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Cédric PIONNEAU

COMPETENCES PROFESSIONNELLES

Protéomique
Biochimie des protéines (extraction, fractionnement, chromatographie)
Electrophorèse bidimensionnelle 2D-DIGE
Spectrométrie de masse MALDI-TOF/TOF et LC-MS/MS

Bioinformatique
Analyse des données MS (identification, quantification label-free)
Analyse d’images de gels 2D (DeCyder, SameSpots)

Biologie moléculaire
Extraction d’ADN, PCR
Techniques de marquage moléculaire (microsatellites, RAPD, RFLP, SSCP)

Informatique
Bases de données relationnelles
Langages PHP, HTML, Visual Basic

 

FORMATIONS

2019  Annotation fonctionnelle et interprétation de données protéomiques (PROFI/IFB)
2018  Analyses statistiques : ANOVA pour les « omiques » (INSERM)
2016  Utilisation des outils bioinformatiques de la plateforme PAPPSO pour l’analyse de données protéomiques (INRA)
2015  Sensibilisation aux enjeux ISO 9001 et NFX 50-900 (société LRQA)
2014  Gestion et Management du temps (UPMC)

 

EXPERIENCE PROFESSIONNELLE – STAGES

Depuis 2006
Ingénieur d’études Sorbonne Université sur la Plateforme Post-génomique de la Pitié-Salpêtrière (P3S) : réalisation des projets de protéomique (www.p3s.sorbonne-universite.fr)

2003-2005
CDD d’Ingénieur d’études au Laboratoire de Biologie et Biochimie des Protéines – UFR SMBH, Université Paris XIII – Recherche de biomarqueurs du cancer par approche protéomique 

2002
Stage de DESS Protéomique – société LESAFFRE INTERNATIONAL à Lille – Electrophorèse bidimensionnelle de protéines de levure de boulangerie

2000
CDD au laboratoire CNRS de Génétique et Evolution des Populations Végétales, Université de Lille – Génotypage d’une population d’algue rouge à l’aide de marqueurs microsatellites, analyses statistiques des résultats (logiciels MINITAB et STATGRAPHICS)

1999-2000
CDI Analyste-réalisateur, ABACA INSERTION, Paris – Gestion d’une interface logicielle assurant la migration des données de la base du personnel de la société Renault

1998
stage de DEA au Laboratoire d’Amélioration Génétique des Arbres Forestiers - INRA à Cestas-Pierroton (33) – Electrophorèse bidimensionnelle de protéines de xylème en formation chez le pin maritime et l’eucalyptus

1996-1997
stage au Laboratoire d’Amélioration Génétique des Arbres Forestiers – INRA à Cestas-Pierroton – Génotypage d’une descendance de pin maritime à l’aide de marqueurs RAPD, cartographie génétique

 

