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Evolution and management of the ligneous vegetation during the neolithic: chacoal analysis of two sheepfold caves in Provence (south of France) : (Pendimoun & Perthus II, France)

 J Battentier , Didier Binder , Cécile Lepère , Isabelle Théry-Parisot , S. Thiébault , et al.
9th European plaeobotany and palynology conference, Aug 2014, Padova, Italy
Communication dans un congrès hal-02543157v1

Unexpected predominance of photosynthetic picoeukaryotes in shallow eutrophic lakes

 Shengnan Li , Xiaoli Shi , Cécile Lepère , Mixue Li , Xiujuan Wang , et al.
Journal of Plankton Research, 2016, 38 (4), pp.830-842. ⟨10.1093/plankt/fbw042⟩
Article dans une revue hal-01984159v1
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Distinct Spatial Patterns of SAR11, SAR86, and Actinobacteria Diversity along a Transect in the Ultra-oligotrophic South Pacific Ocean

 Nyree J. West , Cécile Lepère , Carmem-Lara de O. Manes , Philippe Catala , David J. Scanlan , et al.
Frontiers in Microbiology, 2016, 7, pp.234. ⟨10.3389/fmicb.2016.00234⟩
Article dans une revue hal-01294340v1

Geographic distance and ecosystem size determine the distribution of smallest protists in lacustrine ecosystems.

 Cécile Lepère , Isabelle Domaizon , Najwa Taïb , Jean-François Mangot , Gisèle Bronner , et al.
FEMS Microbiology Ecology, 2013, 85 (1), epub ahead of print. ⟨10.1111/1574-6941.12100⟩
Article dans une revue hal-00806709v1

Photosynthetic picoeukaryote community structure in the South East Pacific Ocean encompassing the most oligotrophic waters on Earth

 Cécile Lepère , Daniel Vaulot , David J. Scanlan
Environmental Microbiology, 2009, 11 (12), pp.3105-3117. ⟨10.1111/j.1462-2920.2009.02015.x⟩
Article dans une revue istex hal-01254025v1

Genetic diversity of freshwater small eukaryotes in the largest french natural lake (Bourget)

 Cécile Lepère , Isabelle Domaizon , Didier Debroas
European Large Lakes Symposium 2006 - Ecosystem changes and their ecological and socioeconomic impacts, Sep 2006, Tartu, Estonia. 1 p., 2006
Poster de conférence hal-02811582v1

Community structure and dynamics of small eukaryotes targeted by new oligonucleotide probes: new insight into the lacustrine microbial food web

 Jean-François Mangot , Cécile Lepère , Christophe Bouvier , Didier Debroas , Isabelle Domaizon
Applied and Environmental Microbiology, 2009, 75 (19), pp.6373-81. ⟨10.1128/AEM.00607-09⟩
Article dans une revue hal-00528240v1

Analysis of the Role of a Putative Fusion Peptide in HBV Entry

 Cécile Lepère , Maud Trotard , Jacques Le Seyec , Philippe Gripon
International MeetingThe Molecular Biology of Hepatitis B Viruses, Aug 2008, San Diego, United States
Communication dans un congrès hal-00677661v1

Unexpected importance of potential parasites in the composition of the freshwater small-eukaryote community

 Cécile Lepère , Isabelle Domaizon , Didier Debroas
Applied and Environmental Microbiology, 2008, 74 (10), pp.2940-9. ⟨10.1128/AEM.01156-07⟩
Article dans une revue hal-00528208v1

Vertical structure of small eukaryotes in three lakes that differ by their trophic status: a quantitative approach

 Cécile Lepère , Sylvie Masquelier , Jean-François Mangot , Didier Debroas , Isabelle Domaizon
The International Society of Microbiologial Ecology Journal, 2010, 4, pp.1509-1519. ⟨10.1038/ismej.2010.83⟩
Article dans une revue hal-00528243v1

Involvement of the phosphatidylinositol 4-kinases of type III at the entry and replication stages of the Hepatitis C Virus life cycle

 Maud Trotard , Cécile Lepère , Morgane Régeard , Claire Piquet-Pellorce , Dimitri Lavillette , et al.
The 34th European Symposium on Hormones and Cell Regulation, Sep 2009, Obernai, France
Communication dans un congrès hal-00676589v1
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Metagenomes of the picoalga Bathycoccus from the Chile coastal upwelling.

 Daniel Vaulot , Cécile Lepère , Eve Toulza , Rodrigo de La Iglesia , Julie Poulain , et al.
PLoS ONE, 2012, 7 (6), pp.e39648. ⟨10.1371/journal.pone.0039648⟩
Article dans une revue hal-00848707v1

Temporal and spatial variations in the composition of freshwater photosynthetic picoeukaryotes revealed by MiSeq sequencing from flow cytometry sorted samples

 Shengnan Li , Gisèle Bronner , Cécile Lepère , Fanxiang Kong , Xiaoli Shi
Environmental Microbiology, 2017, 19 (6), pp.2286 - 2300. ⟨10.1111/1462-2920.13724⟩
Article dans une revue hal-01867890v1

Whole-genome amplification (WGA) of marine photosynthetic eukaryote populations.

