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Aurélie Allais-Bonnet

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	Multi-omics data integration for the identification of biomarkers for bull fertility Valentin Costes , Eli Sellem , Sylvain Marthey , Chris Hoze , Aurélie Allais-Bonnet PLoS ONE, 2024, 19, ⟨10.1371/journal.pone.0298623⟩ Article dans une revue hal-04489600v1
	Analysis of Polycerate Mutants Reveals the Evolutionary Co-option of HOXD1 for Horn Patterning in Bovidae Aurélie Allais-Bonnet , Aurélie Hintermann , Marie-Christine Deloche , Raphael Cornette , Philippe Bardou Molecular Biology and Evolution, 2021, ⟨10.1093/molbev/msab021⟩ Article dans une revue hal-03164832v1
	Dynamics of cattle sperm sncRNAs during maturation, from testis to ejaculated sperm Eli Sellem , Sylvain Marthey , Andrea Rau , Luc Jouneau , Aurélie Allais-Bonnet Epigenetics & Chromatin, 2021, 14, pp.2-18. ⟨10.1186/s13072-021-00397-5⟩ Article dans une revue hal-03233594v1
	A comprehensive overview of bull sperm-borne small non-coding RNAs and their diversity across breeds Eli Sellem , Sylvain Marthey , Andrea Rau , Luc Jouneau , Aurélie Allais-Bonnet Epigenetics & Chromatin, 2020, 13 (1), ⟨10.1186/s13072-020-00340-0⟩ Article dans une revue hal-03176141v1
	Dual role of DMXL2 in olfactory information transmission and the first wave of spermatogenesis Clara Gobe , Maeva M. El Zaiat , Nicolas Meunier , Marjolaine André , Eli Sellem PLoS Genetics, 2019, 15 (2), pp.1-28. ⟨10.1371/journal.pgen.1007909⟩ Article dans une revue hal-02622530v1
	An initiator codon mutation in SDE2 causes recessive embryonic lethality in Holstein cattle Sebastien Fritz , Chris Hoze , Emmanuelle Rebours , Anne Barbat , Méline Bizard Journal of Dairy Science, 2018, 101 (7), pp.6220-6231. ⟨10.3168/jds.2017-14119⟩ Article dans une revue hal-02623515v1
	Rapid discovery of de novo deleterious mutations in cattle enhances the value of livestock as model species Emmanuelle Bourneuf , P. Otz , H. Pausch , V. Jagannathan , Pauline Michot Scientific Reports, 2017, 7 (1), pp.11466. ⟨10.1038/s41598-017-11523-3⟩ Article dans une revue hal-01608270v1
	A specific role for PRND in goat fetal Leydig cells is suggested by prion family gene expression during gonad development in goats and mice Aurélie Allais-Bonnet , Johan J. Castille , Maëlle Pannetier , Bruno B. Passet , Maeva Elzaiat FEBS Open Bio, 2016, 6, pp.4-15. ⟨10.1002/2211-5463.12002⟩ Article dans une revue hal-02636701v1
	A reverse genetic approach identifies an ancestral frameshift mutation in RP1 causing recessive progressive retinal degeneration in European cattle breeds Pauline Michot , Sabine Chahory , Andrew Marete , Cécile Grohs , Dimitri Dagios Genetics Selection Evolution, 2016, 48 (1), pp.56. ⟨10.1186/s12711-016-0232-y⟩ Article dans une revue hal-01479315v1
	Whole-genome sequencing identifies a homozygous deletion encompassing exons 17 to 23 of the [i]integrin beta 4[/i] gene in a Charolais calf with junctional epidermolysis bullosa Pauline Michot , Oscar Fantini , Régis Braque , Aurélie Allais-Bonnet , Romain Saintilan Genetics Selection Evolution, 2015, 47 (1), pp.1-7. ⟨10.1186/s12711-015-0110-z⟩ Article dans une revue hal-01194111v1
	Role of the prion protein family in the gonads Aurélie Allais-Bonnet , Eric Pailhoux Frontiers in Cell and Developmental Biology, 2014, 2, ⟨10.3389/fcell.2014.00056⟩ Article dans une revue hal-02632043v1
