CV Accueil - Archive ouverte HAL

	Molecular phenotyping to predict neonatal maturity Laurence Liaubet , Nathalie Marty-Gasset , Pauline Brenaut , Laure Gress , Agnès Bonnet EAAP, Aug 2023, Lyon, France Poster de conférence hal-04239517v1
	SK8 : Un service institutionnel de gestion et d'hébergement d'applications Shiny Élise Maigné , Isabelle Sanchez , David Carayon , Joseph Tran , Jean-François Rey Rencontres R 2023, Jun 2023, Avignon (FR), France. Poster de conférence hal-04141247v1
	Leçons apprises de l' évaluation des méthodes d'inférence de réseau de gènes chez Bacillus subtilis Léa Grima , Celine Brouard , Simon De Givry , Anne Goelzer , Élise Maigné Journée Régionale Bioinfo/Biostat, Dec 2022, Toulouse, France. Poster de conférence hal-03882985v1
	ASTERICS: A Tool for the ExploRation and Integration of omiCS data Élise Maigné , Céline Noirot , Jérôme J. Mariette , Yaa Adu Kesewaah , Sébastien Dejean ECCB: 21st European Conference on Computational Biology, Sep 2022, Sitges, Spain. , 2022, ⟨10.7490/f1000research.1119290.1⟩ Poster de conférence hal-03890660v1
	Molecular phenotyping to predict neonatal maturity Laurence Liaubet , Nathalie Marty-Gasset , Pauline Brenaut , Laure Gress , Agnès Bonnet Journées Scientifiques du départment Génétique Animale, Sep 2022, Bordeaux, France Poster de conférence hal-04239539v1
	ASTERICS: A Tool for the ExploRation and Integration of omiCS data Élise Maigné , Céline Noirot , Jérôme J. Mariette , Yaa Adu Kesewaah , Sébastien Dejean Journée Régional Bioinfo/Biostat, Dec 2022, Toulouse, France Poster de conférence hal-03882998v1

	HiCDOC : A/B compartment detection and differential analysis Cyril Kurylo , Matthias Zytnicki , Sylvain Foissac , Élise Maigné 2023, ⟨swh:1:dir:5d9eea392428649c41d31ed01fe6bf69b899a574;visit=swh:1:snp:d754577801ec4863675d53f6864d975b7c831479;anchor=swh:1:rev:35e459d9583f99c610f9f1a7c5886883ca6d8c0b⟩ Logiciel hal-04212832v1
	ASTERICS Elise Maigné , Céline Noirot , Julien Henry , Yaa Adu Kesewaah , Ludovic Badin 2022, ⟨swh:1:dir:313f6ac758c7daab63c6b81a0fe5717de3da7b08;origin=https://forgemia.inra.fr/asterics/asterics;visit=swh:1:snp:241132a0f4b9dc0a22a1f6df8ac9be0f7035428b;anchor=swh:1:rev:fce1072b8cc351d499edf7f700351732ce81a29d⟩ Logiciel hal-04095877v1
	Explo-SIQO Élise Maigné , Thomas Poméon 2018 Logiciel hal-02788348v1
	MODEMO'bovin Élise Maigné , Olivier Pauly 2018 Logiciel hal-02790843v1

