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David GOURICHON

DU Adjoint PEAT

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sophie-leroux

	Short communication: Effects of in-ovo injection of endocrine disruptors and methyltransferase inhibitor on quail growth and egg-laying performances Chloé Cerutti , Sophie Leroux , David Gourichon , Yann Labrune , Ingrid David Animal, 2022, 16 (3), ⟨10.1016/j.animal.2022.100464⟩ Article dans une revue hal-03617287v1
	RNA-Seq Data for Reliable SNP Detection and Genotype Calling Frédéric Jehl , Fabien Degalez , Frédéric Lecerf , Maria Bernard , Laetitia Lagoutte Frontiers in Genetics, 2021, 12, pp.655707. ⟨10.3389/fgene.2021.655707⟩ Article dans une revue hal-03276149v1
	Chicken adaptive response to low energy diet: main role of the hypothalamic lipid metabolism revealed by a phenotypic and multi-tissue transcriptomic approach Frédéric Jehl , Colette Désert , Christophe C. Klopp , Mathias Brenet , Andrea Rau BMC Genomics, 2019, 20 (1), ⟨10.1186/s12864-019-6384-8⟩ Article dans une revue hal-02463367v1
	Two new structural mutations in the 5′ region of the ASIP gene cause diluted feather color phenotypes in Japanese quail Annie Robic , Mireille Morisson , Sophie Leroux , David Gourichon , Alain Vignal Genetics Selection Evolution, 2019, 51 (1), pp.12. ⟨10.1186/s12711-019-0458-6⟩ Article dans une revue hal-02105885v1
	Accounting for Linkage Disequilibrium in genome scans for selection without individual genotypes: the local score approach Maria Inès Fariello Rico , Simon Boitard , Sabine Mercier , David Robelin , Thomas Faraut Molecular Ecology, 2017, 26 (14), pp.3700-3714. ⟨10.1111/mec.14141⟩ Article dans une revue hal-01607837v1
	Embryonic environment and transgenerational effects in quail Sophie Leroux , David Gourichon , Christine Leterrier , Yann Labrune , Vincent Coustham Genetics Selection Evolution, 2017, 49 (1), pp.14. ⟨10.1186/s12711-017-0292-7⟩ Article dans une revue hal-01479143v1
	The extent of mRNA editing is limited in chicken liver and adipose, but impacted by tissular context, genotype, age and feeding as exemplified with a conserved edited site in COG3 Pierre-François Roux , Laure Fresard , Morgane Boutin , Sophie Leroux , Christophe C. Klopp G3, 2016, 6 (2), pp.321-335. ⟨10.1534/g3.115.022251⟩ Article dans une revue hal-01251260v1
	Genome-Wide Characterization of RNA Editing in Chicken Embryos Reveals Common Features among Vertebrates Laure Fresard , Sophie Leroux , Pierre-François Roux , Christophe C. Klopp , Stéphane Fabre PLoS ONE, 2015, 10 (5), pp.1-20. ⟨10.1371/journal.pone.0126776⟩ Article dans une revue hal-01207762v1
	Transcriptome-wide investigation of genomic imprinting in chicken Laure Fresard , Sophie Leroux , Bertrand Servin , David Gourichon , Patrice Dehais Nucleic Acids Research, 2014, 42 (6), pp.3768-3782. ⟨10.1093/nar/gkt1390⟩ Article dans une revue hal-01019569v1
	Fine mapping of complex traits in non-model species: using next generation sequencing and advanced intercross lines in Japanese quail Laure Fresard , Sophie Leroux , Patrice Dehais , Bertrand Servin , Hélène Gilbert BMC Genomics, 2012, 13, online (october), Non paginé. ⟨10.1186/1471-2164-13-551⟩ Article dans une revue hal-01129669v1
	Non PCR-amplified transcripts and AFLP® fragments as reduced representations of the quail genome for 454 Titanium sequencing Sophie Leroux , Katia Feve , Florence Vignoles , Olivier Bouchez , Christophe C. Klopp BMC Research Notes, 2010, 3, online (july), Non paginé. ⟨10.1186/1756-0500-3-214⟩ Article dans une revue hal-01129412v1
	Microsatellite mapping of QTLs affecting resistance to coccidiosis (Eimeria tenella) in a Fayoumi × White Leghorn cross Marie-Hélène Pinard-van Der Laan , Bertrand Bed'Hom , Jean-Luc Coville , Frederique Pitel , Katia Feve BMC Genomics, 2009, 10 (1), pp.31. ⟨10.1186/1471-2164-10-31⟩ Article dans une revue hal-02360305v1

