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benjamin linard

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eric-rivals
"nikolai-romashchenko"
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EPIK: Precise and scalable evolutionary placement with informative $k$-mers

 Nikolai Romashchenko , Benjamin Linard , Fabio Pardi , Eric Rivals
Bioinformatics, 2023, 39 (12), pp.btad692. ⟨10.1093/bioinformatics/btad692⟩
Article dans une revue lirmm-04308461v1
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Computing Phylo-k-mers

 Nikolai Romashchenko , Benjamin Linard , Eric Rivals , Fabio Pardi
IEEE/ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics, 2023, 20 (5), pp.2889-2897. ⟨10.1109/TCBB.2023.3278049⟩
Article dans une revue lirmm-03778953v2
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PEWO: a collection of workflows to benchmark phylogenetic placement

 Benjamin Linard , Nikolai Romashchenko , Fabio Pardi , Eric Rivals
Bioinformatics, 2020, 36 (21), pp.5264-5266. ⟨10.1093/bioinformatics/btaa657⟩
Article dans une revue hal-02905244v1
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Rapid screening and detection of inter-type viral recombinants using phylo- $k$ -mers

 Guillaume E. Scholz , Benjamin Linard , Nikolai Romashchenko , Eric Rivals , Fabio Pardi
Bioinformatics, 2020, pp.#btaa1020. ⟨10.1093/bioinformatics/btaa1020⟩
Article dans une revue hal-03094833v1