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Les communautés benthiques comme outils de caractérisation de la contamination des sédiments superficiels des grands lacs : application au Lac Léman

 Stéphane Pesce , E. Lyautey , R. Vivien , L. Apotheloz Perret Gentil , C. Bonnineau , et al.
Colloque de l'Association Française de Limnologie, Nov 2018, Strasbourg, France. pp.1
Communication dans un congrès hal-02608047v1

Exposure of benthic microbial communities to pharmaceuticals and resulting adaptation including tolerance, biodegradation and antibiotic resistance: advances and challenges

 Chloé Bonnineau , Joan Artigas , Agnes Bouchez , Christophe Dagot , Marion Devers-Lamrani , et al.
EcotoxicoMic 2022, 3rd international conference on Microbial Ecotoxicology, Nov 2022, Montpelier, France
Communication dans un congrès hal-03982093v1

Des biofilms témoins et acteurs du fonctionnement de la rivière

 Frédéric Garabetian , S. Boulêtreau , François Delmas , E. Lyautey , Soizic Morin , et al.
Ecole thématique CNRS - Microbiologie et physico-chimie des biofilms, Oct 2009, Vittel, France. pp.3
Communication dans un congrès hal-02592318v1

Impact de la spéciation du cuivre sur la structure et le fonctionnement d'un écosystème aquatique : étude en mésocosme lotique

 Hélène Roussel , Jean-Marc Bonzom , Selim Ait-Aissa , D. Baird , V. Chauvet , et al.
5. Congrès International de Limnologie-Océanographie, Sep 2002, Paris, France
Communication dans un congrès ineris-00969807v1
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Changes in sediment microbial diversity following chronic copper-exposure induce community copper-tolerance without increasing sensitivity to arsenic

 Ayanleh Mahamoud Ahmed , Vincent Tardy , Chloé Bonnineau , Patrick Billard , Stéphane Pesce , et al.
Journal of Hazardous Materials, 2020, 391, pp.122197. ⟨10.1016/j.jhazmat.2020.122197⟩
Article dans une revue hal-03116548v1

Combined effects of environmental concentrations of copper and arsenic on natural river sediment microbial communities

 Ayanleh Mahamoud Ahmed , Stéphane Pesce , A. Dabrin , C. Bonnineau , J. Gahou , et al.
14th International Conference AquaConSoil, Jun 2017, Lyon, France. pp.27
Communication dans un congrès hal-02606932v1
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Structural and functional response of river sediment microbial communities to environmental concentrations of copper and arsenic, alone or in mixture

 Ayanleh Mahamoud Ahmed , E. Lyautey , A. Dabrin , C. Bonnineau , B. Motte , et al.
1st International Conference on Microbial Ecotoxicology (EcotoxicoMic 2017), Nov 2017, Lyon, France. pp.1, 2017
Poster de conférence hal-02606933v1

Lateral variations and vertical structure of the microbial methane cycle in the sediment of Lake Onego (Russia)

 Camille Thomas , Victor Frossard , Marie-Elodie Perga , Natacha Tofield-Pasche , Hilmar Hofmann , et al.
Inland Waters, 2019, 9 (2), pp.205-226. ⟨10.1080/20442041.2018.1500227⟩
Article dans une revue hal-02627919v1

The impact of ancient mining activity on the critical zone: the example of the Peisey-Nancroix Pb-Ag mine (19th-20th century)

 Magali Rossi , E. Naffrechoux , Emilie Lyautey , Stéphane Pesce , Laura Amigo , et al.
1st RFG meeting (Resources for Future Generation), Jun 2018, Vancouver, Canada
Communication dans un congrès hal-01882486v1
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Utilisation du biofilm comme indicateur fonctionnel pour la caractérisation et la surveillance des cours d'eau : développement et validation de dispositifs de détection et de mesure de la croissance de biofilms in situ (capteurs biofilms)

