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An Alternative Approach to Multiple Genome Comparison

 Alban Mancheron , Raluca Uricaru , Eric Rivals
Nucleic Acids Research, 2011, 39 (15), pp.e101. ⟨10.1093/nar/gkr177⟩
Article dans une revue lirmm-00620931v1
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Asymptotic Limits of a New Type of Maximization Recurrence with an Application to Bioinformatics

 Kun-Mao Chao , An-Chiang Chu , Jesper Jansson , Richard S. Lemence , Alban Mancheron
TAMC'12: 9th Annual Conference on Theory and Applications of Models of Computation, May 2012, Beijing, China. pp.622, ⟨10.1007/978-3-642-29952-0⟩
Communication dans un congrès lirmm-00717670v1

Ehrlichia Ruminantium Genome Segmentations Reveal Novel Homologous Genes

 Alban Mancheron , Raluca Uricaru , Eric Rivals
ISCB Africa ASBCB Joint Conference on Bioinformatics of Infectious Diseases, Nov 2009, Bamako, Mali
Communication dans un congrès lirmm-00491362v1
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A Novel Approach for Comparative Genomics & Annotation Transfer

 Alban Mancheron , Raluca Uricaru , Eric Rivals
2010
Autre publication scientifique lirmm-00491326v2
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Combinatorial Characterization of the Language Recognized by Factor and Suffix Oracles

 Alban Mancheron , Christophe Moan
International Journal of Foundations of Computer Science, 2005, 16 (6), pp.1179-1191. ⟨10.1142/S0129054105003741⟩
Article dans une revue hal-00487228v1
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FIASCO : un nouvel algorithme d'extraction d'itemsets fréquents dans les flots de données.

 Lionel Vinceslas , Jean-Émile Symphor , Alban Mancheron , Pascal Poncelet
EGC: Extraction et Gestion des Connaissances, Jan 2008, Sophia-Antipoli, France. pp.235-236
Communication dans un congrès hal-00447421v1
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Conservez l’historique de vos commandes pour chaque projet, le retour

 Alban Mancheron
GNU/Linux Magazine, 2020, 241, pp.24-39
Article dans une revue lirmm-02987788v1
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Pattern discovery allowing gaps, substitution matrices and multiple score functions

 Alban Mancheron , Irena Rusu
Workshop on Algorithms in BioInformatics (WABI), Sep 2003, Budapest, Hungary. pp.129-145
Communication dans un congrès hal-00487245v1
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Voyage initiatique vers la bioinformatique

 Alban Mancheron
GNU/Linux Magazine, 2021, 251, pp.44-56
Article dans une revue lirmm-03508541v1
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Combining DGE and RNA-sequencing data to identify new polyA+ non-coding transcripts in the human genome

 Nicolas Philippe , Elias Bou Samra , Anthony Boureux , Alban Mancheron , Florence Rufflé , et al.
Nucleic Acids Research, 2014, 42 (5), pp.2820-2832. ⟨10.1093/nar/gkt1300⟩
Article dans une revue lirmm-01233107v1
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Reliable Bacterial Genome Comparison Tools

 Eric Rivals , Alban Mancheron , Raluca Uricaru
ERCIM News, 2010, 82, pp.017-018
Article dans une revue lirmm-00511509v1
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On-line & Incremental Update Properties of the Subsequence Automaton

 Alban Mancheron , Jean-Émile Symphor
[Research Report] 2007, pp.13
Rapport inria-00257567v1
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¡Viva la libertad!

 Alban Mancheron
GNU/Linux Magazine, 2021, 254, pp.14-20
Article dans une revue lirmm-03508567v1
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C’est l’histoire d’un make…

 Alban Mancheron
GNU/Linux Magazine, 2021, 247
Article dans une revue lirmm-03184547v2
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Extraction de Motifs Communs dans un Ensemble de Séquences. Application à l'identification de sites de liaison aux protéines dans les séquences primaires d'ADN.

