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The crisis of the scientific mind : an investigation, a tragedy and a collective redistribution of roles

 Eric Tannier , Vincent Daubin , Sophie Quinton
Les Cahiers de Framespa : e-Storia, 2022, 40, ⟨10.4000/framespa.13150⟩
Article dans une revue hal-03714886v1
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Lateral gene transfer as a support for the tree of life.

 Sophie S Abby , Eric Tannier , Manolo Gouy , Vincent Daubin
Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 2012, 109 (13), pp.4962-4967. ⟨10.1073/pnas.1116871109⟩
Article dans une revue hal-00752055v1

L'époque romantique contre la peine de mort

 Eric Tannier
incollection, 2011, --, pp.54-56
Article dans une revue hal-00698248v1
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Multichromosomal median and halving problems under different genomic distances

 Eric Tannier , Chunfang Zheng , David Sankoff
BMC Bioinformatics, 2009, 10 (1), pp.120. ⟨10.1186/1471-2105-10-120⟩
Article dans une revue hal-00784456v1
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Prediction of Contiguous Regions in the Amniote Ancestral Genome

 Aïda Ouangraoua , Frédéric Boyer , Andrew Mcpherson , Eric Tannier , Cedric Chauve
ISBRA 2009, 5th International Symposium on Bioinformatics Research and Applications,, May 2009, Fort Lauderdale, Florida, United States. ⟨10.1007/978-3-642-01551-9_18⟩
Communication dans un congrès hal-00368187v1
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Evolutionary superscaffolding and chromosome anchoring to improve Anopheles genome assemblies

 Robert Waterhouse , Sergey Aganezov , Yoann Anselmetti , Jiyoung Lee , Livio Ruzzante , et al.
BMC Biology, 2020, 18 (1), pp.1-20. ⟨10.1186/s12915-019-0728-3⟩
Article dans une revue hal-02455139v1
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Linearization of ancestral multichromosomal genomes

 Ján Maňuch , Murray Patterson , Roland Wittler , Cedric Chauve , Eric Tannier
BMC Bioinformatics, 2012, 13 (Suppl 19), pp.S11. ⟨10.1186/1471-2105-13-S19-S11⟩
Article dans une revue hal-00773071v1

Models and Algorithms for Genome Evolution

 Cedric Chauve , Nadia El-Mabrouk , Eric Tannier
Springer, pp.318, 2013, 978-1-4471-5297-2
Ouvrages hal-00847154v1
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A Methodological Framework for the Reconstruction of Contiguous Regions of Ancestral Genomes and its Application to Mammalian Genomes

 Eric Tannier , Cedric Chauve
[Research Report] RR-6494, INRIA. 2008, pp.26
Rapport inria-00269397v2
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Mapping ancestral genomes with massive gene loss: a matrix sandwich problem.

 Haris Gavranović , Cedric Chauve , Jérôme Salse , Eric Tannier
Bioinformatics, 2011, 27 (13), pp.i257-65. ⟨10.1093/bioinformatics/btr224⟩
Article dans une revue hal-00680540v1

ANGES: reconstructing ANcestral GEnomeS maps.

 Bradley R Jones , Ashok Rajaraman , Eric Tannier , Cedric Chauve
Bioinformatics, 2012, 28 (18), pp.2388-2390. ⟨10.1093/bioinformatics/bts457⟩
Article dans une revue hal-00733180v1
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Sorting by reversals in subquadratic time

 Eric Tannier , Marie-France Sagot
[Research Report] RR-5097, INRIA. 2004
Rapport inria-00071486v1

Effective Stochastic Local Search Algorithms for the Genomic Median Problem

 Renaud Lenne , Christine Solnon , Thomas Stützle , Eric Tannier , Mauro Birattari
Doctoral Symposium on Engineering Stochastic Local Search Algorithms (SLS-DS), Sep 2007, Bruxelles, Belgium. pp.1-5
Communication dans un congrès hal-01542514v1

Comparative Genomics

 Eric Tannier
incollection, 2010, 6938, pp.1-12
Article dans une revue hal-00539254v1

Preface : Satellite Workshop on Comparative Genomics Research in Computational Molecular Biology (RECOMB-CG 2010)

 Eric Tannier
Journal of Computational Biology, 2011, 18(9), pp.1-3
Article dans une revue hal-00698246v1
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Karyotype and Gene Order Evolution from ReconstructedExtinct Ancestors Highlight Contrasts in Genome Plasticity ofModern Rosid Crops

