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16

Antoine Marin - Curriculum Vitae


Recherches passées

Développement d'une méthode de modélisation de la structure des protéines et son application aux séquences orphelines.

 

Recherches actuelles

Recherches participatives sur la diversité cultivée en agriculture biologique autour des semences paysannes.

 


Journal articles2 documents

  • Jean-Francois Taly, Antoine Marin, Jean-François Gibrat. Can molecular dynamics simulations help in discriminating correct from erroneous protein 3D models?. BMC Bioinformatics, BioMed Central, 2008, 9 (6), pp.on line. ⟨10.1186/1471-2105-9-6⟩. ⟨hal-02668783⟩
  • Juliette Martin, Guillaume Letellier, Antoine Marin, Jean-François Taly, Alexandre de Brevern, et al.. Protein secondary structure assignment revisited: a detailed analysis of different assignment methods.. BMC Structural Biology, BioMed Central, 2005, 5 (17), pp.17. ⟨10.1186/1472-6807-5-17⟩. ⟨inserm-00090199⟩

Conference papers5 documents

  • Antoine Marin, Véronique Chable. Organic on-farm research to explore the impact of diversity on winter wheat. European Conference on Crop Diversification, Sep 2019, Budapest, Hungary. ⟨hal-02898270⟩
  • Stéphane Téletchéa, Serigne Fallou Wade, Antoine Marin, Jean-François Gibrat, Edith Pajot, et al.. Automatic modelling of olfactory receptor 3D structures and classification of odor - receptor affinities. 52. Annual Meeting Biophysical Society, Feb 2008, Long Beach, United States. ⟨hal-02752770⟩
  • Guillaume Collet, Antoine Marin, Nicola Yanev, Rumen Andonov, Jean-François Gibrat. Implémentation d'un algorithme d'alignement semi-global utilisant des paramètres non locaux pour la reconnaissance de repliement. ROADEF, Feb 2006, Lilles, France. ⟨inria-00177926⟩
  • Guillaume Collet, Nicola Yanev, Antoine Marin, Rumen Andonov, Jean-François Gibrat. A flexible model for protein fold recognition. Journées Ouvertes Biologie, Informatique et Mathématiques, Jul 2006, Bordeaux, France. ⟨inria-00185460⟩
  • Stéphane Téletchéa, Antoine Marin, Jean-François Gibrat, Edith Pajot, Guenhaël Sanz. Prédiction de la structure des récepteurs olfactifs et classement des affinités. Colloque DOC'J 2006, May 2006, Jouy-en-Josas, France. ⟨hal-02751744⟩

Poster communications1 document

  • Stéphane Téletchéa, Antoine Marin, Jean-François Gibrat, Edith Pajot, Guenhaël Sanz. Olfactory receptor structure prediction and classification of ligand-receptor affinities. JOBIM 2006 (Journées Ouvertes de Biologie, Informatique, Mathématiques), Jul 2006, Bordeaux, France. 1 p, 2006. ⟨hal-02820387⟩

Book sections5 documents

  • Rumen Andonov,, Guillaume Collet, Jean-François Gibrat, Antoine Marin, Vincent Poirriez, et al.. Recent advances in solving the protein threading problem. Grid Computing for Bioinformatics and Computational Biology, Wiley, 2008, ⟨10.1002/9780470191637.ch14⟩. ⟨hal-02821336⟩
  • Jean-François Gibrat, Antoine Marin. Detecting protein function from genome sequences. Functional Plant Genomics, Science Publishers, 2007, 978-1-57808-506-4. ⟨hal-02812156⟩
  • Rumen Andonov, Guillaume Collet, Jean-François Gibrat, Antoine Marin, Vincent Poirriez, et al.. Recent advances in solving the protein threading problem. Talbi, El-Ghazali and Zomaya, Albert Y. Grid Computing for Bioinformatics and Computational Biology, Wiley, pp.325-356, 2007, 978-0-471-78409-8. ⟨inria-00180695⟩
  • Marc-André Delsuc, Thérèse Malliavin, Antoine Marin, Bernard Mourrain. Biologie Moléculaire Structurale et Géométrie. Yves Gautier. La Science au Présent, Encyclopaedia Universalis, pp.128-131, 2007, 2-85229-514-8. ⟨inria-00175688⟩
  • Jean-François Gibrat, Antoine Marin. Stratégies permettant d'assigner une fonction in silico aux séquences protéiques issues de projets de génomique. La génomique en biologie végétale, INRA Editions, 2004, Science Update, 2-7380-1167-5. ⟨hal-02833608⟩

Reports3 documents

  • Antoine Marin, Véronique Chable. Rapport final scientifique et technique du projet SAFARI: Agro-diversités génétique et spécifique pour la Santé des plantes, la Fertilité des sols, l’Adaptation et la Résilience des systèmes de culture. [Contrat] INRAE. 2018. ⟨hal-02936012⟩
  • Rumen Andonov, Guillaume Collet, Jean-François Gibrat, Antoine Marin, Vincent Poirriez, et al.. Recent Advances in Solving the Protein Threading Problem. [Research Report] PI 1856, 2007, pp.38. ⟨inria-00170619⟩
  • Rumen Andonov, Guillaume Collet, Jean-François Gibrat, Antoine Marin, Vincent Poirriez, et al.. Recent Advances in Solving the Protein Threading Problem. [Research Report] RR-6253, INRIA. 2007, pp.41. ⟨inria-00165274v2⟩