	Modemo -Construction et mise à disposition d'un modèle de prévision démographique pour l'élevage bovin français, et test d'application à l'espèce porcine Eva Groshens , Bérengère Lecuyer , Élise Maigné , Olivier Pauly Innovations Agronomiques, 2022, 85, pp.371-382. ⟨10.17180/ciag-2022-vol85-art29⟩ Article dans une revue hal-03791833v1
	Gene regulatory network inference methodology for genomic and transcriptomic data acquired in genetically related heterozygote individuals Lise Pomiès , Celine Brouard , Harold Duruflé , Élise Maigné , Clément Carré Bioinformatics, 2022, 38 (17), pp.4127-4134. ⟨10.1093/bioinformatics/btac445⟩ Article dans une revue hal-03776333v1
	How to make a pie: Reproductible research for empirical economics and econometrics Valérie Orozco , Christophe Bontemps , Élise Maigné , Virginie Piguet , Annie Hofstetter Journal of Economic Surveys, 2020, 34 (5), pp.1134-1169. ⟨10.1111/joes.12389⟩ Article dans une revue hal-03014999v1
	Defining health standards through economic optimisation: The example of colostrum management in beef and dairy production Didier Raboisson , Pauline Trillat , Marie Dervillé , Célia Cahuzac , Élise Maigné PLoS ONE, 2018, 13 (5), pp.1-16. ⟨10.1371/journal.pone.0196377⟩ Article dans une revue hal-01809647v1
	Organic Food Retailing and the Conventionalisation Debate Marion Desquilbet , Élise Maigné , Sylvette Monier Dilhan Ecological Economics, 2018, 150, pp.194-203. ⟨10.1016/j.ecolecon.2018.04.025⟩ Article dans une revue hal-02625996v1
	Internal and contextual drivers of dairy restructuring: evidence from French mountainous areas and post-quota prospects Marie Dervillé , Gilles Allaire , Élise Maigné , Eric E. Cahuzac Agricultural Economics, 2017, 48 (1), pp.91 - 103. ⟨10.1111/agec.12297⟩ Article dans une revue hal-01524565v1
	Crop Production and Crop Diversity in France: A Spatial Analysis Hermann Pythagore Pierre Donfouet , Aleksandra Barczak , Cécile Détang-Dessendre , Élise Maigné Ecological Economics, 2017, 134, pp.29-39. ⟨10.1016/j.ecolecon.2016.11.016⟩ Article dans une revue hal-01535190v1
	Impact of the consumer’s environment on the demand for organic food in France Élise Maigné , Sylvette Monier-Dilhan , Thomas Poméon Journal of Organics, 2017, 4 (1), pp.3-20 Article dans une revue hal-01603846v1
	Carrières d’agriculteurs et transformation des structures des exploitations agricoles Gilles Allaire , Élise Maigné 2017, 357-358, pp.123-144. ⟨10.4000/economierurale.5161⟩ Article dans une revue hal-02483839v1
	How metabolic diseases Impact the use of antimicrobials: a formal demonstration in the field of veterinary medicine Didier D. Raboisson , Maxime Barbier , Élise Maigné PLoS ONE, 2016, 11 (10), pp.1-13. ⟨10.1371/journal.pone.0164200⟩ Article dans une revue hal-02629983v1
	Dynamiques spatiales dans le développement de l’agriculture biologique : entre cohérences territoriales et logiques de marché Gilles Allaire , Eric Cahuzac , Élise Maigné , Thomas Poméon Innovations Agronomiques, 2016, 51, pp.29-40. ⟨10.15454/1.4721171497297053E12⟩ Article dans une revue hal-01652916v1
	Localisation de l’agriculture biologique et accès aux marchés Gilles G. Allaire , Eric E. Cahuzac , Élise Maigné , Thomas Poméon Revue d'Etudes en Agriculture et Environnement - Review of agricultural and environmental studies, 2015, 96 (02), pp.277-312 Article dans une revue hal-02630489v1
	Evaluating the impact of rural development measures on nature value indicators at different spatial levels: Application to France and The Netherlands Yann Desjeux , Pierre Dupraz , Tom Kuhlman , Maria Luisa Paracchini , Rolf Michels Ecological Indicators, 2015, 59, pp.41-61. ⟨10.1016/j.ecolind.2014.12.014⟩ Article dans une revue hal-02638882v1
	Localisation de l'agriculture biologique et accès aux marchés Gilles Allaire , Eric Cahuzac , Élise Maigné , Thomas Poméon Revue d'Etudes en Agriculture et Environnement - Review of agricultural and environmental studies, 2015, 96 (2), pp.277-312 Article dans une revue hal-01884956v1
	Territorial analysis of the diffusion of organic farming in France : Between heterogeneity and spatial dependence Gilles G. Allaire , Thomas Poméon , Élise Maigné , Eric E. Cahuzac , Michel Simioni Ecological Indicators, 2015, 59 (Decembre 2015), pp.70-81. ⟨10.1016/j.ecolind.2015.03.009⟩ Article dans une revue hal-02637012v1
	La productivité de l’industrie agroalimentaire française de 1996 à 2006 Christophe Bontemps , Vincent V. Requillart , Élise Maigné Economie et Prévision, 2014, 2012/2 (200-201), pp.121-139 Article dans une revue hal-02630531v1
	Diseases, reproductive performance, and changes in milk production associated with subclinical ketosis in dairy cows: A meta-analysis and review Didier D. Raboisson , Michaël Mounié , Élise Maigné Journal of Dairy Science, 2014, 97 (12), pp.7547 - 7563. ⟨10.3168/jds.2014-8237⟩ Article dans une revue hal-02638246v1
	Factors influencing dairy calf and replacement heifer mortality in France. Didier D. Raboisson , Élise Maigné , Pierre Sans , Gilles G. Allaire , Eric E. Cahuzac Journal of Dairy Science, 2014, 97 (1), pp.202-211. ⟨10.3168/jds.2013-6847⟩ Article dans une revue hal-02637092v1
	Réflexion à partir d'une analyse spatiale sur les politiques de soutien et la diffusion de l'agriculture biologique. Gilles G. Allaire , Eric E. Cahuzac , Élise Maigné , Thomas Poméon , Michel Simioni Innovations Agronomiques, 2013, 32, pp.227-241 Article dans une revue hal-02646184v1
	A novel method for mapping agricultural intensity reveals its spatial aggregation: Implications for conservation policies Félix Teillard , Gilles Allaire , Eric Cahuzac , Francois Leger , Élise Maigné Agriculture, Ecosystems & Environment, 2012, 149, pp.135-143. ⟨10.1016/j.agee.2011.12.018⟩ Article dans une revue hal-01019792v1

