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Expressed alleles of imprinted IGF2, DLK1 and MEG3 colocalize in 3D-preserved nuclei of porcine fetal cells

 Yvette Lahbib Mansais , Harmonie Barasc , Maria Marti-Marimon , Florence Mompart , Eddie Iannuccelli , et al.
BMC Cell Biology, 2016, 17, pp.Non Paginé. ⟨10.1186/s12860-016-0113-9⟩
Article dans une revue hal-02637087v1
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Meiotic recombinaison analyses of individual chromosomes in male domestic pigs (sus scrofa domestica)

 Nicolas Mary , Harmonie Barasc , Stéphane Ferchaud , Yvon Billon , Frederic Meslier , et al.
PLoS ONE, 2014, 9 (6), pp.Non Paginé. ⟨10.1371/journal.pone.0099123⟩
Article dans une revue hal-02634784v1

Investigating the nuclear spatial conformation of livestock genomes using Hi-C

 Sylvain Foissac , Hervé Acloque , Florence Mompart , Diane Esquerre , David Robelin , et al.
NGS'16 Genome Annotation, Apr 2016, Barcelone, Spain
Communication dans un congrès hal-01581540v1

Architecture nucléaire du neutrophile au repos et soumis à activation

 Florence Mompart , Eddie Iannuccelli , David Robelin , Yvette Lahbib Mansais , Chantal Delcros , et al.
Symposium GDR Cytogénétique Structurale et Evolutive 2008, Oct 2008, Toulouse, pp.Inconnu
Communication dans un congrès hal-02816623v1

3D nuclear positioning of IGF2 alleles and trans interactions with imprinted genes in pig fetal cells

 Yvette Lahbib Mansais , Maria Marti-Marimon , Valentin Voillet , Harmonie Barasc , Florence Mompart , et al.
Conference on Genome Architecture in Space and Time, Jun 2016, Trieste, Italy. 2016
Poster de conférence hal-02794242v1

Local score based method on pool-sequenced behaviour-divergent quail lines precisely detected selection signatures related to autism

 Simon S. Boitard , Maria Inès M. I. Fariello Rico , Sabine Mercier , David Robelin , Thomas Faraut , et al.
35. Colloque du Petit Pois Déridé, Aug 2013, Marseille, France
Communication dans un congrès hal-02810860v1

Detecting local high-scoring segments: a first stage approach for genome-wide studies

 Gregory Nuel , Mickaël Guedj , J. Wojcik , David Robelin , M. Hoebeke
Statistical Applications in Genetics and Molecular Biology, 2006, 1 (5), pp.52
Article dans une revue hal-00271490v1

QTLMAP, un logiciel pour la détection de QTL dans les populations animales expérimentales.

 J.M. Elsen , Hélène Gilbert , Pascale P. Le Roy , Carole C. Moreno , David Robelin
Journées Scientifiques, Département de Génétique Animale, Apr 2008, Lacanau
Communication dans un congrès hal-02756971v1
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Profiling the landscape of transcription, chromatin accessibility and chromosome conformation of cattle, pig, chicken and goat genomes [FAANG pilot project]

 Sylvain Foissac , Sarah Djebali Quelen , Hervé Acloque , Philippe Bardou , Fany Blanc , et al.
36th International Society for Animal Genetics Conference, Jul 2017, Dublin, Ireland. 2017, ISAG 2017 - Genomes to Phenomes - Abstract Book
Poster de conférence hal-01608449v1
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Multi-species annotation of transcriptome and chromatin structure in domesticated animals

 Sylvain Foissac , Sarah Djebali , Kylie Munyard , Nathalie Vialaneix , Andrea Rau , et al.
BMC Biology, 2019, 17 (1), 25 p. ⟨10.1186/s12915-019-0726-5⟩
Article dans une revue hal-02437599v1

Construction of whole genome interaction maps and study of correlation with gene expression level in fetal muscle cells

 Maria Marti-Marimon , Hervé Acloque , David Robelin , Matthias Zytnicki , Sarah Djebali , et al.
22. International Colloquim on Animal Cytogenetics and Genomics (ICACG), Jul 2016, Toulouse, France. INRA - INP - ENVT, Chromosome Research, 24 (S1), 116 p., 2016, 22nd International Colloquim on Animal Cytogenetics and Genomics
Poster de conférence hal-02743692v1

Présentation du projet ANR 2008 SheepSNPQTL : utilisation de la puce 60 000 SNP pour la cartographie fine de QTL chez les ovins.

 Carole Moreno-Romieux Moreno , Andres Legarra , David Robelin , Christèle Robert-Granié , Rachel Rupp , et al.
Journées Scientifiques, Département de Génétique Animale, Apr 2008, Lacanau, France
Communication dans un congrès hal-02813290v1

3D nuclear organization of the CMH complex in control and LPS-activated porcine and human macrophages

 Florence Mompart , David Robelin , Claire Gaillard , Martine M. Yerle
22. International Colloquim on Animal Cytogenetics and Genomics (ICACG), Jul 2016, Toulouse, France. 116 p
Communication dans un congrès hal-01533941v1
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QGP: Quantitative Genetics Platform. A high performance computing solution for quantitative genetics software

 Misharl Monsoor , André Neau , Martin Souchal , Sylvie Nugier , François Laperruque , et al.
Journées Ouvertes en Biologie, Informatique et Mathématiques - JOBIM 2012, Jul 2012, Rennes, France. LIRMM UMR CNRS/UM2 5506, 2012, Journées Ouvertes de Biologie, Informatique et Mathématiques
Poster de conférence hal-02749290v1
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Local Score Based Method On Pool-Sequenced Behavior-Divergent Quail Lines Precisely Detected Selection Signatures Related To Autism

