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Fouille de texte, un écosystème en évolution

 Claire Nédellec
JNSO - Journées Nationales de la Science Ouverte, Dec 2018, Paris, France
Communication dans un congrès hal-01954718v1
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Annotation Guidelines BIONLP-ST 2016 SeeDev task

 Estelle Chaix , Bertrand B. Dubreucq , Dialekti Valsamou , Abdelhak Fatihi , Louise Deleger , et al.
2016, pp.47
Autre publication scientifique hal-02795594v1

Ontology mapping for wheat trait information management

 Claire Nédellec , Sophie Aubin , Clara Sauvion , Sonia Bravo , Jacques Le Gouis , et al.
Séminaire résidentiel INRAE Semantic Linked Data, 2023
Autre publication scientifique hal-04420465v1
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Learning language in logic - genic interaction extraction challenge

 Claire Nédellec
4. Learning language in logic workshop (LLL05), Aug 2005, Born, Germany
Communication dans un congrès hal-02762818v1

Ontologies and information extraction

 Claire Nédellec , Adeline Nazarenko
, 23 p., 2005
Ouvrages hal-02832403v1

Bibliographical information extraction in genomics

 Claire Nédellec
IEEE Intelligent Systems, 2002, 17 (3), pp.76-80
Article dans une revue hal-02669274v1

Content Mining in Life Sciences

 Claire Nédellec
Science Europe TDM workshop, Oct 2015, Bruxelles, Belgium
Communication dans un congrès hal-01519341v1
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Customized automatic corpus annotations using AlvisNLP/ML

 Mouhamadou Ba , Robert Bossy , Claire Nédellec
BLAH3, Jan 2017, Tokyo, Japan. 11 diapos
Communication dans un congrès hal-02790613v1
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Global alignment for relation extraction in Microbiology

 Anfu Tang , Claire Nédellec , Pierre Zweigenbaum , Louise Deléger , Robert Bossy
Junior Conference on Data Science and Engineering, Feb 2021, Orsay, France
Communication dans un congrès hal-03447763v1
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Un langage de référence pour le phénotypage des animaux d’élevage : l’ontologie ATOL

 Pierre-Yves Le Bail , Jérôme Bugeon , Olivier Dameron , Alice Fatet , Wiktoria Golik , et al.
INRA Productions Animales, 2014, 27 (3), pp.195-208. ⟨10.20870/productions-animales.2014.27.3.3067⟩
Article dans une revue hal-01129862v1

ATOL: an ontology for livestock

 Marie-Christine Meunier-Salaün , Jérôme Bugeon , Olivier Dameron , Alice Fatet , Isabelle Hue , et al.
63. Annual Meeting of the European Federation of Animal Science (EAAP), Aug 2012, Bratislava, Slovakia. Academic Publishers, Annual Meeting of the European Association for Animal Production, 18, 476 p., 2012, Annual Meeting of the European Association for Animal Production
Poster de conférence hal-01210638v1
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BioAlvis II, NLP-based semantic mining of literature on molecular biology of bacteria

 Sophie Aubin , Philippe Bessières , Robert R. Bossy , Laurent Gillard , Julien Jourde , et al.
BioCreative II.5 workshop 2009: special session on digital annotations, Oct 2009, Madrid, Spain
Communication dans un congrès hal-02753174v1

Activité de MIG en IA et bioinformatique

 Claire Nédellec
Bulletin de l'Association Française pour l'Intelligence Artificielle, 2007, 63, pp.25-26
Article dans une revue hal-02653792v1
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Des technologies sémantiques pour l'information scientifique et technique

 Claire Nédellec , Agnès Girard
Frédoc 2013, Oct 2013, Aussois, France
Communication dans un congrès hal-02805803v1
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Deliverable D5.1: Report on method and language for the production of the augmented document representations

 Erick Alphonse , Sophie Aubin , Julien Derivière , Thierry Hamon , Dunja Mladenic , et al.
2006
Pré-publication, Document de travail hal-00101549v1

Ontology and Information Extraction: a necessary symbiosis

 Claire Nédellec , Adeline Nazarenko
Paul Buitelaar, Philipp Cimiano, Bernardo Magnini. Ontology Design and Population, IOS Press, pp.155-170, 2005
Chapitre d'ouvrage hal-00097093v1

Final report on NLP analysis and normalization

 Adeline Nazarenko , Sophie Aubin , Robert Bossy , Tomaz Erjavec , Thierry Hamon , et al.
2007, pp.118
Autre publication scientifique hal-00711871v1
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Proceedings of the learning language in logic ICML joint workshop and the challenge task, extracting relations from biomedical texts