Journal articles27 documents

  • Anchel González-Barriga, Louison Lallemant, Diana Dincã, Sandra Braz, Hélène Polvèche, et al.. Integrative Cell Type-Specific Multi-Omics Approaches Reveal Impaired Programs of Glial Cell Differentiation in Mouse Culture Models of DM1. Frontiers in Cellular Neuroscience, Frontiers, 2021, 15, pp.662035. ⟨10.3389/fncel.2021.662035⟩. ⟨hal-03235993⟩
  • Camille Meslin, Françoise Bozzolan, Virginie Braman, Solenne Chardonnet, Cédric Pionneau, et al.. Sublethal Exposure Effects of the Neonicotinoid Clothianidin Strongly Modify the Brain Transcriptome and Proteome in the Male Moth Agrotis ipsilon. Insects, MDPI, 2021, 12 (2), ⟨10.3390/insects12020152⟩. ⟨hal-03138710⟩
  • Marion Bouvet, Olivier Claude, Maguelonne Roux, Dan Skelly, Nihar Masurkar, et al.. Anti-integrin αv therapy improves cardiac fibrosis after myocardial infarction by blunting cardiac PW1+ stromal cells. Scientific Reports, Nature Publishing Group, 2020, 10 (1), pp.11404. ⟨10.1038/s41598-020-68223-8⟩. ⟨hal-02899381⟩
  • Wei Zhang, Françoise Cochet, Maharajah Ponnaiah, Sandrine Lebreton, Lucrèce Mathéron, et al.. The MPK 8‐ TCP 14 pathway promotes seed germination in Arabidopsis. Plant Journal, Wiley, In press, 100 (4), pp.677-692. ⟨10.1111/tpj.14461⟩. ⟨hal-02322115⟩
  • Karim Dorgham, Nicolas Pietrancosta, Amel Affoune, Olivier Lucar, Tahar Bouceba, et al.. Reverse Immunology Approach to Define a New HIV-gp41-Neutralizing Epitope. Journal of Immunology Research, Hindawi Publishing Corporation, 2019, 2019, pp.9804584. ⟨10.1155/2019/9804584⟩. ⟨hal-02162037⟩
  • Sylvie Briquet, Asma Ourimi, Cédric Pionneau, Juliana Bernardes, Alessandra Carbone, et al.. Identification of Plasmodium falciparum nuclear proteins by mass spectrometry and proposed protein annotation. PLoS ONE, Public Library of Science, 2018, 13 (10), pp.e0205596. ⟨10.1371/journal.pone.0205596⟩. ⟨hal-01927646⟩
  • Amandine Anastacio, Kenny Rodriguez-Wallberg, Solenne Chardonnet, Cédric Pionneau, Christian Federici, et al.. Protein profile of mouse ovarian follicles grown in vitro. Molecular Human Reproduction, Oxford University Press (OUP), 2017, 23 (12), pp.827-841. ⟨10.1093/molehr/gax056⟩. ⟨hal-02552340⟩
  • Carlos Dombret, Daphné Capela, Kévin Poissenot, Caroline Parmentier, Emma Bergsten, et al.. Neural Mechanisms Underlying the Disruption of Male Courtship Behavior byAdult Exposure to Di(2-ethylhexyl) Phthalate in Mice. Molecular Human Reproduction, Oxford University Press (OUP), 2017, 23 (12), pp.827-841. ⟨10.1289/EHP1443⟩. ⟨hal-01595166⟩
  • Patricia Hermand, Liliane Cicéron, Cédric Pionneau, Catherine Vaquero, Christophe Combadière, et al.. Plasmodium falciparum proteins involved in cytoadherence of infected erythrocytes to chemokine CX3CL1. Scientific Reports, Nature Publishing Group, 2016, 6, pp.33786. ⟨10.1038/srep33786⟩. ⟨hal-01371569⟩
  • Candelaria Merino-Jimenez, Jorge Aragón, Victor Ceja, Griselda Rodriguez-Martinez, Febe E. Cazares-Raga, et al.. Dp71 Delta(78-79) dystrophin mutant stimulates neurite outgrowth in PC12 cells via upregulation and phosphorylation of HspB1. Proteomics, Wiley-VCH Verlag, 2016, 16 (9), pp.1331-1340. ⟨10.1002/pmic.201500211⟩. ⟨hal-01515294⟩
  • Karim Dorgham, Zahir Amoura, Christophe Parizot, Laurent Arnaud, Camille Frances, et al.. Ultraviolet light converts propranolol, a nonselective β-blocker and potential lupus-inducing drug, into a proinflammatory AhR ligand. European Journal of Immunology, Wiley-VCH Verlag, 2015, 45 (11), pp.3174-3187. ⟨10.1002/eji.201445144⟩. ⟨hal-02556942⟩
  • Henri Weidmann, Zahia Touat-Hamici, Hervé Durand, Christian Mueller, Solenne Chardonnet, et al.. SASH1, a new potential link between smoking and atherosclerosis. Atherosclerosis, Elsevier, 2015, 242 (2), pp.571-579. ⟨10.1016/j.atherosclerosis.2015.08.013⟩. ⟨hal-01514450⟩
  • J. Duez, J. P. Holleran, P. A. Ndour, C. Pionneau, S. Diakité, et al.. Mechanical clearance of red blood cells by the human spleen: Potential therapeutic applications of a biomimetic RBC filtration method. Transfusion Clinique et Biologique, Elsevier, 2015, 22 (3), pp.151-157. ⟨10.1016/j.tracli.2015.05.004⟩. ⟨hal-01514449⟩
  • Philippe Mondon, Melanie Hillion, Olivier Peschard, Nada Andre, Thibault Marchand, et al.. Evaluation of dermal extracellular matrix and epidermal-dermal junction modifications using matrix-assisted laser desorption/ionization mass spectrometric imaging, in vivo reflectance confocal microscopy, echography, and histology: effect of age and peptide applications. Journal of Cosmetic Dermatology, Wiley, 2015, 14 (2), pp.152-160. ⟨10.1111/jocd.12135⟩. ⟨hal-01514442⟩
  • Cynthia Frapsauce, Cédric Pionneau, Julien Bouley, Vanina Delarouziere, Isabelle Berthaut, et al.. Proteomic identification of target proteins in normal but nonfertilizing sperm. Fertility and Sterility, Elsevier, 2014, 102 (2), pp.372-380. ⟨10.1016/j.fertnstert.2014.04.039⟩. ⟨hal-01514458⟩
  • A Perrot, C Pionneau, N Azar, C. Baillou, F. M. Lemoine, et al.. Waldenström’s macroglobulinemia harbors a unique proteome where Ku70 is severely underexpressed as compared with other B-lymphoproliferative disorders. Blood Cancer Journal, Nature Publishing Group, 2012, 2 (9), pp.e88-e88. ⟨10.1038/bcj.2012.35⟩. ⟨hal-02558486⟩
  • A. Fekkar, V. Balloy, C. Pionneau, C. Marinach-Patrice, M. Chignard, et al.. Secretome of Human Bronchial Epithelial Cells in Response to the Fungal Pathogen Aspergillus fumigatus Analyzed by Differential In-Gel Electrophoresis. Journal of Infectious Diseases, Oxford University Press (OUP), 2012, 205 (7), pp.1163-1172. ⟨10.1093/infdis/jis031⟩. ⟨hal-02558514⟩
  • A. Fekkar, C. Pionneau, J.Y. Brossas, C. Marinach-Patrice, G. Snounou, et al.. DIGE enables the detection of a putative serum biomarker of fungal origin in a mouse model of invasive aspergillosis. Journal of Proteomics, Elsevier, 2012, 75 (9), pp.2536-2549. ⟨10.1016/j.jprot.2012.01.040⟩. ⟨hal-02558501⟩
  • C. Marinach-Patrice, C. Pionneau, D. Mazier. Spectrométrie de masse en biologie médicale: principes et applications. Bio tribune magazine, 2011, 40 (1), pp.4-12. ⟨10.1007/s11834-011-0061-9⟩. ⟨hal-02558528⟩
  • Aurore Perrot, Cédric Pionneau, Sophie Nadaud, Frederic Davi, Véronique Leblond, et al.. A unique proteomic profile on surface IgM ligation in unmutated chronic lymphocytic leukemia. Blood, American Society of Hematology, 2011, 118 (4), pp.e1-e15. ⟨10.1182/blood-2011-02-335125⟩. ⟨hal-02558548⟩
  • Julien Bouley, Cédric Pionneau, Justine Varinot, Denis Biard, Catherine Genestie, et al.. Proteomic analysis of BRCA1-depleted cell line reveals a putative role for replication protein A2 up-regulation in BRCA1 breast tumor development. PROTEOMICS - Clinical Applications, Wiley-VCH Verlag, 2010, 4 (5), pp.NA-NA. ⟨10.1002/prca.200900107⟩. ⟨hal-02558561⟩
  • C. Frapsauce, C. Pionneau, J. Bouley, V. de Larouzière, I. Berthaut, et al.. Infertilité masculine chez les patients normospermiques : analyse protéomique des spermes normaux non fécondants en fécondation in vitro classique. Gynécologie Obstétrique & Fertilité, Elsevier Masson, 2009, 37 (10), pp.796-802. ⟨10.1016/j.gyobfe.2009.07.014⟩. ⟨hal-02558587⟩
  • Christophe Plomion, C. Pionneau, H. Bailleres. Analysis of protein expression along the normal to tension wood gradient in Eucalyptus gunnii. Holzforschung, De Gruyter, 2003, 57 (4), pp.353-358. ⟨hal-02672696⟩
  • P. Costa, D. Pot, Christian Dubos, J.M. Frigerio, C. Pionneau, et al.. A genetic map of Maritime pine based on AFLP, RAPD and protein markers. TAG Theoretical and Applied Genetics, Springer Verlag, 2000, 100, pp.39-48. ⟨hal-02691111⟩
  • Christophe Plomion, C. Pionneau, J. Brach, P. Costa, H. Bailleres. Compression wood-responsive proteins in developing xylem of maritime pine (Pinus pinaster Ait.). Plant Physiology, American Society of Plant Biologists, 2000, 123, pp.959-969. ⟨hal-02696160⟩
  • Christophe Plomion, P. Hurme, J.M. Frigerio, M. Ridolfi, D. Pot, et al.. Developing SSCP markers in two Pinus species. Molecular Breeding, Springer Verlag, 1999, 5 (1), pp.21-31. ⟨hal-02688015⟩
  • P. Costa, C. Pionneau, G. Bauw, Christian Dubos, N. Bahrmann, et al.. Separation and characterization of needle and xylem maritime pine proteins. Electrophoresis, Wiley-VCH Verlag, 1999, 20 (4-5), pp.1098-1108. ⟨hal-02687346⟩