	RNA-seq data for detecting reliable SNPs & genotypes in livestock species: interest for coding variant characterization and cis-regulation analysis by allele-specific expression ! Frédéric Jehl , Fabien Degalez , Maria Bernard , Frédéric Lecerf , Laetitia Lagoutte World Poultry Congress (WPC) 2022, Aug 2022, Paris, France Communication dans un congrès hal-04258396v1
	Integrated metabolomic and transcriptomic analysis evaluating heat and feed stress in layer chickens Denis Laloë , Frédéric Jehl , Colette Désert , Morgane Boutin , Sophie Leroux 37. International Society for Animal Genetics (ISAG) Conference, Jul 2019, Lleida, Spain Communication dans un congrès hal-02737948v1
	Molecular characterization of transgenerational epigenetic phenomena after genistein exposure in quail Sophie Leroux , Marie Jérémie , David Gourichon , Vincent Coustham , Tatiana Zerjal Epigenetic Inheritance Symposium 2019, Aug 2019, Zurich, Switzerland Communication dans un congrès hal-02789041v1
	Layers response to a suboptimal diet through phenotype and transcriptome changes in four tissues Frédéric Jehl , M. Brenet , Andrea Rau , Colette Désert , Morgane Boutin 69. Annual Meeting of the European Association of Animal Production, Aug 2018, Dubrovnik, Croatia Communication dans un congrès hal-02734608v1
	Liver and whole blood transcriptome response to chronic heat exposure in laying hens Frédéric Jehl , Andrea Rau , Colette Désert , Morgane Boutin , Kévin Muret 36. International Conference on Animal Genetics (ISAG), Jul 2017, Dublin, Ireland. pp.15 Communication dans un congrès hal-02463163v1
	Quelques résultats issus du programme EpiBird, "Analyses Epigénétiques chez les Oiseaux" Frederique Pitel , Mireille Morisson , Sophie S. Leroux , Alexis Cornuez , Marie-Dominique M.-D. Bernadet 2. Réunion d'Animation épiPHASE, Institut National de Recherche Agronomique (INRA). UAR Département Physiologie Animale et Systèmes d'Elevage (0558)., Mar 2016, Saint-Pée-sur-Nivelle, France Communication dans un congrès hal-02794792v1
	Une modification de l'environnement embryonnaire influence le phénotype des descendants sur trois générations chez la caille Sophie Leroux , David Gourichon , Christine Leterrier , Yann Labrune , Vincent Coustham 11. Journées de la Recherche Avicole et des Palmipèdes à Foie Gras, Mar 2015, Tours, France Communication dans un congrès hal-01194125v1
	Transcriptome-wide investigation of genomic imprinting in chicken Laure Fresard , Sophie Leroux , Bertrand Servin , David Gourichon , Patrice Dehais 22. International Plant and Animal Genome (PAG), Jan 2014, San Diego, United States Communication dans un congrès hal-01193927v1
	Detection de SNP chez la caille : production d'un outil commum pour des programmes scientifiques multiples Sophie Leroux , Patrice Dehais , Alain Vignal , Olivier Bouchez , Thomas Faraut 10. Journées de la Recherche Avicole et Palmipèdes à Foie Gras, Institut Technique de l'Aviculture et des Elevages de Petits Animaux (ITAVI). Nouzilly, FRA. Institut National de la Recherche Agronomique (INRA). Agence nationale de sécurité sanitaire de l'alimentation, de l'environnement et du travail (ANSES), FRA., Mar 2013, La Rochelle, France Communication dans un congrès hal-01190264v1
	Transcriptome-wide investigation of genomic imprinting in chicken Laure L. Fresard , Sophie S. Leroux , David Gourichon , Magali San Cristobal , Nathalie N. Marsaud 33. Conference of the International Society for Animal Genetics, Jul 2012, Cairns, Australia. pp.75 Communication dans un congrès hal-01000657v1
	SNP detection for QTL analysis of social behaviour and production traits in quail Frederique Pitel , Sophie Leroux , Patrice Dehais , Alain Vignal , Olivier Bouchez 33rd Conference of the International Society for Animal Genetics, Jul 2012, Cairns, Australia Communication dans un congrès hal-01191281v1
	SNP-BB : Recherche de QTL pour des caractères de comportement social et de production chez l'oiseau Christine Leterrier , Cécile Arnould , Ludovic Calandreau , Aline Bertin , David Gourichon Colloque Génomique Animale et Microbienne, AGENAE - Analyse du Génome des Animaux d'Elevage (AGENAE). Labo/service de l'auteur, FRA., Mar 2012, La Rochelle, France Communication dans un congrès hal-02746131v1
	Développement de SNP chez la caille par séquençage haut-débit Sophie S. Leroux , Katia K. Feve , Florence F. Vignoles , Olivier O. Bouchez , Laure Frésard 9. Journées de la Recherche Avicole, Mar 2011, Tours, France Communication dans un congrès hal-02750356v1
	Development of polymorphic markers in quail by new generation sequencing Florence Vignoles , Katia Feve , Sophie Leroux , David Gourichon , Christine Leterrier 13. European Poultry Conference (EPC 2010), Aug 2010, Tours, France Communication dans un congrès hal-01193587v1
	Pyroséquençage pour le développement d'EST et de SNP aviaires Frederique Pitel , Alain Vignal , Sophie Leroux , Katia Feve , Florence Vignoles 8èmes Journées de la Recherche Avicole, Mar 2009, Paris (FR), France. pp.594-598 Communication dans un congrès hal-00730058v1
	Projet de pyroséquençage pour le développement d'EST et de SNP aviaires. Frederique Pitel , Alain Vignal , Sophie S. Leroux , Katia K. Feve , Aurelie Secula Tircazes Journées Scientifiques, Département de Génétique Animale, Apr 2008, Lacanau Communication dans un congrès hal-02756545v1

