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74

Dr. Cécile CABASSON, Associate Professor at University of Bordeaux


30 ans d'expérience dans l'Enseignement Supérieur et la Recherche

 

Coordonnées

Adresse UMR 1332 Biologie du Fruit et Pathologie, Centre INRAE Bordeaux Nouvelle Aquitaine, 71, avenue Edouard Bourlaux, 33882 Villenave d'Ornon Cedex, France

Tel +33 (0)5 57 12 25 56

Courriel cecile.cabasson@u-bordeaux.fr

 

TITRES

Doctorat en PhysiologieUniversité des Sciences & Techniques du Languedoc-Montpellier II (Décembre 1993) Mention très honorable

Ecole doctorale "Biologie des systèmes intégrés Agronomie-Environnement"
Laboratoire : CIRAD-BIOTROP
Titre de la thèse : Régénération de la Mandrine commune (Citrus deliciosa Ten.) par embryogenèse somatique en milieu liquide. Fusions somatiques et essais de transformation génétique.” 
Directeur et co-directeur de thèse : Dr. Claude Teisson et Dr. Patrick Ollitrault, CIRAD Montpellier

 

EXPÉRIENCE EN ENSEIGNEMENT

Depuis 2018 Maître de conférences, UF Biologie, Collège Sciences & Technnologies, Université de Bordeaux
UF Biologie : Licence (Physiologie végétale), en Master (Biostatistique)
Responsable de cinq unités d'enseignement en Master et en Licence. Agronomie des plantes à valeurs santé, Complément alimentaire Securité & innovation, Biostatistique, Bio stage dating, Simulating life. 

2000-2018 Maître de conférences, IUT Périgueux, Université de Bordeaux IV
Département Génie biologique : DUT1 (Biologie cellulaire, Physiologie végétale, Ecologie, Statistique) et DUT2 (Ecophysiologie, Biotechnologie)
Responsable pédagogique du DUT1 (2001/2002)
UF Biologie : Master Biologie et Biotechnologie des plantes (Biostatistique)

1999-2000 Attachée temporaire à l'Enseignement et à la Recherche, Dép.Génie biologique, IUT Périgueux, Université de Bordeaux IV
Département Génie biologique : DUT1 (Biologie cellulaire, Ecologie, Statistique)

1993-1994 Attachée temporaire à l'Enseignement et à la Recherche, Université de Montpellier II
UFR Biologie : Préparation au CAPES, DEUG B (Biologie végétale)

1996-1999 Chargée de mission, Université d'Avignon et des Pays du Vaucluse
Formation continue : DAEU-B (Biologie)
Département Génie biologique/IUT d'Avignon : Création de l'option Agronomie

1990-1993 Monitrice de l'enseignement supérieur, Université Montpellier II
UF Bioologie : DEUG B (Biologie végétale TP/TD) 

 

EXPÉRIENCE EN RECHERCHE

Depuis 2002 UMR 1332 Biologie du fruit & Pathologie (UMR 619 Biologie du fruit jusqu'en 2010), Université de Bordeaux et INRAE
Rattachée à l'équipe Métabolisme sous la direction du Dr. Yves GIBON (Pr. D. ROLIN jusqu'en 2010), Département des Sciences de l'Environnement
Thématique de recherche : Etude de la régulation du métabolisme au cours des phases précoces du développement des fruits charnus dans le cadre d’une approche de génomique fonctionnelle chez la tomate.

2010/2011 UMR 5200, Laboratoire de Biogenèse membranaire, CNRS et Université de Bordeaux
Détachement dans l'équipe Métabolisme lipidique sous la direction du Dr JJ Bessoule et R. LESSIRE
Thématique de recherche : Etude du métabolisme des lipides dans la graine de tomate

1999-2000 Equipe de Recherche Appliquée de Périgueux
En collaboration avec l'Institut de Chimie de la Matière Condensée de Bordeaux sous la direction du Pr. G. DEMAZEAU
Thématique de recherche : Application des Hautes Pressions à la conservation des végétaux

1993-1994 Station de Génétique et d'Amélioration des Fruits et Légumes, INRA Avignon 
Rattachée à l'équipe Amélioration des Curcubitaceae sous la Direction des Dr. M. Pitrat et C. Dogimont 
Thématique de recherche : Amélioration génétique du Melon par hybridation somatique pour l'introgression de gènes d'intérêt dans la résistance aux pathogènes.

