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Redesign of iPPI-DB, a database for modulators of Protein-Protein Interactions

 Rachel Torchet , Alexandra Moine-Franel , Hélène Borges , Bryan Brancotte , Olivia Doppelt-Azeroual , et al.
JOBIM (Journées Ouvertes Biologie, Informatique et Mathématiques), Société Française de BioInformatique; GdR Bioinformatique Moléculaire; Institut Francais de Bioinformatique, Jul 2019, Nantes, France
Communication dans un congrès pasteur-02867265v1

S1 ribosomal protein functions in translation initiation and ribonuclease RegB activation are mediated by similar RNA/protein interactions. An NMR and SAXS analysis.

 Pascale Aliprandi , Christina Sizun , Javier Perez , Fabien Mareuil , Sandrine Caputo , et al.
Journal of Biological Chemistry, 2008, 283 (19), pp.13289-13301. ⟨10.1074/jbc.M707111200⟩
Article dans une revue hal-00254022v1
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NGPhylogeny.fr: new generation phylogenetic services for non-specialists

 Frédéric Lemoine , Damien Correia , Vincent Lefort , Olivia Doppelt-Azeroual , Fabien Mareuil , et al.
Nucleic Acids Research, 2019, 47 (W1), pp.W260-W265. ⟨10.1093/nar/gkz303⟩
Article dans une revue hal-02341225v1
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ABRomics: An integrated multi-omics platform for antibiotic resistance research and public health

 Julie Lao , Pierre Marin , Romain Dallet , Fabien Mareuil , Alix De Toisy , et al.
9ème symposium sur la résistance aux antimicrobiens chez les animaux et dans l'environnement (ARAE 2023), Jul 2023, Vinci International Convention Centre, Tours, France
Poster de conférence hal-04369175v1
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Improved reliability, accuracy and quality in automated NMR structure calculation with ARIA.

 Fabien Mareuil , Thérèse E Malliavin , Michael Nilges , Benjamin Bardiaux
Journal of Biomolecular NMR, 2015, Epub. ⟨10.1007/s10858-015-9928-5⟩
Article dans une revue pasteur-01144918v1
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Scientific workflows for computational reproducibility in the life sciences: Status, challenges and opportunities

 Sarah Cohen-Boulakia , Khalid Belhajjame , Olivier Collin , Jérôme Chopard , Christine Froidevaux , et al.
Future Generation Computer Systems, 2017, 75, pp.284-298. ⟨10.1016/j.future.2017.01.012⟩
Article dans une revue hal-01516082v1
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Community-Driven Data Analysis Training for Biology

 Bérénice Batut , Saskia Hiltemann , Andrea Bagnacani , Dannon Baker , Vivek Bhardwaj , et al.
2020
Pré-publication, Document de travail pasteur-02613129v1
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Tools and data services registry: a community effort to document bioinformatics resources.

 Jon Ison , Kristoffer Rapacki , Hervé Ménager , Matúš Kalaš , Emil Rydza , et al.
Nucleic Acids Research, 2016, 44 (D1), pp.D38-47. ⟨10.1093/nar/gkv1116⟩
Article dans une revue hal-01594840v1
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ABRomics - an open access online platform on antimicrobial resistance to store, integrate, analyze and share multi-omics data

 Julie Lao , Pierre Marin , Romain Dallet , Fabien Mareuil , Alix De Toisy , et al.
FEMS 2023 European Congress of Microbiology, Jul 2023, Congress Center Hamburg Hamburg, Germany, Germany
Poster de conférence hal-04369134v1
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ARIAweb: a server for automated NMR structure calculation

 Fabrice Allain , Fabien Mareuil , Hervé Ménager , Michael Nilges , Benjamin Bardiaux
Nucleic Acids Research, 2020, ⟨10.1093/nar/gkaa362⟩
Article dans une revue pasteur-02569631v1

ABRomics: An integrated multi-omics platform for antibiotic resistance research and public health

 Julie Lao , Pierre Marin , Romain Dallet , Fabien Mareuil , Alix De Toisy , et al.
18ème congrès national de la SFM: MICROBES 2023, Société Français de Microbiologie, Oct 2023, Le couvant des Jacobins, Rennes, France
Communication dans un congrès hal-04369101v1
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A simple genetic algorithm for the optimization of multidomain protein homology models driven by NMR residual dipolar coupling and small angle X-ray scattering data.

 Fabien Mareuil , Christina Sizun , Javier Perez , Marc Schoenauer , Jean-Yves Lallemand , et al.
European Biophysics Journal, 2007, 37 (1), pp.95-104. ⟨10.1007/s00249-007-0170-2⟩
Article dans une revue istex inria-00177279v2
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ABRomics - a digital platform on antimicrobial resistance to store, integrate, analyze and share multi-omics data

 Pierre Marin , Julie Lao , Kenzo-Hugo Hillion , Aurélien Birer , Nadia Goué , et al.
JOURNÉES OUVERTES EN BIOLOGIE, INFORMATIQUE ET MATHÉMATIQUES ( JOBIM ) 2022, Jul 2022, Rennes, France. Actes JOBIM 2022
Poster de conférence hal-04369049v1
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ReGaTE: Registration of Galaxy Tools in Elixir

 Olivia Doppelt-Azeroual , Fabien Mareuil , Eric Deveaud , Matúš Kalaš , Nicola Soranzo , et al.
GigaScience, 2017, 6 (6), pp.1-4. ⟨10.1093/gigascience/gix022⟩
Article dans une revue pasteur-02613125v1
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