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Elisabeth Dirlewanger

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Identifiants chercheurs

Présentation

**Diplômes** 2005 : Habilitation à Diriger des Recherches (HDR) Université de Bordeaux 2 1991 : Thèse de Doctorat de l’Université Paris XI Orsay 1987 : DEA de Biologie Moléculaire et Cellulaire Végétale- Université Paris XI Orsay 1986 : Ingénieur Agronome de l'Ecole Nationale Supérieure d'Agronomie, Rennes **Position actuelle** Directrice de Recherche - Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Département Biologie et Amélioration des Plantes (BAP) Directrice de l'équipe ‘Adaptation du Cerisier au Changement Climatique’ (A3C), UMR Biologie du Fruit et Pathologie (UMR 1332 BFP), Centre de Bordeaux **Thématique de recherche** Les recherches menées par l’équipe ‘Adaptation du Cerisier au Changement Climatique’ (A3C) que je dirige au sein de l’UMR BFP visent à comprendre les réponses adaptatives du cerisier au changement climatique. Elles portent sur l’analyse de caractères liés d’une part à la phénologie en lien avec le réchauffement climatique (besoins en froid pour lever la dormance des bourgeons, besoins en chaud nécessaires à leur débourrement, date de floraison) et, d’autre part, à la qualité du fruit et principalement à la tolérance à l’éclatement, caractère devenant primordiale compte-tenu des épisodes pluvieux de plus en plus fréquents au printemps. Les objectifs principaux de ces recherches visent à identifier 1) les critères phénotypiques les plus pertinents pour évaluer l’ensemble de ces caractères, 2) les déterminants génétiques et moléculaires impliqués dans la variation des caractères liés à la réponse du cerisier soumis à des contraintes environnementales, 3) les données génétiques, phénotypiques et climatiques et les mécanismes à prendre en compte pour prédire les étapes clés de la phénologie et permettre le choix d’idéotypes adaptés aux conditions climatiques futures. A terme, les résultats obtenus devraient permettre la mise en place une sélection assistée par marqueurs (SAM) pour favoriser le choix et la création de matériel végétal adapté aux nouvelles conditions climatiques et produisant des fruits de qualité. L’enjeu économique et sociétal de ces recherches est le maintien, voir l’expansion, de la production de cerisier dans les régions traditionnelles de culture du cerisier et la prospection de nouvelles régions qui deviendront propices à cette culture. En tant que généticienne, je m’intéresse plus particulièrement à l’étude du contrôle génétique des caractères étudiés, aux interactions gène-environnement (GxE) et au développement d’outils utilisables en SAM pour le programme de création variétale du cerisier mené par l’équipe. Ceci comprend la recherche de QTL à partir de descendances F1 et F2 dont l’une est implantée sur plusieurs sites en Europe pour les études GxE, l’identification d’associations marqueur/phénotype (GWAS) basée sur l’étude de la collection de ressource génétique INRAE cerisier et enfin, l’identification de gènes candidats. En parallèle à ces activités sur le cerisier, depuis 2017 et en partenariat avec le Ctifl, je m’investis dans l’étude approfondie de la collection de ressource génétique INRAE noyer, une des plus riches au monde, dans le but d’identifier l’architecture génétique de caractères d’intérêt agronomique pour ensuite mettre à disposition des outils nécessaires à un nouveau programme de création variétale. Les résultats obtenus sauvegardent et valorisent 30 années de recherches INRAE sur le noyer.

Publications

benedicte-wenden
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Genotype-by-environment and QTL-by-environment interactions in sweet cherry (Prunus avium L.) for flowering date

Camille Branchereau , Craig Hardner , Elisabeth Dirlewanger , Bénédicte Wenden , Loïck Le Dantec
Frontiers in Plant Science, 2023, 14, ⟨10.3389/fpls.2023.1142974⟩
Article dans une revue hal-04050266v1
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Genome-wide association mapping in a sweet cherry germplasm collection ( Prunus avium L.) reveals candidate genes for fruit quality traits