	Transgenerational response to endocrine disruptor : phenotypic, genotypic and epigenotypic analyses in quail Stacy Rousse , Sophie Leroux , David Gourichon , Ludovic Calandreau , Chloé Cerutti Environmental and Agronomical Genomics Symposium, Feb 2024, Toulouse, France. , pp.128, 2024, Book of abstracts Poster de conférence hal-04474289v1
	Transgenerational epigenetics in quail: whole genome DNA methylation analysis Chloé Cerutti , Sophie Leroux , Paul Terzian , Joanna Lledo , David Gourichon Epigenetic Inheritance: Impact for Biology and Society, Aug 2023, Zurich, Switzerland Poster de conférence hal-04212971v1
	Transgenerational epigenetics in quail Chloé Cerutti , Sophie Leroux , Paul Terzian , Joanna Lledo , David Gourichon ECCB2022 - 21st European Conference on Computational Biology, Sep 2022, Sitges, Spain Poster de conférence hal-03935584v1
	CARActérisation Moléculaire de phénomènes Epigénétiques transgénérationneLs chez la caille (CARAMEL) Sophie Leroux , Marie Jérémie , David Gourichon , Vincent Coustham , Tatiana Zerjal 5. Journée d'Animation Scientifique du réseau épiPhase, Jun 2019, Toulouse, France. 35 p., 2019, épiPHASE Poster de conférence hal-02735568v1
	Layers response to suboptimal diet through phenotypic and transcriptomic changes in four tissues Frédéric Jehl , M. Brenet , Andrea Rau , Colette Désert , Morgane Boutin PAG XXVII - Plant & Animal Genome Conference, Jan 2019, San Diego, United States. , 2019 Poster de conférence hal-02789419v1
	Phenotype and multi-tissue transcriptome response to diet changes in laying hens M. Brenet , Andrea Rau , Colette Désert , Morgane Boutin , Kévin Muret 36. Conference of the International Society for Animal Genetics (ISAG), Jul 2017, Dublin, Ireland. 2017, ISAG 2017 - Genomes to Phenomes - Abstract Book Poster de conférence hal-01621916v1
	Liver and whole blood transcriptome response to chronic heat exposure in laying hens Frédéric Jehl , Andrea Rau , Colette Désert , Morgane Boutin , Kévin Muret 36. Conference of the International Society for Animal Genetics (ISAG), Jul 2017, Dublin, Ireland. 2017, Proceedings of the 36th International Conference on Animal Genetics Poster de conférence hal-01605567v1
	Recherche de régions génomiques responsables du diabète insipide et de la couleur de la coquille celadon chez la Caille japonaise par RADseq Sophie Leroux , Anna Marissal , Maria Bernard , Diane Esquerre , Johanna Barbieri 12. Journées de la Recherche Avicole et des Palmipèdes à Foie Gras, Apr 2017, Tours, France. ITAVI - Institut Technique de l'Aviculture, Journées de la Recherche Avicole et des Palmipèdes à Foie Gras, 12, 2017, Journées de la Recherche Avicole et des Palmipèdes à Foie Gras Poster de conférence hal-01604801v1
	Transgenerational effects of modifications of the embryonic environment in quail Sophie Leroux , David Gourichon , Christine Leterrier , Yann Labrune , Vincent Coustham latsis symposium 2017, Aug 2017, Zürich, Switzerland. 2017 Poster de conférence hal-02785014v1
	Transgenerational effects of modifications of the embryonic environment in quail Sophie Leroux , David Gourichon , Christine Leterrier , Yann Labrune , Vincent Coustham 10. European Symposium on Poultry Genetics (ESPG), Jun 2017, St Malo, France. 2017 Poster de conférence hal-02789943v1