	Installation en agriculture et renouvellement de la population agricole : retour sur 10 ans de politique de développement rural Gilles G. Allaire , Élise Maigné Le développement rural en Europe. Quel avenir pour le deuxième pilier de la Politique agricole commune ?, 4, Peter Lang, pp.173-203, 2013, Business and Innovation, 978-2-87574-031-1 Chapitre d'ouvrage hal-02803561v1

	Biens produits par l'écosystème Olivier Therond , Muriel Tichit , Anaïs Tibi , Francesco Accatino , Luc Biju‐duval DEPE; Etude_9-EFESE-Agri. Partie III Chapitre 10. 2017 Chapitre de rapport hal-02791226v1
	Services culturels et récréatifs Olivier Therond , Muriel Tichit , Anaïs Tibi , Francesco Accatino , Luc Biju‐duval DEPE; Etude_9-EFESE-Agri. Partie III Chapitre 9. 2017 Chapitre de rapport hal-02791448v1

	ASTERICS: A Tool for the ExploRation and Integration of omiCS data Élise Maigné , Céline Noirot , Jérôme Mariette , Yaa Adu Kesewaah , Sébastien Déjean Les Journées Ouvertes en Biologie, Informatique et Mathématiques (JOBIM), Inria; INRAE, Jul 2022, Rennes, France Communication dans un congrès hal-03697843v1
	How to make a pie? Reproducible Research for Empirical Economics & Econometrics Valérie Orozco , Christophe Bontemps , Élise Maigné , Virginie Piguet , Annie Hofstetter 11e Journées de Recherches en Sciences Sociales (JRSS) - INRA SFER CIRAD, Société Française d'Economie Rurale (SFER). FRA., Dec 2017, Lyon, France. 41 p Communication dans un congrès hal-01939942v1
	Organic food retailing and the conventionalization debate Marion Desquilbet , Sylvette Monier-Dilhan , Élise Maigné Annual Conference of the French Association of Environmental and Resource Economists, Sep 2017, Nancy, France Communication dans un congrès hal-02789332v1
	Distribution des produits alimentaires bio et débat sur la conventionnalisation de l’agriculture biologique Marion Desquilbet , Élise Maigné , Sylvette Monier-Dilhan 10es Journées de Recherche en Sciences Sociales (JRSS), Société Française d'Economie Rurale (SFER). FRA., Dec 2016, Paris La Défense, France Communication dans un congrès hal-01605496v1
	Économétrie spatiale des effets environnementaux et sociaux des mesures de développement rural de la politique agricole commune Pierre Dupraz , Yann Desjeux , Laure Latruffe , Eric Cahuzac , Élise Maigné 3. Workshop Crem-Smart Lereco, Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS). FRA.; Institut National de Recherche Agronomique (INRA). UMR Structures et Marchés Agricoles, Ressources et Territoires (1302)., Apr 2015, Rennes, France Communication dans un congrès hal-01209070v1
	The impact of the consumer's environment on the demand for organic products Sylvette Monier-Dilhan , Élise Maigné , Thomas Poméon Regional Studies Association Annual International Conference, "Global growth agendas: Regions, institutions and sustainability", Regional Studies Association (RSA). GBR., May 2015, Piacenza, Italy. np Communication dans un congrès hal-02794119v1
	Case study Midi-Pyrénées Yann Desjeux , Pierre Dupraz , Élise Maigné , Eric Cahuzac SPARD final workshop, Jun 2013, Bruxelles, Belgium. 30 p Communication dans un congrès hal-01208894v1
	The spatial agglomeration of low-input farming intensity : implications for biodiversity conservation Félix F. Teillard d'Eyry , Gilles G. Allaire , Eric E. Cahuzac , Francois F. Leger , Élise Maigné 5. World Congress of Conservation Agriculture incorporating 3rd Farming Systems Design Conference, Sep 2011, Brisbane, Australia. 4 p Communication dans un congrès hal-01000821v1

	Volet "écosystèmes agricoles" de l’Évaluation Française des Écosystèmes et des Services Écosystémiques Olivier Therond , Muriel Tichit , Anaïs Tibi , Francesco Accatino , Luc Biju-Duval [0] INRA. 2017, pp.966 Rapport hal-02791232v1
	Localisation de l’agriculture biologique et accès aux marchés. Livrable 3 du projet de recherche AgriBio3 PEPP « Rôle de la Performance Economique des exploitations et des filières, et des Politiques Publiques, dans le développement de l’AB » Gilles G. Allaire , Eric E. Cahuzac , Élise Maigné , Thomas Poméon 2013 Rapport hal-02810217v1
	Calibration of model and estimation - FRANCE - Yann Desjeux , Pierre Dupraz , Élise Maigné , Eric E. Cahuzac D5.2-France, 2012 Rapport hal-02807850v1