 James Cussens , Claire Nédellec
4. Learning language in logic workshop (LLL05), Jun 2005, York, United Kingdom. 75 p., 2005
Proceedings/Recueil des communications hal-02832103v1
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Omnicrobe, an open-access database of microbial habitats and phenotypes using a comprehensive text mining and data fusion approach

 Sandra Dérozier , Robert Bossy , Louise Deléger , Mouhamadou Ba , Estelle Chaix , et al.
2022
Pré-publication, Document de travail hal-03828105v1
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C-Norm: a neural approach to few-shot entity normalization

 Arnaud Ferré , Louise Deléger , Robert Bossy , Pierre Zweigenbaum , Claire Nédellec
BMC Bioinformatics, 2020, 21 (S23), pp.1-19. ⟨10.1186/s12859-020-03886-8⟩
Article dans une revue hal-03100410v1

Ontologies et recherche d’informations dans le domaine scientifique

 Claire Nédellec
Comunication technique de plein champ : recherche et innovation, Mar 2011, Université Paris Diderot, Paris, France
Communication dans un congrès hal-02802164v1
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More than food: Why restoring the cycle of organic matter in sustainable plant production is essential for the One Health nexus

 Cindy E. Morris , Andrea Radici , Christine N. Meynard , Nicolas Sauvion , Claire Nédellec , et al.
CAB Reviews Perspectives in Agriculture Veterinary Science Nutrition and Natural Resources, 2024, 19, pp.1. ⟨10.1079/cabireviews.2024.0008⟩
Article dans une revue hal-04524528v1
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Text mining tools for extracting information about microbial biodiversity in food

 Estelle Chaix , Louise Deleger , Robert Bossy , Claire Nédellec
Microbial Spoilers in Food 2017, Association pour le Développement de la Recherche Appliquée aux Industries Agricoles et Alimentaires (ADRIA). FRA., Jun 2017, Quimper, France. pp.95
Communication dans un congrès hal-01602552v1

Representation of complex terms in a vector space structured by an ontology for a normalization task

 Arnaud Ferré , Pierre Zweigenbaum , Claire Nédellec
BioNLP 2017 Workshop, Association for Computational Linguistics, Aug 2017, Vancouver, Canada. ⟨10.18653/v1/W17-2312⟩
Communication dans un congrès hal-01582292v1
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BIBLIOME : Acquisition et Formalisation de Connaissances à partir de Textes

 Robert Bossy , Arnaud Ferré , Équipe Bibliome , Claire Nédellec , Louise Deleger
Bulletin de l'Association Française pour l'Intelligence Artificielle, 2020, Dossier « Technologies du Langage Humain », 107, pp.7-9
Article dans une revue hal-03025321v1
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Does constituency analysis enhance domain-specific pre-trained BERT models for relation extraction?

 Anfu Tang , Louise Deléger , Robert Bossy , Pierre Zweigenbaum , Claire Nédellec
BioCreative VII Challenge Evaluation Workshop, Nov 2021, on-line, Spain
Communication dans un congrès hal-03447774v1
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Getting the unknown from the known in bacteria, and the role of text mining

 Philippe Bessières , Robert R. Bossy , Alain-Pierre Manine , Erick Alphonse , Claire Nédellec
Data and Text Mining in Integrative Biology Workshop, associ ECML/PKDD, Sep 2006, Berlin, Germany
Communication dans un congrès hal-02750687v1
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Omnicrobe : une base de données d’habitats et de phénotypes microbiens

 Hélène Falentin , Olivier Harlé , Sandra Derozier , Louise Deléger , Estelle Chaix , et al.
23ème édition du colloque du Club des Bactéries Lactiques, Jun 2022, Rennes, France. , 2022
Poster de conférence hal-03694214v1

Building large lexicalized ontologies from text: a use case in automatic indexing of biotechnology patents

 Claire Nédellec , Wiktoria Golik , Sophie Aubin , Robert R. Bossy
Lecture Notes in Computer Science, 2010, 6317, pp.514-523. ⟨10.1007/978-3-642-16438-5_41⟩
Article dans une revue hal-02661057v1

Named and specific entity detection in varied data: The Quaero Named Entity baseline evaluation

 Olivier Galibert , Ludovic Quintard , Sophie Rosset , Pierre Zweigenbaum , Claire Nédellec , et al.
Seventh International Language Resources and Evaluation (LREC'10), 2010, La Valette, Malta
Communication dans un congrès hal-02496836v1
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