	FOXL2 is a female sex-determining gene in the goat Laurent Boulanger , Maëlle Pannetier , Laurence Gall Pouget Gall , Aurélie Allais-Bonnet , Maeva M. El Zaiat Current Biology - CB, 2014, 24 (4), pp.404-408. ⟨10.1016/j.cub.2013.12.039⟩ Article dans une revue hal-02638689v1
	High-throughput sequencing analyses of XX genital ridges lacking [i]FOXL2[/i] reveal [i]DMRT1[/i] up-regulation before [i]SOX9[/i] expression during the sex-reversal process in goats Maeva El Zaiat , Luc Jouneau , Dominique Thepot Thépot , Christophe C. Klopp , Aurélie Allais-Bonnet Biology of Reproduction, 2014, 91 (6), pp.1-14. ⟨10.1095/biolreprod.114.122796⟩ Article dans une revue hal-01194038v1
	Novel insights into the bovine polled phenotype and horn ontogenesis in Bovidae Aurélie Allais-Bonnet , Cécile Grohs , Ivica I. Medugorac , Stefan S. Krebs , Anis Djari PLoS ONE, 2013, 8, online (5), Non paginé. ⟨10.1371/journal.pone.0063512⟩ Article dans une revue hal-01000794v1
	A 3.7 Mb deletion encompassing ZEB2 causes a novel polled and multisystemic syndrome in the progeny of a somatic mosaic bull Aurelien Capitan , Aurélie Allais-Bonnet , Alain Pinton , Brigitte Marquant-Le Guienne , Daniel Le Bourhis PLoS ONE, 2012, 7, online (11), Non paginé. ⟨10.1371/journal.pone.0049084⟩ Article dans une revue hal-01019835v1
	Balanced effect of PACAP and FasL on granule cell death during cerebellar development: a morphological, functional and behavioural characterization. Aurélie Allais , Delphine Burel , Vincent Roy , Sébastien Arthaud , Ludovic Galas Journal of Neurochemistry, 2010, 113 (2), pp.329-40. ⟨10.1111/j.1471-4159.2009.06555.x⟩ Article dans une revue pasteur-00819614v1

	Integration of multi-tissues data. An example from bovine embryos. Denis Laloë , Aurélie Allais-Bonnet , Béatrice Mandon-Pepin , Luc Jouneau , Anne Frambourg 25eme congress of Animal Production Science. ASPA 2023, ASPA, Jun 2023, Bari, Italy Communication dans un congrès hal-04329926v1
	La production in vitro des embryons bovins modifie les dimorphismes sexuels des methylomes foetaux Véronique Duranthon , Aurélie Chaulot-Talmon , Sebukhan Derya , Anne Frambourg , Francesca Ali Epiphase 2023, Epiphase, Oct 2023, Jouy en Josas, France Communication dans un congrès hal-04331159v1
	Différenciation et reprogrammation épigénétique des cellules germinales mâles dans le testicule fœtal bovin Marjolaine André , Béatrice Mandon-Pepin , Aurélie Allais-Bonnet , Hélène Jammes , Amélie Bonnet-Garnier EpiPHASE 6ème journée d'animation scientifique autour de l'épigénétique, Jun 2021, Lyon, France Communication dans un congrès hal-03284625v1
	Bull sperm sncRNAs: A new source for potential fertility biomarkers? Eli Sellem , Sylvain Marthey , Hélène Kiefer , Chrystelle Le Danvic , Aurélie Allais-Bonnet International Bull Fertility Conference, British Society of Animal Science (BSAS). GBR., May 2018, Westport, Ireland Communication dans un congrès hal-02734297v1
	Epigenetic reprogramming in the male germ line of ruminants Béatrice Mandon-Pepin , Aurélie Allais-Bonnet , Marjolaine André , Pierre Calvel , Eli Sellem France-Japan Epigenetics Workshop 2017, ATouT. Com. FRA., Nov 2017, Paris, France Communication dans un congrès hal-02791776v1
	Les petits ARN non codants du spermatozoïde bovin, de potentiels biomarqueurs de la fertilité mâle ? Eli Sellem , Sylvain Marthey , Hélène Kiefer , Chrystelle Le Danvic , Aurélie Allais-Bonnet 3. Journée de Séminaires du Département Phase sur l'Epigénétique EpiPhase, May 2017, Jouy-en-Josas, France. 1p Communication dans un congrès hal-01608764v1