 François Delmas , Frédéric Garabetian , Soizic Morin , V. Roubeix , A.C. Martins Azevedo , et al.
[Rapport de recherche] Irstea. 2010, pp.180
Rapport hal-02594683v1

Effects of nutrients and warming on Planktothrix dynamics and diversity: a palaeolimnological view based on sedimentary DNA and RNA

 Olga Savichtcheva , Didier Debroas , Marie Elodie Perga , Fabien Arnaud , Clement Villar , et al.
Freshwater Biology, 2015, 60 (1), pp.31-49. ⟨10.1111/fwb.12465⟩
Article dans une revue istex hal-01452304v1
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Electroactivity of phototrophic river biofilms and constitutive cultivable bacteria

 E. Lyautey , A. Cournet , Soizic Morin , S. Bouletreau , L. Etcheverry , et al.
Applied and Environmental Microbiology, 2011, 77, pp.5394-5401. ⟨10.1128/AEM.00500-11⟩
Article dans une revue hal-00655900v1

Viability of differentiated epilithic bacterial communities in the River Garonne (SW France)

 E. Lyautey , S. Boulêtreau , E. Madigou , Frédéric Garabetian
Hydrobiologia, 2010, 637 (1), pp.207-218. ⟨10.1007/s10750-009-9997-0⟩
Article dans une revue istex hal-02594471v1

Spatial distribution of sediment archaeal and bacterial communities relates to the source of organic matter and hypoxia – a biogeographical study on Lake Remoray (France)

 Vincent Tardy , David Etienne , Hélène Masclaux , Valentin Essert , Laurent Millet , et al.
FEMS Microbiology Ecology, 2021, 97 (10), ⟨10.1093/femsec/fiab126⟩
Article dans une revue hal-03439896v1
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Autogenic versus environmental control during development of river biofilm

 Armelle Paule , Émilie Lyautey , Frédéric Garabetian , Jean-Luc Rols
Annales de Limnologie - International Journal of Limnology, 2009, 45, pp.1-10. ⟨10.1051/limn/09007⟩
Article dans une revue hal-00913041v1
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Diversity, Functions and Antibiotic Resistance of Sediment Microbial Communities From Lake Geneva Are Driven by the Spatial Distribution of Anthropogenic Contamination

 Emilie Lyautey , Chloé Bonnineau , Patrick Billard , Jean-Luc Loizeau , Emmanuel Naffrechoux , et al.
Frontiers in Microbiology, 2021, 12, ⟨10.3389/fmicb.2021.738629⟩
Article dans une revue hal-03403564v1

Benthic communities can inform about the contamination of large lakes surface sediments: A case-study in Lake Geneva

 Stéphane Pesce , R. Vivien , L. Apotheloz Perret Gentil , C. Bonnineau , C. Casado Martinez , et al.
European Large Lakes Symposium, Sep 2018, Evian, France. pp.13
Communication dans un congrès hal-02608043v1
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Environmental concentrations of copper, alone or in mixture with arsenic, can impact river sediment microbial community structure and functions

 A. Mahamoud Ahmed , E. Lyautey , C. Bonnineau , Aymeric Dabrin , Stéphane Pesce
Frontiers in Microbiology, 2018, 9, 13 p. ⟨10.3389/fmicb.2018.01852⟩
Article dans une revue hal-01927769v1

Two thousand-year reconstruction of livestock production intensity in France using sediment-archived fecal Bacteroidales and source-specific mitochondrial markers

 D. Etienne , M. Destas , E. Lyautey , R. Marti , P. Ruffaldi , et al.
The Holocene, 2015, 25 (9), pp.1384-1393. ⟨10.1177/0959683615585836⟩
Article dans une revue hal-01305098v1
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Recommandations d'un collectif franco-suisse d'experts pour une meilleure évaluation de la qualité écotoxicologique des sédiments par l'étude des communautés benthiques

