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		MacSyFinder: a program to mine genomes for molecular systems with an application to CRISPR-Cas systems. Sophie S Abby , Bertrand Néron , Hervé Ménager , Marie Touchon , Eduardo P C Rocha PLoS ONE, 2013, 9 (10), pp.e110726. ⟨10.1371/journal.pone.0110726⟩ Article dans une revue pasteur-01080418v1	Envoyer sur ORCID Exporter BibTeX XML-TEI Dublin Core DC Terms EndNote DataCite Export avancé Partager Gmail Facebook X LinkedIn More
		Bioinformatics applications discovery and composition with the Mobyle suite and MobyleNet Hervé Ménager , Vivek Gopalan , Bertrand Néron , Sandrine Larroudé , Julien Maupetit , et al. Resource Discovery, 6799, Springer Berlin Heidelberg, pp.11-22, 2012, Lecture Notes in Computer Science, ⟨10.1007/978-3-642-27392-6_2⟩ Chapitre d'ouvrage istex pasteur-03682347v1	Envoyer sur ORCID Exporter BibTeX XML-TEI Dublin Core DC Terms EndNote DataCite Export avancé Partager Gmail Facebook X LinkedIn More
		MacSyFinder Bertrand Néron , Sophie Abby , Eduardo Rocha 2023, ⟨swh:1:dir:b7595ff8d8bfbb327f63ae0dc8f33314f46c0996;origin=https://github.com/gem-pasteur/macsyfinder;visit=swh:1:snp:d01ecf21ed904146f244bad043bf052f2d2f8d0d;anchor=swh:1:rev:1821de180b026abe24043305cbfbdcf5e63d2881⟩ Logiciel hal-04372564v1	Envoyer sur ORCID Exporter BibTeX XML-TEI Dublin Core DC Terms EndNote DataCite Export avancé Partager Gmail Facebook X LinkedIn More
		Integron cassettes integrate into bacterial genomes via widespread non-classical attG sites Céline Loot , Gael A Millot , Egill Richard , Eloi Littner , Claire Vit , et al. Nature Microbiology, 2024, 9 (1), pp.228-240. ⟨10.1038/s41564-023-01548-y⟩ Article dans une revue pasteur-04384854v1	Envoyer sur ORCID Exporter BibTeX XML-TEI Dublin Core DC Terms EndNote DataCite Export avancé Partager Gmail Facebook X LinkedIn More
		CRISPRCasFinder, an update of CRISRFinder, includes a portable version, enhanced performance and integrates search for Cas proteins David Couvin , Aude Bernheim , Claire Toffano-Nioche , Marie Touchon , Juraj Michalik , et al. Nucleic Acids Research, 2018, 46 (W1), pp.W246-W251. ⟨10.1093/nar/gky425⟩ Article dans une revue pasteur-02098389v1	Envoyer sur ORCID Exporter BibTeX XML-TEI Dublin Core DC Terms EndNote DataCite Export avancé Partager Gmail Facebook X LinkedIn More
		Identification and analysis of integrons and cassette arrays in bacterial genomes Jean Cury , Thomas Jové , Marie Touchon , Bertrand Néron , Eduardo Pc Rocha Nucleic Acids Research, 2016, 44 (10), pp.4539 - 4550. ⟨10.1093/nar/gkw319⟩ Article dans une revue pasteur-01374968v1	Envoyer sur ORCID Exporter BibTeX XML-TEI Dublin Core DC Terms EndNote DataCite Export avancé Partager Gmail Facebook X LinkedIn More
		Abundance and co-occurrence of extracellular capsules increase environmental breadth: Implications for the emergence of pathogens Olaya Rendueles , Marc Garcia-Garcerà , Bertrand Néron , Marie Touchon , Eduardo P C Rocha PLoS Pathogens, 2017, 44, pp.289 - 289. ⟨10.1371/journal.ppat.1006525.s020⟩ Article dans une revue pasteur-01578349v1	Envoyer sur ORCID Exporter BibTeX XML-TEI Dublin Core DC Terms EndNote DataCite Export avancé Partager Gmail Facebook X LinkedIn More