1992 Citrus Research & Education Center, University of Florida
Stage doctoral dans le laboratoire de Plant Cell Genetics sous la direction du Pr J.W. Grosser
Thématique de recherche : Amélioration génétique des Citrus par hybridation somatique pour l'introgression de gènes d'intérêt pour la flaveur des fruits.

 

PROJETS

  • Participation à plusieurs projets nationaux et européens :

Projet Investissement infrastructure nationale en métabolomique et fluxomique METABOHUB (2013-2024). Analyse et gestion des données.

Projet ANR FRIMOUSS (2015-2019) sur la modélisation du métabolisme des fruits. Quantification des isoprénoïdes et des nucléotides, gestion des données.

Projet FEDER OPTIFRAISE (2015-2018) sur la gestion de l'eau en culture hors-sol. Membre du COPIL, experte en physiologie végétale.

Projet Erasysbio+ Fruit Integrative Modelling (2011-2015). Participation l'échantillonnage et à l'analyse des données.

Projet européen STREP META-PHOR Metabolomics for Plants, Health and Outreach (2006-2009). Participation à l'échantillonnage et mise au point de protocoles d'extraction pour l'analyse RMN haut débit.

Projet Genoplante GEN036 - MetaboP (2004-2006). Contribution à la création de Mery-B a web knowledgebase for the storage, visualization, analysis and annotation of plant NMR metabolomic profiles et interaction avec le Plant Ontology Consortium pour la mise en place d'une ontologie chez la tomate.

Projet Alliance (2005-2006). Collaboration avec la Dr M. Defernez de l'Institut of Food Research à Norwich (UK). Développement d'une méthodologie d'alignement des spectres RMN et d'analyse des données.

 

  • Porteuse de projets locaux :

Projet visiting scholars financé par l’Initiative d'Excellence de Bordeaux (2017). Invitation du Pr J.W Grosser.

Projet d’innovation pédagogique financé par l’Initiative d'Excellence de Bordeaux (2015). Création d'un enseignement hybride en Biostatistique.

 

RESPONSABILITES

Membre de la Plateforme METABOHUB Bordeaux depuis sa création en 2002, labellisée IBISA en 2008
Pilote de processus (2011 à 2014), corresponsable de la gestion des données depuis 2018.

Membre élue à la section CNU 66 depuis 2015 (titulaire depuis 2019)

Membre élue au Comité Technique de l'Université de Bordeaux depuis 2018

Membre élue au Conseil d' Administration del'IUT de Périgueux de 2001 à 2004

Membre du groupe fonctionnel pour la mise en place de la Mission d'Appui à la Pédagogie et à l'Innovation de l'Université de Bordeaux (2014) 

 

FORMATION

1990 - D.E.A. Sciences Agronomique, Université Montpellier II, Ecole Nationale Supérieure d'Agronomie de Montpellier
Titre : La culture d'anthères chez le blé dur (Triticum aestivum turgidum ssp. durum L. : étape de l'androgenèse et variabilité)
Directeur et co-directeur : Dr. Marc Coumans et Pr. J.J. Macheix

 

1989 - Maîtrise Biolgie des Organismes et des Population option Recherche, Université Aix-Marseille III (mention Bien)

1988 - Licence Biologie des Organismes, Université Aix-Marseille III (mention Bien)

1987 - DUT Génie biologie option Agronomie, IUT Villers-lès-Nancy, Université Nancy I

1985 - Baccalauréat C, Académie de Strasbourg

 

 