 Stéphane Pesce , J.D. Ferrari , C. Bonnineau , C. Casado , L. Apotheloz Perret Gentil , et al.
Sciences Eaux & Territoires, 2019, HS, pp.9. ⟨10.14758/SET-REVUE.2019.hs.04⟩
Article dans une revue hal-02609267v1
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AntibiotoolS : Des outils pour caractériser et suivre les antibiotiques et antibiorésistances dans les écosystèmes aquatiques

 C. Bonnineau , Agnes Bouchez , A. Charton , Christophe Dagot , M. Devers , et al.
7ème conférence Eau et Santé, Nov 2019, Villeurbanne, France. pp.1, 2019
Poster de conférence hal-02609885v1

Seasonal Dynamics of Abundance, Structure, and Diversity of Methanogens and Methanotrophs in Lake Sediments

 Emilie Lyautey , Elodie Billard , Nathalie Tissot , Stéphan Jacquet , Isabelle Domaizon
Microbial ecology, 2021, 82 (3), pp.559 - 571. ⟨10.1007/s00248-021-01689-9⟩
Article dans une revue hal-03770085v1

The impact of urban contamination on antibioresistance in microbial communities from periphyton and sediments

 Chloe Bonnineau , Agnes Bouchez , Anais Charton , Christophe Dagot , Marion Devers , et al.
EcotoxicoMic 2020, 2nd International Conference on Microbial Ecotoxicology, Oct 2020, Montpellier (virtual), France
Communication dans un congrès hal-03145351v1

Multi-scale phylogenetic heterogeneity of archaea, bacteria, methanogens and methanotrophs in lake sediments

 Elodie Billard , Isabelle Domaizon , Nathalie Tissot , Fabien Arnaud , Emilie Lyautey
Hydrobiologia, 2015, 751 (751), pp. 159-173. ⟨10.1007/s10750-015-2184-6⟩
Article dans une revue hal-01349098v1

Effectiveness of the clean-up of a PCB contaminated river on lake Bourget ?

 N. Nathalie Cottin , E. Lyautey , B.J.D. Ferrari , B. Clément , V. Verneaux , et al.
CONTASED "Contaminated Sediments: Environmental Chemistry, Ecotoxicology and Engineering", Mar 2015, Ascona, Switzerland
Communication dans un congrès hal-01995512v1

La tolérance et l'adaptation des communautés microbiennes aux micropolluants comme indicateur de l'état des milieux

 Amani Tlili , Stéphane Pesce , E. Lyautey , F. Martin-Laurent , Agnes Bouchez
Séminaire SediCommuTOX, Apr 2017, Villié-Morgon, France. pp.27
Communication dans un congrès hal-02606718v1

Réponse des communautés microbiennes de sédiment à une exposition réaliste au cuivre : Remaniement structurel et acquisition de tolérance

 Ayanleh Mahamoud Ahmed , Vincent Tardy , B. Volat , - Charton A. , C. Bonnineau , et al.
4ème Journées d'Ecotoxicologie Microbienne - Forum Santé Environnement & Molécules, Oct 2018, Valence, France. pp.1, 2018
Poster de conférence hal-02608051v1
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Use and relevance of artificial organic matter substrates to assess the functional effects of metals on natural sediment communities

 Sophie Campiche , Ayanleh Mahamoud Ahmed , C. Casado Martinez , C. Bonnineau , A. Dabrin , et al.
10th International SedNet Conference, Jun 2017, Genoa, Italy. pp.1, 2017
Poster de conférence hal-02606930v1
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In situ translocation experiment to assess the adaptation and resilience of periphytic communities to pharmaceutical substances using a PICT approach

 Hélène Rogue , Cécile Miège , Chloé Bonnineau , Bernadette Volat , Christophe Rosy , et al.
3rd International Conference in Microbial Ecotoxicology, Nov 2022, Montpellier, France
Poster de conférence hal-04372475v1

Les biofilms épilithiques, témoins du niveau d'enrichissement de la Garonne

 Frédéric Garabetian , François Delmas , C. Othoniel , S. Teissier , E. Lyautey
La Garonne dans son bassin, 2005, pp.4-6
Autre publication scientifique hal-02587293v1
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