Armel Donkpegan , Anthony Bernard , Teresa Barreneche , José Quero-Garcia , Hélène Bonnet
Horticulture research, 2023, 10 (10), pp.uhad191. ⟨10.1093/hr/uhad191⟩
Article dans une revue hal-04264100v1

New insights into flowering date in Prunus : fine mapping of a major QTL in sweet cherry

Camille Branchereau , José Quero-García , Nathalia Helena Zaracho-Echagüe , Laurine Lambelin , Mathieu Fouché
Horticulture research, 2022, 9, pp.uhac042. ⟨10.1093/hr/uhac042⟩
Article dans une revue hal-03582995v1

Fine tuning of hormonal signaling is linked to dormancy status in sweet cherry flower buds

Noémie Vimont , Adrian Schwarzenberg , Mirela Domijan , Armel Donkpegan , Rémi Beauvieux
Tree Physiology, 2021, 41, pp.544-561. ⟨10.1093/treephys/tpaa122⟩
Article dans une revue hal-03038118v1

ChIP-seq and RNA-seq for complex and low-abundance tree buds reveal chromatin and expression co-dynamics during sweet cherry bud dormancy

Noémie Vimont , Fu Xiang Quah , David Guillaume Schöpfer , François Roudier , Elisabeth Dirlewanger
Tree Genetics and Genomes, 2020, 16 (1), pp.9. ⟨10.1007/s11295-019-1395-9⟩
Article dans une revue hal-02623341v1

Yield potential definition of the chilling requirement reveals likely underestimation of the risk of climate change on winter chill accumulation.

José Antonio Campoy , Rebecca Darbyshire , Elisabeth Dirlewanger , José Quero-Garcia , Bénédicte Wenden
International Journal of Biometeorology, 2019, 63 (2), pp.183-192. ⟨10.1007/s00484-018-1649-5⟩
Article dans une revue hal-02625590v1
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From bud formation to flowering: transcriptomic state defines the cherry developmental phases of sweet cherry bud dormancy

Noémie Vimont , Mathieu Fouche , José Antonio Campoy , Meixuezi Tong , Mustapha Arkoun
BMC Genomics, 2019, 20 (1), pp.974. ⟨10.1186/s12864-019-6348-z⟩
Article dans une revue hal-02503665v1
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Bud Dormancy in Perennial Fruit Tree Species: A Pivotal Role for Oxidative Cues

Rémi Beauvieux , Bénédicte Wenden , Elisabeth Dirlewanger
Frontiers in Plant Science, 2018, 9, pp.657. ⟨10.3389/fpls.2018.00657⟩
Article dans une revue hal-02625631v1
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Etude des déterminants génétiques et moléculaires de caractères influencés par le changement climatique chez l'abricotier et le cerisier

José Quero-Garcia , Guillaume Roch , Gérard Charlot , Christian Hilaire , Teresa Barreneche
Innovations Agronomiques, 2016, 50, pp.51-58. ⟨10.15454/1.472108874009284E12⟩
Article dans une revue hal-01578240v1
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Mapping of Candidate Genes Involved in Bud Dormancy and Flowering Time in Sweet Cherry (Prunus avium).

Sophie Castede , José Antonio Campoy , Loick Le Dantec , José Quero-Garcia , Teresa Barreneche
PLoS ONE, 2015, 10 (11), pp.e0143250. ⟨10.1371/journal.pone.0143250⟩
Article dans une revue hal-02640312v1

Genetic determinism of phenological traits highly affected by climate change in Prunus avium: flowering date dissected into chilling and heat requirements

Sophie Castede , José Antonio Campoy , José Quero-Garcia , Loick Le Dantec , Maria-Das-Dores Lafargue
New Phytologist, 2014, 202 (2), pp.703-15. ⟨10.1111/nph.12658⟩
Article dans une revue hal-02637961v1

Transcriptomic profiles accurately predict the dormancy stages in sweet cherry flower buds

Bénédicte Wenden , Noémie Vimont , Mathieu Fouche , José Antonio Campoy , Meixuezi Tong
SEB's Annual meeting, Jul 2019, Sevilla, Spain
Communication dans un congrès hal-02737891v1