Journal articles14 documents

  • Théo Poucet, María Begoña González-Moro, Cecile Cabasson, Bertrand Beauvoit, Yves Gibon, et al.. Ammonium supply induces differential metabolic adaptive responses in tomato according to leaf phenological stage. Journal of Experimental Botany, Oxford University Press (OUP), 2021, 72 (8), pp.3185-3199. ⟨10.1093/jxb/erab057⟩. ⟨hal-03179910⟩
  • Kentaro Mori, Bertrand Beauvoit, Benoit Biais, Maxime Chabane, J. William Allwood, et al.. Central Metabolism Is Tuned to the Availability of Oxygen in Developing Melon Fruit. Frontiers in Plant Science, Frontiers, 2019, 10, pp.594. ⟨10.3389/fpls.2019.00594⟩. ⟨hal-02621412⟩
  • Guillaume Decros, Bertrand Beauvoit, Sophie Colombie, Cecile Cabasson, Stéphane Bernillon, et al.. Regulation of Pyridine Nucleotide Metabolism During Tomato Fruit Development Through Transcript and Protein Profiling.. Frontiers in Plant Science, Frontiers, 2019, 10, pp.1201. ⟨10.3389/fpls.2019.01201⟩. ⟨hal-02620533⟩
  • Sophie Colombié, Bertrand Beauvoit, Christine Nazaret, Camille Bénard, Gilles Vercambre, et al.. Respiration climacteric in tomato fruits elucidated by constraint-based modelling.. New Phytologist, Wiley, 2016, 213 (4), pp.1726-1739. ⟨10.1111/nph.14301⟩. ⟨hal-01445653⟩
  • Camille Bénard, Stéphane Bernillon, Benoit Biais, Sonia Osorio, Mickael Maucourt, et al.. Metabolomic profiling in tomato reveals diel compositional changes in fruit affected by source-sink relationships.. Journal of Experimental Botany, Oxford University Press (OUP), 2015, 66 (11), pp.3391-404. ⟨10.1093/jxb/erv151⟩. ⟨hal-02641303⟩
  • Hédia Hédiji, Wahbi Djebali, Aïcha Belkadhi, Cécile Cabasson, Annick Moing, et al.. Impact of long-term cadmium exposure on mineral content of Solanum lycopersicum plants: Consequences on fruit production. South African Journal of Botany, Elsevier, 2015, 97, pp.176-181. ⟨10.1016/j.sajb.2015.01.010⟩. ⟨hal-02640851⟩
  • Stéphane Bernillon, Benoit Biais, Catherine Deborde, Mickael Maucourt, Cécile Cabasson, et al.. Metabolomic and elemental profiling of melon fruit quality as affected by genotype and environment. Metabolomics, Springer Verlag, 2013, 9 (1), pp.57-77. ⟨10.1007/s11306-012-0429-1⟩. ⟨hal-02651407⟩
  • Yosra Ben Akal-Ben Fatma, Katia Pianelli, Martine Dieuaide Noubhani, Aline Le Menn, Catherine Deborde, et al.. 1H-NMR metabolomics: Profiling method for a rapid and efficient screening of transgenic plants. African Journal of Biotechnology, Academic Journals, 2012, 11 (52), pp.11386-11399. ⟨10.5897/AJB12.088⟩. ⟨hal-02643145⟩
  • Hédia Hédiji, Wahbi Djebali, Cécile Cabasson, Mickael Maucourt, Pierre Baldet, et al.. Effects of long-term cadmium exposure on growth and metabolomic profile of tomato plants. Ecotoxicology and Environmental Safety, Elsevier, 2010, 73 (8), pp.1965-1974. ⟨10.1016/j.ecoenv.2010.08.014⟩. ⟨hal-02668879⟩
  • Cécile Cabasson, Stéphane Bernillon, Catherine Deborde. La Métabolomique appliquée à l'étude de la physiologie de la tomate : démarche et perspectives. Spectra Analyse, PCI, 2009, 271, pp.26-31. ⟨hal-02656881⟩
  • Faouzi Horchani, Philippe Gallusci, Pierre Baldet, Cécile Cabasson, Mickael Maucourt, et al.. Prolonged root hypoxia induces ammonium accumulation and decreases the nutritional quality of tomato fruits. Journal of Plant Physiology, Elsevier, 2008, 165 (13), pp.1352-1359. ⟨10.1016/j.jplph.2007.10.016⟩. ⟨hal-02669168⟩
  • Fabien Mounet, Martine Lemaire, Mickael Maucourt, Cécile Cabasson, Jean-Luc Giraudel, et al.. Quantitative metabolic profiles of tomato flesh and seeds during fruit development: complementary analysis with ANN and PCA. Metabolomics, Springer Verlag, 2007, 3 (3), pp.273-288. ⟨10.1007/s11306-007-0059-1⟩. ⟨hal-02667259⟩
  • Patrick Ollitrault, D. Dambier, Yann Froelicher, Françoise Carreel, Angélique d'Hont, et al.. Apport de l'hybridation somatique pour l'exploitation des ressources génétiques des agrumes. Cahiers Agricultures, EDP Sciences, 2000, pp.223-236. ⟨hal-02694551⟩
  • Patrick Ollitrault, Frédérique Ollitrault, Cecile Cabasson. Induction de cals embryogenes d'agrumes par culture d'ovules. Determination isoenzymatique de l'origine tissulaire des embryons. Fruits, EDP Sciences/CIRAD, 1992, pp.204-212. ⟨hal-02715765⟩

