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Chapitre XI: Fonctionnement des écosystèmes: métagénomique et intégration des omiques.

 Philippe Bertin , Télesphore Sime-Ngando , Didier Debroas , Denis Le Paslier , Roland Marmeisse , et al.
CNRS. Les cahiers prospectives Génomique environnementale (INEE-CNRS), les cahiers prospectives, pp.73-82, 2013
Chapitre d'ouvrage hal-00913463v1

Recherche de la signature biologique de la dégradation de la chlordécone dans les sols des antilles (Biodechlord). AAP INRA Demichlord, Plan National d’Action Chlordécone, Rapport final, Octobre 2013, 179 p

 Fabrice Martin-Laurent , Wafa Achaouak , Pierre Benoit , J. M. Chovelon , Marion Devers , et al.
2013
Autre publication scientifique hal-03266671v1

Recombinations in Individuals Homozygous by Descent Localize the Friedreich Ataxia Locus in a Cloned 450-kb Interval

 François Rodius , Franck Duclos , Klaus Wrogemann , Denis Le Paslier , Pierre Ougen , et al.
American Journal of Human Genetics, 1970, 54 (6)
Article dans une revue hal-03990489v1
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Deciphering the chemical and microbiological degradation pathways of a recalcitrant molecule: the case of chlordecone

 Oriane Della-Negra , Sébastien Chaussonnerie , Marion L. Chevallier , Agnès Barbance , Delphine Muselet , et al.
EUGLOH Annual Student research Conference 2020, Sep 2020, Szeged, Hungary
Communication dans un congrès hal-04410266v1

Distinct Carbon Isotope Fractionation Signatures during Biotic and Abiotic Reductive Transformation of Chlordecone

 Marion L. Chevallier , Myriel Cooper , Steffen Kuemmel , Agnès Barbance , Denis Le Paslier , et al.
Environmental Science and Technology, 2018, 52 (6), pp.3615-3624. ⟨10.1021/acs.est.7b05394⟩
Article dans une revue cea-02291361v1
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A human gut microbial gene catalogue established by metagenomic sequencing

 Junjie Qin , Ruiqiang Li , Jeroen Raes , Manimozhiyan Arumugam , Kristoffer Solvsten Burgdorf , et al.
Nature, 2010, 464 (7285), pp. 59-65. ⟨10.1038/nature08821⟩
Article dans une revue cea-00908974v1
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Devenir des hydrochlordécones, du mirex et d'autres analogues en condition de (bio)dégradation réductive

 Oriane Della-Negra , Marion L. Chevallier , Sebastien Chaussonnerie , Agnès Barbance , Delphine Muselet , et al.
50e congrès du Groupe Français de recherche sur les Pesticides,, May 2022, Namur, Belgium
Communication dans un congrès hal-04409949v1
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Natural Chlordecone Degradation Revealed by Numerous Transformation Products Characterized in Key French West Indies Environmental Compartments

 Marion L. Chevallier , Oriane Della-Negra , Sébastien Chaussonnerie , Agnès Barbance , Delphine Muselet , et al.
Environmental Science and Technology, 2019, 53 (11), pp.6133-6143. ⟨10.1021/acs.est.8b06305⟩
Article dans une revue hal-02309073v1

Biodechlord search for evidence for microbial degradation of chlordecone in French West Indies contaminated soils

 Fabrice Martin-Laurent , Chloé Merlin , Stéphane Vuilleumier , G. Imfeld , Timothy M Vogel , et al.
Intersol'2014, Mar 2014, Lille, France. 1p
Communication dans un congrès hal-01192455v1

The CIC YAC library : sizing of the clones and determination of clones carrying repeated DNA sequences

 Floriane Creusot , E. Fouilloux , M. Dron , Jacqueline Lafleuriel , G. Picard , et al.
Weeds World, 1995, 2 (2), pp.19-20
Article dans une revue hal-02715259v1

The Gene Coding for Interferon-γ Is Linked to the D12S335 and D12S313 Microsatellites and to the MDM2 Gene

 J.F. Bureau , F. Bihl , M. Brahic , D. Le Paslier
Genomics, 1995, 28 (1), pp.109-112. ⟨10.1006/geno.1995.1114⟩
Article dans une revue istex hal-02526306v1

Construction and characterization of a yeast artificial chromosome library containing seven haploid human genome equivalents.