Genomics of Fruit Quality, Nutritional Composition and Phytochemical Content of Cherries and Plums

José Quero-Garcia , Igor Pacheco , Amy Lezzoni , Manuel Serradilla , Loïck Le Dantec
27. International Plant and Animal Genome Conference (PAG XXVII), Jan 2019, San Diego, United States
Communication dans un congrès hal-02737887v1

Hormonal control of dormancy in sweet cherry flower buds

Vimont Noémie , Rémi Beauvieux , A. Schwarzenberg , P. Wigge , Elisabeth Dirlewanger
XXX International Horticultural Congress IHC2018: V International Symposium on Plant Genetic Resources and International Symposium on Applied Functional Molecular Biology, ISHS, Aug 2018, Istanbul, Turkey. pp.543-550, ⟨10.17660/actaHortic.2020.1297.71⟩
Communication dans un congrès hal-03356259v1

New sweet cherry genomic tools and their use in marker-assisted breeding

Elisabeth Dirlewanger , Loïck Le Dantec , Teresa Barreneche , Bénédicte Wenden , Timothée Flutre
XXX. International Horticultural Congress, ISHS, Aug 2018, Istanbul, Turkey
Communication dans un congrès hal-02877345v1

New sweet cherry genomic tools and their use in marker-assisted breeding

Elisabeth Dirlewanger , Loïck Le Dantec , Mathieu Fouché , N H Zaracho Echagüe , J. A. Campoy
XXX. International Horticultural Congress, ISHS, Aug 2018, Istanbul, Turkey. pp.533 - 542, ⟨10.17660/actahortic.2020.1297.70⟩
Communication dans un congrès hal-03356206v1

A comparison of sweet cherry chilling requirements estimated using statistical and biological approaches

Bénédicte Wenden , José Quero-Garcia , Elisabeth Dirlewanger , R. Darbyshire
International Symposium on Flowering, Fruit Set and Alternate Bearing, International Society for Horticultural Science (ISHS). INT., 2018, Palerme, Italy. ⟨10.17660/ActaHortic.2018.1229.27⟩
Communication dans un congrès hal-02735478v1
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Statistical analysis of trends in sweet cherry flowering data across Europe

Bénédicte Wenden , Mahendra Mariadassou , José Antonio Campoy , José Quero-Garcia , Elisabeth Dirlewanger
10. International Symposium on Modelling in Fruit Research and Orchard Management, 2017, Leuven, Belgium. ⟨10.17660/ActaHortic.2017.1160.31⟩
Communication dans un congrès hal-02737108v1

The presence of H3K4me3 histone mark is positively correlated with expression at the DAM loci in sweet cherry during dormancy

Noémie Vimont , Rémi Beauvieux , Mustapha Arkoun , Jean-Claude Yvin , Elisabeth Dirlewanger
8. International Cherry Symposium, Jun 2017, Yamagata, Japan. ⟨10.17660/ActaHortic.2019.1235.57⟩
Communication dans un congrès hal-02734718v1

Breeding sweet cherries at INRA-Bordeaux: from conventional techniques to marker-assisted selection

José Quero-Garcia , José Antonio Campoy-Corbalan , Sophie Castede , C. Pitiot , Teresa Barreneche
7. International Cherry Symposium, 2017, Plasencia, Spain. ⟨10.17660/ActaHortic.2017.1161.1⟩
Communication dans un congrès hal-02736847v1

Dynamics of bud metabolites during dormancy in sweet cherry genotypes with contrasted chilling requirements

Rémi Beauvieux , Bénédicte Wenden , Patricia Ballias , Hélène Christmann , Yves Gibon
8. International Cherry Symposium, Jun 2017, Yamagata, Japan. ⟨10.17660/ActaHortic.2019.1235.56⟩
Communication dans un congrès hal-02737043v1

Present and future of marker-assisted breeding in sweet and sour cherry

José Quero-Garcia , J.A. Campoy , Teresa Barreneche , Loick Le Dantec , Bénédicte Wenden
8. International Cherry Symposium, Jun 2017, Yamagata, Japan. ⟨10.17660/ActaHortic.2019.1235.1⟩
Communication dans un congrès hal-02736020v1

