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christele Robert-Granie

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Documents
Identifiants chercheurs

Présentation

Directrice de Recherche INRAE à l'UMR GenPhySE (Génétique, Physiologie et Systèmes d’Elevage) à Toulouse. Mes travaux de recherche visent à perfectionner les outils issus des travaux de la génétique quantitative classique, fondée sur le modèle polygénique et proposer des méthodes statistiques et génétiques d'analyse de nouvelles données issues des progrès significatifs réalisés dans la connaissance des génomes d'animaux. Je développe des outils et méthodes (i) pour maximiser les connaissances extraites des expériences de QTL, en particulier la cartographie des QTL et des gènes afin d’étudier le déterminisme génétique des caractères, (ii) pour analyser les données omiques (transcriptomes, métabolomes, protéomes, etc), (iii) pour optimiser l'efficacité de la sélection en incorporant les informations moléculaires dans les modèles d’évaluation génétique. Mes principales recherches ont porté sur la modélisation des hétérogénéités de variance dans les modèles mixtes gaussiens, l'analyse et la modélisation des données longitudinales dans le cadre des modèles mixtes, l'analyse des données 'omiques et le développement de méthodes innovantes et originales en sélection génomique. Je contribue à la définition des orientations stratégiques et scientifique, à l'animation et au fonctionnement du collectif de recherche du département via mes fonctions de Cheffe de Département Adjointe du département Génétique Animale depuis 2018.

Publications

andres-legarra
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La sélection génomique des ovins laitiers en France

Jean-Michel Astruc , Guillaume G. Baloche , Diane Buisson , Julie Labatut , Gilles Lagriffoul
INRA Productions Animales, 2016, 29 (1), pp.41-56
Article dans une revue hal-02634736v1

Assessment of accuracy of genomic prediction for French Lacaune dairy sheep

Guillaume G. Baloche , Andres Legarra , Guillaume Salle Sallé , Helene H. Larroque , Jean-Michel Astruc
Journal of Dairy Science, 2014, 97 (2), pp.1107-1116. ⟨10.3168/jds.2013-7135⟩
Article dans une revue hal-02634041v1
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Genetic parameters for growth and faecal worm egg count following Haemonchus contortus experimental infestations using pedigree and molecular information

Fabrizio Assenza , Jean-Michel Elsen , Andres Legarra , Clément Carré , Guillaume Sallé
Genetics Selection Evolution, 2014, 46 (1), pp.13. ⟨10.1186/1297-9686-46-13⟩
Article dans une revue hal-01341221v1
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Application of Bayesian least absolute shrinkage and selection operator (LASSO) and BayesCπ methods for genomic selection in French Holstein and Montbéliarde breeds

Carine Colombani Colombani , Andres Legarra , Sebastien S. Fritz , François F. Guillaume , Pascal Croiseau
Journal of Dairy Science, 2013, 96 (1), pp.575-591. ⟨10.3168/jds.2011-5225⟩
Article dans une revue hal-01001340v1
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A comparison of partial least squares (PLS) and sparse PLS regressions in genomic selection in French dairy cattle

Carine Colombani Colombani , Pascal Croiseau , S. S. Fritz , F. F. Guillaume , Andres Legarra
Journal of Dairy Science, 2012, 95 (4), pp.2120-2131. ⟨10.3168/jds.2011-4647⟩
Article dans une revue hal-01000898v1
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Genomic selection in the French Lacaune dairy sheep breed

Sandrine Duchemin , Carine Colombani Colombani , Andres Legarra , Guillaume G. Baloche , Helene H. Larroque
Journal of Dairy Science, 2012, 95 (5), pp.2723-2733. ⟨10.3168/jds.2011-4980⟩
Article dans une revue hal-02644688v1
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Fine tuning genomic evaluations in dairy cattle through SNP pre-selection with the Elastic-Net algorithm

Pascal Croiseau , Andres Legarra , François F. Guillaume , Sébastien S. Fritz , Aurélia A. Baur
Genetics Research, 2011, 93 (6), pp.409-417. ⟨10.1017/S0016672311000358⟩
Article dans une revue hal-01000269v1
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Principes de base de la sélection génomique

Christèle Robert-Granié , Andres Legarra , Vincent Ducrocq
INRA Productions Animales, 2011, 24 (4), pp.331-340
Article dans une revue hal-01000275v1
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Improved lasso for genomic selection