Conference papers41 documents

  • Cecile Cabasson, Sophie Colombie, Bertrand Beauvoit, Christine Nazaret, Camille Benard, et al.. Integrative and predictive biology outside the plant: linking computational tools to fleshy fruit systems. Colloque Biologie synthétique et systémique, BioSynSys, Jun 2016, Bordeaux, France. ⟨hal-02739719⟩
  • Sophie Colombie, Bertrand Beauvoit, Christine Nazaret, Camille Bénard, Cécile Cabasson, et al.. Flux balance modelling in developing tomato fruit: the respiration climacteric as an emergent property. 10. journées scientifiques du Réseau Francophone de Métabolomique et Fluxomique RFMF 2016, Réseau Francophone de Métabolomique et Fluxomique (RFMF). FRA., May 2016, Montpellier, France. ⟨hal-02740471⟩
  • Sophie Colombie, Bertrand Beauvoit, Dominique Rolin, Stéphane Bernillon, Camille Bénard, et al.. Using metabolomic approaches and modelling of central metabolic to study fleshy fruit quality. 1. International Symposium on Metabolomics in Mexico, Jun 2015, Guadalajara, Mexico. 2 p. ⟨hal-02800371⟩
  • Clémence de Jaham, Benjamin Thiombiano, Camille Bénard, A.P. Alonso, J.C. Cocuron, et al.. Cellular and subcellular metabolomics reveal changes during tomato leaf development. 9. Journées scientifiques du RFMF, Réseau Francophone de Métabolomique et Fluxomique (RFMF). FRA., Jun 2015, Lille, France. ⟨hal-02740382⟩
  • Camille Bénard, Stéphane Bernillon, Benoit Biais, Sonia Osorio-Algar, Mickael Maucourt, et al.. Using developmental and diurnal compositional changes of tomato to study metabolism. 8. Journées Scientifiques du Réseau Français de Métabolomique et Fluxomique RFMF, May 2014, Lyon, France. 1 p. ⟨hal-02793195⟩
  • Dominique Rolin, Bertrand Beauvoit, Stéphane Bernillon, Camille Bénard, Patricia Ballias, et al.. La métabolomique : un outil de la génomique fonctionnelle au service de la biologie des systèmes. 8e Congrès Jeunes Chercheurs de la SFBV, Société Française de Biologie Végétale (SFBV). FRA., Jun 2014, Tours, France. 1 p. ⟨hal-02801036⟩
  • Camille Benard, Stéphane Bernillon, Sonia Osorio-Algar, Mickael Maucourt, Benoit Biais, et al.. Diurnal compositional changes of tomato fruit and leaf. Metabolomics 2013, Jul 2013, Glasgow, United Kingdom. 1 p. ⟨hal-02803658⟩
  • Cécile Cabasson, Ousmane Harouna Kore, Catherine Deborde, Mickael Maucourt, Annick Moing, et al.. Compositional changes of tomato seeds during development and maturation. 6. Journées Scientifiques du Réseau Français de Métabolomique et Fluxomique (RFMF), May 2012, Nantes, France. p. 60. ⟨hal-02807332⟩
  • Camille Bénard, Dominique Rolin, Stéphane Bernillon, Mickael Maucourt, Benoit Biais, et al.. Metabolomics data integration in tomato plant-fruit systems biology. Metabolomics-2012, International Conference and Exhibition on Metabolomics & Systems Biology, Feb 2012, San Francisco, United States. ⟨hal-02803433⟩
  • Hédia Hédiji, Cécile Cabasson, Wahbi Djebali, Annick Moing, Mickael Maucourt, et al.. Profils métaboliques du fruit de tomate au cours de sa maturation en présence de cadmium. 5. Journées scientifiques du Réseau Français de Métabolomique et Fluxomique, Labo/service de l'auteur, Ville service., May 2011, Paris, France. ⟨hal-02746272⟩
  • Catherine Deborde, Stéphane Bernillon, Mickael Maucourt, Cécile Cabasson, Benoit Biais, et al.. Tools and applications in plant metabolomics at Bordeaux Metabolome Fluxome Facility (PMFB; http://www.bordeaux.inra.fr/umr619/NMR.htm). 5. Journées scientifiques du Réseau Français de Métabolomique et Fluxomique, Labo/service de l'auteur, Ville service., May 2011, Paris, France. ⟨hal-02749839⟩
  • Camille Benard, Stéphane Bernillon, Mickael Maucourt, Benoit Biais, Sonia Osorio-Algar, et al.. Variation journalière de la composition métabolique de fruit de tomate en cours de maturation. 5. Journées scientifiques du Réseau Français de Métabolomique et Fluxomique, Labo/service de l'auteur, Ville service., May 2011, Paris, France. ⟨hal-02749748⟩
