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Membrane microdomains emergence through non-homogeneous diffusion.

 Hédi Soula , Antoine Coulon , Guillaume Beslon
BMC Biophysics, 2012, 5 (1), pp.6. ⟨10.1186/2046-1682-5-6⟩
Article dans une revue inserm-00768564v1

Chromatin is a major player in regulating gene expression stochasticity in higher eukaryotic cells

 José Viñuelas , Gaël Kaneko , Valérie Morin , Elodie Vallin , Antoine Coulon , et al.
Stochastic Systems Biology conference, Jul 2011, Ascona, Switzerland. 2011
Poster de conférence hal-01354566v1

Enhanced Stimulus Encoding Capabilities with Spectral Selectivity in Inhibitory Circuits by STDP

 Antoine Coulon , Guillaume Beslon , Hédi Soula
Neural Computation, 2011, 23 (4), pp.882-908
Article dans une revue inria-00593704v1

Relationship between chromosomal features and gene expression stochasticity in higher eukaryotic cells

 José Viñuelas , Gaël Kaneko , Antoine Coulon , Guillaume Beslon , Olivier Gandrillon
Integrative Post-Genomics, Nov 2009, Lyon, France. pp.36-36, 2009
Poster de conférence hal-01437813v1

Vers des modèles multi-agents à l'échelle moléculaire

 Antoine Coulon
Session publique de l'Atelier Épigénèse, Programme d'épigenomique, Jan 2007, Evry, France
Communication dans un congrès hal-01585098v1
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On the spontaneous stochastic dynamics of a single gene: complexity of the molecular interplay at the promoter.

 Antoine Coulon , Olivier Gandrillon , Guillaume Beslon
BMC Systems Biology, 2010, 4, pp.2. ⟨10.1186/1752-0509-4-2⟩
Article dans une revue hal-00542455v1
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Live-cell micromanipulation of a genomic locus reveals interphase chromatin mechanics

 Veer I P Keizer , Simon Grosse-Holz , Maxime Woringer , Laura Zambon , Koceila Aizel , et al.
Science, 2022, 377 (6605), pp.489-495. ⟨10.1126/science.abi9810⟩
Article dans une revue hal-03740646v2

Scale-free models of chromosome structure, dynamics, and mechanics

 Simon Grosse-Holz , Antoine Coulon , Leonid Mirny
2023
Pré-publication, Document de travail hal-04310841v1

Binding cooperation and competition among transcription factors can cause complex stochastic properties in gene expression

 Antoine Coulon , Guillaume Beslon , Olivier Gandrillon
Integrative Post-Genomics, IPG'07, Nov 2007, Lyon, France. 2007
Poster de conférence hal-01613869v1

Mécanismes moléculaires de la stochasticité de l'expression des gènes

 Antoine Coulon
Le hasard au coeur de la cellule, Jan 2008, Paris, France
Communication dans un congrès hal-01585195v1

Stochasticité de l'expression génique et dynamique des complexes de régulation

 Antoine Coulon
Biomaths seminar, Jun 2008, Lyon, France
Communication dans un congrès hal-01585208v1

Gene expression and the dynamics of transcriptional regulation : a model for theoretical and experimental investigations

 Antoine Coulon , Olivier Gandrillon , Guillaume Beslon
Integrative Post-Genomics, IPG'08, Nov 2008, Lyon, France. 2008
Poster de conférence hal-01614314v1

Large multiprotein structures modeling and simulation: the need for mesoscopic models.

 Antoine Coulon , Guillaume Beslon , Olivier Gandrillon
Methods in Molecular Biology, 2008, 484, pp.537-58. ⟨10.1007/978-1-59745-398-1_32⟩
Article dans une revue hal-00294029v1

Oncogenic chimeric transcription factors drive tumor-specific transcription, processing, and translation of silent genomic regions

 Julien Vibert , Olivier Saulnier , Céline Collin , Floriane Petit , Kyra J.E. Borgman , et al.
Molecular Cell, 2022, 82 (13), pp.2458-2471.e9. ⟨10.1016/j.molcel.2022.04.019⟩
Article dans une revue hal-04032863v1

Towards experimental manipulation of stochasticity in gene expression.

 José Viñuelas , Gaël Kaneko , Antoine Coulon , Guillaume Beslon , Olivier Gandrillon
Progress in Biophysics and Molecular Biology, 2012, 100 (1), epub ahead of print. ⟨10.1016/j.pbiomolbio.2012.04.010⟩
Article dans une revue istex hal-00720054v1

Modélisation cellulaire pour l'émergence de structures multiprotéiques auto-organisées

 Antoine Coulon , Hédi Soula , Olivier Mazet , Olivier Gandrillon , Guillaume Beslon
Revue des Sciences et Technologies de l'Information - Série TSI : Technique et Science Informatiques, 2007, 1-2, 26, pp.123-148. ⟨10.3166/tsi.26.123-148⟩
Article dans une revue istex hal-01613745v1
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Molecular basis of CTCF binding polarity in genome folding

 Elphège P Nora , Laura Caccianini , Geoffrey Fudenberg , Kevin So , Vasumathi Kameswaran , et al.
Nature Communications, 2020, 11 (5612), ⟨10.1038/s41467-020-19283-x⟩
Article dans une revue hal-03047137v2

Stochasticité de l'expression génique et dynamique des complexes de régulation

 Antoine Coulon
Seminar of the Symbiose project, May 2008, Rennes, France
Communication dans un congrès hal-01585198v1
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Stochasticité de l'expression génique et régulation transcriptionnelle -- Modélisation de la dynamique spatiale et temporelle des structures multiprotéiques

 Antoine Coulon
Modélisation et simulation. INSA de Lyon, 2010. Français. ⟨NNT : ⟩
Thèse tel-00538047v1

Agent-Based Modeling for Nuclear Structures - Study of nucleolus disruption during Herpes Simplex Virus infection

 Antoine Coulon
Séminaire de modélisation du vivant, SeMoVi, Sep 2006, Lyon, France
Communication dans un congrès hal-01585121v1

Dynamique de la régulation transcriptionnelle et stochasticité de l'expression génique

 Antoine Coulon
Séminaires de l'institut du thorax, Nov 2008, Nantes, France
Communication dans un congrès hal-01585257v1
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Quantifying the contribution of chromatin dynamics to stochastic gene expression reveals long, locus-dependent periods between transcriptional bursts.

 José Viñuelas , Gaël Kaneko , Antoine Coulon , Elodie Vallin , Valérie Morin , et al.
BMC Biology, 2013, 11 (1), pp.15. ⟨10.1186/1741-7007-11-15⟩
Article dans une revue inserm-00817963v1

Mécanismes moléculaires et fonction biologique de la variabilité de l'expression génique à l'échelle de la cellule unique : une approche systémique

 Antoine Coulon , Guillaume Beslon , François Chatelain , Alexandra Fuchs , Olivier Gandrillon , et al.
Le Hasard au coeur de la cellule, Syllepse edition, pp.82-111, 2009, ⟨10.3917/edmat.kupie.2011.01.0082⟩
Chapitre d'ouvrage hal-01499539v1
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Two HIRA-dependent pathways mediate H3.3 de novo deposition and recycling during transcription

 Júlia Torné , Dominique Ray-Gallet , Ekaterina Boyarchuk , Mickaël Garnier , Patricia Le Baccon , et al.
Nature Structural and Molecular Biology, 2020, 27 (11), pp.1057-1068. ⟨10.1038/s41594-020-0492-7⟩
Article dans une revue hal-03028701v1
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