Conference papers1 document

  • Christophe Plomion, G. Le Provost, Jorge Almiro Paiva, J.M. Gion, Céline Lalanne, et al.. Approches moléculaires de la qualité du bois chez le pin maritime. 12. Colloque, May 2002, Bordeaux, France. ⟨hal-02762381⟩

Poster communications2 documents

  • Cédric Pionneau, Soumia Hamada, Olivier Silvie, Carine Marinach, Solenne Chardonnet. Proteomic analysis of Plasmodium sporozoites limited samples using the timsTOF Pro. Congrès SMAP 2019, Sep 2019, Strasbourg, France. ⟨hal-02861794⟩
  • Solenne Chardonnet, Cédric Pionneau. Analysis of low abundance protein samples using the timsTOF Pro.. Congrès SFEAP 2019, Sep 2019, Albi, France. 22 (3), pp.151-157, 2018. ⟨hal-02862799⟩

Book sections1 document

  • Christophe Plomion, Nasser Bahrman, Paulo Costa, Christian Dubos, Jean-Marc Frigerio, et al.. Proteomics for genetic and physiological studies in forest trees : application in Maritime Pine. Molecular genetics and breeding of forest trees, Haworth press, 2004, 978-1-56022-958-0 978-1-56022-959-9. ⟨hal-02827253⟩