Andres Legarra , Christèle Robert-Granié , Pascal Croiseau , François F. Guillaume , Sébastien S. Fritz
Genetics Research, 2011, 93 (1), pp.77-87. ⟨10.1017/S0016672310000534⟩
Article dans une revue hal-01000151v1
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Product versus additive threshold models for analysis of reproduction outcomes in animal genetics

Ingrid David , Loys L. Bodin , Daniel Gianola , Andres Legarra , Eduardo Manfredi
Journal of Animal Science, 2009, 87 (8), pp.2510-2518. ⟨10.2527/jas.2008-1586⟩
Article dans une revue hal-02656727v1
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Performance of genomic selection in mice

Andres Legarra , Christèle Robert-Granié , Eduardo Manfredi , Jean Michel J. M. Elsen
Genetics, 2008, 180 (1), pp.611-618. ⟨10.1534/genetics.108.088575⟩
Article dans une revue hal-02669161v1

Les chèvres françaises à l’heure de la sélection génomique

Helene Larroque , Isabelle Palhiere , Céline Carillier-Jacquin , Marc Teissier , Andres Legarra
Journées Scientifiques du Département Génétique Animale - La Génétique Animale et les Interactions, Oct 2018, Dienné, France
Communication dans un congrès hal-02788943v1
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French genomic experience: genomics for all ruminant species

Eric Venot , Anne Barbat , Didier Boichard , Pascal Croiseau , Vincent Ducrocq
2016 Interbull Meeting, Oct 2016, Puerto Varas, Chile
Communication dans un congrès hal-02743221v1
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French genomic experience: genomics for all ruminant species

Eric Venot , Didier Boichard , Vincent Ducrocq , Pascal Croiseau , S. Fritz
40. Biennal session of ICAR, Oct 2016, Puerto Varas, Chile
Communication dans un congrès hal-01606324v1
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Toward genomic breeding programs in French dairy sheep and goats

Helene H. Larroque , Francis F. Barillet , Guillaume G. Baloche , Jean-Michel Astruc , Diane Buisson
10. World Congress on Genetics Applied to Livestock Production (WCGALP), Aug 2014, Vancouver, Canada
Communication dans un congrès hal-02742056v1
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Sélection génomique en ovins laitiers en France : principaux résultats et conséquences pour la mise en place de schémas de sélection génomique

Francis F. Barillet , Guillaume G. Baloche , Diane Buisson , Gilles Lagriffoul , Xavier Aguerre
21. Rencontres autour des Recherches sur les Ruminants, Dec 2014, Paris, France. pp.411
Communication dans un congrès hal-02743895v1
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La sélection génomique des ovins laitiers en France : stratégies, premiers résultats des évaluations génomiques et perspectives

Jean-Michel Astruc , Guillaume G. Baloche , Helene H. Larroque , Ignacia Beltran de Heredia , Julie Labatut
19. Rencontres Recherche Ruminants, Dec 2012, Paris, France. pp.81-84
Communication dans un congrès hal-02750263v1
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Comparison of genomic evaluation in Lacaune dairy sheep using single or multiple step GBLUP

Guillaume G. Baloche , Andres Legarra , Gilles Lagriffoul , Helene H. Larroque , Carole Moreno-Romieux Moreno
63. Annual Meeting of the European Association of Animal Production (EAAP), Aug 2012, Bratislava, Slovakia. 476 p., ⟨10.3920/978-90-8686-761-5⟩
Communication dans un congrès hal-02748963v1

Genomic selection in French Lacaune and Manech dairy sheep breeds : comparison of BLUP and GBLUP accuracies

Francis F. Barillet , Guillaume G. Baloche , Gilles Lagriffoul , Helene H. Larroque , Christèle Robert-Granié
38. ICAR Biennal Session, May 2012, Cork, Ireland
Communication dans un congrès hal-02803975v1
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Could genomic selection methods be efficient to detect QTLs? Application in French dairy cattle

Carine Colombani , Pascal Croiseau , Chris Hoze , Sebastien Fritz , François Guillaume
QTLMAS, May 2011, Rennes, France. pp.30
Communication dans un congrès hal-01190269v1
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Work in progress on genomic evaluation using GBLUP in French Lacaune dairy sheep breed

Guillaume G. Baloche , Helene H. Larroque , Jean-Michel Astruc , J.M. Babilliot , M.Y. Boscher
62. Annual Meeting of the European Federation of Animal Science (EAAP), Aug 2011, Stavanger, Norway. 529 p
Communication dans un congrès hal-02746669v1