	Reprogrammation de la méthylation de l’ADN des cellules germinales au cours du développement testiculaire chez Capra Hircus Aurélie Allais-Bonnet , Béatrice Mandon-Pepin , Marjolaine André , Eric Pailhoux , Audrey Prézelin 3. Journée de Séminaires du Département Phase sur l'Epigénétique EpiPhase, May 2017, Jouy-en-Josas, France. 1 p Communication dans un congrès hal-01607860v1
	Small non coding RNA from Frozen bull sperm cells Eli Sellem , Sylvain S. Marthey , Hélène Kiefer , Chrystelle Le Danvic , Aurélie Allais-Bonnet 18. International Congress on Animal Reproduction (ICAR), International Organisation on Animal Reproduction. FRA., Jun 2016, Tours, France. 676 p Communication dans un congrès hal-02743053v1
	Whole-genome sequencing identifies a homozygous deletion encompassing exons 17 to 22 of the integrin beta 4 gene in a Charolais calf with junctional epidermolysis bullosa Pauline Michot , Oscar Fantini , Régis Braques , Aurélie Allais-Bonnet , Romain Saintilan 23. Plant and Animal Genome, Jan 2015, San Diego, United States. 1 p Communication dans un congrès hal-01194035v1
	FOXL2, a critical regumator of steroid synthesis, acts as a female sex-determining gene in goats Maëlle Pannetier , Maeva Elzaiat , Laurent Boulanger , Aurélie Allais-Bonnet , Laurence Gall Pouget Gall 27. Conference of European Comparative Endocrinologists, European Society of Endocrinology (ESE). GBR., Aug 2014, Rennes, France Communication dans un congrès hal-02741073v1
	FOXL2 is a female sex-determining gene in the goat Laurent Boulanger , Maëlle Pannetier , Laurence Gall Pouget Gall , Aurélie Allais-Bonnet , Maeva M. El Zaiat Opening Conference "COST Action BM1308. Sharing Advances on Large Animal Models", European Cooperation in Science and Technology (COST). BEL., Dec 2014, Munich, Germany Communication dans un congrès hal-02741098v1
	DMRT1 turns on testicular differentiation during XX sex-reversal in the goat Maeva El Zaiat , Luc Jouneau , Dominique Thepot Thépot , Christophe C. Klopp , Aurélie Allais-Bonnet 18. European Testis Workshop, May 2014, Elsinore, Denmark. 1 p Communication dans un congrès hal-01193822v1
	Effects of Dmxl2 invalidation on murine ovaries Maeva El Zaiat , Aurélie Allais-Bonnet , Marjolaine André , Clara Gobe , Eric Pailhoux 5. Journées d'Animation Scientifique du département Phase (JAS Phase 2013), Institut National de Recherche Agronomique (INRA). UAR Département Physiologie Animale et Systèmes d'Elevage (0558)., Oct 2013, Paris, France Communication dans un congrès hal-01189842v1
	Invalidation du gène FOXL2 chez la chèvre; démonstration de son rôle de déterminant ovarien chez les bovidés Laurent Boulanger , Maëlle Pannetier , Laurence Gall , Aurélie Allais-Bonnet , Maeva Elzaiat Journées d'Animation Scientifique Phase 2013, Institut National de Recherche Agronomique (INRA). UAR Département Physiologie Animale et Systèmes d'Elevage (0558)., Oct 2013, Paris, France. 1 p Communication dans un congrès hal-01019184v1
	GENIDOV: Gene network involved in ovarian development in goat and mouse Eric Pailhoux , Maëlle Pannetier , Dominique Thepot Thépot , Geneviève Jolivet , Ikrame Naciri 9. Colloque Agenae / ANR, Colloque Génomique Animale et Microbienne, AGENAE - Analyse du Génome des Animaux d'Elevage (AGENAE). FRA., Mar 2012, La Rochelle, France. 1 p Communication dans un congrès hal-01193796v1