  • Catherine Deborde, Stéphane Bernillon, Mickael Maucourt, Cécile Cabasson, Patricia Ballias, et al.. Applications and tools in plant metabolomics at Bordeaux Metabolome-Fluxome Facility. Metabolomics 2010, Jun 2010, Amsterdam, Netherlands. ⟨hal-02757642⟩
  • Catherine Deborde, Stéphane Bernillon, Mickael Maucourt, Cécile Cabasson, Isabelle Quintana, et al.. Plant metabolomics at Bordeaux Metabolome-Fluxome Facility. Tools and applications at PMFB. 4. Journées scientifiques du Réseau Français de Métabolomique et Fluxomique, May 2010, Marseille, France. ⟨hal-02756773⟩
  • H. Hediji, W. Djebali, Cécile Cabasson, Pierre Baldet, Renaud Brouquisse, et al.. Impact d’une contamination à long terme au cadmium sur la qualité du fruit de tomate (Solanum lycopersicum). 21. Forum des sciences biologiques, Mar 2010, Mahdia, Tunisie. ⟨hal-02754676⟩
  • Cécile Cabasson, Martine Dieuaide Noubhani, Y. Ben Akal-Ben Fatma, Mickael Maucourt, Catherine Deborde, et al.. Fruit metabolome changes of antisens transformants of fruit specific phosphenolpyruvate carboxylase (S1-ppc2) under various environmental conditions. 8. Colloque national de la SFBV, Jul 2009, Strasbourg, France. ⟨hal-02754892⟩
  • Catherine Deborde, Hélène Ferry-Dumazet, Cécile Cabasson, Mickael Maucourt, Laurent Gil, et al.. Mery-B : Base de Données Métabolomiques dédiée au végétal et outils d’intégration, de visualisation et de traitement statistique de profils RMN 1H. 2. Journée scientifique du réseau RMN aquitain, Apr 2009, Bordeaux, France. ⟨hal-02752654⟩
  • Benoit Biais, Catherine Deborde, Mickael Maucourt, Cécile Cabasson, Y. Tadmor, et al.. Metabolic profiling techniques to assess and manage fruit quality. SMASH Meeting, Sep 2009, Chamonix, France. ⟨hal-02751149⟩
  • Benoit Biais, Catherine Deborde, Mickael Maucourt, Stéphane Bernillon, Cécile Cabasson, et al.. NMR profiling for the characterisation of melon commercial varieties and genetic resources. Metabomeeting 2009, Jul 2009, Norwich, United Kingdom. ⟨hal-02753178⟩
  • Daniel Jacob, Hélène Ferry-Dumazet, Laurent Gil, Catherine Deborde, Stéphane Bernillon, et al.. Mery-B : management and analysis of plant metabolomics 1H-NMR profiles. Metabomeeting 2009, Jul 2009, Norwich, United Kingdom. ⟨hal-02751144⟩
  • H. Hediji, W. Djebali, Cécile Cabasson, Mickael Maucourt, Pierre Baldet, et al.. Effets prolongés du cadmium sur certains métabolites primaires et secondaires à activités antioxydantes chez la tomate (Solanum lycopersicon). Third SMBBM International Congress of Biochemistry in parallel with the IUBMB Special Meeting on Plant stresses and The Sixth FASBMB Congress, Apr 2009, Marrakech, Maroc. ⟨hal-02754417⟩
  • Yosra Ben Akal, Ethel Mendocilla Sato, Gwenaelle Spieldenner, Raphael Henri, Catherine Deborde, et al.. Profils et empreintes métaboliques par RMN du proton pour évaluer les modifications attendues et inattendues de la composition de tomates transgéniques. 3. Journées, Feb 2008, Bordeaux, France. ⟨hal-02756617⟩
  • Yosra Ben Akal, Ethel Mendocilla Sato, Gwenaelle Spieldenner, Raphael Henry, Catherine Deborde, et al.. Profils et empreintes métaboliques par RMN du proton pour évaluer les modifications attendues et inattendues de la composition de tomates transgéniques. 3.Journées Scientifiques, Feb 2008, Bordeaux, France. ⟨hal-02752709⟩
  • H. Hediji, Cécile Cabasson, Philippe Gallusci, W. Djebali, Mickael Maucourt, et al.. Analyse du profil métabolique chez des plants de tomate en réponse au stress cadmique. 3. Journées scientifiques RFMF, Feb 2008, Bordeaux, France. ⟨hal-02755981⟩
  • Stéphane Bernillon, Ethel Mendocilla Sato, Cécile Cabasson, Yosra Ben Akal, Mickael Maucourt, et al.. 1H NMR and LC-MS metabolomic analysis of tomato leaf. Metabomeeting 2008, Apr 2008, Lyon, France. ⟨hal-02756215⟩
  • Cécile Cabasson, Yosra Ben Akal, Hédia Hédiji, Dominique Rolin. L'étude du métabolome de la tomate par RMN du proton. 14. Colloque de la recherche en IUT, May 2008, Lyon, France. ⟨hal-02758187⟩