Application of PLS and Sparse PLS regression in genomic selection

Carine Colombani , Andres Legarra , Pascal Croiseau , F. Guillaume , S. Fritz
9. World Congress on Genetics Applied to Livestock Production, Aug 2010, Leipzig, Germany
Communication dans un congrès hal-01193580v1
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Searching for genes of interest in sheep

Carole Moreno-Romieux Moreno , Jean Michel J. M. Elsen , Andres Legarra , Rachel Rupp , Jacques J. Bouix
8. World Merino Conference, May 2010, Rambouillet, France. pp.1-7
Communication dans un congrès hal-02817254v1
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Lasso bayesiano mejorado para seleccion genomica

Andres Legarra , Christèle Robert-Granié , Pascal Croiseau , Guillaume François , Sébastien Fritz
XV Reunion Nacional de Mejora Genetica Animal, Jun 2010, Vigo, España. pp.1-6
Communication dans un congrès hal-01193386v1

Aptitude of Bayesian lasso for genomic selection

Andres Legarra , Christèle Robert-Granié , Pascal Croiseau , F. Guillaume , S. Fritz
9. World Congress on Genetics Applied to Livestock Production, Aug 2010, Leipzig, Germany
Communication dans un congrès hal-01193524v1

Improving genomic evaluation strategies in dairy cattle through SNP pre-selection

Pascal Croiseau , Carine Colombani , Andres Legarra , F. Guillaume , S. Fritz
9. World Congress on Genetics Applied to Livestock Production, Aug 2010, Leipzig, Germany
Communication dans un congrès hal-01193548v1

Utilisation dune puce 60 000 SNP pour cartographier finement des QTL affectant des caractères de production, de résistance aux maladies et de comportement chez les ovins

Carole Moreno-Romieux Moreno , Bertrand Servin , Thomas Faraut , Christophe C. Klopp , Rachel Rupp
16. Rencontres autour des Recherches sur les Ruminants, Dec 2009, Paris, France
Communication dans un congrès hal-02755058v1

Modèles d'évaluation génomique : application aux populations bovines laitières françaises

F. Guillaume , S. Fritz , Pascal Croiseau , Andres Legarra , Christèle Robert-Granié
16. Rencontres autour des Recherches sur les Ruminants, Dec 2009, Paris, France
Communication dans un congrès hal-01193599v1

Présentation du projet ANR 2008 SheepSNPQTL : utilisation de la puce 60 000 SNP pour la cartographie fine de QTL chez les ovins.

Carole Moreno-Romieux Moreno , Andres Legarra , David Robelin , Christèle Robert-Granié , Rachel Rupp
Journées Scientifiques, Département de Génétique Animale, Apr 2008, Lacanau, France
Communication dans un congrès hal-02813290v1

Modèles conjoints d'analyse de la fertilité femelle et de la fécondance mâle.

Ingrid David , Loys Bodin , Eduardo Manfredi , Andres Legarra , Gilles Lagriffoul
Journées Scientifiques, Département de Génétique Animale, Apr 2008, Lacanau
Communication dans un congrès hal-02755986v1

Performance of genomic selection in mice.

Andres Legarra , Christèle Robert-Granié , Eduardo Manfredi , J.M. Elsen
Journées Scientifiques, Département de Génétique Animale, Apr 2008, Lacanau
Communication dans un congrès hal-02751918v1

Computation of recursive models and an example on fertility traits.

Andres Legarra , Christèle Robert-Granié
8th World Congress on Genetics Applied to Livestock Production, Belo Horizonte, 2006, Brazil, pp.Inconnu
Communication dans un congrès hal-02816393v1
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Genetic parameters of growth and faecal egg counts obtained by using pedigree or SNP information

Fabrizio Assenza , Jean Michel J. M. Elsen , Andres Legarra , Clément Carré , Guillaume Salle Sallé
64. Annual Meeting of the European Federation of Animal Science (EAAP), Aug 2013, Nantes, France. Wageningen Academic Publishers, Annual Meeting of the European Association for Animal Production, 19 (1ère Ed.), 665 p., 2013, Book of Abstracts of the 64th Annual Meeting of the European Federation of Animal Science
Poster de conférence hal-02745089v1

Searching for genes of interest in sheep

Carole Moreno-Romieux Moreno , Jean Michel J. M. Elsen , Andres Legarra , Rachel Rupp , Jacques J. Bouix
61. Annual Meeting of the European Association for Animal Production, Aug 2010, Heraklion, Greece. FEZ - EAAP, 16 (1ère Ed), 2010, 61th Annual Meeting of the European Association for Animal Production
Poster de conférence hal-02755092v1