 Alban Mancheron
Autre [cs.OH]. Université de Nantes, 2006. Français. ⟨NNT : ⟩
Thèse tel-00257587v1
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RedOak: a reference-free and alignment-free structure for indexing a collection of similar genomes

 Clément Agret , Annie Chateau , Gaëtan Droc , Gautier Sarah , Alban Mancheron , et al.
2021
Pré-publication, Document de travail lirmm-03117453v1
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Combinatorial Characterization of the Language Recognized by Factor and Suffix Oracles

 Alban Mancheron , Christophe Moan
Prague Stringology Conference, Aug 2004, Prague, Czech Republic. pp.139--154
Communication dans un congrès hal-00487234v1
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SPAMS : A Novel Incremental Approach for Sequential Pattern Mining in Data Streams

 Lionel Venceslas , Jean-Émile Symphor , Alban Mancheron , Pascal Poncelet
Springer Verlag. Advances in Knowledge Discovery and Management, pp.201-216, 2009
Chapitre d'ouvrage lirmm-00435841v1
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Le FIA: un nouvel automate permettant l'extraction efficace d'itemsets fréquents dans les flots de données.

 Jean-Émile Symphor , Alban Mancheron , Lionel Vinceslas , Pascal Poncelet
EGC: Extraction et Gestion des Connaissances, Jan 2008, Sophia-Antipolis, France. pp.157-168
Communication dans un congrès hal-00447420v1
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Novel Definition and Algorithm for Chaining Fragments with Proportional Overlaps

 Raluca Uricaru , Alban Mancheron , Eric Rivals
RECOMB-CG: Comparative Genomics, Oct 2010, Ottawa, Canada. pp.161-172, ⟨10.1007/978-3-642-16181-0_14⟩
Communication dans un congrès lirmm-00527915v1
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iMOKA: k-mer based software to analyze large collections of sequencing data

 Claudio Lorenzi , Sylvain Barriere , Jean-Philippe Villemin , Laureline Dejardin Bretones , Alban Mancheron , et al.
Genome Biology, 2020, 21 (1), ⟨10.1186/s13059-020-02165-2⟩
Article dans une revue lirmm-02987774v1
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Mieux comprendre les conditions d’utilisation de services

 Alban Mancheron
GNU/Linux Magazine, 2022, Hors-Série, 117, pp.8-11
Article dans une revue lirmm-03655012v1
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Entre algorithmique et programmation

 Alban Mancheron
GNU/Linux Magazine, 2022, 255, pp.6-22
Article dans une revue lirmm-03508634v1
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Voyage initiatique vers la bioinformatique

 Alban Mancheron
GNU/Linux Magazine, 2021, 253, pp.20-38
Article dans une revue lirmm-03508556v1
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Novel definition and algorithm for chaining fragments with proportional overlaps

 Raluca Uricaru , Alban Mancheron , Eric Rivals
Journal of Computational Biology, 2011, 18 (9), pp.1141-1154. ⟨10.1089/cmb.2011.0126⟩
Article dans une revue lirmm-00834143v1
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Spams, une nouvelle approche incrémentale pour l'extraction de motifs séquentiels fréquents dans les Data streams

 Lionel Vinceslas , Jean-Émile Symphor , Alban Mancheron , Pascal Poncelet
EGC: Extraction et Gestion des Connaissances, Jan 2009, Strasbourg, France. pp.205-216
Communication dans un congrès lirmm-00345563v1
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RedOak

 Clément Agret , Alban Mancheron , Gautier Sarah
2017, ⟨swh:1:dir:b0ab791cdb79f7adebb98549a2546e0b070b8237;origin=https://gite.lirmm.fr/doccy/RedOak;visit=swh:1:snp:ee2f64fb510a243f2e7ac0875b80c782c4bc0351;anchor=swh:1:rev:c875c2a7a70de544e900ffdbc0fecc11c8ecd469⟩
Logiciel lirmm-03925385v1
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Statistical Properties of Similarity Score Functions

 Jérémie Bourdon , Alban Mancheron
Fourth Colloquium on Mathematics and Computer Science Algorithms, Trees, Combinatorics and Probabilities, 2006, Nancy, France. pp.129-140, ⟨10.46298/dmtcs.3502⟩
Communication dans un congrès hal-01184706v1
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Une introduction à la programmation parallèle avec Open MPI et OpenMP

 Alban Mancheron
GNU/Linux Magazine, 2018, Hors-Série, 99, pp.16-35
Article dans une revue lirmm-01981916v1
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Finding Frequent Subsequences in a Set of Texts

 Alban Mancheron , Jean-Émile Symphor
[Research Report] 2007, pp.13
Rapport inria-00257561v1
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