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Curriculum Vitae


ACTIVITES

Janvier 2020- : Directrice de l'UR 1164 de Génomique-Info

2019 : Adjointe à la direction de l’UR 1164 de Génomique-Info

Septembre 2018- : Coordination scientifique du Centre de Ressources Biologiques pour les Plantes Cultivées (BRC4Plants) de l’Infrastructure RARe

Janvier 2018 : Deputy Head of Node du nœud français de l’infrastructure ELIXIR (https://elixir-europe.org). Animation des activités en lien avec ELIXIR de l’Institut Français de Bioinformatique qui constitue le nœud français d’ELIXIR (www.france-bioinformatique.fr).

Novembre 2011- : Intégration dans l’UR 1164 Génomique-Info (URGI, Centre INRA de Versailles-Grignon). 2011-2015 Contribution à l’étude de la structure du génome de la vigne. Septembre 2015 : animation de l’équipe Système d’Information. Développement d’architectures logicielle soutenant des fédérations de données et intégration sémantique de données.

Avril 2010–Février 2019 : Chef de département adjointe au département de Génétique et Amélioration des plantes puis de Biologie et Amélioration des Plantes. En charge du dossier Ressources génétiques et du suivi d’un panel d’unité du département.

Janvier 2008-Avril 2010 : Adjointe à la direction de l’UMR 1165 de Génomique Végétale.

Août 2001- Novembre 2011 : UMR 1165 de Génomique Végétale (URGV ; Centre INRA de Versailles-Grignon) : développement d’outils de génomique structurale pour le groupe vigne INRA, d’abord au sein de l’équipe animée par Boulos Chalhoub, puis dans une équipe indépendante que j’ai co-animé avec Christian Clépet (CR1 CNRS). 2009, animatrice de l’équipe « Génomique de la vigne et des arbres forestiers ».

Août 1996-juillet 2001: Equipe Viticulture de l’UMR Diversité de Génomes des Plantes Cultivées, Centre de Montpellier. Cartographie fine d’un gène majeur de résistance à l’oïdium et réalisation d’une carte génétique de référence du génome de la vigne à l’aide de loci microsatellites.

Septembre 1994 - Juin 1996: Stage post-doctoral dans le Laboratoire de Phytopathologie Moléculaire dirigé par M. Dron. Localisation de séquences codant pour des protéines kinases sur le génome d’A. thaliana. Développement d’approches “gènes candidats“ pour la résistance à l’anthracnose.

Octobre 1994 : Recrutement à l'INRA, au sein de l’Unité de Recherches Génétique et Amélioration des Plantes groupe Viticulture sur un poste de CR2

 

Coordination de projets

2021-2026: ANR PIA3 MUDIS4LS - Espaces numériques mutualisés pour les sciences du vivant (work package leader)

2020-2024: H2020 AGENT (GA n° 862613; coord N. Stein, IPK) - Activated GEnebank NeTwork (Partner)

2020-2023: H2020 ELIXIR-CONVERGE (GA n°871075) Connect and align ELIXIR nodes to deliver sustainable FAIR life-science data management services (work package leader)

2019-2021: H2020 GenRes Bridge (GA n°817580). Genetic resources for a food-secure and forested Europe (work package leader)

2018-2022: Action COST INTEGRAPE (CA 17111; www.integrape.eu). Data integration to maximize the power of OMICs for grapevine improvement (co-coordination)

2016-2018: IBISA Coll-GATE: Collaborative development of a web application for the management of the collections

2012-2016: FP7 KBBE Innovine (GA n°311775) : Combining innovation in vineyard management and genetic for a sustainable European viticulture

2013-2015: IBISA Plant BRC Network: Towards a european research infrastructure of genetic resources for crops

2009-2011 : Trilateral GABI-Génoplante-MyCT, KBBE-008-01 “GrapeReSeq : Large scale re-sequencing in the Vitis genus for identification of resistance genes, SNP discovery and high throughput genotyping”

2005- 2008 : ANR-05-GPLA-014« Sequencing the grape genome »

2004-2007 : Trilatéral GABI-Génoplante-MyCT, TRI017 « CoreGrapeGene : Exploitation of the natural diversity of grape through functional genomics for improved resistance and quality »

1999-2001 : Génoplante CI1999096 “Etablissement d’une carte génétique consensus de la vigne.

 

FORMATION

2009 - 2010 : Ecole de Management pour la Recherche Agronomique

1994 : Contrat à durée déterminée (7 mois) dans le laboratoire de Martin Kreis (Université Paris Sud). Participation au projet de séquençage du génome d’Arabidopsis thaliana.

1990 - 1994 : Thèse de l'Institut National Agronomique Paris-Grignon dans le laboratoire de Phytopathologie Moléculaire de l'Université Paris-Sud sous la direction de M. Dron sur le sujet: "Cartographie génétique de Phaseolus vulgaris L. Localisation de gènes de résistance à l'anthracnose". Soutenue le 14/01/94.

1988 – 1989 : DEA de Génétique et Amélioration des Plantes dirigé par A. Gallais à l'Institut National Agronomique Paris-Grignon.

1986 - 1988 : Diplôme d'Agronomie Générale de l'Ecole Nationale Supérieure Agronomique de Montpellier.

1983 – 1986 : Mathématiques Supérieures et Mathématiques Spéciales Biologie au lycée Saint-Louis à Paris.

1983 : Baccalauréat D au lycée du Golfe de Saint-Tropez.

 


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Journal articles1 document

  • . International Wheat Genome Sequencing Consortium (iwgsc), Arnaud Bellec, Helene Berges, Sonia Vautrin, Michael Alaux, et al.. Shifting the limits in wheat research and breeding using a fully annotated reference genome. Science, American Association for the Advancement of Science, 2018, 361 (6403), pp.7191. ⟨10.1126/science.aar7191⟩. ⟨hal-01885399⟩