Genetic analyses of chilling requirements and flowering date in sweet cherry, two key traits for breeding programs

Elisabeth Dirlewanger , José Antonio Campoy , Bénédicte Wenden , Sophie Castede , Loick Le Dantec
14. EUCARPIA Symposium on Fruit Breeding and Genetics, 2017, Bologna, Italy. ⟨10.17660/ActaHortic.2017.1172.57⟩
Communication dans un congrès hal-02733546v1

Flowering time response to temperature in sweet cherry across Europe: multi-cultivar and multi-environment analysis

Bénédicte B. Wenden , Mahendra Mariadassou , José Antonio Campoy , José Quero-Garcia , Elisabeth Dirlewanger
8. International Rosaceae Genomics Conference (RGC8), Jun 2016, Angers, France
Communication dans un congrès hal-02740156v1

Mapping of Candidate Genes Involved in Bud Dormancy and Flowering Time in Sweet Cherry (Prunus avium)

José Antonio Campoy , Sophie Castede , Loick Le Dantec , José Quero-Garcia , Bernard Lafargue
10. Jornadas de fruticultura de la SECH. FruitSECH 2016, Siciedad Espanola de Ciencias., Jan 2016, Murcia, Spain
Communication dans un congrès hal-02793836v1

An unexpected candidate gene may be involved in the control of fruit acidity in peach

Elisabeth Dirlewanger , José Antonio Campoy , Bénédicte B. Wenden , Laurent Richard , Hélène Christmann
8. International Rosaceae Genomics Conference (RGC8), Jun 2016, Angers, France
Communication dans un congrès hal-02739595v1

Genetic Determinism of Chilling and Heat Requirements and Flowering Date, Three Phenological Traits Highly Affected By Climate Change in Sweet Cherry

José Antonio Campoy , Sophie Castede , Loick Le Dantec , José Quero-Garcia , Bernard Lafargue
10. Jornadas de fruticultura de la SECH. FruitSECH 2016, Siciedad Espanola de Ciencias., Jan 2016, Murcia, Spain
Communication dans un congrès hal-02795194v1

Breeding sweet cherry varieties adapted to climate change and producing high-quality fruits

José Quero-Garcia , Teresa Barreneche , Rémi Beauvieux , José Antonio Campoy , Hélène Christmann
10. Plant Biology Meeting, Dec 2015, Valdivia, Chile
Communication dans un congrès hal-02739500v1

Genetic analyses of chilling requirement and flowering date in sweet cherry, two key traits for breeding programs

Elisabeth Dirlewanger , José Antonio Campoy , Bénédicte B. Wenden , Sophie Castede , Loick Le Dantec
14. Eucapia Fruit breeding and genetics symposium, Jun 2015, Bologne, Italy
Communication dans un congrès hal-02793879v1

Statistical analysis of trends in Sweet Cherry flowering data across Europe

Bénédicte B. Wenden , Mahendra Mariadassou , José Antonio Campoy , José Quero-Garcia , Elisabeth Dirlewanger
10. International Symposium on Modelling in Fruit Research and Orchard Management, Jun 2015, Montpellier, France
Communication dans un congrès hal-02793616v1
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A la recherche de méthodes alternatives aux tests biologiques classiques pour la détermination de la date de sortie d'endodormance, la quête du haut débit par le Groupe de Travail Dormance de Perpheclim et d'ODS.