  • Ethel Mendocilla Sato, Stéphane Bernillon, Cécile Cabasson, Yosra Ben Akal-Ben Fatma, Hédia Hédiji, et al.. 1H-NMR metabolomic analysis of tomato leaf. 3. Annual international conference, Jun 2007, Manchester, United Kingdom. ⟨hal-02756940⟩
  • Stéphane Bernillon, Fabien Mounet, Gwenaëlle Le Gall, Mickael Maucourt, Catherine Deborde, et al.. LC-MS metabolomic profiling of mesocarp tissue during tomato fruit development: comparison of different data pre-processing methods and analyses. 3. Annual international conference, Jun 2007, Manchester, United Kingdom. ⟨hal-02756030⟩
  • Fabien Mounet, Annick Moing, Johann Petit, Mickael Maucourt, Virginie Garcia, et al.. Cell expansion in tomato mesocarp and locular tissues: integration of transcriptome and metabolome data. 3. Annual international conference, Jun 2007, Manchester, United Kingdom. ⟨hal-02754523⟩
  • H. Ferry-Dumazet, A. Barre, D. Jacob, A. de Daruvar, Annick Moing, et al.. Bioinformatics resources for the study of plant metabolomics. 4. International conference, Apr 2006, Reading, United Kingdom. ⟨hal-02754398⟩
  • Annick Moing, Graham Noctor, Catherine Deborde, Mickael Maucourt, Christel Renaud, et al.. MétaboP: a French initiative supported by Génoplante for the development of analytical and bioinformatic tools for plant metabolomics. 4. International conference, Apr 2006, Reading, United Kingdom. ⟨hal-02754317⟩
  • Catherine Deborde, Stéphane Bernillon, Cécile Cabasson, Mickael Maucourt, Christel Renaud, et al.. The Metabolome pole of the Functional Genomics Platform of Bordeaux. 2. Journées, Dec 2006, Saint Sauves d'Auvergne, France. ⟨hal-02753989⟩
  • Catherine Deborde, Mickael Maucourt, Christel Renaud, Monique Gaudillère, Cécile Cabasson, et al.. Metabolome-Fluxome facility at the Plant Systems Biology Institute in Bordeaux, France. 4. International conference, Apr 2006, Reading, United Kingdom. ⟨hal-02754805⟩
  • Fabien Mounet, Martine Lemaire, Mickael Maucourt, Cécile Cabasson, J.L. Giraudel, et al.. 1H-NMR metabolic profiling reveals tissue specificity in tomato fruit. 4. International conference, Apr 2006, Reading, United Kingdom. ⟨hal-02757194⟩
  • Stéphane Bernillon, Fabien Mounet, Gwenaëlle Le Gall, Mickael Maucourt, Catherine Deborde, et al.. Metabolomic profiling of two tissues during tomato (Solanum lycopersicum) fruit development: cross-validation of LC, LC/MS and NMR approaches. 2. Journées, Dec 2006, Saint Sauves d'Auvergne, France. ⟨hal-02753431⟩
  • Catherine Deborde, Cécile Cabasson, Mickael Maucourt, Christel Renaud, Monique Gaudillère, et al.. Pôle Métabolome à l'IFR 103 Biologie Végétale Intégrative de Bordeaux. Premières journées scientifiques, Dec 2005, Toulouse, France. ⟨hal-02764501⟩
  • Hélène Ferry-Dumazet, Daniel Jacob, Aurélien Barré, Cécile Cabasson, Christel Renaud, et al.. Un outil informatique générique pour le stockage et le data-mining de données de métabolome de plantes. Premières journées scientifiques, Dec 2005, Toulouse, France. ⟨hal-02759485⟩
  • Catherine Deborde, G. Fourloubey, Daniel Jacob, Fabien Mounet, Cécile Cabasson, et al.. Chemical fingerprinting for the evaluation of polar and non polar metabolite changes during fruit development in tomato (Solanum lycopersicum) by means of H NMR. 6. Colloque national de la SFBV, Apr 2005, Arcachon, France. ⟨hal-02762461⟩
  • Annick Moing, Catherine Deborde, Fabien Mounet, Martine Lemaire-Chamley, Cécile Cabasson, et al.. Profils quantitatifs et empreintes métaboliques par RMN pour étudier la qualité des fruits. Premières journées scientifiques, Dec 2005, Toulouse, France. ⟨hal-02759652⟩
  • Annick Moing, M. Dieuaide-Noubhani, Catherine Deborde, P. Raymond, M. Maucourt, et al.. Regulation of carbon metabolism in fruit through metabolomics and fluxomics. France Israël Agro-Biotechnologies Workshop, Dec 2004, Auzeville, France. ⟨hal-02761369⟩
  • Annick Moing, Cédric Renaud, M. Maucourt, F. Belvert, Cecile Cabasson, et al.. Metabolic profiling by 1H NMR for detecting unintended effects in plant responses to pathogen, hormones and genetic variability. 5. Colloque général, Jul 2003, Orsay, France. ⟨hal-02760372⟩