 Cécile Lepère , Mikihide Demura , Masanobu Kawachi , Sarah Romac , Ian Probert , et al.
FEMS Microbiology Ecology, 2011, 76 (3), pp.513-23. ⟨10.1111/j.1574-6941.2011.01072.x⟩
Article dans une revue hal-00848702v1

Succession and regulation factors of small eukaryote community composition in a lacustrine ecosystem (Lake Pavin)

 Cécile Lepère , Delphine Boucher , Ludwig Jardillier , Isabelle Domaizon , Didier Debroas
Applied and Environmental Microbiology, 2006, 72 (4), pp.2971-81. ⟨10.1128/AEM.72.4.2971-2981.2006⟩
Article dans une revue hal-00528203v1

Virus, bactéries et protistes pathogènes du phytoplancton, le rôle insoupçonné des parasites dans le fonctionnement des écosystèmes aquatiques

 Stéphan Jacquet , Isabelle Domaizon , Sylvie Masquelier , Cécile Lepère , Laure Guillou , et al.
Le Courrier de l'environnement de l'INRA, 2011, 60 (60), pp.37-50
Article dans une revue hal-01196814v1

Les Réseaux trophiques microbiens

 Isabelle Domaizon , Sébastien Personnic , Jérôme Comte , Cécile Lepère , Abdourahmane Mbade Sène , et al.
Autour du lac du Bourget, May 2006, Le Bourget du Lac, France. pp. 116-124
Communication dans un congrès halshs-00380857v1
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Diversity, spatial distribution and activity of fungi in freshwater ecosystems

 Cécile Lepère , Isabelle Domaizon , Jean-François Humbert , Ludwig Jardillier , Mylène Hugoni , et al.
PeerJ, 2019, 7, pp.e6247. ⟨10.7717/peerj.6247⟩
Article dans une revue hal-02058841v1

Les Réseaux trophiques microbiens : structure et facteurs de contrôle dans le lac du Bourget

 Isabelle Domaizon , Sébastien Personnic , Cécile Lepère , Jérôme Comte , Abdou Mdabe-Sene , et al.
Autour du lac du Bourget - Colloque pluridisciplinaire, May 2006, Le Bourget du Lac, France
Communication dans un congrès hal-02758267v1

Dynamics of ammonia-oxidizing Archaea and Bacteria in contrasted freshwater ecosystems.

 Mylène Hugoni , Sandrine Etien , Antoine Bourges , Cécile Lepère , Isabelle Domaizon , et al.
Research in Microbiology, 2013, 164 (4), a compléter. ⟨10.1016/j.resmic.2013.01.004⟩
Article dans une revue istex hal-00813624v1

A global perspective on marine photosynthetic picoeukaryote community structure.

 Amy R Kirkham , Cécile Lepère , Ludwig E Jardillier , Fabrice Not , Heather Bouman , et al.
The International Society of Microbiologial Ecology Journal, 2013, 7 (5), pp.922-36. ⟨10.1038/ismej.2012.166⟩
Article dans une revue hal-00848701v1
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Plastid 16S rRNA gene diversity among eukaryotic picophytoplankton sorted by flow cytometry from the South Pacific Ocean.

 Xiao Li Shi , Cécile Lepère , David J Scanlan , Daniel Vaulot
PLoS ONE, 2011, 6 (4), pp.e18979. ⟨10.1371/journal.pone.0018979⟩
Article dans une revue hal-00848706v1
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Single Cell Analysis Reveals a New Microsporidia-Host Association in a Freshwater Lake

 Marina Chauvet , Arthur Monjot , Anne Mone , Cécile Lepère
Microbial ecology, In press, ⟨10.1007/s00248-022-02023-7⟩
Article dans une revue hal-03666982v1
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Short-term responses of unicellular planktonic eukaryotes to increases in temperature and UVB radiation.

 Isabelle Domaizon , Cécile Lepère , Didier Debroas , Marc Bouvy , Jean Francois Ghiglione , et al.
BMC Microbiology, 2012, 12, pp.202. ⟨10.1186/1471-2180-12-202⟩
Article dans une revue hal-00816078v1

In situ interactions between photosynthetic picoeukaryotes and bacterioplankton in the Atlantic Ocean: evidence for mixotrophy

 Manuela Hartmann , Michael V. Zubkov , Dave J. Scanlan , Cécile Lepère
Environmental Microbiology Reports, 2013, pp.doi:10.1111/1758-2229.12084
Article dans une revue hal-00848704v1

In situ associations between marine photosynthetic picoeukaryotes and potential parasites – a role for fungi?

 Cécile Lepère , Martin Ostrowski , Manuela Hartmann , Mikhail V. Zubkov , David J. Scanlan
Environmental Microbiology Reports, 2016, 8 (4), ⟨10.1111/1758-2229.12339⟩
Article dans une revue hal-01367397v1
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Diversity and Dynamics of Active Small Microbial Eukaryotes in the Anoxic Zone of a Freshwater Meromictic Lake (Pavin, France)

 Cécile Lepère , Isabelle Domaizon , Mylène Hugoni , Agnès Vellet , Didier Debroas
Frontiers in Microbiology, 2016, 7 (130), ⟨10.3389/fmicb.2016.00130⟩
Article dans une revue hal-01599386v2

Structure et facteurs de régulation du picoplancton eucaryote en milieu lacustre

 Cécile Lepère , Delphine Boucher , Ludwig Jardillier , Isabelle Domaizon , Didier Debroas
2. Colloque d'écologie microbienne, May 2005, Obernai, France
Communication dans un congrès hal-02760863v1

Community composition of lacustrine small eukaryotes in hyper-eutrophic conditions in relation to top-down and bottom-up factors

 Cécile Lepère , Isabelle Domaizon , Didier Debroas
FEMS Microbiology Ecology, 2007, 61 (3), pp.483-95. ⟨10.1111/j.1574-6941.2007.00359.x⟩
Article dans une revue hal-00528205v1

Genetic diversity of freshwater small eukaryotes in the largest French natural lake (Bourget)

 Cécile Lepère , Isabelle Domaizon , Delphine Debroas
8. Congrès International des Limnologues d'Expression Française (CILEF), Apr 2006, Hammamet, Tunisia
Communication dans un congrès hal-02751653v1
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