Marc Bonhomme , Jean-Paul Charpentier , Vincent Segura , Luc Pâques , Jean Marc Audergon
Colloque francophone PHENOLOGIE, Nov 2015, Clermont-Ferrand, France. 135 p
Communication dans un congrès hal-01580642v1

Dynamique de métabolites en relation avec l’état de dormance des bougeons floraux chez le cerisier doux

Rémi Beauvieux , Bénédicte B. Wenden , Yves Y. Gibon , Elisabeth Dirlewanger
Colloque Francophone Phénologie, Nov 2015, Clermont-Ferrand, France
Communication dans un congrès hal-02743152v1

Analyse statistique de données multisites de floraison pour le cerisier doux

Bénédicte B. Wenden , Mahendra Mariadassou , José Antonio Campoy , José Quero-Garcia , Elisabeth Dirlewanger
Colloque Francophone Phénologie, Nov 2015, Clermont Ferrand, France
Communication dans un congrès hal-02744122v1

Etude et compréhension du déterminisme génétique et moléculaire de la floraison chez le cerisier doux (Prunus avium)

Sophie Castede , José Antonio Campoy , Loick Le Dantec , José Quero-Garcia , Teresa Barreneche
Colloque Francophone Phénologie, Nov 2015, Clermont-Ferrand, France
Communication dans un congrès hal-02739364v1

Epigenome dynamics during dormancy in sweet cherry

Noémie Vimont , Bénédicte B. Wenden , Sandra Cortijo , Mustapha Arkoun , Jean-Claude Yvin
4. European Workshop on Plant Chromatin, Jun 2015, Uppsala, Sweden. 1 p
Communication dans un congrès hal-02792263v1

Genetic determinism of chilling and heat requirements and flowering date, three phenological traits highly affected by climate change in sweet cherry

Sophie Castede , José Antonio Campoy , José Quero-Garcia , Loick Le Dantec , Maria-Das-Dores Lafargue
22. Conference Fruit/Nuts Workshop. Plant and Animal Genome, Jan 2014, San Diego, United States
Communication dans un congrès hal-02799562v1

Manejo de frutales termplados bajo un escenario de cambio climatico

José Antonio Campoy-Corbalan , Teresa Barreneche , Elisabeth Dirlewanger , Bénédicte B. Wenden , Loick Le Dantec
XV Simposio Internacional de Nogal Pecanero, Sep 2014, Sonora, México
Communication dans un congrès hal-02793929v1
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Breeding sweet cherries at INRA Bordeaux : from conventional techniques to marker-assisted selection

José Quero-Garcia , José Antonio Campoy , Sophie Castede , Teresa Barreneche , Loick Le Dantec
7. International Cherry Symposium, International Society for Horticultural Science (ISHS). INT., Jun 2013, Plasencia, Spain
Communication dans un congrès hal-02810346v1

The impact of global warming on bud dormancy in temperate fruit trees. An approach in sweet cherry

José Antonio Campoy , Loick Le Dantec , José Quero-Garcia , Sophie Castede , Bénédicte B. Wenden
21. Plant and Animal Genome Conference, Jan 2013, San Diego, United States
Communication dans un congrès hal-02807244v1

Sweet cherry phenology in the context of climate change: a systems biology approach

Bénédicte B. Wenden , José Antonio Campoy , José Quero-Garcia , Sophie Castede , Loick Le Dantec
SPS Conference : Plant signalling in a changing environment, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA). FRA., Jul 2013, Evry, France
Communication dans un congrès hal-02804908v1
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Transcriptomic profiles highlight the role of ABA signalling in the regulation of sweet cherry flower bud dormancy

Noémie Vimont , Mathieu Fouché , José Antonio Campoy , Adrián Schwarzenberg , Mirela Domijan
10th International Rosaceae Genomics Conference (RGC 10), Dec 2020, Barcelone, Spain
Poster de conférence hal-03318896v1

Changement climatique et production fruitière : exemple du cerisier. Bilan et perspectives

Elisabeth Dirlewanger , Sophie Castede , Camille Branchereau , Armel Donkpegan , José Quero-Garcia
Séminaire ACCAF, Nov 2019, Noisy-Le-Grand, France. 2019
Poster de conférence hal-02569987v1

Physiological control of dormancy in sweet cherry flower buds

Rémi Beauvieux , Noémie Vimont , Adrian Schwarzenberg , Elisabeth Dirlewanger , Bénédicte Wenden
XXX. International Horticultural Congress, Aug 2018, Istanbul, Turkey. 2018
Poster de conférence hal-02915386v1
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A High Quality Draft Assembly of the Diploid 'Regina' Sweet Cherry Genome