		MacSyFinder v2: Improved modelling and search engine to identify molecular systems in genomes Bertrand Néron , Rémi Denise , Charles Coluzzi , Marie Touchon , Eduardo P.C. Rocha , et al. Peer Community Journal, 2023, 3, pp.e28. ⟨10.24072/pcjournal.250⟩ Article dans une revue pasteur-04060331v2	Envoyer sur ORCID Exporter BibTeX XML-TEI Dublin Core DC Terms EndNote DataCite Export avancé Partager Gmail Facebook X LinkedIn More
		Antisense transcriptional interference mediates condition-specific gene repression in budding yeast Alicia Nevers , Antonia Doyen , Christophe Malabat , Bertrand Néron , Thomas Kergrohen , et al. Nucleic Acids Research, 2018, 46 (12), pp.6009-6025. ⟨10.1093/nar/gky342⟩ Article dans une revue hal-02349600v1	Envoyer sur ORCID Exporter BibTeX XML-TEI Dublin Core DC Terms EndNote DataCite Export avancé Partager Gmail Facebook X LinkedIn More
		BioWorkFlow: Web Services toolkit and workflow applications evaluation to deploy a confidence network Marc Wessner , Martin Senger , Franck Samson , Philippe Picouet , François Moreews , et al. Jobim (Journées Ouvertes Biologie Informatique Mathématiques), Jun 2008, Lille, France Communication dans un congrès inria-00327528v1	Envoyer sur ORCID Exporter BibTeX XML-TEI Dublin Core DC Terms EndNote DataCite Export avancé Partager Gmail Facebook X LinkedIn More
		Key components of the eight classes of type IV secretion systems involved in bacterial conjugation or protein secretion J. Guglielmini , Bertrand Néron , E. P. C. Rocha , S. S. Abby , M. P. Garcillan-Barcia , et al. Nucleic Acids Research, 2014, 42 (9), pp.5715 - 5727. ⟨10.1093/nar/gku194⟩ Article dans une revue pasteur-01374962v1	Envoyer sur ORCID Exporter BibTeX XML-TEI Dublin Core DC Terms EndNote DataCite Export avancé Partager Gmail Facebook X LinkedIn More
		IntegronFinder 2.0: Identification and Analysis of Integrons across Bacteria, with a Focus on Antibiotic Resistance in Klebsiella Bertrand Néron , Eloi Littner , Matthieu Haudiquet , Amandine Perrin , Jean Cury , et al. Microorganisms, 2022, 10 (4), pp.700. ⟨10.3390/microorganisms10040700⟩ Article dans une revue hal-03655020v1	Envoyer sur ORCID Exporter BibTeX XML-TEI Dublin Core DC Terms EndNote DataCite Export avancé Partager Gmail Facebook X LinkedIn More
		Mobyle: a new full web bioinformatics framework Bertrand Néron , Hervé Ménager , Corinne Maufrais , Nicolas Joly , Julien Maupetit , et al. Bioinformatics, 2009, 25 (22), pp.3005-3011. ⟨10.1093/bioinformatics/btp493⟩ Article dans une revue hal-01287963v1	Envoyer sur ORCID Exporter BibTeX XML-TEI Dublin Core DC Terms EndNote DataCite Export avancé Partager Gmail Facebook X LinkedIn More
		Identifying Conjugative Plasmids and Integrative Conjugative Elements with CONJscan Jean Cury , Sophie S. Abby , Olivia Doppelt-Azeroual , Bertrand Néron , Eduardo P C Rocha Fernando de la Cruz. Horizontal Gene Transfer : Methods and Protocols, Springer Science; Business Media, pp.265-283, 2019, 978-1-4939-9876-0. ⟨10.1007/978-1-4939-9877-7_19⟩ Chapitre d'ouvrage pasteur-02867882v1	Envoyer sur ORCID Exporter BibTeX XML-TEI Dublin Core DC Terms EndNote DataCite Export avancé Partager Gmail Facebook X LinkedIn More
		Identification of protein secretion systems in bacterial genomes Sophie S. Abby , Jean Cury , Julien Guglielmini , Bertrand Néron , Marie Touchon , et al. Scientific Reports, 2016, 6, ⟨10.1038/srep23080⟩ Article dans une revue pasteur-01374967v1	Envoyer sur ORCID Exporter BibTeX XML-TEI Dublin Core DC Terms EndNote DataCite Export avancé Partager Gmail Facebook X LinkedIn More