	Involvment of [i]DMRT1[/i] in XX sex-reversed polled goats Maeva Elzaiat , Dominique Thepot Thépot , Luc Jouneau , Aurélie Allais-Bonnet , Christophe C. Klopp 6. International Symposium on the Biology of Vertebrate Sex Determination, Vertebrate-biosex. USA., Apr 2012, Kona, Hawai, United States. 1 p Communication dans un congrès hal-01019618v1

	In vitro production of bovine embryos modified sex-dimorphims in fetal liver methylome Véronique Duranthon , Aurélie Chaulot-Talmon , Francesca Ali , Ludivine Laffont , Anne Frambourg AETE 39th annual meeting, Sep 2023, Heraklion - Crète, Greece. AETE proceedings 2023, pp.146 Poster de conférence hal-04355532v1
	ETUDE DES REMANIEMENTS ÉPIGÉNÉTIQUES AU MOMENT DE L'EGA CHEZ LE BOVIN À L'AIDE D'APPROCHES CORRÉLATIVES EN MICROSCOPIE OPTIQUE Martine Letheule , Aurélie Allais-Bonnet , Marie-Christine Deloche , Ludivine Laffont , Hélène Jammes 10emes Journées Scientifiques et Techniques du Réseau des Microscopistes INRAE, Nov 2021, TOURS, France Poster de conférence hal-03517503v1
	Différenciation et reprogrammation épigénétique de la lignée germinale – Analyses transcriptomiques à l’échelle de la cellule. Geneviève Jolivet , Hérault Eloïse , Aurélie Allais-Bonnet , Marjolaine André , Béatrice Mandon-Pepin Séminaire Défis Scientifiques du Département Physiologie Animale et Systèmes d'Elevage, 2019, Rennes, France Poster de conférence hal-02949117v1
	DNA methylation dynamics during spermatogenesis in ruminants Aurélie Allais-Bonnet , Sébastien Messiaen , Marjolaine André , Béatrice Mandon-Pepin , Gabriel Livera Mammalian Reproductive Gordon Research, Jul 2018, Lucca, Italy. , 2018 Poster de conférence hal-02790316v1
	Small non coding RNA from frozen bull sperm cells: biomarkers of male fertility? Eli Sellem , Sylvain Marthey , Hélène Kiefer , Chrystelle Le Danvic , Aurélie Allais-Bonnet PAG XXVI Plant and Animal Genome Conference, Jan 2017, San Diego, United States. , 2017 Poster de conférence hal-02738420v1
	Small non coding RNA from frozen bull sperm cells: biomarkers of male fertility? Eli Sellem , Sylvain Marthey , Hélène Kiefer , Chrystelle Le Danvic , Aurélie Allais-Bonnet 36. Conference of the International Society for Animal Genetics (ISAG), Jul 2017, Dublin, Ireland. , pp.222, 2017, ISAG 2017 36th International Society for Animal Genetics Conference Poster de conférence hal-02735698v1
	Small non coding RNA from frozen bull sperm cells: A Biomarkers panel of male fertility Eli Sellem , Sylvain Marthey , Hélène Kiefer , Chrystelle Le Danvic , Aurélie Allais-Bonnet PAG XXV - Plant and Animal Genome Conference, Jan 2017, Qan Diego, United States. , 2017 Poster de conférence hal-02738179v1
	[i]Dmxl2[/i] is involved in follicle formation in the mouse Maëva El Zaiat , Clara Gobe , Bruno Passet , Nicolas Meunier , Marjolaine André 1. Journées du GdR 3606 Repro, Apr 2015, Rennes, France. , 105 p., 2015, 1ères Journées Scientifiques du GdR Repro Poster de conférence hal-01194103v1
	Invalidation of Dmxl2 in female germ cells and fertility trouble Clara Gobe , Maeva M. El Zaiat , Marjolaine André , Aurélie Allais-Bonnet , Eric Pailhoux 1. Journées du GdR 3606 Repro, Apr 2015, Rennes, France. , 105 p., 2015, 1ères Journées Scientifiques du GdR Repro Poster de conférence hal-02741048v1

	Massive detection of cryptic recessive genetic defects in cattle mining millions of life histories Florian Besnard , Ana Guintard , Cécile Grohs , Laurence Guzylack-Piriou , Margarita Cano 2023 Pré-publication, Document de travail hal-04251455v1