 Maria Inès Fariello Rico , Cécile Arnould , Simon Boitard , Patrice Dehais , Thomas Faraut , et al.
Journée Régionale de Bioinformatique et Biostatistique, Génopole Toulouse, Jun 2014, Toulouse, France. 2014
Poster de conférence hal-01194044v1
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3D organization of telomeres in control and LPS-activated neutrophils

 Florence Mompart , David Robelin , Chantal Delcros , Martine Yerle-Bouissou
Cold spring Harbor meeting, Sep 2012, New York, United States. 2012
Poster de conférence hal-02804452v1

3D nuclear positioning of IGF2 alleles and trans interactions with imprinted genes in pig fetal cells

 Yvette Lahbib Mansais , Maria Marti-Marimon , Valentin Voillet , Harmonie Barasc , Florence Mompart , et al.
22. International Colloquim on Animal Cytogenetics and Genomics (ICACG), Jul 2016, Toulouse, France. 116 p
Communication dans un congrès hal-02743243v1

Meiotic recombination analysis for individual chromosomes in male pigs

 Nicolas Mary , Harmonie Barasc , Stéphane Ferchaud , Yvon Billon , Frederic Meslier , et al.
21. International Colloquium on Animal Cytogenetics and Gene mapping, Jun 2014, Ischia, Italy. ⟨10.1007/s10577-014-9435-7⟩
Communication dans un congrès hal-02739753v1

3D organization of telomeres in control and LPS-activated porcine neutrophils

 Florence Mompart , David Robelin , Chantal Delcros , Martine Yerle-Bouissou
20. International Colloquium on Animal Cytogenetics and Gene Mapping, Apr 2012, Cordoba, Spain
Communication dans un congrès hal-02750360v1

Pool-hmm: a Python program for estimating the allele frequency spectrum and detecting selective sweeps from next generation sequencing of pooled samples

 Simon S. Boitard , Robert Kofler , Pierre Francoise , David Robelin , Christian Schlötterer , et al.
Molecular Ecology Resources, 2013, 13 (2), pp.337-340. ⟨10.1111/1755-0998.12063⟩
Article dans une revue hal-02650144v1

Local Score Based Method On Pool-Sequenced Behavior-Divergent Quail Lines Precisely Detected Selection Signatures Related To Autism

 Maria Inès Fariello Rico , Simon Boitard , S. Mercier , David Robelin , Thomas Faraut , et al.
10. World Congress on Genetics Applied to Livestock Production (WCGALP), Aug 2014, Vancouver, Canada. American Society of Animal Science, 2014, 10th Word Congress on Genetics Applied to Livestock Production
Poster de conférence hal-01194042v1
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Arcitecture nucléaire 3D et expression du génome

 Martine Yerle-Bouissou , Yvette Lahbib Mansais , Florence Mompart , Hervé Acloque , David Robelin
Séminaire du Departement de Génétique Animale, Apr 2014, Fréjus, France. 2013
Poster de conférence hal-02810380v1
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The 3D nuclear conformation of the major histocompatibility complex changes upon cell activation both in porcine and human macrophages

 Florence Mompart , Alain Kamgoué , Yvette Lahbib Mansais , David Robelin , Agnès Bonnet , et al.
BMC Molecular and Cell Biology, 2021, 22 (1), ⟨10.1186/s12860-021-00384-4⟩
Article dans une revue hal-03350877v1
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Livestock genome annotation: transcriptome and chromatin structure profiling in cattle, goat, chicken and pig

 Sylvain Foissac , Sarah Djebali , Kylie Munyard , Nathalie Vialaneix , Andrea Rau , et al.
2018
Pré-publication, Document de travail hal-02791029v1
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Characterization of 3D genomic interactions in fetal pig muscle

 Maria Eugenia Marti Marimon , Hervé Acloque , Matthias Zytnicki , David Robelin , Sarah Djebali Quelen , et al.
36. International Society for Animal Genetics Conference (ISAG), Jul 2017, Dublin, Ireland. pp.43
Communication dans un congrès hal-02868765v1

QTLMAP : a large possibility software to detect QTL in outbred populations

 Hélène Gilbert , Pascale P. Le Roy , Carole Moreno-Romieux Moreno , David Robelin , Didier Boichard , et al.
The 3rd International Conference of Quantitative Genetics, Aug 2007, Hangzhou, China. pp.1 volume
Communication dans un congrès hal-02820142v1

Pool-HMM & Freq-HMM

 Simon S. Boitard , David Robelin , Robert Koffler
2012
Logiciel hal-02802079v1

DNA sequence drives nucleosome occupancy of yeast promoters

 V. Miele , C. Vaillant , Y. d'Aubenton , David Robelin , B. Prum , et al.
incollection, 2006, --, pp.2783-2784
Article dans une revue hal-00427880v1
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Détection de courts segments inversés dans les génomes - méthodes et applications

 David Robelin
Sciences du Vivant [q-bio]. Université Paris Sud - Paris XI, 2005. Français. ⟨NNT : ⟩
Thèse tel-00010628v1
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Méthodes et outils informatiques du Cati Sicpa

 Alexandre Journaux , Thierry Heirman , Matthieu Matthieu.Reichstadt@inrae.Fr Reichstadt , Thierry Coudert , David Robelin , et al.
Cahier des Techniques de l'INRA, 2018, pp.27-36
Article dans une revue hal-02620322v1
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