	Caractérisation d'une duplication de 71kb au locus ASIP impliquée dans le phénotype beige/fawn du plumage de la caille japonaise Annie Robic , Sophie Leroux , David Gourichon , Damien Trussardi , Tatiana Zerjal 12. Journées de la Recherche Avicole et des Palmipèdes à Foie Gras, Apr 2017, Tours, France. ITAVI - Institut Technique de l'Aviculture, 1124 p., 2017, 12èmes Journées de la Recherche Avicole et des Palmipèdes à Foie Gras Poster de conférence hal-01602669v1
	Analyse du méthylome chez l'embryon de poulet par séquençage haut-débit Marjorie Mersch , Celine Noirot , Sophie Leroux , Diane Esquerre , David Gourichon 12. Journées de la Recherche Avicole et des Palmipèdes à Foie Gras, Apr 2017, Tours, France. ITAVI - Institut Technique de l'Aviculture, 1124 p., 2017, 12èmes Journées de la Recherche Avicole et des Palmipèdes à Foie Gras Poster de conférence hal-01606018v1
	Transgenerational effects of modifications of the embryonic environment in quail Sophie Leroux , David Gourichon , Christine Leterrier , Yann Labrune , Vincent Coustham PAG XXIV - Plant and Animal Genome Conference, Jan 2016, San Diégo, United States. 2016 Poster de conférence hal-02792417v1
	Transgenerational effects of modifications of the embryonic environment in quail Tatiana Zerjal , Sophie Leroux , David Gourichon , Christine Leterrier , Yann Labrune 35. International Society for Animal Genetics Conference, Jul 2016, Salt Lake City, United States. ASAS - American Society of Animal Science, Journal of Animal Science, 94 (Supplement 4), 2016, Journal of Animal Science Poster de conférence hal-01533939v1
	Architecture génétique des comportements sociaux et de peur en relation avec les caractères de production chez la caille japonaise Julien Recoquillay , Frederique Pitel , Cécile Arnould , Sophie Leroux , Patrice Dehais 11. Journées de la Recherche Avicole et Palmipèdes à Foie Gras, Mar 2015, Tours, France. ITAVI, Journées de la Recherche Avicole et des Palmipèdes à Foie Gras, 11, 2015, Journées de la Recherche Avicole et des Palmipèdes à Foie Gras Poster de conférence hal-01194127v1
	Simultaneous characterization of genomic regions associated with two feather traits and two eggshell colors in domestic Japanese quail ([i]Coturnix japonica[/i]) Bertrand Bed'Hom , Frederique Pitel , Patrice Dehais , Sophie Leroux , David Gourichon 34. International Society for Animal Genetics Conference (ISAG), Jul 2014, Xi'An, China. 2014 Poster de conférence hal-01193929v1
	Y a-t-il de l'empreinte chez la poule ? Laure Fresard , Sophie Leroux , David Gourichon , Patrice Dehais , Bertrand Servin 10. Journées de la Recherche Avicoles et Palmipèdes à Foie Gras, Mar 2013, La Rochelle, France. pp.551-555, 2013 Poster de conférence hal-01190360v1
	Development of polymorphic markers in quail by next generation sequencing Mireille Morisson , Florence Vignoles , Katia Feve , Sophie Leroux , David Gourichon 32nd Conference of the International Society of Animal Genetics (ISAG), Jul 2010, Edinburgh, United Kingdom. 2010, Proceedings of the 32nd International Conference on Animal Genetics Poster de conférence hal-01193847v1

	A new local score based method applied to behavior-divergent quail lines sequenced in pools precisely detects selection signatures on genes related to autism Maria Inès Fariello Rico , Simon Boitard , Sabine Mercier , David Robelin , Thomas Faraut 2015 Pré-publication, Document de travail hal-01194146v1

	Genome-wide characterization of RNA editing in chicken: lack of evidence for non-A-to-I events Laure Fresard , Sophie Leroux , Pierre-François Roux , Christophe C. Klopp , Stéphane Fabre [University works] auto-saisine. 2014 Rapport hal-01210706v1