Genomics 2012, Apr 2012, Pont Royal en Provence, France
Communication dans un congrès
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Phénotypes induits par l'inactivation fonctionnelle par RNAi du gène ACYPY007803 (phényalanine hydroxylase) chez le puceron du pois5. Journées du Réseau BAPOA (Biologie Adaptative des Pucerons et Organismes Associés), Nov 2012, Lyon, France
Communication dans un congrès
hal-03506379v1
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Integration of metabolic pathways and host regulation in symbiosis: tyrosine and cuticular protein biosynthesis during the pea aphid embryonic developmentSixth International Symposium on Molecular Insect Science, 2011, Amsterdam, Netherlands
Communication dans un congrès
hal-00748785v1
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Transcriptome analysis of embryo development in a parthenogenetic and symbiotic insect model, the pea aphidIPG'10 Integrative Post-Genomics, Centre Jacques Cartier. Lyon, FRA., Nov 2011, Lyon, France
Communication dans un congrès
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Genomic analysis of the transport function in the symbiotic system of the pea aphid Acyrthosiphon pisum5. Meeting GDRE-RA "Comparative genomics", Institut d'Estudis Catalans (IEC). Barcelona, ESP., Nov 2010, Barcelone, Spain. n. p
Communication dans un congrès
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Annotation et évolution des familles de transporteurs chez le puceron du pois (Acyrthosiphon pisum)3. Réunion Réseau Français de Biologie Adaptative des Pucerons, Institut National de Recherche Agronomique (INRA). UMR Biologie Fonctionnelle, Insectes et Interactions (0203)., Oct 2010, Lyon, France. n. p
Communication dans un congrès
hal-02818835v1
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Individual and compartment specific response to RNAi in aphids: each individual matters3. Réunion Réseau Français de Biologie Adaptative des Pucerons, Institut National de Recherche Agronomique (INRA). UMR Biologie Fonctionnelle, Insectes et Interactions (0203)., Oct 2010, Lyon, France
Communication dans un congrès
hal-02821530v1
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Caractérisation transcriptomique du développement embryonnaire et larvaire du puceron du pois Acyrthosiphon pisum16. Colloque de Biologie de l’Insecte, Oct 2010, Lyon, France. 126 p
Communication dans un congrès
hal-02755293v1
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Aphicibles : Symbiosis, digestion and reproduction as aphid physiological processes to identify new targets for insecticidesGenoplante 2010, Agence Nationale de la Recherche (ANR). Paris, FRA., Mar 2010, Avignon, France. 40 diapos
Communication dans un congrès
hal-02824684v1
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Characterization of partenogenetic embryo development in the context of symbiosis using transcriptome analysis in the pea aphid modelEMBO Workshop on Systems Biology of Development, EMBO. Heidelberg, DEU., Aug 2010, Ascona, Switzerland. 1 p
Communication dans un congrès
hal-01231279v1
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Isolation of Insect as a Platform for Transcriptomic AnalysesRNA abundance analysis, 2170, pp.185-198, 2021, ⟨10.1007/978-1-0716-0743-5_13⟩
Chapitre d'ouvrage
hal-03052268v1
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