Loick Le Dantec , Nabil Girollet , Mathieu Fouche , Jerome Gouzy , Erika Sallet
Plant & Animal Genome Conference XXVI, Jan 2018, San Diego, United States
Poster de conférence hal-01865005v1

Physiological Analysis of Buds Dormancy in Sweet Cherry

Rémi Beauvieux , Bénédicte Wenden , Camille Benard , Hélène Christmann , Yves Gibon
Plant and Animal Genome XXV, Jan 2017, San Diego, United States. 2017
Poster de conférence hal-01603066v1

The Sweet Cherry Genome: A New Sequencing Project

Mathieu Fouche , Loick Le Dantec , Bénédicte Wenden , José Quero-Garcia , Teresa Barreneche
Plant and Animal Genomes XXV, Jan 2017, San Diego, United States. 2017
Poster de conférence hal-01603064v1

Epigenome and Transcriptome Studies during Dormancy in Sweet Cherry Flower Buds

Noémie Vimont , Mustapha Arkoun , Jean-Claude Yvin , Philip A. Wigge , Elisabeth Dirlewanger
Plant and Animal Genome XXV, Jan 2017, San Diego, United States. 2017
Poster de conférence hal-01603065v1

Molecular and epigenetic mechanisms during dormancy in sweet cherry flower buds

Noémie Vimont , Mustapha Arkoun , Jean-Claude Yvin , Philip A. Wigge , Elisabeth Dirlewanger
27. International Conference on Arabidopsis Research (ICAR 2016), Jun 2016, Gyeongju, South Korea. 2016
Poster de conférence hal-02739199v1

Metabolites analysis of flower buds during dormancy in sweet cherry

Rémi Beauvieux , Bénédicte B. Wenden , Camille Bénard , Hélène Christmann , Yves Y. Gibon
8. International Rosaceae Genomics Conference (RGC8), Jun 2016, Angers, France. 2016
Poster de conférence hal-02739660v1

Molecular and epigenetic mechanisms during dormancy in sweet cherry flower buds

Noémie Vimont , Mustapha Arkoun , Jean-Claude Yvin , Philip A. Wigge , Mathieu Fouché
8. International Rosaceae Genomics Conference (RGC8), Jun 2016, Angers, France. 2016
Poster de conférence hal-02743557v1

Analysis of candidate genes involved in flowering date in sweet cherry (Prunus avium)

Sophie Castede , José Antonio Campoy , Loick Le Dantec , José Quero-Garcia , Bénédicte B. Wenden
7. International Rosaceae Genomics Conference, Jun 2014, Seattle, United States. 2014
Poster de conférence hal-02793294v1

Analysis of trends in Sweet Cherry flowering data across Europe

Bénédicte B. Wenden , José Antonio Campoy-Corbalan , José Quero-Garcia , Elisabeth Dirlewanger
7. International Rosaceae Genomics Conference, Jun 2014, Seattle, United States. 2014
Poster de conférence hal-02798804v1

Candidate genes involved in flowering pathway in sweet cherry (Prunus avium)

Sophie Castede , Loick Le Dantec , José Antonio Campoy , José Quero-Garcia , Bénédicte B. Wenden
7. International Cherry Symposium, Jun 2013, Plasencia, Spain. 2013
Poster de conférence hal-02811411v1

QTL detection of two important traits, chilling requirement and flowering date in sweet cherry (Prunus avium)

Sophie Castede , José Antonio Campoy , José Quero-Garcia , Jacques Joly , Maria-Das-Dores Lafargue
7. International Cherry Symposium, Jun 2013, Plasencia, Spain. 2013
Poster de conférence hal-02808422v1
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Genetic determinism and candidate genes for chilling requirement and flowering date in sweet cherry (Prunus avium)

Sophie Castede , José Antonio Campoy , Maria-Das-Dores Lafargue , José Quero-Garcia , Loick Le Dantec
6. Rosaceous Genomics Conference, Sep 2012, Mezzocorona, Italy. 2012
Poster de conférence hal-02803178v1