Poster communications16 documents

  • Stéphane Bernillon, Cecile Cabasson, Cédric Cassan, Grégory da Costa, Catherine Deborde, et al.. MetaboHUB-Bordeaux. Journées Scientifiques INRA-BAP, Sep 2019, Hyères, France. 2019, ⟨10.15454/1.5572412770331912E12⟩. ⟨hal-02570809⟩
  • Catherine Deborde, Patricia Ballias, Camille Bénard, Stéphane Bernillon, Thierry Berton, et al.. Plant Metabolomics at Bordeaux Metabolome Facility, a member of MetaboHUB and PHENOME IA projects. Tools and Applications. 10. journées scientifiques du Réseau Francophone de Métabolomique et Fluxomique RFMF 2016, May 2016, Montpellier, France. 2016. ⟨hal-02743906⟩
  • Isma Belouah, Thierry Balliau, Camille Benard, Bertrand Beauvoit, Sophie Colombie, et al.. The timing of shifts in the transcriptome and proteome in relation to metabolic state during tomato fruit development. Metabolomics 2016. 12. Annual Conference of the Metabolomics Society, Jun 2016, Dublin, Ireland. 2016. ⟨hal-01603579⟩
  • Catherine Deborde, Patricia Ballias, Camille Bénard, Stéphane Bernillon, Thierry Berton, et al.. Plant Metabolomics at Bordeaux Metabolome Facility, a member of MetaboHUB and PHENOME IA projects. Tools and Applications. Metabolomics 2016. 12. Annual Conference of the Metabolomics Society, Jun 2016, Dublin, United Kingdom. 2016. ⟨hal-02741696⟩
  • Annick Moing, Catherine Deborde, Patricia Ballias, Camille Bénard, Stéphane Bernillon, et al.. Plant Metabolomics at Bordeaux Metabolome Facility, a member of MetaboHUB and PHENOME IA projects. Tools and Applications.. 9. Journées scientifiques du RFMF, Jun 2015, Lille, France. 2015. ⟨hal-02743630⟩
  • Stéphane Bernillon, Stéphanie Arrivault, Manuela Guenther, Regina Feil, Patricia Ballias, et al.. Primary metabolism intermediates of two tomato leaf tissues in contrasted light intensity conditions. 9. Journées scientifiques du RFMF, Jun 2015, Lille, France. 2015. ⟨hal-02740588⟩
  • Léa Roch, Stéphane Bernillon, Mickael Maucourt, Catherine Deborde, Camille Bénard, et al.. Combining MS and NMR metabolomic profiling during tomato fruit development to study environment effect on metabolism. 9. Journées scientifiques du RFMF, Jun 2015, Lille, France. 2015. ⟨hal-02739251⟩
  • Léa Roch, Stéphane Bernillon, Mickael Maucourt, Catherine Deborde, Camille Benard, et al.. Combining MS and proton NMR metabolomic profiling during tomato fruit development to study environment effect on metabolism. 12. Solanaceae Conference SOL 2015, Oct 2015, Bordeaux, France. 2015, SOL 2015 - Book of abstracts. ⟨hal-01606414⟩
  • Clémence de Jaham, Benjamin Thiombiano, Camille Benard, A. P. Alonso, J. C. Cocuron, et al.. Assessment of metabolome compartmentation changes during tomato leaf development using nonaqueous fractionation. 12. Solanaceae Conference SOL 2015, Oct 2015, Bordeaux, France. 2015, SOL 2015 - Book of abstracts. ⟨hal-01603745⟩