 Florent Murat , Rongzhi R. Zhang , Sébastien Guizard , Haris Gavranovic , Raphael Flores , et al.
Genome Biology and Evolution, 2015, 7 (3), pp.735-749. ⟨10.1093/gbe/evv014⟩
Article dans une revue hal-01133906v1
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Phylogenetic signal from rearrangements in 18 Anopheles species by joint scaffolding extant and ancestral genomes

 Yoann Anselmetti , Wandrille Duchemin , Eric Tannier , Cedric Chauve , Sèverine Bérard
BMC Genomics, 2018, 19 (S2), pp.1-15. ⟨10.1186/s12864-018-4466-7⟩
Article dans une revue hal-01791884v1
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Ancestral gene synteny reconstruction improves extant species scaffolding

 Yoann Anselmetti , Vincent Berry , Cedric Chauve , Annie Chateau , Eric Tannier , et al.
BMC Genomics, 2015, 16 (Suppl 10), pp.S11. ⟨10.1186/1471-2164-16-S10-S11⟩
Article dans une revue hal-01180303v2

L'informatique les pieds sur Terre

 Eric Tannier
Interstices, 2020
Article dans une revue hal-02953016v1
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Probabilistic modeling of the evolution of gene synteny within reconciled phylogenies

 Magali Semeria , Eric Tannier , Laurent Guéguen
BMC Bioinformatics, 2015, 16 (Suppl 14), pp.S5. ⟨10.1186/1471-2105-16-S14-S5⟩
Article dans une revue hal-01179596v2
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Efficient gene tree correction guided by genome evolution

 Emmanuel Noutahi , Magali Semeria , Manuel Lafond , Jonathan Seguin , Bastien Boussau , et al.
PLoS ONE, 2016, 11 (8), e0159559 (22 p.). ⟨10.1371/journal.pone.0159559⟩
Article dans une revue hal-01162963v4

Comparative Genomics on Artificial Life

 Priscila Biller , Carole Knibbe , Guillaume Beslon , Eric Tannier
Computability in Europe, Jun 2016, Paris, France. pp.35-44
Communication dans un congrès hal-01334930v1

Genome-scale phylogenetic analysis finds extensive gene transfer among fungi

 G.J. Szollosi , Adrián Arellano Davin , Eric Tannier , Vincent Daubin , Bastien Boussau
Philosophical Transactions of the Royal Society of London. Series B, Biological Sciences (1934–1990), 2015, 370, 20140335 (11 p.). ⟨10.1098/rstb.2014.0335⟩
Article dans une revue hal-01218565v1

Approximating the number of Double Cut-and-Join scenarios

 Istvan Miklos , Eric Tannier
Theoretical Computer Science, 2012, 439, pp.30-40. ⟨10.1016/j.tcs.2012.03.006⟩
Article dans une revue hal-00699567v1

Connected Joins in Graphs

 András Sebő , Eric Tannier
International Conference on Integer Programming and Combinatorial Optimization (IPCO), Jun 2001, Utrecht, Netherlands. pp.383-395
Communication dans un congrès hal-00427193v1

Cassis: detection of genomic rearrangement breakpoints.

 Christian Baudet , Claire Lemaitre , Zanoni Dias , Christian Gautier , Eric Tannier , et al.
Bioinformatics, 2010, 26 (15), pp.1897-8. ⟨10.1093/bioinformatics/btq301⟩
Article dans une revue hal-00681095v1
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Genome rearrangements with indels in intergenes restrict the scenario space

 Laurent Bulteau , Guillaume Fertin , Eric Tannier
BMC Bioinformatics, 2016, 17 (Suppl 14), 426 (7 p.). ⟨10.1186/s12859-016-1264-6⟩
Article dans une revue hal-01396842v1
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Ghost lineages can invalidate or even reverse findings regarding gene flow

 Théo Tricou , Eric Tannier , Damien M. de Vienne
PLoS Biology, 2022, 20 (9), pp.e3001776. ⟨10.1371/journal.pbio.3001776⟩
Article dans une revue hal-03781025v2

Foundations of Coding: Compression, Encryption, Error-Correction

 Jean-Guillaume Dumas , Jean-Louis Roch , Eric Tannier , Sébastien Varrette
Wiley, pp.376, 2015, 978-1-118-88144-6
Ouvrages hal-00765802v1

Sorting by reversals in subquadratic time

 Eric Tannier , M.-F. Sagot
Annual Symposium on Combinatorial Pattern Matching (CPM), Jul 2004, Istanbul, Turkey. pp.1-13, ⟨10.1007/978-3-540-27801-6_1⟩
Communication dans un congrès istex hal-00427659v1
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