 H. Albertsen , H. Abderrahim , H. Cann , J. Dausset , D. Le Paslier , et al.
Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 1990, 87 (11), pp.4256-4260. ⟨10.1073/pnas.87.11.4256⟩
Article dans une revue hal-03104109v1
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Back to the Future of Soil Metagenomics

 Joseph Nesme , Wafa Achouak , Spiros N. Agathos , Mark Bailey , Petr Baldrian , et al.
Frontiers in Microbiology, 2016, 7, ⟨10.3389/fmicb.2016.00073⟩
Article dans une revue hal-01923285v1
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Nitrite-driven anaerobic methane oxidation by oxygenic bacteria

 Katharina F. Ettwig , Margaret K. Butler , Denis Le Paslier , Eric Pelletier , Sophie Mangenot , et al.
Nature, 2010, 464 (7288), pp.543-548. ⟨10.1038/nature08883⟩
Article dans une revue cea-00907649v1

Identification and assembly of genomes and genetic elements in complex metagenomic samples without using reference genomes

 H Bjørn Nielsen , Mathieu Almeida , Agnieszka Sierakowska Juncker , Simon Rasmussen , Junhua Li , et al.
Nature Biotechnology, 2014, 32, pp.822-828. ⟨10.1038/nbt.2939⟩
Article dans une revue hal-01195477v1
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Transformation of the recalcitrant pesticide chlordecone by Desulfovibrio sp.86 with a switch from ring-opening dechlorination to reductive sulfidation activity

 Oriane Della-Negra , Sébastien Chaussonnerie , Nuria Fonknechten , Agnès Barbance , Delphine Muselet , et al.
Scientific Reports, 2020, 10 (1), ⟨10.1038/s41598-020-70124-9⟩
Article dans une revue hal-02998150v1
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Microbiological versus Chemical Reductive Sulfidation: An Experimental and Theoretical Study

 Oriane Della-Negra , Brieuc Le Cacher de Bonneville , Sébastien Chaussonnerie , Denis Le Paslier , Gilles Frison , et al.
ACS Omega, 2021, 6 (11), pp.7512-7523. ⟨10.1021/acsomega.0c06041⟩
Article dans une revue hal-03193479v1

Structure, fluctuation and magnitude of a natural grassland soil metagenome.

 Tom Delmont , Emmanuel Prestat , Kevin P. Keegan , Michael Faubladier , Patrick Robe , et al.
The International Society of Microbiologial Ecology Journal, 2012, 6 (9), pp.1677-87. ⟨10.1038/ismej.2011.197⟩
Article dans une revue hal-00747243v1

Reconstructing rare soil microbial genomes using in situ enrichments and metagenomics

 Tom O. Delmont , A. Murat Eren , Lorrie Maccario , Emmanuel Prestat , Özcan C. Esen , et al.
Frontiers in Microbiology, 2015, 6, ⟨10.3389/fmicb.2015.00358⟩
Article dans une revue hal-01589179v1

Discovery and characterization of a new bacterial candidate division using a metagenomic approach on anaerobic sludge digestor

 S. Guermazi , E. Pelletier , C. Dauga , P. Daegelen , T. Bouchez , et al.
ISME-11, International Symposium on Microbial Ecology, Vienna, AUT, 20-25 August 2006, 2006, pp.1
Communication dans un congrès hal-02588209v1

Enrichment and Genome Sequence of the Group I.1a Ammonia-Oxidizing Archaeon “Ca. Nitrosotenuis uzonensis” Representing a Clade Globally Distributed in Thermal Habitats