	How To Make A Pie: Reproducible Research for Empirical Economics & Econometrics Valérie Orozco , Christophe Bontemps , Élise Maigné , Virginie Piguet , Annie Hofstetter 2019 Pré-publication, Document de travail hal-02025843v1
	La productivité de l'agro-alimentaire français de 1996 à 2006 Christophe Bontemps , Élise Maigné , Vincent V. Requillart 2010 Pré-publication, Document de travail hal-02818031v1

	L'écosystème Git : fonctionnement, outils, possibilités Élise Maigné 2022 Autre publication scientifique hal-03579693v1
	Package renv : présentation et retour d’expérience Élise Maigné 2021 Autre publication scientifique hal-03579700v1

Elise Maigné

Publications

Molecular phenotyping to predict neonatal maturity

SK8 : Un service institutionnel de gestion et d'hébergement d'applications Shiny

Leçons apprises de l' évaluation des méthodes d'inférence de réseau de gènes chez Bacillus subtilis

ASTERICS: A Tool for the ExploRation and Integration of omiCS data

Molecular phenotyping to predict neonatal maturity

ASTERICS: A Tool for the ExploRation and Integration of omiCS data

HiCDOC : A/B compartment detection and differential analysis

ASTERICS

Explo-SIQO

MODEMO'bovin

Modemo -Construction et mise à disposition d'un modèle de prévision démographique pour l'élevage bovin français, et test d'application à l'espèce porcine

Gene regulatory network inference methodology for genomic and transcriptomic data acquired in genetically related heterozygote individuals

How to make a pie: Reproductible research for empirical economics and econometrics

Defining health standards through economic optimisation: The example of colostrum management in beef and dairy production

Organic Food Retailing and the Conventionalisation Debate

Internal and contextual drivers of dairy restructuring: evidence from French mountainous areas and post-quota prospects

Crop Production and Crop Diversity in France: A Spatial Analysis

Impact of the consumer’s environment on the demand for organic food in France

Carrières d’agriculteurs et transformation des structures des exploitations agricoles

How metabolic diseases Impact the use of antimicrobials: a formal demonstration in the field of veterinary medicine

Dynamiques spatiales dans le développement de l’agriculture biologique : entre cohérences territoriales et logiques de marché

Localisation de l’agriculture biologique et accès aux marchés

Evaluating the impact of rural development measures on nature value indicators at different spatial levels: Application to France and The Netherlands

Localisation de l'agriculture biologique et accès aux marchés

Territorial analysis of the diffusion of organic farming in France : Between heterogeneity and spatial dependence

La productivité de l’industrie agroalimentaire française de 1996 à 2006

Diseases, reproductive performance, and changes in milk production associated with subclinical ketosis in dairy cows: A meta-analysis and review

Factors influencing dairy calf and replacement heifer mortality in France.

Réflexion à partir d'une analyse spatiale sur les politiques de soutien et la diffusion de l'agriculture biologique.

A novel method for mapping agricultural intensity reveals its spatial aggregation: Implications for conservation policies

Installation en agriculture et renouvellement de la population agricole : retour sur 10 ans de politique de développement rural

Biens produits par l'écosystème

Services culturels et récréatifs

ASTERICS: A Tool for the ExploRation and Integration of omiCS data

How to make a pie? Reproducible Research for Empirical Economics & Econometrics

Organic food retailing and the conventionalization debate

Distribution des produits alimentaires bio et débat sur la conventionnalisation de l’agriculture biologique

Économétrie spatiale des effets environnementaux et sociaux des mesures de développement rural de la politique agricole commune

The impact of the consumer's environment on the demand for organic products

Case study Midi-Pyrénées

The spatial agglomeration of low-input farming intensity : implications for biodiversity conservation

Volet "écosystèmes agricoles" de l’Évaluation Française des Écosystèmes et des Services Écosystémiques

Localisation de l’agriculture biologique et accès aux marchés. Livrable 3 du projet de recherche AgriBio3 PEPP « Rôle de la Performance Economique des exploitations et des filières, et des Politiques Publiques, dans le développement de l’AB »

Calibration of model and estimation - FRANCE -

How To Make A Pie: Reproducible Research for Empirical Economics & Econometrics

La productivité de l'agro-alimentaire français de 1996 à 2006

L'écosystème Git : fonctionnement, outils, possibilités

Package renv : présentation et retour d’expérience