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Inférence de réseaux de régulation de gènes à partir de données dynamiques multi-échelles

 Arnaud Bonnaffoux
Bio-Informatique, Biologie Systémique [q-bio.QM]. Université de Lyon, 2018. Français. ⟨NNT : ⟩
Thèse tel-01920262v1

WASABI: a dynamic iterative framework for gene regulatory network inference

 Arnaud Bonnaffoux , Ulysse Herbach , Angélique Richard , Anissa Guillemin , Sandrine Gonin-Giraud , et al.
BMC Bioinformatics, 2019, 20 (1), pp.1-19. ⟨10.1186/s12859-019-2798-1⟩
Article dans une revue hal-02159694v1
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A Cloud-aware autonomous workflow engine and its application to Gene Regulatory Networks inference

 Arnaud Bonnaffoux , Eddy Caron , Hadrien Croubois , Olivier Gandrillon
CLOSER 2018 - 8th International conference on Cloud computing and Service Science., Mar 2018, Funchal, Madeira, Portugal. pp.1-8
Communication dans un congrès hal-01808764v1
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Inferring gene regulatory networks from single-cell data: a mechanistic approach

 Ulysse Herbach , Arnaud Bonnaffoux , Thibault Espinasse , Olivier Gandrillon
BMC Systems Biology, 2017, 11 (1), pp.105. ⟨10.1186/s12918-017-0487-0⟩
Article dans une revue hal-01646910v1
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Evidence for close molecular proximity between reverting and undifferentiated cells

 Souad Zreika , Camille Fourneaux , Elodie Vallin , Laurent Modolo , Remi Seraphin , et al.
BMC Biology, 2022, 20 (1), pp.155. ⟨10.1186/s12915-022-01363-7⟩
Article dans une revue hal-04134084v1
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