  • Mickael Maucourt, Camille Bénard, Benoit Biais, Patricia Ballias, Catherine Deborde, et al.. Combining metabolite and enzymatic profiling during tomato fruit development. 8. Journées Scientifiques du Réseau Français de Métabolomique et Fluxomique RFMF, May 2014, Lyon, France. 1 p., 2014. ⟨hal-02793996⟩
  • Annick Moing, Catherine Deborde, Patricia Ballias, Camille Bénard, Stéphane Bernillon, et al.. Plant Metabolomics at Bordeaux Metabolome Facility, a member of MetaboHUB IA project. Tools and Applications. 8. Journées Scientifiques du Réseau Français de Métabolomique et Fluxomique RFMF, May 2014, Lyon, France. 1 p., 2014. ⟨hal-02799366⟩
  • Benjamin Dartigues, Kenny Biliau, Cécile Cabasson, Yves Gibon, Joachim Kopka, et al.. XEML Interactive designer: Machine Readable Metadata describing Genotypes, Environmental Conditions and Sampling Strategy. Bordeaux Computational Biology and Bioinformatics, Nov 2014, Bordeaux, France. 1 p., 2014. ⟨hal-01203290⟩
  • Camille Benard, Stéphane Bernillon, Sonia Osorio-Algar, Mickael Maucourt, Benoit Biais, et al.. Influence of diurnal factor on compositional changes of tomato fruit and leaf. 7. Journées scientifiques du Réseau Français de Métabolomique et Fluxomique, Jun 2013, Amiens, France. 2013. ⟨hal-02805301⟩
  • Catherine Deborde, Annick Moing, Cécile Cabasson, Stéphane Bernillon, Dominique Rolin, et al.. Mery-B: a plant metabolomics database and knowledge base. Metabolomics 2012, Jun 2012, Washington, United States. 1 p., 2012. ⟨hal-02801976⟩
  • Annick Moing, Benoit Biais, Mickael Maucourt, Camille Benard, Patricia Ballias, et al.. Compositional changes in fruit pericarp of water-stressed tomato in greenhouse. Metabolomics 2012, Jun 2012, Washington, United States. 1 p., 2012. ⟨hal-02805488⟩
  • Camille Bénard, Benoit Biais, Stéphane Bernillon, Mickael Maucourt, Sonia Osorio-Algar, et al.. Diurnal compositional changes in pericarp of tomato fruit. Metabomeeting 2011, Sep 2011, Helsinki, Finland. 1 p., 2011. ⟨hal-02747463⟩

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  • Camille Benard, Sébastien Acket, Yannick Rossez, Olivier Fernandez, Thierry Berton, et al.. Untargeted Analysis of Semipolar Compounds by LC-MS and Targeted Analysis of Fatty Acids by GC-MS/GC-FID: From Plant Cultivation to Extract Preparation. Plant Metabolomics, 1778, Springer Science + Business Media B.V., pp.101-124, 2018, Methods in Molecular Biology, 978-1-4939-7818-2. ⟨10.1007/978-1-4939-7819-9_8⟩. ⟨hal-01972166⟩
  • Dominique Rolin, Catherine Deborde, Mickael Maucourt, Cécile Cabasson, Florence Fauvelle, et al.. High-resolution 1H-NMR spectroscopy and beyond to explore plant metabolome. Metabolomics Coming of Age with its Technological Diversity, 67 (1ère éd.), Elsevier Ltd, 693 p., 2013, Advances in Botanical Research, 978-0-12-397922-3. ⟨10.1016/B978-0-12-397922-3.00001-0⟩. ⟨hal-02811296⟩
  • Michel Pitrat, Catherine Dogimont, S. Baudracco-Arnas, Cecile Cabasson, J.C. Rode, et al.. Recherches sur le melon. Rapport d'activités 1993-1994, INRA Editions, 1995, 2-7380-0631-0. ⟨hal-02849188⟩