 Elena Lebedeva , Roland Hatzenpichler , Eric Pelletier , Nathalie Schuster , Sandra Hauzmayer , et al.
PLoS ONE, 2013, 8 (11), pp.e80835. ⟨10.1371/journal.pone.0080835⟩
Article dans une revue hal-02352316v1
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Metabolic diversity among main microorganisms inside an arsenic-rich ecosystem revealed by meta-and proteo-genomics

 P.N. Bertin , A. Heinrich-Salmeron , E. Pelletier , F. Goulhen-Chollet , F. Arsène-Ploetze , et al.
The International Society of Microbiologial Ecology Journal, 2011, 5 (11), pp.1735-1747. ⟨10.1038/ismej.2011.51⟩
Article dans une revue hal-01631857v1

A Conserved Gene Cluster Rules Anaerobic Oxidative Degradation of L-Ornithine

 Nuria Fonknechten , A. Perret , N. Perchat , S. Tricot , C. Lechaplais , et al.
Journal of Bacteriology, 2009, 191 (9), pp.3162-3167. ⟨10.1128/JB.01777-08⟩
Article dans une revue hal-02503069v1

Cloacibacillus evryensis gen. nov., sp. nov., a novel asaccharolytic, mesophilic, amino-acid-degrading bacterium within the phylum Synergistetes', isolated from an anaerobic sludge digester

 A. Ganesan , S. Chaussonnerie , A. Tarradel , C. Dauga , T. Bouchez , et al.
International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, 2008, 58, pp.2003-2012
Article dans une revue hal-02590822v1
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Découverte de différentes espèces bactériennes d'origine antillaise permettant de transformer la chlordécone

 Sébastien Chaussonnerie , Edgardo Ugarte , Déborah Martin , Delphine Muselet , Agnès Barbance , et al.
Rencontres Chlordécone 2022 - Chlordécone, connaître pour agir, Dec 2022, Le Gosier (Guadeloupe), France. CPSN, CLoReCA, 2022. Actes du colloque scientifique « Chlordécone, connaître pour agir ». Le Gosier, Guadeloupe, 12-14 décembre 2022, pp.98-99, 2022
Poster de conférence hal-04380353v1
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Genetic Analysis of Citrobacter sp.86 Reveals Involvement of Corrinoids in Chlordecone and Lindane Biotransformations

 Agnès Barbance , Oriane Della-Negra , Sébastien Chaussonnerie , Valérie Delmas , Delphine Muselet , et al.
Frontiers in Microbiology, 2020, 11, pp.590061. ⟨10.3389/fmicb.2020.590061⟩
Article dans une revue hal-02998518v1

The CIC library: a large insert YAC library for genome mapping in Arabidopsis thaliana

 Floriane Creusot , E. Fouilloux , M. Dron , Jacqueline Lafleuriel , G. Picard , et al.
Plant Journal, 1995, 8 (5), pp.763-770
Article dans une revue hal-02714075v1

Ataxia with vitamin E deficiency: refinement of genetic localization and analysis of linkage disequilibrium by using new markers in 14 families

 N. Doerflinger , C. Linder , K. Ouahchi , Gabor Gyapay , Jean Weissenbach , et al.
American Journal of Human Genetics, 1995, 56 (5), pp.1116-1124
Article dans une revue hal-03831536v1
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Clostridium sticklandii, a specialist in amino acid degradation:revisiting its metabolism through its genome sequence.

 Nuria Fonknechten , Sébastien Chaussonnerie , Sabine Tricot , Aurélie Lajus , Jan Andreesen , et al.
BMC Genomics, 2010, 11 (1), pp.555. ⟨10.1186/1471-2164-11-555⟩
Article dans une revue pasteur-00670622v1
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Microbial Degradation of a Recalcitrant Pesticide: Chlordecone

 Sébastien Chaussonnerie , Pierre-Loïc Saaidi , Edgardo Ugarte , Agnès Barbance , Aurélie Fossey , et al.
Frontiers in Microbiology, 2016, 7, pp.2025. ⟨10.3389/fmicb.2016.02025⟩
Article dans une revue hal-02352188v1
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